第十七章 基因重组与基因工程 (genetic recombination and genetic engineer)

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第四节 RNA 的空间结构与功能. RNA 的种类和功能 核糖体 RNA ( rRNA ):核蛋白体组成成分 转移 RNA ( tRNA ):转运氨基酸 信使 RNA ( mRNA ):蛋白质合成模板 不均一核 RNA ( hnRNA ):成熟 mRNA 的前体 小核 RNA ( snRNA ):
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植物生理 植物细胞生理基础 同工酶. 学习目标 Click to add title in here Click to add title n here  掌握同工酶的概念。  了解同工酶的意义。
分子生物学部分开发实验 植物遗传亲缘关系研究.
第十章 重组DNA技术 DNA Recombination Technique
1.1 DNA重组技术的基本工具.
重组DNA技术和基因工程Recombinant DNA technology and Genetic Engineering
1.2 基因工程的基本操作程序 善假于物也.
现代生物技术试验四 绿色荧光蛋白工程菌株的构建与表达调控 黄绍松
考点 32 基因工程.
第二十二章 基因诊断与基因治疗.
第三章 基因工程载体 第一节 克隆载体 第二节 表达载体 第三节 特殊用途载体.
Molecular biology for ecologists
1.2基因工程的基本操作程序.
第十二章 分子生物学常用技术 及其应用.
第六章 第二节 基因工程及其应用.
蛋白质工程的崛起.
2012届高考生物二轮专题复习课件:现代生物科技专题
选修部分  选修3 现代生物科技专题.
基因工程简介.
第十七章 基因重组与基因工程 (genetic recombination and genetic engineering)
Recombinant DNA Technology
第一章 工具酶.
生命的物质基础.
细胞核是遗传信息库.
C 1.关于生物体内的遗传物质 下列说法正确的是( ) A.细菌的遗传物质主要是DNA B.病毒的遗传物质主要是RNA
问 题 探 讨 1.DNA的中文全名是什么? 2.为什么DNA能够进行亲子鉴定? 3.你还能说出DNA鉴定技术在其他方面的应用吗?
重组DNA技术 及人类基因组研究.
遗传与基因工程.
教学目标 1. 掌握基因的含义,以及基因、DNA、染色体之间的关系 2. 理解基因控制蛋白质合成(转录、翻译的含义、过程)
第4章 基因的表达 第1节 基因指导蛋白质的合成.
基因的表达 凌通课件.
B 5. 下列叙述符合基因工程概念的是 A.B淋巴细胞与肿瘤细胞融合,杂交瘤细胞中含有B淋巴细胞中的抗体基因
1、环境中直接影响生物生活的各种因素叫做 。它可以分为 和 两类 。
基因组文库(genomic library)
基因重组和基因工程 Genetic Recombination and Genetic Engineering
基因重组和基因工程 Genetic Recombination and Genetic Engineering
第十四章 基因重组与基因工程.
第二章 分子克隆载体 2001年10月17日.
Recombinant DNA Technology
第三节 重组子的筛选与鉴定      一、 遗传学检测法      二、 物理检测法 三、 核酸分子杂交检测法      四、免疫化学检测法      五、 核酸序列分析及其他方法.
基 因 工 程 四川大学 李永红.
基因重组和基因工程 Genetic recombination and Genetic Engineering
DNA Recombination and Recombinant DNA technology
王梁华 生物化学与分子生物学教研室 第二军医大学基础部
骨质疏松症的遗传学研究(part 2) Hong-Wen Deng, Ph.D. Osteoporosis Research Center
基因工程 Gene Engineering 授课课时: 32学时, 考试方式: 笔试 上课地点: S1406(3-19周 第3周开始)
基 因 工 程 (一轮复习) 佛山市第一中学 黄广慧.
基因重组和基因工程 Genetic Recombination and Genetic Engineering
第一节、重组DNA技术-基因工程 第二节、分子杂交及相关技术 第三节、聚合酶链反应的原理和应用 第四节、基因定位的常用方法
第六章 DNA重组的操作 第一节 DNA的体外重组 第二节 重组体导入受体细胞的原理与技术 第三节 重组子的筛选和鉴定.
病原学- 乙型肝炎病毒(HBV) 双股DNA病毒 三种病毒颗粒 小球型和管型颗粒,直径22nm, 由HBsAg组成
胚胎原位杂交检测基因的时空表达模式.
第八章 DNA文库的构建和 目的基因的筛选 §1 基因组DNA文库的构建 §2 cDNA文库的构建 §3 基因克隆的筛选策略.
第四节 基因差异表达获得目的基因 差异显示PCR(DDRT-PCR) DDRT-PCR:基于PCR的mRNA差异显示技术
第二节 免疫球蛋白的类型 双重特性: 抗体活性 免疫原性(抗原物质).
专项考能集训(四)  碱基含量及DNA复制有关的计算.
Genetic Recombination and Genetic Engineering
第二节 DNA分子的结构.
超越自然还是带来毁灭 “人造生命”令全世界不安
第三节 特殊用途的载体.
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有关“ATP结构” 的会考复习.
第19章 药物研究的生物化学基础 主讲教师:卢涛.
H基因库(重链基因连锁群): --- 第14号染色体 κ基因库(κ链基因连锁群): --- 第2号染色体 λ基因库(λ链基因连锁群):
基因信息的传递.
第三节 转录后修饰.
细胞分裂 有丝分裂.
第十一章 RNA的生物合成 (转录).
五.有丝分裂分离和重组 (一) 有丝分裂重组(mitotic recombination) 1936 Curt Stern 发现
讨论:利用已经灭绝的生物DNA分子,真的能够使灭绝的生物复活吗?
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第十七章 基因重组与基因工程 (genetic recombination and genetic engineer) 基因工程(genetic engineering)和遗传工程的英语中是同一个词汇。从字面上看,遗传工程就是按人们的意思去改造生物的遗传特性、或创建具有新遗传物性的生物。遗传是由基因决定的,改建生物的遗传性,就是改建生物的基因,因此狭义的遗传工程就是基因工程。 对多数生物来说,基因本质是DNA,基因工程就是要改建DNA,涉及DNA序列的重新组合和建造,所以基因工程的核心就是人工的DNA重组(DNA recombination)。 重组、建造的DNA分子只有纯化繁殖才有意义。纯的无性繁殖系统称为克隆。纯化繁殖DNA就称为DNA克隆或分子克隆,基因的纯化繁殖就称为基因克隆。所以DNA重组和分子克隆是与基因工程密切不可分的,是基因工程技术的核心和主要组成部分。重组DNA、分子克隆甚至成了基因工程的代名词。 只有当人类对遗传现象本质和规律有深入的认识,才能按人类的意志去改造或创建生物的遗传特性。20世纪50-60年代分子遗传学的迅速发展,确定了主要遗传物质DNA的双螺旋结构、阐明了遗传信息传递的中心法则、破译了遗传密码,为基因工程奠定了理论基础;同时酶学、细菌学、病毒学的发展,为基因工程提供了必要的工具。1972-1973年Boyer、Cohn和Berg等创立了DNA克隆技术,打破了种属的界限,第一次使本来只存在于真核细胞中的蛋白质能够在大肠杆菌中合成,这是基因工程诞生的里程碑。科学界公认基因工程的出现是20世纪最重要的科学成就这一。标志人类主动改造生物界的能力进入新的阶段。分子生物学的成就是DNA重组技术和基因工程出现和发展的基础,而DNA重组技术和基因工程的发展又有力地推动着分子生物学的进步。 基因工程属于生物技术范畴,生物技术(biotechnology)不是一个独立的学科而是一套技术或手段。广义的生物技术指任何利用活的生物体或其一部分生产产品或改良生物品质的技术;狭义的生物技术是专指以DNA重组技术和单克隆技术为标志发展起来的新技术。如无特别说明,通常生物技术一词就专指新的生物技术而言。一般认为这新的生物技术包括基因工程、细胞工程、酶工程和发酵工程几方面的内容。基因工程是生物技术的核心和关键,是主导技术;细胞技术是生物技术的基础;酶工程是生物技术的条件;发酵工程是生物技术获得最终产品的手段,四个方面相互联系的。生物技术是一个综合技术体系,其中基因工程和细胞融合技术最为突出。蛋白质工程(protein engineering)则是在基因工程基础上综合蛋白质化学、蛋白质晶体学、计算机学辅助设计等知识和技术发展起来的研究新领域,开创了按人类意愿设计和研制人类需要的蛋白质的新时期,被称为第二代基因工程。

基因重组(genetic recombination) 是指在体外用酶学方法将不同来源的DNA进行切割、连接,组成一个新的DNA分子的过程,又称DNA重组。 基因克隆(gene cloning) 将重组DNA分子导入到合适的受体细胞中,使其扩增和繁殖,以获得大量的同一DNA分子,称此为基因克隆、DNA克隆或分子克隆。 基因工程(genetic engineering) 是将不同来源的DNA片段与载体分子连接形成重组DNA分子,再导入宿主细胞内进行表达,也称重组DNA技术。 基因工程(genetic engineering)和遗传工程的英语中是同一个词汇。从字面上看,遗传工程就是按人们的意思去改造生物的遗传特性、或创建具有新遗传物性的生物。遗传是由基因决定的,改建生物的遗传性,就是改建生物的基因,因此狭义的遗传工程就是基因工程。 对多数生物来说,基因本质是DNA,基因工程就是要改建DNA,涉及DNA序列的重新组合和建造,所以基因工程的核心就是人工的DNA重组(DNA recombination)。 重组、建造的DNA分子只有纯化繁殖才有意义。纯的无性繁殖系统称为克隆。纯化繁殖DNA就称为DNA克隆或分子克隆,基因的纯化繁殖就称为基因克隆。所以DNA重组和分子克隆是与基因工程密切不可分的,是基因工程技术的核心和主要组成部分。重组DNA、分子克隆甚至成了基因工程的代名词。 只有当人类对遗传现象本质和规律有深入的认识,才能按人类的意志去改造或创建生物的遗传特性。20世纪50-60年代分子遗传学的迅速发展,确定了主要遗传物质DNA的双螺旋结构、阐明了遗传信息传递的中心法则、破译了遗传密码,为基因工程奠定了理论基础;同时酶学、细菌学、病毒学的发展,为基因工程提供了必要的工具。1972-1973年Boyer、Cohn和Berg等创立了DNA克隆技术,打破了种属的界限,第一次使本来只存在于真核细胞中的蛋白质能够在大肠杆菌中合成,这是基因工程诞生的里程碑。科学界公认基因工程的出现是20世纪最重要的科学成就这一。标志人类主动改造生物界的能力进入新的阶段。分子生物学的成就是DNA重组技术和基因工程出现和发展的基础,而DNA重组技术和基因工程的发展又有力地推动着分子生物学的进步。 基因工程属于生物技术范畴,生物技术(biotechnology)不是一个独立的学科而是一套技术或手段。广义的生物技术指任何利用活的生物体或其一部分生产产品或改良生物品质的技术;狭义的生物技术是专指以DNA重组技术和单克隆技术为标志发展起来的新技术。如无特别说明,通常生物技术一词就专指新的生物技术而言。一般认为这新的生物技术包括基因工程、细胞工程、酶工程和发酵工程几方面的内容。基因工程是生物技术的核心和关键,是主导技术;细胞技术是生物技术的基础;酶工程是生物技术的条件;发酵工程是生物技术获得最终产品的手段,四个方面相互联系的。生物技术是一个综合技术体系,其中基因工程和细胞融合技术最为突出。蛋白质工程(protein engineering)则是在基因工程基础上综合蛋白质化学、蛋白质晶体学、计算机学辅助设计等知识和技术发展起来的研究新领域,开创了按人类意愿设计和研制人类需要的蛋白质的新时期,被称为第二代基因工程。

本章主要内容 重要的工具酶 基因克隆常用的载体 重组DNA基本原理 重组技术在医学和制药 工业中的应用

第一节 重要的工具酶 工具酶 基因工程中的工具酶主要包括用于DNA和RNA分子的切割、连接、聚合、逆转录等相关的各种酶类。

一、限制性核酸内切酶(restriction endonuclease, RE) 是一类由细菌产生的能专一识别和切割双链DNA中的特定碱基序列的核酸内切酶,简称限制酶或切割酶。 根据限制酶作用特性,一般分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ型, 其中常用的是Ⅱ型限制酶。

特异识别及切割48个bp长度且具有回文序列的DNA片断,主要产生3种末端结构: 5ˊ-粘性末端 限制酶(Ⅱ型)识别及切割位点 特异识别及切割48个bp长度且具有回文序列的DNA片断,主要产生3种末端结构: 5ˊ-粘性末端 3ˊ-粘性末端 平端或钝端 回文序列(palindrome) 是指该部位的核苷酸序列呈180O反向重复; 粘性末端(sticky end) 是指经内切酶特异切割后产生的5ˊ-末端突出和3ˊ-末端突出的碱基序列相互间具有互补性。 第一节 工具酶 DNA重组技术中对核酸的“精雕细刻”主要用酶作为工具。分子生物学研究过程中发现的酶,许多都用作工具,表20-列出最常用的几种工具酶。限制性核酸内切酶(restriction endonuclease)在重组DNA技术中有重要地位,在此较详细介绍。 一、限制性核酸内切酶的概念 核酸酶可分为两类:核酸外切酶(exonuclease)是从核酸的一端开始,一个接一个把核苷酸水解下来;核酸内切酶(endonuclease)则从核酸链中间水解3’,5’磷酸二酯键,将核酸链切断。很多细菌和细胞中都能识别外来的核酸并将其分解,1962年发现这是因为细菌中含有特异的核酸内切酶,能识别特定的核酸序列而将核酸切断;同时又伴随有特定的核酸修饰酶,最常见的是甲基化酶,能使细胞自身核酸特定的序列上碱基甲基化,从而避免受内切酶水解,外来核酸没有这种特异的甲基化修饰,就会被细胞的核酸酶所水解.这样细胞就构成了限制一修饰体系,其功能就是保护自身的DNA,分解外来的DNA,以保护和维持自身遗传信息的稳定,这对细菌的生存和繁衍具有重要意义。这就是限制性核酸内切酶名称中“限制”二字概念的由来。 二、限制性核酸内切酶的命名 按酶的来源的属、种名而定,取属名的第一个字母与种名的头两个字母组成的三个斜体字母作略语表示;如有株名,再加上一个字母,其后再按发现的先后写上罗马数字。例如:从流感嗜血杆菌d株(Haemophilus influenzae d)中先后分离到3种限制酶,则分别命名为HindⅠ、HindⅡ和HindⅢ。 三、限制性核酸内切酶的分类 按限制酶的组成、与修饰酶活性关系,切断核酸的情况不同,分为三类: Ⅰ类限制性核酸内切酶  由3种不同亚基构成,兼具有修饰酶活性和依赖于ATP的限制性内切酶活性,它能识别和结合于特定的DNA序列位点,去随机切断在识别位点以外的DNA序列,通常在识别位点周围400-700bp。这类酶的作用需要Mg2+,S腺苷甲硫氨酸及ATP。 Ⅱ类限制性核酸内切酶  与Ⅰ类酶相似,是多亚蛋白质,既有内切酶活性,又有修饰酶活性,切断位点在识别序列周围25-30bp范围内,酶促反应除Mg2+外,也需要ATP供给能量。 Ⅲ类限制性核酸内切酶 只由一条肽链构成,仅需Mg2+,切割DNA特异性最强,且就在识别位点范围内切断DNA。是分子生物学中应用最广的限制性内切酶。通常在重组DNA技术提到的限制性核酸内切酶主要指Ⅱ类酶而言。

⑴ 产生5'-粘性末端 ⑵ 产生3'-粘性末端

⑶ 产生平(头末)端/钝端 同裂酶(异源同工酶) 同尾酶 可变酶 其它特殊性质 的Ⅱ型限制酶

同裂酶 在切割DNA时,其切割点可以是相同的,产生平头末端,称为同识同切; 切割点也可以是不同的,产生3ˊ或5ˊ粘性末端,称为同识异切。 又称异源同工酶。指来源不同,但具有相同的识别序列。 在切割DNA时,其切割点可以是相同的,产生平头末端,称为同识同切; 切割点也可以是不同的,产生3ˊ或5ˊ粘性末端,称为同识异切。

同裂酶——同识同切

同裂酶——同识异切

同 尾 酶 同尾酶 指来源不同,但识别与切割顺序有一定的相关性的一类酶。它们作用后产生相同的粘性末端。

可变酶 可变酶 识别顺序中的一个或几个碱基是可变的, 并且识别顺序往往超过6个碱基对。 如, BstpⅠ,其识别顺序为GGTNACC。

常用限制性核酸内切酶的特性 微生物名称 酶名称 识别顺序 同裂酶 同尾酶 Bacillus amyloliquefaciens H 解淀粉芽孢杆菌 BamHⅠ GGATCC BstⅠ Bgl Ⅱ MboⅠ Bacillius globigil 球芽孢杆菌 Bgl Ⅱ ACATCT Escherichia coli RY13 大肠杆菌 EcoRⅠ GAATTC Haemophilus influenzae 流感嗜血菌 Hind Ⅲ AAGCTT HsuⅠ Providencia stuartii 164 普罗威登细菌 PstⅠ CTGCAG SalpⅠ Streptomyces albus Subspecies pathocidicus 白色链球菌 SalⅠ GTCGAC AvaⅠ XhoⅠ

限制性内切酶的应用 通过切割不同来源DNA双链的特异碱基序列,产生含有黏性末端或平端的、长度不同的DNA片段。 用于DNA重组、制备探针、分子杂交、DNA序列分析等。

二、DNA聚合酶 (最常用的DNA聚合酶有以下4种) DNA聚合酶Ⅰ(全酶) DNA聚合酶Ⅰ大片段——Klenow片段 Taq DNA聚合酶 T4 噬菌体DNA聚合酶

㈠ DNA聚合酶Ⅰ E.Coli DNA聚合酶Ⅰ(DNA pol Ⅰ) 是一个具有 3 种酶活性的多功能性酶。 包括: 5ˊ→3ˊ核酸外切酶活性 3ˊ→5ˊ核酸外切酶活性

DNA pol Ⅰ应用 ⑴ 常用来催化DNA缺口平移反应,制备高比活性DNA 探针; ⑵ cDNA第二条链的合成;

E. coli DNA pol. Ⅰ催化缺口平移 Mg 5' 3' 3' 5' dATP,dCTP,dGTP [- P] dTTP * T 2+ D N a s e I 5' 3' 3' 5' dATP,dCTP,dGTP [- 32 P] dTTP E. coli DNA POL I

㈡ Klenow片段(DNA pol.大片断)

Klenow片段用途 ⑴ 补齐双链DNA的 3ˊ末端; ⑵ 用标记碱基补 齐3ˊ末端 ; ⑶ 用于cDNA克隆中第二股链的合成;

㈢ Taq DNA pol(耐热DNA聚合酶) 作用特点 1) Taq DNA pol催化DNA合成的最适温度范围 70  75℃, 2) 95℃以上高温,半小时不失活, 3) 最适合用于聚合酶链反应(PCR)。

三、逆转录酶(reverse transcriptase) 特点 逆转录酶是一个多功能性酶,至少具有以下3种酶 活性: ⑴ 以单链RNA为模板, 催化合成cDNA单链 ⑵ 具有RNase H 活性,能水解RNA:DNA杂交链中的 RNA ⑶ 以DNA为模板,催化合成cDNA双链。

逆转录酶的应用: ⑴ 将mRNA逆转录成cDNA,构建cDNA文库; ⑵ 补平和标记5ˊ-末端突出的DNA片段; ⑶ 代替Klenow酶用于DNA序列分析; ⑷ 制备杂交探针等。

四、DNA连接酶(DNA ligase) (1) 两个双链DNA片段连接起来 (2) 修补带有缺口的双链DNA分子 催化双链DNA中一条链的3ˊ-OH与另一条链的5ˊ-PO3H2形成磷酸二酯键,从而构成完整的DNA长链。 DNA连接酶的用途 (1) 两个双链DNA片段连接起来 5ˊ- ACG AATTCGT-3ˊ T4DNA连接酶 5ˊ-ACGAATTCGT-3ˊ 3ˊ- TGCTTAA GCA-5ˊ 3ˊ-TGCTTAAGCA-5ˊ (2) 修补带有缺口的双链DNA分子 T4DNA连接酶

五、碱性磷酸酶(alkaline phosphatase) 能够催化水解去除DNA或RNA5ˊ-端的磷酸基团。 用途 ⒈ 制备载体时,用碱性磷酸酶处理去除载体分子 5ˊ-端磷酸基后,可防止载体自身环化连接,提高重组效率。 ⒉ 用32P标记5'-端前,去除5'-P,再通过激酶作用把放射性核苷酸加到5'-端进行标记。

六、末端 (脱氧核苷酸)转移酶(TdT) 作用 将标记或未标记的dNTP加到DNA的3ˊ—OH末端;也可催化载体分子或待克隆的DNA片段上加上互补的同聚尾,便于进一步连接。 应用 ① 探针标记 P32-α.dGTP 3´ G32G32G32G32 G32G32G32G32 3´ ② 在载体和待克隆的片段上形成同聚物尾,以便于进行连接

重要的工具酶 工具酶 活性 限制性核酸内切酶 识别特异碱基序列,切割DNA T4 DNA连接酶 催化DNA5ˊ-磷酸与3ˊ-羟基 形成磷酸二酯键 DNA聚合酶 以DNA为模板合成DNA 逆转录酶 以RNA为模板合成cDNA 碱性磷酸酶 切除5-末端磷酸 T4多聚核苷酸激酶 催化核酸5'-羟基磷酸化 末端脱氧核苷酸转移酶 催化3'-端合成同聚尾

第二节 基因克隆常用的载体 载体(vector) 第二节 基因克隆常用的载体 载体(vector) 是指能在连接酶作用下和外源DNA片段连接起来,并运送到宿主细胞的运载工具。 其化学本质为DNA分子 。 本节主要内容 载体必须具备的基本条件 载体的分类 常用的载体

一、载体必须具备的基本条件 ⒈ 具有独立复制能力 ⒉ 具备多个限制酶的识别位点(多克隆位点) ⒊ 具有遗传表型或筛选标记 ⒈ 具有独立复制能力 ⒉ 具备多个限制酶的识别位点(多克隆位点) ⒊ 具有遗传表型或筛选标记 ⒋ 有足够的容量以容纳外源DNA片段 ⒌ 可导入受体细胞。

二、载体的分类* (一) 克隆载体 用来克隆和扩增DNA片段的载体。 有质粒DNA、噬菌体DNA和病毒DNA三类。 (二) 表达型载体 (一) 克隆载体 用来克隆和扩增DNA片段的载体。 有质粒DNA、噬菌体DNA和病毒DNA三类。 (二) 表达型载体 为了使插入的外源DNA能够表达为多肽链而设计的载体称为表达型载体。 表达型载体除需载体必备条件外,还需相应的启动子、核糖体结合位点、增强子、终止子等表达调控构件。

三、常用的载体 (一) 质粒 (plasmid): 是存在于细菌染色体外的、能自主复制的双链环状DNA分子。 作为克隆载体的质粒应具备以下特点: 1. 分子量相对较小,能稳定存在于细菌体内, 有较高的拷贝数; 2. 具有1个以上的遗传标志,便于筛选; 3. 具有多克隆位点。

总而言之,质粒载体应该是一种分子量较小、高拷贝的“松弛型”质粒,且具有一个以上遗传标志和多克隆位点的质粒。 广泛应用的质粒: pBR32质粒、pUC系列等

pBR322质粒 ① 4363 bp ② 含一个复制点 含一个抗氨卞青霉素基因(ampR) ④ 一个抗四环素基因 (tetR) ② 含一个复制点 含一个抗氨卞青霉素基因(ampR) ④ 一个抗四环素基因 (tetR) ⑤ ampR和tetR抗性基因内各有一些限制酶的酶切位点,供外源基因插入 当外源基因插入抗药基因内后,抗药基因失活。AmpR→Amp敏感(AmpS )、TetR→Tet敏感(TetS). pBR322质粒

pUC系列质粒 (1) 2674bp; (2) 有ampR和与M13噬菌体 相同的多克隆位点(MCS) 由pBR322和M13噬菌体构建而成的双链质粒载体; (1) 2674bp; (2) 有ampR和与M13噬菌体 相同的多克隆位点(MCS) (3)有1个来自E.coli的LacZ基因片断, 编码半乳糖苷酶,便于蓝白筛选

(二)λ噬菌体 组成特点: 双链线状DNA分子, 全长50kb, 含66个基因, 在其分子两端各含有12个碱基的互补单链,是天然的粘性末端,被称为COS位点。

λ噬菌体两种生长途径(示意图)

噬菌体感染细菌后,可将自身DNA整合到细菌的染色体中去,与之一起复制,并遗传给子代细胞,宿主细胞不被裂解 。 λ噬菌体感染细菌后的两种生长途径 溶菌性生长 噬菌体感染细菌后,借助其2个COS位点互补成环,在宿主菌体内连续复制,合成大量基因产物,进而装配成噬菌体颗粒,裂解宿主菌,释放出来的噬菌体又可感染其他细菌。 溶源性生长 噬菌体感染细菌后,可将自身DNA整合到细菌的染色体中去,与之一起复制,并遗传给子代细胞,宿主细胞不被裂解 。

(DNA重组基本程序包括下列过程) 分—获取目的基因和载体 第三节 重组DNA基本原理 接—目的基因与载体的连接 转—重组DNA导入宿主细胞

一、目的基因的获取(分) 目的基因 是指所要研究或应用的基因,也是需要克隆或表达的基因。 目的基因来源 1) 制备基因组DNA 2) 制备cDNA 3) 聚合酶链反应 4) 人工合成基因

(一)制备基因组DNA(基因文库, genomic library ) 分离、纯化基因组DNA 在EDTA等存在下,用蛋白 ↓RE 酶K消化细胞、酚抽提; 大小不同酶切片段 常用蔗糖梯度离心或电泳    ↓             分离酶切片断; 分别与同样RE酶切的载体连接 常用噬菌体载体或质粒载体 ↓ DNA连接酶连接; 导入宿主细胞、扩增 导入宿主细胞内培养、扩增; ↓ 得到分子克隆混合体 用分子杂交等方法进行鉴定、 (基因文库) 筛选、再扩增,分离、回收。

(二)制备cDNA (cDNA文库) 与载体连接,导入宿主细胞扩增 → 构建cDNA文库。 分离目的基因 的mRNA 逆转录生成cDNA单链 水解回折处单链 得到平端双链cDNA 与载体连接,导入宿主细胞扩增 → 构建cDNA文库。

(三)聚合酶链反应( PCR) (四)人工合成基因 在体外,以目的基因为模板,在DNA引物、dNTP、TaqDNA Pol等存在下,构成一个反应体系。经94℃变性、54℃退火及72℃延伸3个步骤的反复多次循环(2530次),扩增目的基因(见18章)。 (四)人工合成基因 应用DNA测序仪测出某一基因的碱基序列,或根据某一蛋白质的氨基酸组成反推核苷酸序列,再用DNA合成仪通过化学合成原理合成目的基因。 (一般先合成短片断DNA,然后再拼接成长片段)

二、 目的基因与载体的连接(接) (主要有以下4种连接方式) 1) 粘性末端连接 2) 平头末端连接 3) 人工接头法 4) 同源多聚尾连接法

相同粘性末端,再通过DNA连接酶作用将两者连接起来,构成重组DNA分子。 (一) 粘性末端连接 将目的基因和载体用同一种限制酶酶切,产生 相同粘性末端,再通过DNA连接酶作用将两者连接起来,构成重组DNA分子。 (二)平头末端连接 有些限制酶只能将目的基因和载体DNA切割成 平端,此时在T4DNA连接酶的作用下同样能连接起 来。

(三) 人工接头法 合成连接子→与DNA平头末端连接→限制酶切割,产生粘性末端→连接,构建重组DNA。

(四)同源多聚尾连接法

三、重组DNA导入宿主细胞(转) 无性繁殖 克隆 宿主细胞 体外重组后的DNA导入受体细胞,然后随受体细胞生长、增殖,使重组DNA发生复制、扩增,这一过程称为无性繁殖。 克隆 从上述无性繁殖细胞中进一步筛选出含目的DNA的重组体分子即为无性繁殖系或克隆。 宿主细胞 进行无性繁殖时所采用的受体细胞.

用特殊方法处理(CaCL2)后,受体细胞才具备接受外源DNA的能力, 这种细胞称感受态细胞。 转化 以质粒作载体构建的重组体导入受体细胞的过程; 转染 以病毒作载体构建的重组体导入受体细胞的过程; 转导 以噬菌体作载体构建的重组体导入受体细胞的过程。 感受态细胞 用特殊方法处理(CaCL2)后,受体细胞才具备接受外源DNA的能力, 这种细胞称感受态细胞。 感受态细胞有原核细胞和真核细胞两大类。

(筛选含重组体的阳性菌落,一般有下列几种方法) 四、重组DNA的筛选与鉴定(筛) (筛选含重组体的阳性菌落,一般有下列几种方法) 1) 平板筛选 2) 限制酶切图谱筛选 3) PCR筛选重组体 4) 原位杂交技术 插入失活 蓝-白筛选

是指利用载体的遗传性标记在平板上直接筛选的方法。 (一) 平板筛选 是指利用载体的遗传性标记在平板上直接筛选的方法。 具有抗药性标记的载体,转化宿主细胞后,能 在含抗生素(Amp或Tet)的培养平板上生长;未转 化的则不能生长。 插入失活 当外源DNA序列插入质粒中某一抗药基因内,使 该基因失活,转化细胞就不能生长在含相应抗生素的 培养平板上。

抗生素平板筛选(插入失活)

利用蓝色化合物的形成作为指示剂,筛选带重组质粒的细菌。 2. 蓝-白筛选 利用蓝色化合物的形成作为指示剂,筛选带重组质粒的细菌。 载体:编码β-半乳糖 宿主: 编码β-半乳糖 苷酶N端序列 苷酶C端序列 (IPTG 存在下) α-互补 细菌表达: β-半乳糖苷酶活性↑ 5-溴-4-氯-3-吲哚( X-gal) → 形成蓝色菌落 当在质粒中插入外源DNA→β-半乳糖苷酶的N端基因失活→ 不能与宿主β-半乳糖苷酶的C端进行α-互补→产生白色菌落。

蓝-白筛选示意图

(二) 限制性内切酶图谱鉴定

(三) PCR筛选重组体 抽提少量重组DNA→PCR扩增→电泳鉴定→序列分析。 (四) 原位杂交技术

DNA重组基本过程(小结) 1、获取

2、重组

3、转化 体

4、筛选

5、克隆

6、表达 表达产物分离纯化

五、重组体在宿主细胞中的表达和调控 基因工程的最终目的是通过载体将外源基因导入合适的宿主细胞中高效表达,产生有重要价值的蛋白质产品。 克隆基因表达有三个条件 ⑴ 基因的编码区不能被插入序列中断; ⑵ 基因转录要有启动子,而启动子必须能被宿主 细胞的RNA聚合酶有效地识别; ⑶ mRNA必须相当稳定,并有效地被翻译,产生的外 源蛋白质必须不为宿主细胞的蛋白酶所降解。

第四节 重组技术在医学和制药工业中的应用 一、疾病基因的发现 1990年美国科学家率先启动人类基因组计划(HGP),计划历时15年,至2005年完成; 2001年2月12日由Since和Nature杂志同时向世界宣布,人类基因组3X109bp的最新图谱,约含34万个基因; 整个人类基因组的全部核苷酸序列不久即将完成。但要揭示人类4万个基因功能的任务将更为艰巨。

人类基因组图谱的初步完成,不仅为全部基因的定位建立了一个开放框架,而且为分离、鉴定人类疾病相关基因提供了参照模板。 如已知人类遗传性疾病约有3000种,推测可能是由于某些基因结构异常或基因位移等突变所致。如果利用分子生物学技术,将患者疾病基因与正常基因图谱作对照分析,必将有助于阐明遗传病的分子机制,这对遗传病的基因治疗将起到不可估量的推动作用。

二、 生产蛋白质和多肽类活性物质 产品名称 治疗功能与医药范围 1. 人胰岛素 治疗糖尿病 2. 人生长激素 治疗侏儒症,加速创口愈合 二、 生产蛋白质和多肽类活性物质 产品名称 治疗功能与医药范围 1. 人胰岛素 治疗糖尿病 2. 人生长激素 治疗侏儒症,加速创口愈合 3. α干扰素 治疗癌症、病毒感染 4. β干扰素 治疗带状疱疹,眼结、角膜炎 5. γ干扰素 治疗癌症、病毒感染 6. 人组织纤溶酶原激活因子(tPA) 溶解血栓,治疗急性心肌梗塞 7. 红细胞生成素 (Epo) 治疗肾病性贫血,增加红细胞及血色素水平 8. 超氧化物歧化酶 清除超氧化物,治疗关节炎,缓解心肌坏死 9. 凝血因子Ⅷ 治疗A型血友病 10. 乙型肝炎疫苗 防治肝炎 11. 神经生长因子 维持神经元细胞存活、生长和分化 12. 脑啡肤 镇痛 13. 降钙素 治疗骨质疏松症

基因工程生产胰岛素的原理(示意图)

基因工程疫苗可以帮助解决传统技术难以解决的 三、制备基因工程疫苗 基因工程疫苗可以帮助解决传统技术难以解决的 一些特殊的病原体疫苗。如, (1) 乙型肝炎病毒疫苗(HBV)、丙型肝炎病毒疫 苗(HCV)等; (2) 有诱发致癌或产生免疫病理作用的疫苗,如人 T细胞免疫缺陷病毒(HITV-1)等; (3) 常规效果较差的疫苗,如霍乱和痢疾疫苗等 (4) 制备一些多价疫苗等。

四、改良物种特性

↓ 动物药厂 ↓ ↓ 通过转基因动物生产感兴趣的基因 把YFG放在β—乳球蛋白的启动子下 注入羊卵细胞→植入借腹怀孕的母羊体内    ↓ 把YFG放在β—乳球蛋白的启动子下     ↓ 注入羊卵细胞→植入借腹怀孕的母羊体内   ↓ YFG在乳腺中表达 乳汁中提纯YFG蛋白。

五、动物克隆 1. 分离体细胞 (先处于“饥饿”的“静止状态”) →使“关闭”的基因全部“打开”。 2. 植入去核的卵细胞中→胚胎细胞 1. 分离体细胞 (先处于“饥饿”的“静止状态”) →使“关闭”的基因全部“打开”。 2. 植入去核的卵细胞中→胚胎细胞 3. 将胚胎细胞植入寄养母体内。

六、其他应用(略)

基因重组和基因工程(课堂练习) 基因工程中常用的限制性内切酶是 A. Ⅰ型限制酶 B. Ⅱ型限制酶 催化DNA缺口平移反应的酶是 核酸外切酶 催化DNA缺口平移反应的酶是 末端转移酶 B. DNA聚合酶Ⅲ DNA聚合酶Ⅱ D. DNA聚合酶Ⅰ Taq DNA聚合酶

Klenow片断具有下列酶活性 碱性磷酸酶的作用是 A. 5´→3´外切酶和 5´→3´聚合酶活性 5´→3´ 和3´→5´外切酶活性 C. 5´→3´聚合酶 和3´→5´外切酶活性 5´→3´ 和3´→5´聚合酶活性 E. 5´→3´ 外切酶和3´→5´聚合酶活性 碱性磷酸酶的作用是 A. 使核酸片段3´端加上磷酸基 B. 去除核酸片段的3´端磷酸基 去除核酸片段的5´端磷酸基 D. 使核酸片段的5´端加上磷酸基 E. 使核酸链水解断裂

下列是关于基因克隆常用载体的叙述,正确的是 在连接酶作用下,载体可与目的DNA连接构成重组体 载体是将目的DNA引入宿主细胞的运载蛋白 载体是将目的DNA引入宿主细胞的DNA分子 常用的载体有质粒、噬菌体和病毒等 载体可将目的DNA运载入宿主细胞内而本身不进入细胞 DNA重组应包括下列过程 分离并获得目的基因和载体 B. 连接目的基因和载体构成重组体 将重组体导入宿主细胞内 从转化菌落中筛选并鉴定含阳性重组体的菌落 E. 以上都包括

目的DNA可来自 目的DNA与载体的连接方法可有 直接从组织中提取 B. 基因文库 cDNA文库 D. PCR扩增 E. DNA合成仪合成