作业调度系统常用命令.

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作业调度系统常用命令

bsub 直接提交作业 bsub –n z –q QUEUENAME –i inputfile –o outputfile COMMAND 其中z代表了提交作业需要的cpu数,–q指定作业提交到的队列,如果不采用–q选项,系统把作业提交到默认作业队列(作业队列详细介绍请看下一节)。inputfile 代表程序需要读入的文件名(例如 namelist等),outputfile 代表一个文件,作业提交后标准输出的信息将会保存到这个文件中。COMMAND是用户要运行的程序

bsub 直接提交作业 串行程序 COMMAND可以直接使用用户的程序名 例如,对一个串行作业mytest, 提交方式为: bsub –n 1 –q QS_Norm –o mytest.out ./mytest

bsub 直接提交作业 并行作业 COMMAND为“–a intelmpi mpirun.lsf 程序名” 因为并行作业必须用到intelmpi库,所以提交的时候必须使用–a intelmpi mpirun.lsf 例:使用12个cpu的并行作业mytest,提交方式为: bsub –n 12 –q QN_Norm –o mytest.out –a intelmpi mpirun.lsf ./mytest

bsub 使用脚本提交作业 bsub 命令可以使用输入脚本多次提交具有相同参数的作业: 提交 bsub < 脚本 #BSUB –n Z #BSUB –q QUEUENAME #BSUB –o %J.out #BSUB –e %J.err COMMAND 提交 bsub < 脚本 更多脚本例子,参照计算平台网站上的作业提交文档

bsub 混合方式 bsub –m “n1” < 脚本名 指定机器提交作业

bhosts显示各节点作业相关情况 Bhosts bhosts <hostname>

bjobs查看作业 bjobs –w bjobs –r 显示正在运行的作业 bjobs –a 显示正在运行的和最近完成的作业 bjobs -p 显示等待运行的作业和等待原因 bjobs –s 显示正在挂起的作业和挂起的原因 bjobs -l 显示该作业的所有信息

bhist bhist 显示最近完成作业或正在运行作业的历史情况 bhist <jobid>

bkill 删除不需要的作业 bkill <jobid> bkill –r <jobid>

bswitch 更改作业队列 如果作业提交一直pend,可以更改作业队列 bswitch -q 目标队列 jobid

bpeek 监视作业运行状态 bpeek 当作业正在运行时显示它的标准输出,监视作业运行 bpeek <jobid>

bacct 作业统计 bacct -b -u 账号 -C 2012/05/02,2013/04/0 bacct -l 122211