第十二章 氨基酸、蛋白质、核酸 第一节 氨基酸 第二节 肽 第三节 蛋白质 第四节 核酸
第一节 氨 基 酸 一、氨基酸的结构、分类和命名 二、氨基酸的性质
一、氨基酸的结构、分类和命名 1、结构特点 均为α-氨基酸(除脯氨酸为亚氨基酸) 天然氨基酸大多属于L型 或
2、分类与命名 分类 命名 酸性氨基酸(NCOOH> NNH3) 碱性氨基酸(NCOOH< NNH3) 氨基酸
3、合成蛋白质的20种氨基酸 P315~317 表12-1~4 酸性氨基酸
碱性氨基酸
中性氨基酸(侧链非极性)
中性氨基酸(侧链极性) 天门冬氨酰胺
4、其它氨基酸 半胱氨酸 胱氨酸
二、氨基酸的性质 两性电离 成肽 脱羧 与亚硝酸的放氮反应 与茚三酮的显色反应 与2,4-二硝基氟苯的反应 与金属离子的螯合作用
注:α-氨基酸固态时就是以内盐形式存在,所以它们的熔点较高。 1、两性电离 Ka1 内盐 偶极离子 (两性离子) 注:α-氨基酸固态时就是以内盐形式存在,所以它们的熔点较高。
注:在水溶液中加入其它的酸或碱时,氨基酸的离解平衡发生移动,使三种离子浓度发生改变。 水溶液中的解离: Ka2 注:在水溶液中加入其它的酸或碱时,氨基酸的离解平衡发生移动,使三种离子浓度发生改变。
溶液pH与溶液中各类离子数量的关系 氨基酸阳离子 氨基酸偶极离子 氨基酸阴离子 纯水溶液 为主(>98%) 为主 pH<pKa1 氨基酸阳离子 氨基酸偶极离子 氨基酸阴离子 纯水溶液 为主(>98%) 为主 pH<pKa1 为主 pH> pKa1 Max(99.9%) =阴离子 =阳离子 pI pH=pKa1~pKa2 为主(≈98%)
溶液pH与溶液各类离子数量关系线段图
各类氨基酸的pI值范围 中性氨基酸:5.0~6.5 酸性氨基酸:2.7~3.2 碱性氨基酸:9.5~10.7
[思考题]为什么中性氨基酸的等电点不等于7?
处于等电点时的氨基酸溶液的特点: [阴离子]=[阳离子] [偶极离子]> 99.9% 氨基酸的溶解度最小,最易从溶液中析出
2、脱水生成肽 二肽 肽键(peptide bond)
不同的氨基酸A与B互相结合时,可按不同的排列方式结合。例: 三肽异构体:6(3!)种,其排列顺序为ABC ACB, BAC, BCA, CAB, CBA。 n肽异构体:n!种。
3、脱羧
4、与亚硝酸的放氮反应 凡是具有氨基的化合物都能与亚硝酸 作用产生氮气。 4、与亚硝酸的放氮反应 凡是具有氨基的化合物都能与亚硝酸 作用产生氮气。 用途:计算混合氨基酸的总含量或蛋白质分子中氨基的含量。
5、与茚三酮的显色反应 用途:鉴定和定量分析氨基酸、肽类和蛋白质。
6、与2,4-二硝基氟苯(桑格试剂)的反应 DNFB 氨基酸 DNP-氨基酸(黄) (桑格试剂) 用途:用于多肽、蛋白质的N-端氨基酸的测定(DNP法)及其氨基酸排列顺序的测定。
7、与金属离子的螯合作用 用途:用于氨基酸的鉴定和分析
第二节 肽 一、肽的分类和命名 二、肽的结构和功能
一、肽的分类和命名 分类: 寡肽或低聚肽(oligopeptide) 多肽(polypeptide)(十一肽以上) 命名:以含有C-端(羧基)的氨基酸为母体,将其余的氨基酸残基作为酰基,依次排列在母体名称之前。
谷胱甘肽 谷氨酸部分 半胱氨酸部分 甘氨酸部分 γ-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸
二、肽的结构和功能 有些肽链中的氨基酸残基之间以二硫键结合。 如氧化型谷胱甘肽 2GSH GS-SG 还原型谷胱甘肽 氧化型谷胱甘肽
C-端酰胺基 人类催产素 抗利尿素
第三节 蛋白质 一、蛋白质的元素组成 二、蛋白质的分类 三、蛋白质的结构 四、蛋白质的性质
主要组成元素:C、H、O、N四种 蛋白质的含氮量 :平均约为16% (每克氮相当于6.25克的蛋白质) 一、蛋白质的元素组成 主要组成元素:C、H、O、N四种 蛋白质的含氮量 :平均约为16% (每克氮相当于6.25克的蛋白质)
二、蛋白质的分类 按蛋白质化学组成的复杂程度分类: 简单蛋白质(由多肽组成 ) 结合蛋白质(由简单蛋白质与非蛋白 质部分--辅基结合而成) 根据蛋白质的性状分类: 纤维状蛋白质(结构蛋白质 ) 球状蛋白质(功能蛋白质 ) 清蛋白(溶于水) 球蛋白(不溶于水,溶于稀盐溶液)
三、蛋白质的结构 1、蛋白质分子内氨基酸残基间的 结合方式 2、蛋白质分子的四级结构 3、形成蛋白质1-4级结构的主要 价键
肽链之间或一条肽链的不同部位之间: 副键(疏水键、氢键、二硫键、盐键及酯键等 ) 1、蛋白质分子内氨基酸残基间的结合方式 肽链之内:肽键(主键) 肽链之间或一条肽链的不同部位之间: 副键(疏水键、氢键、二硫键、盐键及酯键等 )
氢键
盐键
酯键
疏水键
二级结构 主链原子的局部空间排列。即指主链上的α-螺旋、β-片层、β-转角和无规卷曲四种构象单元。 2、蛋白质分子的四级结构 一级结构 多肽链中氨基酸的排列次序 二级结构 主链原子的局部空间排列。即指主链上的α-螺旋、β-片层、β-转角和无规卷曲四种构象单元。 三级结构 侧链与主链上的构象单元按一定方式进一步卷曲,折叠成的更复杂的三度空间结构。 四级结构 几个亚基(具有三级结构的肽链)通过氢键、疏水键或静电引力缔合成一个蛋白质分子时,而具有的空间结构。 实物投影
二级结构 P332 图 12-3多肽链中的“酰胺平面”
3、形成各级结构的主要价键 一级结构 肽键 二级结构 氢键、二硫键 三级结构 盐键、氢键、二硫键及疏 水键等副键 一级结构 肽键 二级结构 氢键、二硫键 三级结构 盐键、氢键、二硫键及疏 水键等副键 四级结构 氢键、疏水键或静电引力
四、蛋白质的性质 1、蛋白质的两性离解及等电点 2、蛋白质的胶体性质及盐析 3、蛋白质的显色反应
1、两性电离及等电点
多数蛋白质的pI接近于5。 蛋白质阳离子 蛋白质偶极离子 蛋白质阴离子 纯水溶液 为主 [阳]>[阴] pH< pI [阴]>[阳] pH> pI Max =阴离子 =阳离子 pI 多数蛋白质的pI接近于5。
2、蛋白质的胶体性质及盐析 透析实验室中常选用不同孔径的半透膜(透析袋)来分离提纯蛋白质的方法。 超过滤在膜上增加压力,进行加压透析的方法。 维持蛋白质高分子溶液稳定的重要因素: 水化膜和同种电荷 沉淀蛋白质的方法: 盐析 (用量大、P不变性、分段盐析 ) 有机溶剂(P可变性) 重金属盐 (P可变性) 某些酸类 (P可变性)
3、蛋白质的显色反应 缩二脲反应 (肽、蛋白质—紫或紫红) 茚三酮反应 (氨基酸、肽、蛋白质—蓝紫) 2,4-二硝基氟苯反应(桑格试剂-DNFB) (氨基酸、肽、蛋白质的N-端氨基—黄) 蛋白黄反应(浓硝酸) (苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸—黄)
第四节 核酸 (nucleic acid) 一、分类 二、分子组成
核糖核酸(ribonucleic acid ,简称RNA) 一、分类 核酸 核糖核酸(ribonucleic acid ,简称RNA) 脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,简称DNA)
有机碱 嘌呤类碱 核苷 嘧啶类碱 戊糖(核糖或2-脱氧核糖 磷酸 二、分子组成 核酸(多核苷酸)单核苷酸 有机碱 嘌呤类碱 核苷 嘧啶类碱 戊糖(核糖或2-脱氧核糖 磷酸
表13-7核酸水解的最终产物 核酸 水解产物 RNA DNA 酸 磷酸 戊糖 核糖 脱氧核糖 有机碱 嘌呤碱 腺嘌呤、鸟嘌呤 嘧啶碱 胞嘧啶、尿嘧啶 胞嘧啶、胸腺嘧啶
腺苷 鸟苷 尿苷
鸟苷-3`-磷酸 (3`-GMP) 尿苷3`-磷酸 (3`-UMP) 腺苷-3`-磷酸 (3`-AMP)
高能磷酸键
ATGC- 核酸一级结构(DNA)
图12-13 DNA双螺旋结构(二级结构) P:磷酸基 S:脱氧核 A:腺嘌呤 T:胸腺嘧啶 G:鸟嘌呤 C:胞嘧啶
DNA中:A=T,G≡C RNA中:A=U,G≡C 图12-14 碱基对结构 DNA中:A=T,G≡C RNA中:A=U,G≡C
本章要求 掌握氨基酸的性质; 理解等电点的概念及蛋白质的四 级结构; 了解核酸的组成及一级结构。