基础医学院 识别多种癌型对顺铂耐药的分子标志 主讲人：黄海燕 指导老师：敖露
目 录目 录 CONTENTS 项目简介 立项依据 项目方案 项目进度与预期成果
1 项目简介 关键词：顺铂的作用 顺铂（ DDP ）是铂类药物家族中第一代抗肿瘤药物，也是主要的 一种抗癌药物。它属于细胞周期非特异性药物，通过抑制癌细胞的 DNA 复制过程，损伤其细胞膜上结构，产生抗癌作用。
1 项目简介 关键词：联合用药、敏感、耐药、筛选患者 在临床上，顺铂常和其他药物联合，用于治疗卵巢癌、肺癌、膀 胱癌等多种实体肿瘤。然而在采用以顺铂为基础的联合化疗中，有 的患者对方案耐药或无受益，说明在临床上缺乏使用特异地与顺铂 耐药相关的可靠的分子标志或耐药存在的差异性，因此，有必要寻 找不同癌型对顺铂耐药的分子标志来筛选患者，进一步分析不同癌 型对顺铂耐药的共同分子机制，让患者受益最大化。
2 立项依据 关键词：耐药患者的比例 临床上治疗晚期卵巢癌的一线化疗方案是以顺铂为基础 的联合化疗，但是约 30% 的患者对该化疗方案耐药。同样， 在 II 期非小细胞肺癌和晚期膀胱癌的的治疗中，约 4%-15% 和 30-40% 患者能够从以顺铂为基础的联合化疗方案受益， 其他患者则无益。
2 立项依据 关键词：国内外研究现状 已有的一些研究工作对顺铂的耐药进行分析，但是缺乏 能够在临床上使用并且特异地与顺铂耐药相关的可靠的分 子标志。
2 立项依据 关键词：研究内容 从多种癌型（卵巢癌、肺癌、膀胱癌等）的顺铂敏感性程度不同 的细胞系表达谱数据出发，通过分析得到与顺铂耐药相关的基因。 接着分析细胞系中得到的和顺铂耐药相关的分子特征与经过顺铂 化疗的临床患者的整体生存时间之间的关系，从中确立核心的耐药 基因。 最后，比较不同癌型中得到的和顺铂耐药相关的分子标志间的功 能关系。
2 立项依据 关键词：研究条件 团队条件：团队成员均为同一班级，彼此存在深厚的友谊。已学 习一定的专业知识，具备逻辑思维能力和数据操作能力。均勤奋上 进、踏实认真，对科研充满热情。 指导老师的研究条件：从事肿瘤预后分子标志识别的生物信息学 的方法研究，在系统生物学、生物信息学等方面的研究有一定的基 础，发表 SCI 论文 3 篇，可以为我们的课题提供关键性的指导。 ！！合照
3 项目方案 研究基础 技术路线图 拟解决问题特色与创新点
3 项目方案 关键词：研究基础 专业基础： 1 、 2014 年暑假参加本校生物信息学实验室为期四周（共 240 学时） 暑期培训班，团队成员对课题的研究有着更深一步的理解。 2 、本项目组成员已经掌握了经顺铂处理的多种肿瘤细胞系数据及 相应的临床化疗组织数据，可以充分地利用数据挖掘工具进行生物 信息学分析。
3 耐药 - 敏感细胞系 表达谱数据 细胞系耐药相关基因细胞系 GI50 或 IC50 值 耐药 - 敏感信息或生存信息 （含有对药物的 response 状 态、生存时间等） 组织 mRNA 表达谱 细胞系耐药基因 构建分类器 核心耐药基因 不同癌型间耐药基因的比较 独立数据验证 COX 相关性分析 训练 验证 分别分析卵巢癌、肺 癌、膀胱癌细胞系数据 将三种癌型的细胞系中 的结果分别对应到卵巢 癌、肺癌、膀胱癌组织 数据进行分析 技术路线图
3 项目方案 关键词：拟解决问题 敏感 - 耐药细胞系中和顺铂耐药相关的分子标志的识别；核心耐药 基因在临床组织（卵巢癌、肺癌、膀胱癌）中分类器的构建。
3 项目方案 关键词：特色与创新性 在构建分类器时，目前大多数研究都采用均值或中值的方法来给 定一个阈值对样本进行分类。但是这样的阈值在独立数据集中往往 工作效能低，并且对临床上单独的一个患者不具有分类意义。本项 目中采用基因对反转的规则来构建分类器，相比于依赖一个固定的 阈值，具有更加稳健的分类能力。
4 项目进度与预期成果 关键词：项目进度 2015 年 4 月～ 7 月：在先前学习准备的相关基础知识上，利用课余时间，收集更多相关的数据 8 月～ 9 月：掌握差异基因分析、相关性分析等方法、原理和技术 10 月～ 12 月：整理数据以及对数据的预处理 2016 年 1 月～ 5 月：分析细胞系数据，寻找敏感 - 耐药细胞系间的差异基因并从中筛选和组织生存 时间显著相关的核心耐药基因 6 月～ 7 月：从核心耐药基因中训练可靠的分类器，并使用独立数据验证 8 月～ 9 月：多种癌型各自获得的耐药基因的功能关系比较 10 月～ 12 月：撰写论文及总结报告材料，同时积极参加相关学术的交流活动，完成项目总结验 收汇报工作
4 项目进度与预期成果 关键词：预期成果 1 、本项创新性实验初步达到对学生独立进行科研调研、科研设 计、科研实践和实践创新的培养目的，提高本科学生自主创新实验 的能力以及实验动手操作能力。为今后继续深造打下坚实的基础。 2 、国家级核心刊物及以上发表相关研究论文 1-2 篇。 3 、参与的每个同学在项目结束时，能从项目的各个方面各写一 篇研究性报告。
基础医学院 请各位专家提出宝贵意见 谢谢！