OvidSP Browse Journals Features Medline中的實證文獻檢索 Presenter Place City Etc. OvidSP Browse Journals Features Medline中的實證文獻檢索 李紹廸 Judy Lee ovid@flysheet.com.tw 飛資得資訊 2009 Nov
實證醫學五步驟 問題形成 文獻搜尋 文獻評讀 臨床應用 過程稽核 實證等級 PICO 臨床問題 檢索詞彙 MeSH Limit 文獻搜尋
MeSH使用與關鍵字檢索技巧
認識並活用MeSH MeSH 直接進入到Subheading MeSH樹狀圖 定義查詢研究方向 瞭解醫學標題上下階層、 Tree MeSH 直接進入到Subheading 定義查詢研究方向 MeSH樹狀圖 瞭解醫學標題上下階層、 從屬關係(Explode) Scope Note 瞭解醫學標題詞 涵括範圍與定義
Medline重要檢索工具:MeSH MeSH:Medline的主題標題表 結構:*Influenza, Human / pc [Prevention & Control] *:表示文獻內容中討論的主要主題之一 Influenza, Human:MeSH標題,表示主題為人類的流行性感冒 / pc [Prevention & Control]:副標題SubHeading,與MeSH搭配使用。表示該文獻討論的主題為人類流行性感冒的預防和控制
樹狀結構MeSH: 以階層方式(hierarchical)展現廣義詞和狹義詞間的關係 Broader Term 廣義主題 表示同時查詢狹義主題 Narrower Term 狹義主題 屬於同一個Broader Term的相關主題
每個MeSH會有對應的副標題可做進階分類
Advanced Ovid Search 適用於一般或資深使用者 查詢方式:查詢完整資料 Keyword: Author:以作者查詢 比對主題詞:提高查詢精確度 關鍵字查詢 Author:以作者查詢 Title:以題名查詢,只查詢題名上的關鍵字 Journal:以期刊名查詢,不可使用縮寫 Enterovirus
MeSH比對規則 Map Term to Subject Heading:先比對後統計 先一一比對在MeSH中有無可對應的標準主題。 如果比對不到標準主題時,先收集在文章篇名、摘要等書目欄位中有出現過我們所輸入的關鍵字的所有文獻。 再統計這些文獻中所有標準主題出現的次數。 出現最多次的這些標準主題就會被列入MeSH的建議選單中。 如果我們在主題建議清單中還是沒有找到適合的,Ovid還是會把關鍵字帶入資料庫中的重要欄位進行查詢。
Keyword: 比對主題詞
使用副標題精確檢索內容
Keyword:以關鍵字查詢 Enterovirus 在篇名、篇名補述、其他篇名、主題詞、摘要中查詢
實用技巧-切截字與萬用字元 切截字:$或* 其他字元:#和?( 前方最少需2個字元以上) 可以查出所有字首相同之關鍵字 depress $depress, depressive, depressants, depressor…… rat$rat , rate, rationalize, ratify…… 查出有相同字首且字尾不少於特定字母數的關鍵字 dog$1 dog, dogs…(但是不會查dogma) 其他字元:#和?( 前方最少需2個字元以上) #:關鍵字有一個字母不確定或單複數變化 wom#n woman、women dog# dogs(但是不會查到dog) ?:美式與英式英文的差異或不確定關鍵字是否包含該字母 colo?r color, colour dog? dog, dogs
實用技巧-布林邏輯與運算元 運算元 範例 OR (pregnancy or birth).ti. 1 or 2 or 3 or 5=or/1,2,3,5=or/1-3,5 AND (pregnancy and birth).ti. 1 and 2 and 3 and 5=and/1,2,3,5=and/1-3,5 Not 排除 (education not patient education).ti. safety not patient safety.ti.⇒safety.mp not patient safety.ti safety not patient safety⇒safety.mp not patient safety.mp 1 not 2 AdjN 指定距離 physician adj5 relationship (information adj3 retrieval).tw. Freq 關鍵字出現頻率 blood pressure.ab./freq=10 (information adj3 retrieval).tw./freq=5 一次僅指定一個欄位;且組合型欄位如SO無法使用Freq.
Map Term to Subject Heading的使用時機 以MeSH精確查詢並必須為文獻主要主題(僅勾選 Focus) 以MeSH精確查詢 以MeSH精確查詢,並擴展查詢其狹義詞。同時篩選出以MeSH及狹義詞為主要主題之文獻(勾選Focus和Explode) 以MeSH精確查詢,並擴展查詢其狹義詞(勾選Explode) 未選Map Term to Subject Heading 若要查詢最新的文獻,建議再以關鍵字查詢,可以同時查出尚未加入MeSH的文獻資料 其他說明: 搭配副標題做更精確查詢 在顯示MeSH清單時,僅能勾選一個才會出現此功能 將第4和第5做聯集,可以獲得最完整的資料 3個的差異
在Search History中以And/Or合併查詢 例外:使用Basic Search表示已輸入所有關鍵字,故不顯示And/Or功能
手動輸入Not指令
Ovid’s MeSH Search Tools 相同於Advanced Ovid Search 直接比對MeSH 直接進入到Subheading 定義查詢研究方向 Map Terms 直接進入MeSH樹狀圖 瞭解醫學標題上下階層、 從屬關係 Subheading Tree MeSH Search Tools 直接延展醫學標題詞 Explode Permuted Index 用於不知如何下檢索標題詞時,可利用此查參考的檢索用詞。 Scope Note Ovid Medline的Search Tools 將MeSH做進階的運用,使用者 可以針對需求作直接性的查找 瞭解醫學標題詞 涵括範圍與定義
Search Tools Map Term:主題比對;等同於Advanced Ovid Search之Map Term to Subject Heading。 Tree:顯示以樹狀構造排列之主題表;標準控制詞彙以具階級架構的樹狀圖排列,使用者可以了解輸入之關鍵字或片語可對應的主題所在位置以及了解相關父階層或子階層的主題。 Permuted Index:替代索引;藉由輸入單一關鍵字顯示所有包含此關鍵字的主題、Related terms和Used-for terms等。 Scope Note:名詞解釋;提供該標準主題詞彙的參考資料。 Explode:延展主題查詢;延展搜尋結果,包含該主題以及子階層之主題。 Subheadings:指定MeSH的副標題查詢;查詢並顯示標準主題詞彙的副標題,副標題詞幫助者找尋描述某一標題詞特定觀點資料。
從Keyword到MeSH 試試下面的檢索詞: Advanced Search Search 創傷後症候群:PTSD 注意力不足過動症:ADHD 肺結核:TB 腸胃道出血:GI bleeding 產婦憂鬱:Mother Blues / baby blues 粒線體夏娃:Mitochondrial Eve Search Tools:Permuted Index 潰瘍:Ulcer Ovid提供精確的檢索結果
副標題詞(SubHeadings) MeSH除了目前已提供的標題詞(Subject Heading),另外亦提供83個對應主題上的副標題(http://www.nlm.nih.gov/mesh/topsubscope2008.html) 副標題詞幫助讀者找尋描述某一標題詞特定觀點資料 這些副標題給予2個字母的代碼來表示,如副標題Nursing即以NU表示,更能方便檢索進行。 副標題詞的查詢: Floating Sub-Heading (FS):指定特定副標題詞查詢 Exploded Sub-Heading (XS):某些副標題詞實際上又可以被歸類成同一類主題,目前共有31類。當我們需要查詢同一類的副標題,譬如ae.xs,就表示查詢包含Adverse Effects、Poisoning和Toxicity這三類副標題的文獻。
快速的找到Influenza A virus遺傳相關的文獻 (即使篇名或摘要中沒有genetics這個關鍵字)
SubHeading可以避免節省刪除不適合文獻的時間
Floating Sub-Heading a 列出83個可使用的副標題 可用代碼或完整副標題詞
Exploded Sub-Heading 共31類主題 各類主題包含相關副標題 副作用 流行病學 生理學 解剖與組織學 倫理學 心理學 分析學 病因學 致病原因 化學 歷史 放射物影響 分類學 傷害 統計與數值數據 併發症 儀器學 手術 細胞學 化學 治療方式 藥物影響 新陳代謝 治療用途 診斷 方法學 獸醫學 教育 組織與管理 共31類主題 各類主題包含相關副標題 胚胎學 藥學
SubHeading 操作範例 針對某疾病或藥物的特定類別的資料:與MeSH合併使用 範例:高血壓的藥物治療 可能該主題非MeSH標題,或是以特定觀點為查詢主角:Search Field單獨使用FS或XS Viagra在臨床上可用於治療女性哪些疾病?! 利用Basic Search查詢Viagra,以協助獲得正式學名 勾選 Floating Subheading,輸入Drug Therapy查詢 除了鋁之外,哪些化學物質的副作用會引發阿茲海默症?!
從PICO到Medline- 以PICO組織臨床問題 實際執行檢索 借助Basic Search轉換成適當關鍵字 使用適當的關鍵字查詢 訂定關鍵字查詢先後 利用資料庫檢索工具精確檢索結果 利用Map Term to Subject Heading比對到MeSH專業主題 適當使用檢索工具和運用實用技巧 查詢 利用布林邏輯合併檢索結果
P I C O 形成一個可以回答的臨床問題 PICO的好處:聚焦問題,容易找到關鍵字。 Patient or Problem 病人是誰,有甚麼問題? P Intervention or Indicator 想要作哪些觀察、診斷或治療? I Comparator 有無其他方式或選擇? C Outcome 效果是甚麼?或是預計的結果? O PICO的好處:聚焦問題,容易找到關鍵字。 分辨臨床問題的型態,如治療、傷害、診斷、預後與病因等類別。 協助瞭解何者是最好且最適合的研究設計 據此而產生的研究結果才是最佳證據等級的文獻。
Advanced Ovid Search 以Limit篩選出適合的結果 以SubHeading(副標題)來精確查詢方向 適度的延展或強調主題的精確性 使用Focus來強調主題的精確度 善用Explode來適時增加主題的廣度 運用標題比對(MeSH),提供適合的專業主題
利用Limit篩選實證文獻
OVID Medline 篩選資料 年齡層 期刊類別 動物 發表語言 出版類型 研究範疇 臨床決策 文獻索引 實證文獻 alzheimer’s disease 年齡層 期刊類別 動物 發表語言 出版類型 研究範疇 臨床決策 文獻索引 實證文獻 特定主題類別
在Medline找到實證文獻 EBM Resource in Ovid Systematic Review in Ovid Medline 臨床問題取向:Clinical Queries 依實證等級依次篩選EBM文獻 Additional Limits: Subject Subsets:Systematic reviews Publication Type 利用MeSH標題詞指定 指定特定文獻出處
1. EBM Resource in Ovid Ovid Medline Ovid EBMR Topic Reviews: Cochrane Collaboration Cochrane Database of Systematic Reviews (CDSR) Cochrane Database of Methodology Reviews (CDMR) NHS Centre for Reviews and Dissemination (CRD) The Database of Abstracts of Reviews of Effectiveness (DARE) Health Technology Assessments (HTA) NHS Economic Evaluation Database (NHSEED) Article Reviews: American College of Physicians:ACP Journal Club Definitive Controlled Trials: Cochrane Collaboration:Cochrane Central Register of Controlled Trials Methodology Reviews: Cochrane Collaboration:Cochrane Methodology Register (CMR)
EBM Reviews 子資料庫簡介 Cochrane Database of Systematic Reviews 子資料庫名稱 子資料庫簡介 Cochrane Database of Systematic Reviews 由Cochrane 50個主題研究小組有系統的收集臨床研究資料,統一分析並發表系統性的評論文章 (Topic Reviews) Database of Abstracts of Reviews of Effects 根據各篇系統性評論文章加以摘錄評論(Article Reviews) Cochrane Central Register of Controlled Trials 收錄各專業組織臨床試驗資料 Cochrane Methodology Register 針對產生對照實驗的方法使用的出版書目資訊。 Health Technology Assessment 收錄關於全球健康管理技術評估的資訊,包括進行中的計畫和健康技術評估單位完整的出版品的詳細資訊 NHS Economic Evaluation Database 收錄醫療經濟評估相關之文獻摘要。 ACP Journal Club 內容屬雙月刊,由醫學專家篩選大量的臨床期刊並整理摘要評論而成的實證評論文獻(Article Reviews)
直接使用EBMR瀏覽 瀏覽實證醫學主題群組 了解該主題小組之相關資訊 Cochrane下分有50個主題研究小組,因此我們可以利用瀏覽功能,針對想瞭解的研究主題來找尋實證研究文獻。 了解該主題小組之相關資訊
研究小組介紹
點選Table of Content可瀏覽該研究小組所完成或正在進行中的的實證研究評論 瀏覽Topic Reviews
Table of Contents
在Medline連結EBMR
2. Systematic Review in Ovid Medline 包含以下類型文獻 systematic reviews meta-analyses reviews of clinical trials evidence-based medicine consensus development conferences Guidelines 使用方式: Additional Limits Subject Subsets Systematic Reviews 詳細檢索策略請參考: http://www.nlm.nih.gov/bsd/pubmed_subsets/sysreviews_strategy.html
選擇Systematic reviews
Sens / spec / prec / acc(%) 3. Clinical Queries (I) Strategy Type Optimization Sens / spec / prec / acc(%) Ovid Syntax Therapy 治療 Sensitivity 99 / 70 / 10 / 71 clinical trial.mp. OR clinical trial.pt. OR random:.mp. OR tu.xs Specificity 93 / 97 / 54 / 97 randomized controlled trial.pt. OR randomized controlled trial.mp. Optimized 96 / 95 / 39 / 95 randomized controlled trial.pt. OR randomized.mp. OR placebo.mp. Diagnosis 診斷 99 / 74 / 1 / 74 sensitiv:.mp. OR diagnos:.mp. OR di.fs. 65 / 98 / 11 / 98 specificity.tw. 93 / 92 / 3 / 92 sensitiv:.mp. OR predictive value:.mp. OR accurac:.tw. Prognosis 預後 90 / 80 / 2 / 80 incidence.sh. OR exp mortality OR follow-up studies.sh. OR mortality.sh. OR prognos:.tw. OR predict:.tw. OR course:.tw. 52 / 94 / 3 / 94 prognos:.tw. OR first episode.tw. OR cohort.tw. 83 / 84 / 2 / 84 prognosis.sh. OR diagnosed.tw. OR cohort:.mp. OR predictor:.tw. OR death.tw. OR exp models, statistical Sensitivity/sens = 敏感度; Specificity/spec = 特異性; Optimized=最佳化; prec = 精確性; acc = 準確性
Clinical Queries (II) Strategy Type Optimization Sens / spec / prec / acc(%) Ovid Syntax Reviews 評論 Sensitivity 99.9 / 52 / 3 / 53 search:.tw.OR meta analysis.mp,pt.OR review.pt.OR di.xs. OR associated.tw. Specificity 71 / 99.2 / 57 / 99 MEDLINE.tw.OR systematic review.tw.OR meta analysis.pt. Optimized 98 / 91 / 14 / 91 meta analysis.mp,pt.OR review.pt.OR search:.tw. Clinical Prediction Guides 臨床預測指引 96 / 79 / 1 / 79 predict:.mp. OR scor:.tw. OR observ:mp. 54 / 99 / 12 / 99 validation.tw. OR validate.tw. 90 / 90 / 2 / 90 predict:tw. OR validat:.mp. OR develop.tw. Qualitative Studies 質化研究 95 / 70 / 2 / 70 interview:.tw. OR px.fs. OR exp health services administration 61 / 99 / 37 / 99 qualitative.tw. OR themes.tw. 92 / 92 / 7 / 92 interview:.mp. OR experience:.mp. OR qualitative.tw. Sensitivity/sens = 敏感度; Specificity/spec = 特異性; Optimized=最佳化; prec = 精確性; acc = 準確性
Clinical Queries (III) Strategy Type Optimization Sens / spec / prec / acc(%) Ovid Syntax Etiology 病因 Sensitivity 93 / 63 / 2 / 63 risk:.mp. OR exp cohort studies OR between group:.tw. Specificity 51 / 95 / 6 / 95 relative risk:.tw. OR risks.tw. OR cohort stud:.mp. Optimized 83 / 83 / 3 / 83 risk.mp. OR mortality.mp. OR cohort.tw. Costs 成本 100 / 96 / 13 / 96 ec.fs. OR cost.tw. OR health care costs.sh. 57 / 99.5 / 37 / 99 cost effectiveness.tw. OR health care costs.sh. 98 / 98 / 18 / 98 exp "costs and cost analysis" OR costs.tw. OR cost effective:.tw. Economics 成本效益 100 / 94 / 1 / 94 randomized controlled trial.pt. OR cost effectiveness.tw. OR cost effective.tw. 51 / 99.4 / 6 / 99 cost effective.tw. OR sensitivity analys:.tw. 97 / 96 / 2 / 96 cost:.mp. OR cost benefit analys:.mp. OR health care costs.mp. Sensitivity/sens = 敏感度; Specificity/spec = 特異性; Optimized=最佳化; prec = 精確性; acc = 準確性
臨床問題取向:Clinical Queries
4. 依實證等級依次篩選EBM文獻 Based on material from SUNY Downstate Medical Center/Medical Research Library of Brooklyn Pyramid modified from "Navigating the Maze", University of Virginia, Health Sciences Library
Ovid Medline EBM 文獻查詢順位 Systematic Review Cochrane System Review Health Technology Assessments ACP Journal club Meta-Analysis Consensus Development Reports Decision Analyses Guideline/Practice Guideline --------Clinical Queries-------- RCTs Double Blind studies (therapy, diagnosis) Controlled Clinical Trials Multicenter Studies Crossover Design Cohorts Studies (prognosis, etiology, prevention) Longitudinal Studies Follow-Up Studies Prospective Studies Case Control Studies Retrospective Studies Cross-Sectional Survey Review Case Series/Case Reports 使用Limits/Additional Limits篩選,例如RCTs 研究方法可使用Map Term to Subject Heading查詢,如Cohorts Studies
使用 Limits/Additional Limits篩選 選擇適合文獻類型:RCT, Case Report……
Search in EBMR & Medline EBM Reviews DB Medline Clinical Query Publication Type/ MeSH 篩選出適合文獻 文獻判讀 Topic Review Article Review
檢索範例一 In elderly patients with congestive heart failure, is digoxin effective in reducing the need for rehospitalization? Clinical Question Clinical Scenario Medline Strategy Patient or problem congestive heart failure, elderly heart failure, congestive Limit to Aged Intervention, exposure, prognostic factor digoxin Comparison none or placebo Outcome rate of hospitalization hospitalization Type of question Therapy Clinical queries:Therapy Type of study RCT或以上 檢索範例參考自http://www.hsl.unc.edu/services/tutorials/ebm/
檢索範例二 In a 65 year old man with a stroke and moderate carotid stenosis, can ASA decrease the risk of another stroke compared with no treatment? Does a carotid bruit predict significant carotid stenosis? How effective is a carotid endarterectomy in someone with moderate carotid stenosis? Patient or Problem Intervention Comparison Intervention Outcome 65 year old man with a stroke Carotid bruit Doppler ultrasonography or angiography Carotid stenosis Patient or Problem Intervention Comparison Intervention Outcome 65 year old man with a stroke Carotid endarterectomy Medical therapy Stroke
Questions? Thank You.