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刘立明 江南大学生物工程学院环境生物技术室

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Presentation on theme: "刘立明 江南大学生物工程学院环境生物技术室"— Presentation transcript:

1 刘立明 江南大学生物工程学院环境生物技术室
如何撰写高水平的学术论文 -----从事论文研究的一点心得 刘立明 江南大学生物工程学院环境生物技术室

2 导言 为什么要撰写学术论文? 一篇高水平的学术论文包括哪些要素? 如何撰写高水平的学术论文?

3 一、为什么要撰写学术论文?

4 为什么要撰写学术论文? 基础研究的成果以论文形式表现 研究结果只有发表了,他人才能重复、验证,结果才可能成为知识
提供书面材料让同行知道:做了什么?为什么这样做?怎样做的?发现了什么?发现意味了什么? 撰写和发表论文是科研工作的最后一道工序 发表论文的质量与数量:衡量水平和效率的客观标准 更为重要的是,发表论文是获得学位的先决条件

5 二、一篇高水平的学术论文包括哪些要素?

6 科技论文的五要素 创新性 可读性 信息量 参考文献 署名与致谢 个人观点: 一篇高水平的学术论文,其实质是一动听的故事

7 高水平论文要求(4C) Clear: 思路清晰、概念清楚、层次清楚、表达清楚
Complete:内容完整、结构完整匀称,切忌虎头蛇尾,有始无终 Correct:科学内容正确(不出错)、资料数据正确(数据可靠、可信)、语言正确(无语法错) Concise:论述深刻、充分揭示其科学内涵、使用定量方法

8 创新性 Nature:创新是科研成果新颖,引人注意(出人意料或令人吃惊),而且该项研究看来在该领域之外具有广泛的意义,无论是报道一项突出的发现,还是某一重要的问题的实质性进展的第一手报告,均应使其他领域的科学家感兴趣。 Science:创新是指对自然或理论提出新见解,而不是对已有研究结论的再次论证,内容激动人心并富有启发性,具有广泛的科学兴趣。具体而言,就是说在已沉寂的研究领域提出创新思想;在十分活跃的研究领域取得重大进展或者是将原先彼此分离的研究领域融合在一起。

9 创新性 如何体现创新:一篇论文或一项研究课题,规模不一定很大,但研究一定要深入,结论一定要深刻,要能反映研究者独到的见解。

10 可读性 Nature:来稿应清楚、简练,以便让其他领域的读者和母语为非英语的读者能够读懂。
在投稿之前,请从事其他学科研究的同事对最终文稿在清楚易懂方面提供意见往往很有用。 Nature的编辑常常建议修改并重写论文的摘要和引言 保证文章和图片对非该领域的读者明确、能读懂。 Nature一再申明:凡不符合他们要求的稿件,毋需深入阅读即行退稿。

11 什么是可读性 简明、清楚、易懂! 可读性:使读者能够明了你要说的什么问题,是怎样着手解决的,并不需要读者非得全面理解你的论文的全部内容。

12 可读性包括: 结论的可靠性:实质性进展?阶段性成果的指导意义? 构思的严密性和写作的逻辑性:解释学术思想,介绍研究背景 论述的生动性:
文字和图表的规范性:数据的取舍和图表的设计 论文格式的标准性:严格按照Guide for authors

13 文字和图表的规范性

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15 信息量 Chinese Physics Letters:“要尽可能多地给出有关研究的信息,尽可能少地运用investigate(调查),Study(研究),discuss(讨论)等词。 如:“The acid concentration is 25 g/L 就比“The acid concentration is measured”包含更多的信息量。 避免或少使用“it is shown, it is obvious”等冗余词语

16 信息量 读之前或者不知道,或者模糊不清或者不确切的知识,在读过该文之后不仅获得新知识,还消除了模糊不清或不确切之处,就说明这篇文章包含较多的信息量。 如:“多点测量”的信息量要比“6点测量”少得多,前者给出的是模糊的、不确切的信息,而后则是清楚的、确切的信息

17 论文篇幅的限制 新的学术思想,实验,发现等结果决定论文信息量 篇幅的严格限制,可删除那些与文章主题关系不大的或次要的内容
篇幅限制:重新构思论文的框架,选择最重要的素材,采纳最恰当的表述方式并对文字的叙述仔细推敲。 Watson与Crick发现DNA双螺旋结构的论文发表在Nature,只有约500字和一幅DNA的双螺旋图;这篇论文使作者获得了诺贝尔生物医学奖。

18 如何列举参考文献 一定要将产生新的学术思想之前最重要的文献列举出来,说明当时的研究所达到的水平;
在研究工作开展中,受哪些文献资料的启发,从哪些论文中获得了教益,促进了研究进度,属于这类的文献均应列出。 写论文时应对论文涉及的学科内容进行检索,看看是否遗漏了重要的相关文献。

19 列出参考文献的重要性 编辑和审稿人根据参考文献,初步判断该论文的水平以及作者对有关学科的背景知识水平
在一定程度上也可以判断作者的科学道德,如果未能列出密切相关的主要文献,读者、编辑和审稿人可能会看作是一种不良学风。参考文献关系到论文的可信度和作者的声誉。 勿二次引用别人的文献

20 署名和致谢 优秀科技论文的署名反映了作者的科学道德,应经得起时间的考验。论文作者和参与工作的人应区别开。
致谢:国内一般是感谢基金支持。课题组的集体力量、同行的学术交流等等都应当致谢。 致谢不是可有可无。论文公开发表后,就用书面形式记载了你的科研成果,同时也记下了你的科研道德,

21 三、如何撰写高水平的学术论文?

22 怎样阅读科技论文 What is the major question addressed in this paper?
Is this question important and why? What are the approaches used in this paper, and whether they are adequate for the questions? What are the novel idea or using innovative approaches? What is the concept coming out of this paper? Do the results presented support this new concept?

23 科技论文的基本结构 Introduction, Methods, Results, and Discussion (IMRAD)
I: What and why? 研究什么问题?为什么研究这个问题? M:How? 如何研究的? R:What? 发现了什么? D:What? 发现意味着什么?

24 标题 重要性 Important/significant 体现创新点 Unexpected/unusual 包含所有关键词
吸引人 用动词、句子 Important/significant Unexpected/unusual Functional Simple Straight forward Specific

25 最好不用“…的研究”、“…的意义”、“…的发现” 、“…的特征”、“…的讨论” 、 “…的分析”等词;某某问题的研究、初步研究、某某的初探
用论文中的主要结论作为标题

26 摘要 写文章的目的 研究过程和使用的方法 主要结果和结论。基础研究应体现创新,但不宜过分强调;应用研究要提出应用前景。 不要把文中内容照搬
重要事实开头,避免第一人称或辅助从句 过去时叙述作者工作,现在时表达主要结论 效果:国外同行根据英文摘要和图表,可以大致看懂全文。

27 举例 摘 要:为进一步提高光滑球拟酵母发酵生产丙酮酸的水平(文章的目的),在途径分析的基础上提出了一种组成型降低丙酮酸脱酸酶、但增强乙酰辅酶A合成酶活性的育种策略。通过亚硝基胍诱变(研究过程和使用方法) ,获得一株乙酸需求型突变株CCTCC M202019,在外加乙酸的培养基中表现出高于出发株21%的丙酮酸生产能力和良好的遗传稳定性。检测突变株CCTCC M202019中丙酮酸代谢相关酶的活性,发现(1)丙酮酸脱羧酶活性降低了40%;(2)外加乙酸与否的条件下,乙酰辅酶A合成酶的活性分别提高了103.5%和57.4%;(3)添加乙酸和突变对丙酮酸羧化酶、丙酮酸脱氢酶系、乙醇脱氢酶和乙醛脱氢酶的活性没有显著影响。在含有乙酸的培养基中突变株细胞干重比出发株高21.7%,可能是因为乙酰辅酶A合成酶活性的提高,补充了因丙酮酸脱羧酶活性降低而引起的胞质乙酰辅酶A短缺。在7 L罐中含有6 g/L乙酸钠的培养基中发酵62 h,丙酮酸产量达到68.7 g/L,对葡萄糖的产率为0.651 g/g(主要结果和结论)。

28 前言 (1) “为什么要做?” 简要回顾本文所涉及到的科学问题的研究历史,阐述本课题的研究目的。
(1) “为什么要做?” 简要回顾本文所涉及到的科学问题的研究历史,阐述本课题的研究目的。 (2) “别人做了什么工作? 存在什么问题?” 应当对国内外在本课题上的研究作一总结。总结用图表的形式比较好,再辅以适当的论述。不要引一大堆参考文献,要引自己看过的参考文献,这一点请特别注意。 (3) “准备做什么?” 针对他人研究工作中存在的问题,提出自己的思路和研究内容,扼要交代本研究所采用的方法和技术手段等,强调研究的重要性。

29 举例 丙酮酸作为一种重要的工业原料,不仅在化工、制药及农用化学品工业中有着广泛的用途,在食品保健业也具有巨大的市场潜力。最近,广东太阳神集团以丙酮酸钙制成减肥胶囊即为一例。日益增长的市场需求,使得研究者对发酵法生产丙酮酸的兴趣不断增大[1]。(为什么要做) 球拟酵母(Torulopsis)的维生素营养缺陷型具有大量积累丙酮酸的潜力,曾有一些学者研究过溶氧对其产酸性能的影响。Miyata和Yonehara认为供氧不足会造成丙酮酸产量下降,而乙醇产量显著增加[2];Hua和Shimizu等则利用代谢通量分析方法研究了不同溶氧水平下Torulopsis glabrata胞内的代谢流分配[3,4]。作者在前期工作中也发现,较高的溶氧有利于丙酮酸的积累[5]。(别人做了什么工作?)但是,若要实现丙酮酸发酵过程高产量、高产率和高生产强度的统一,溶氧应当高到什么程度,在发酵过程中应当采取何种控制策略,这是已有文献尚未阐明的问题。(存在什么问题?) Torulopsis glabrata WSH-IP12是一株能够积累丙酮酸的多重维生素营养缺陷型[6]。作者对其进行诱变改良,获得了一株产丙酮酸性能更佳的T. glabrata突变株WSH-IP303[7]。在优化了培养基中维生素浓度的基础上[8],本文首先分析了不同体积传氧系数下(溶氧均高于50%)WSH-IP303发酵的动力学特征,根据主要动力学参数(m、qs和qp)的变化特性提出了分阶段供氧控制模式。然后,实验验证了该模式在实现丙酮酸高产量和高产率的统一上的有效性,并对不同供氧方式下细胞的代谢活性进行了讨论。(准备做什么?)

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31 材料与方法 材料与方法是论文中非常重要的一个环节。国外期刊对此尤其重视,国内限于文章篇幅,对此要求不是很严格。
材料与方法∶让他人看到你的论文后能重复研究工作。

32 结果 在结果的开始部分简单介绍原理和实验目的 按照图表,看图说明,描述具体结果。不能遗漏,按照结果在正文和图表中的逻辑顺序。
实验结果的顺序,绝不是按获得数据的先后排列,而是要按企图说明问题的逻辑顺序排列。 要学会合理使用图、表和文字说明。 要敢于舍弃不必要的数据!

33 讨论 What do we learn from this research? 概括主要发现,不要重复前言和结果
引用可以支持你的文章,但不会影响或降低文章的创新性 主要缺点(或局限性)是什么?为什么? 不要做太多假设,不要夸大不能被实验数据完全支持的结论 在文章的最后突出研究的重要性!

34 举例(中文) 本文基于对光滑球拟酵母中丙酮酸节点主要代谢途径的分析,提出选育PDC活性组成型降低而ACS活性增强的突变株的育种策略,以期提高丙酮酸的产量,并降低对维生素B1的依赖性。由于该突变株中丙酮酸经PDC途径的降解被进一步抑制,且对乙酸的利用能力加强,7 L发酵罐中丙酮酸的产量和产率与前期研究相比又有了进一步的提高[10]。此外,本文研究表明,提高T. glabrata PDH旁路中ACS活性可以增强对乙酸的同化能力,为酵母细胞提供额外的胞质AcCoA。这不仅有利于细胞生长,也为生产其它与AcCoA代谢相关的物质提供了可能。(在文章的最后突出研究的重要性)

35 举例(英文) There are three main findings in the present study. First, we report a GDNF-induced long-term facilitation of neurotransmitter release at the neuromuscular synapses. Second, we show that the effect of GDNF on synaptic transmission is mediated by an increase in the expression of the Ca2+-binding protein frequenin. Finally, we demonstrate that GDNF and frequenin facilitate synaptic transmission by enhancing N-type Ca2+ channel activation, leading to an enhancement of Ca2+ influx. Thus, this study has identified, for the first time, a molecular target that mediates the long-term, synaptic action of a neurotrophic factor. Our findings may also provide new insights into the regulatory mechanisms of neurotransmitter release. The results in the present study may have a number of implications in the cell biology of tyrosine kinase receptors. First, we report the ... To our knowledge, this is the first demonstration for ... Thus, our results suggest a cross-talk between Ca2+ and tyrosine kinase signaling pathways. Second, the present study reveals an important regulatory effect of ... It will be interesting to determine whether ... Finally, we show that ... Xxx ... Taken together, these results suggest a general role of tyrosine kinase in the endocytosis of growth factor receptors.

36 如何答复修改意见 导师和学生对评审意见逐条进行讨论,决定如何答复,是否需作补充实验。 由学生拟出答复意见。

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39 如何写好科技论文? 每年精读50篇原文,200篇摘要。 仔细体会,熟记一些惯用写法。 勤于思考,勤于实践。 开拓视野:他山之石,可以攻玉。

40 如何写好科技论文? 1 做好研究提纲 2 及时总结分析 个人操作经验 研究目标:为什么我要做这件工作,主要学术目标什么?
研究框架:需要研究什么?预期结果是什么?这些预期结果 能证明什么?出现负结果的原因是什么?说明什么?物质保证? 2 及时总结分析 及时整理实验数据:作成图表 及时分析实验数据:深度分析你的实验数据 及时记录你的分析:得到什么结论?说明什么?将你的分析记录到电脑 及时设计实验:在上述分析的基础上,围绕学术目标设计实验

41 厚积薄发 夯实基础 3 多看资料 多看本子专题的研究资料 多看课题的研究资料 多看你所研究的那株菌的资料:扩充你的视野
多看类似目标产物的研究资料 厚积薄发 夯实基础

42 结束语 一篇学术论文的产生,要经历学术思想的形成,实验,数据分析,论文写作,投稿,修改,校对,发表这样一个漫长的过程。往往从做实验到论文发表出来需要2年甚至更长的时间。唯其艰难,所以才有乐趣。 在研究生期间发表高水平的学术论文,并不仅仅是一种学术要求,更多的是一种自我挑战。若干年后,这种经历一定会成为你们记忆中宝贵的财富。

43 文献管理软件:Endnote简单介绍

44 你的苦恼 (1)一大堆文献?如何管理?毕业论文的绪论的写作,一两百篇如何插入进去? (2)文章成型后修改,增删参考文献,重新编号; (3)重复引用同一篇文章费时,费力且容易出错; (4)向国外投稿被拒,转投其他杂志,又需要重新更改文献格式 (如果遇到按文献出现顺序-按作者姓名排序的转变,那是非常悲惨的事情)

45 Endnote的优点

46 祝各位同仁顺利地写出和发表高水平论文, 顺利地获得学位! 谢谢!


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