中文生物医学文献数据库检索 北京大学医学图书馆 信息咨询部.

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中国生物医学文献服务系统 1 、概况:该系统由中国医学科学院医学信 息研究所 / 图书馆开发研制。其中的 CBM (中国生物医学文献数据库)收录 1978 年以 来 1800 余种中国生物医学期刊,以及汇编、 会议论文的文献题录。中国医学科普文献 数据库收录 2000 年以来国内出版的医学科普 期刊近百种。北京协和医学博硕学位论文.
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中文生物医学文献数据库检索 北京大学医学图书馆 信息咨询部

主要内容 中国生物医学文献服务系统(SinoMed)

(一)中国生物医学文献服务系统 系统概况 检索技巧和方法 检索结果的处理 个性化服务 检索实习

1. 系统概况 中国医学科学院医学信息研究所开发研制 内容覆盖: 中国生物医学文献数据库(CBM) 西文生物医学文献数据库(WBM) 日文生物医学文献数据库 俄文生物医学文献数据库 英文文集汇编文摘数据库 英文会议文摘数据库 北京协和医学院博硕学位论文数据库 中国医学科普文献数据库

1. 系统概况 中国生物医学文献数据库(CBM) 收录1978年至今1800余种中国生物医学期刊以及汇编、会议论文的文献题录820余万篇(持续更新中),新增1989年以来中文参考文献410余万篇(持续更新中),全部题录均进行主题标引、分类标引,同时对作者机构、发表期刊、所涉基金等进行规范化加工处理,支持在线引文检索,辅助用户开展引证分析、机构分析等学术分析。

2. 检索技巧和方法 跨库检索 快速检索 高级检索 主题检索 分类检索 期刊检索 作者检索 机构检索 基金检索 引文检索

2.1 跨库检索 进入SinoMed,首先呈现在您面前的即是跨库检索。跨库检索能同时在SinoMed平台集成的一个或多个数据库进行检索。

跨库检索

跨库检索 如在“中国生物医学文献数据库”和“西文生物医学文献数据库”中查找标题包括“aids”的文献,您只需进行两步操作: 第一步:在跨库检索的高级检索页面,勾选数据库。 第二步:在“构建表达式”中选择“标题”,输入“aids”,点击“发送到检索框”后再执行“检索“操作,即可查找到所需文献。

注意:如要检索CBM,请在sinomed首页面点击CBM进入单库进行检索

2.2 快速检索 快速检索是在数据库的全部字段内执行检索,且集成了智能检索功能,让您的检索过程更简单,检索结果更全面。 输入多个检索词时,词间用空格分隔,默认为“AND”逻辑组配关系。

2.2 快速检索 美托洛尔治疗高血压的文献 关键词 美托洛尔 高血压 ("美托洛尔"[全字段] OR "H93-26"[全字段] OR "美托洛尔"[主题词]) AND ("高血压"[全字段] OR "高血压"[主题词])

智能检索 如:如输入“艾滋病”,系统将用“艾滋病”、“获得性免疫缺陷综合征”等表达同一概念的一组词在全部字段中进行智能检索。 智能检索基于自由词-主题词转换表,能将输入的检索词转换成表达同一概念的一组词的一种检索方式,即自动实现检索词、检索词对应主题词及该主题词所含下位词的同步检索。智能检索不支持逻辑组配检索。

2.1 快速检索 逻辑组配检索 : 通配符检索 短语检索 二次检索 智能检索 “AND”(逻辑与)、“OR”(逻辑或)、“NOT”(逻辑非) 单字通配符(?):? 替代一个字符 ,如“血?动力 ” 任意通配符(%): %替代任意个字符 ,如“肝炎%疫苗” 短语检索 检索词中含有“-”、“(”、“,”等特殊符号时 半角双引号 (” ”) 二次检索 在已有检索结果的基础上再检索,逐步缩小检索范围 智能检索 CBM 自动实现检索词、检索词对应主题词及该主题词所含下位词的同步检索

通配符检索 输入“血?动力” 输入“肝炎%疫苗”

短语检索 输入"1,25-(OH)2D3"

二次检索练习 非洛地平联合美托洛尔治疗高血压 关键词 非洛地平 美托洛尔 高血压

快速检索练习 北京大学第三医院发表的文章 (北京%大学%第三%医院) and (100083 or 100191)

2.3 高级检索 高级检索支持多个检索入口、多个检索词之间的逻辑组配检索,方便用户构建复杂检索表达式。

2.3 高级检索 构建表达式:每次只允许输入一个检索词,同一检索表达式里不支持逻辑运算符检索。 常用字段:由中文标题、摘要、关键词、主题词四个检索项组成。 智能检索:实现检索词及其同义词(含主题词)的扩展检索。 精确检索:检索结果与检索词完全匹配的一种检索方式,适用于关键词、主题词、作者、分类号、刊名等字段。 限定检索:可以对文献的年代、文献类型、年龄组、性别、研究对象等特征进行限定。 检索历史:最多能保存200条检索表达式,可实现一个或多个历史检索表达式的逻辑组配检索。

高级检索举例 1992-2005年发表的有关成年人艾滋病合并肺炎的文献

限定检索练习 2001-2010年发表的关于美托洛尔治疗高血压的综述文献 限定条件 2000-2010年 综述 关键词 美托洛尔 高血压

2.4 主题检索 主题检索是基于文献内容的主题概念进行检索,有利于提高查全率和查准率。 主题检索的依据 : 《医学主题词表(MeSH)》中译本 《中国中医药学主题词表》

关键词(自由词) 主题词 艾滋病 AIDS 爱滋病 获得性免疫缺陷综合征

规范化处理之前 标题:艾滋病并发结核致免疫重建炎性综合征的临床及影像表现 著者:袁春旺; 赵大伟; 梁连春; 李在村; 陈枫; 段勇; 王微 著者:袁春旺; 赵大伟; 梁连春; 李在村; 陈枫; 段勇; 王微 著者单位:首都医科大学附属北京佑安医院放射科, 100069 文摘:目的:探讨艾滋病(AIDS)并发结核患者在高效抗逆转录病毒治疗(HAART)中发生免疫重建炎性综合征(IRIS)的临床特征及影像表现。方法:回顾分析4例AIDS并发结核患者在HAART中发生IRIS的临床及影像资料。结果:以上临床及影像表现均具有临时性及白限性特征,随着抗结核及HAART联合治疗的继续,病情均出现好转。结论:AIDS并发结核患者在HAART中均有可能发生IRIS,影像检查对IRIS的早期诊断、病情监测、疗效评价及治疗具有重要的作用。 出处:中华放射学杂志 2008; 42(2) : 149-151

利用《中国图书馆分类法 · 医学专业分类表》 规范化处理之后 分类号: R442.8; R512.91; R52; *R734.2 标题:艾滋病并发结核致免疫重建炎性综合征的临床及影像表现 著者:袁春旺; 赵大伟; 梁连春; 李在村; 陈枫; 段勇; 王微 著者单位:首都医科大学附属北京佑安医院放射科, 100069 文摘:目的:探讨艾滋病(AIDS)并发结核患者在高效抗逆转录病毒治疗(HAART)中发生免疫重建炎性综合征(IRIS)的临床特征及影像表现。方法:回顾分析4例AIDS并发结核患者在HAART中发生IRIS的临床及影像资料。结果:以上临床及影像表现均具有临时性及白限性特征,随着抗结核及HAART联合治疗的继续,病情均出现好转。结论:AIDS并发结核患者在HAART中均有可能发生IRIS,影像检查对IRIS的早期诊断、病情监测、疗效评价及治疗具有重要的作用。 出处:中华放射学杂志 2008; 42(2) : 149-151 主题词:结核/并发症; 结核/*放射摄影术; 获得性免疫缺陷综合征/并发症; 获得性免疫缺陷综合征/*放射摄影术; 综合征; 回顾性研究; 炎症/病因学; 炎症/*放射摄影术 利用主题词表

主题词 : 结核/并发症; 结核/*放射摄影术; 获得性免疫缺陷综合征/并发症; 获得性免疫缺陷综合征/*放射摄影术; 综合征; 回顾性研究; 炎症/病因学; 炎症/*放射摄影术

2.2 主题检索 主题词/副主题词组配检索 主题词:自然语言的规范化用语 副主题词:用于对主题词的某一特定方面加以限定 如主题词“获得性免疫缺陷综合征”涵盖了“艾滋病”、“AIDS”、“爱滋病”等词语。 副主题词:用于对主题词的某一特定方面加以限定 如:治疗、诊断、药物作用等 如:“肝/药物作用”表明文章讨论药物对肝脏的影响

2.2 主题检索 主题词加权检索 仅对加星号(*)主题词(主要概念主题词)检索 非加权检索表示对加星号和非加星号主题词(非主要概念主题词)均进行检索

若使用“高血压,肾血管性/治疗”的加权检索就检索不到哪篇文献? 标题: RNA干扰血管紧张素受体对肾血管性高血压大鼠血压及心肌肥厚的影响 主题词: *RNA干扰; 高血压, 肾血管性/*病理生理学; 高血压, 肾血管性/遗传学; 高血压, 肾血管性/治疗; 心脏扩大/*病理生理学; 血压/*生理学; 血压/遗传学 A文献 标题:肾动脉直接支架置入治疗肾血管性高血压5例 主题词:高血压, 肾血管性/*治疗; 可行性研究; 气囊扩张术; *肾动脉; *支架 B文献 若使用“高血压,肾血管性/治疗”的加权检索就检索不到哪篇文献? A文献

2.4 主题检索 扩展检索 主题词扩展检索:对当前主题词及其下位主题词进行检索 副主题词扩展检索:对当前副主题词及其下位副主题词进行检索

2.4 主题检索 例1. 在《中国生物医学文献数据库(CBM)》中利用主题途径检索有关“骨关节结核治疗”的文献。

选择恰当的主题词“结核, 骨关节”后,点击进入该主题词的注释信息显示界面

加权检索:仅对加星号(*)主题词(主要概念主题词)检索 扩展检索:对当前主题词及其下位主题词进行检索 副主题词选择窗 副主题词扩展检索:对当前副主题词及其下位副主题词进行检索 主题词树状结构 本例“结核,骨关节”有下位词“结核,脊柱”

选择“加权检索”、“扩展检索”,添加组配相应的副主题词“治疗”后,点击“主题检索”按钮进行文献检索。

主题检索练习 检索有关肾血管性高血压的诊断的文献 肾血管性高血压 诊断

主题检索练习 检索有关长春新碱治疗白血病的文献 长春新碱 白血病

2.5 分类检索 通过分类导航逐级展开来实现 在类名、类号输入框输入学科类名或类号 分类号扩展检索 :对该类号及其下位类号进行查找 复分组配检索 :对于可复分的类号,选择复分组配检索(可选择多个复分号)

2.5 分类检索 例3. 查找关于“婴幼儿麻疹病因”方面的文献

分类检索界面,选择“类名”检索字段并输入检索词“麻疹”

类名列表中选择准确类名“小儿麻疹”

选择复分组配检索(可选择多个复分号);最后点击“分类检索”按钮

2.5 期刊检索 目标期刊定位: 期刊文献查找: 可通过检索入口处选择刊名、出版地、出版单位、期刊主题词或者ISSN直接查找期刊; 也可通过“期刊分类导航”或“首字母导航”逐级查找浏览期刊; 期刊文献查找: 可以直接指定年、卷期进行浏览; 也可以输入欲检索的内容后在指定的年卷期中查找浏览具体文献。

2.5 期刊检索 例4. 通过《中华医院管理杂志》了解农村医疗机构管理方面的研究进展情况。

2.6 作者检索 高级检索 作者机构限定检索 与高级检索相比,作者机构限定检索支持作者精确定位,能够比较有效地解决“同名著者”、“同构异名”问题,提高查准率与查全率。

2.6 作者检索 例5. 在《中国生物医学文献数据库(CBM)》中查找“中国医学科学院基础医学研究所沈岩教授”以第一著者身份发表的论文情况。 高级检索 作者机构限定检索法

(1)高级检索 “高级检索”界面,选择“第一作者”检索入口,输入“沈岩”,点击“发送到检索框” 2. 选择“作者单位”检索入口,输入“中国医学科学院基础医学研究所”,点击“发送到检索框”

(2)作者机构限定检索法

作者列表中选择作者“沈岩”,并点击“下一步”按钮 (2)作者机构限定检索法 作者列表中选择作者“沈岩”,并点击“下一步”按钮

作者机构列表中选择该作者所在机构,然后点击“完成”按钮。 (2)作者机构限定检索法 作者机构列表中选择该作者所在机构,然后点击“完成”按钮。

2.7 机构检索 机构检索是CBM新增的功能,可以了解指定机构及作为第一机构时论文发表情况和被引用情况。 查找“山西省儿童医院”发表的文献

2.8 基金检索 基金检索是CBM新增的另一项功能,可帮助用户查找特定基金项目成果发表情况。 查找“长江学者奖励计划”发表的文献

2.9 引文检索 引文检索是CBM新增的一项重要功能。支持从被引文献题名、主题、作者/第一作者、出处、机构/第一机构、资助基金等途径查找引文,帮助您了解感兴趣文献在生物医学领域的引用情况。

3. 检索结果的处理 检索结果聚类 检索结果显示、打印和保存 从不同角度(主题、学科、期刊、作者、时间、地区)对检索出来的文献进行聚类处理 结果显示格式:“题录格式”“文摘格式”、 结果输出方式: 打印、保存、E-mail 、写作助手 排序方式:“年代”、“作者”、“期刊”、“相关度” 全文获取 : CBM数据库与维普科技期刊全文数据库链接

4 个性化服务 “个人用户” 直接使用系统注册时所用的用户名和密码即可登录“我的空间”;但“集团用户”下的子用户则需要单独注册后才可登录使用 定题检索 在开展某项课题研究时,需要及时跟踪国内外在该领域的研究进展,把握最新研究动态和成果 创建个人数据库来保存感兴趣的检索结果 可以对感兴趣的文献进行保存、管理与再利用。

5. 检索实习 例1:腹痛的并发症 检索课题中包含两个主要概念:腹痛、并发症 采用主题词途径和基本途径相结合方法进行检索。

第一步,输入相应的中文主题词 “腹痛”为了不遗漏文献,主题检索有关设置为:主题词扩展、不加权 ,组配相应的副主题词“并发症”, 并设置为“扩展副主题词” ; 第二步,在缺省字段中输入(腹痛 OR 腹疼)AND 并发症进行基本检索; 第三步,点击“检索历史”,根据尽量不遗漏文献的需要, 在检索框中输入 #1 OR #2 或者点选相应检索式前的方框,再点击“OR”按钮,进行检索。

例1:腹痛的并发症 检索策略: #1 主题词=="腹痛/CO/全部树" #2 (腹痛 OR 腹疼)AND 并发症 #3 #1 OR #2

习题 1. 检索有关“新生儿窒息的诊断”的综述文献 2. 检索“北京大学的王宪2002年发表的有关动脉粥样硬化”的文献 3. 检索“女贞子治疗老年便秘”的文献

(二)中文生物医学期刊文献数据库 CMCC简介 检索方法与技巧 检索结果的显示 CBM与CMCC的比较

1.CMCC简介 是由解放军医学图书馆数据库研究部开发的中文生物医学文献目录型数据库。 收录范围:基础医学,临床医学,预防医学,医学生物学,中医药学,药学,医院管理,医学信息学等卫生相关信息。 CMCC新,更新速度快,收录期刊全(1400余种),可弥补CBM时滞长的缺点,特别有利于课题的查新和追踪检索。 CMCC由1994年正式出版,半月一期,按年度存放文献数据。

CMCC有三个版本: 2007年以前的数据 单独的CMCC 与CMCI集成在一起 与CMAC集成在一起 最新的数据

单独的CMCC系统

检索界面

2. 检索方法与技巧 基本检索 高级检索 引文检索

2.1 基本检索

2.1 基本检索

2.1 基本检索

检索示例 检索胡大一以第一作者身份发表的文献 检索北京大学第三医院发表的文献 北京*第三*医院

2.2.高级检索

高级检索示例:禽流感的流行病学

3.检索结果的处理

4. CBM与CMCC的比较 一般中文生物医学文献课题的检索过程 课题的主题分析和策略制定——检索CBMdisc数据库(课题的回溯检索,了解课题的主要文献)——结合现刊和网检文献的阅读,每半月检索一次CMCC(掌握最新文献信息,定题跟踪检索)——课题修正——循环检索——课题完成

4.1 CBM的特点 主题检索功能强:CBM是受控的检索数据库,具有主题检索功能。它既可对单个主题词加权检索,也可扩展检索,还可以选择副主题词进行方面组配,对查全率和查准率都有一定保证。 CBM,界面友好,方便操作,检索途径多,还可以进行分类途径检索,还可以进行年限的限制。

4.1 CBM的特点 收录1978年以来的文献题录 ,可进行课题的回溯检索。

4.2 CMCC的特点 新、快、全。更新快,半月一期。与印刷版比较,平均时滞为3个月,很好地补充了CBM的时间差。收录生物医学期刊1400余种,几乎囊括了(90%以上)生物医学正式出版的期刊。 采用关键词标引,非受控数据库,没有主题词和分类检索途径,查全率和查准率难以保证。