药学信息资源获取和利用 解放军医学图书馆 学科化服务部 王萧
目 录 一、综合性医药学数据库 二、药物化学相关的数据库 三、网络资源 四、其它资源及工具书
药学是以各种科学为基础来研究药物的知识系统。 信息检索,简单来说就是从信息的集合中找到所需信息的过程。 而药学信息的集合涵盖了药物研制、生产、流通、使用和管理的各个方面,因此具有一定的复杂性。 从资源类型区分,药学信息包括图书、期刊文献、专利、产品信息等; 从资源性质区分,有数据库资源、网络资源、纸本资源等; 从专业角度区分,分为药理、药分、药化、药剂、药物流行病学等。
一、综合性医药学数据库 文摘数据库: (1)Embase (1)ADIS药学电子期刊全文数据库 (2)Pubmed (3)国际药学文摘 (4)德温特药学文档 全文数据库: (1)ADIS药学电子期刊全文数据库 (2)Clinical Pharmacology临床药理学数据库(事实数据)
1.1 Embase Embase(Excerpt Medical Database,http://www.embase.com)是药物和生物医药的综合数据库,由荷兰Elsevier Science出版公司建立。 Embase包含的内容涉及药学、临床医学、基础医学、预防医学和生物医学工程等,其中40%左右为药物文献信息,在检索的时候可以与PubMed互补使用。
1.1.1 综合检索
1.1.2 药物检索 简单检索,如:“low molecular weight heparin”,系统规定对输入的词组或短语必须加上引号(单引号和双引号均可)。该同时支持“*”和“?”截词符、“NEXT/n”和“NEAR/n”近似运算符及布尔逻辑运算符。 在检索框中键入需要搜索的药物名(generic name)、专利商品名(proprietary name)、实验室代码(laboratory code)和化学名(chemical name)来检索相关药物信息。
Embase还可以提示用户将输入的检索词转化为合适的优选术语或药物名称或主题词。 如:在“Drug ”搜索栏中输入:药物的商品名claritin克敏能,系统提供自动识别和匹配功能,提供该药物的化学名loratadine。
如果需要查询与某代号相应的药物主题词,可在Drug检索栏中直接输入代号,如:sch29851,系统会提示用户“use:loratadine”。 这个功能是Embase的主题词查找功能。
在药物检索的界面,针对检索需要还增加了17种药物副主题词(Drug Subheading)和47种给药途径(Route)的限定选项。 如何提高查准率? 在药物检索的界面,针对检索需要还增加了17种药物副主题词(Drug Subheading)和47种给药途径(Route)的限定选项。 其中“Drug Subheading”中包括药物不良反应(Adverse drug reaction)、临床实验(Clinical trial)、药物分析(Drug analysis)等, 给药途径包括:吸入、注射、皮下、口服等。
如果使用主题词合并副主题词等检索限制条件,将大大提高查准率。 如单独检索“loratadine”(氯雷他定),系统会出现5543条Records; 检索“loratadine”并在“Drug Subheading”中勾选“Clinical trial”,系统则返回505条Records, 检索“loratadine”并在“Route”中勾选“Oral drug administration”,系统则返回553条Records.
检索结果的二次筛选: 在界面左侧有一列“Results Filters”,将5543Records按不同的分类标准划分。 如查找loratadine与临床实验有关的检索结果,在“Study Types”中勾选“clinical trial”,可以看到1071篇相关文献。
需要注意的是,要将“Results Filters”和“Drug Subheading”的功能区分清楚。
1.2 国际药学文摘 国际药学文摘(International Pharmaceutical Abstracts,简称“IPA”)由美国医院药师协会出版。IPA 数据库主要用于检索和显示药学文献,范围包括药物临床和技术信息、药学实践、药学教育以及相关的法律法规。 IPA 数据库:美国医药卫生协会(ASHP) 的论文文摘(1998年——) 美国药学协会(APhA)推荐的论文文摘 美国药学学院协会(AACP)年会推荐的论文文摘 IPA 另一特点是,它既包括了美国所有州的药学期刊,又包括了大部分化妆品出版物。
IPA分类采用美国医院药典(American Hospital Formulary Service,AHFS) 。 数据库中药物术语,是由美国医院药剂师学会(American Society of Hospital Pharmacists)公布,AHFS 确定种类。 如果需要检索药物学或治疗学,需要在检索词后面加上字段标识。格式为:“分类号.pc”或“药物类别.pc”。
1.3 德温特药学文档(DDF) DDF由德温特公司推出,涵盖1983年至今几乎所有药学文献,年收录文献约10万条,数据来源于大约1200种科学出版物,包括世界范围内的期刊和会议录。 新药的所有资料均予收录,而常规药的一般资料如病例报告、讨论、社论和述评等则不予收录,除非论文中有重大发现如副反应等。综述文献一般选择那些对药物进行了详细的讨论和引用文献较多的才收录。
该数据库内容涉及药品发展、生产制备、评估等方面的资料,包括药品在分析、生物化学、化学、内分泌、免疫学、医学、微生物学、制药学、药理学、生理学、毒理学等方面的资料。 在检索方面,DDF的特点是,链接词字段(LT)中的药品或疾病还包含一个修饰词作用代码(Role code)。该作用代码是2个字母的缩写。用“-”连接在药品或疾病名称的后面,如“mitoxantrone-tr”或“asthma-st”对其前面的药品或疾病进行范围限定。
二、与药物化学相关的数据库 文摘数据库: 全文数据库: (1)Reaxys (2)SciFinder (1)ACS 美国化学会电子期刊 (2)RSC 英国皇家化学学会 (3) Thieme harmaceutical E-package 化学与药学期刊,Synthesis和Synlett
二者收录范围对比: SciFinder和Reaxys数据库是化学化工及其相关领域的两大重要数据库,首先对二者进行一个对比分析,再分别介绍。 Reaxys中虽然文献数据不及SciFinder全面,但其文献收录的时间更长,部分子数据库信息可回溯到1771年,其许多事实数据如熔点、沸点等物理和化学性质数据更详细,并有来源摘要,化学物质及反应引用的早期文献记录数据较多,可与SciFinder互补使用。 SciFinder包含的数据较广泛,收录的文献类型包括期刊、专利评论、会议录、论文、技术报告和图书中的各种化学研究成果,涉及化学、药学、医学、物理、生命科学、聚合体学、材料学、地质学、食品科学和农学等诸多学科领域。
二者功能对比: 区别: 都含有:结构式检索、反应式检索、二次检索 登录: reaxys是IP绑定模式, scifinder是IP绑定结合账号密码模式。 检索结果: reaxys是事实数据形式, scifinder是文献列表形式。 简单检索:reaxys是quick search,scifinder是文献检索(含主题检索、作者名、机构名、文献标识符) 高级功能: reaxys有反应路线设计功能,scifinder有对检索结果的深入分析功能。
2.1 Reaxys Reaxys数据库是由爱思唯尔(Elsevier)公司出品的化学数值与事实数据库。 Reaxys数据库包括: Beilstein:涵盖时间范围从1771年至今;包含化学结构相关的化学、物理等方面的性质; Gmelin:涵盖时间范围从1772年至今;包含详细的理化性质,以及地质学、矿物学、冶金学、材料学等方面的信息资源。 Patent:选自1976年以来有机化学、药物(医药、牙医、化妆品制备)、生物杀灭剂(农用化学品、消毒剂等)、染料等的英文专利(WO、US、EP)以及化学相关期刊的内容整合为统一的资源。
三种检索方法: (1)Quick Search (2)Create structure or reaction drawing (3)Query builder
(1)快速检索栏可以查什么?
(2)如何通过绘制结构,进行检索
(3)Query builder:相当于个性化定制检索条件 提供Reaxys注册号、CAS注册号、化学名、理化性质、光学性质等途径,可多选。 在空白区域的右侧,还提供了一些检索的限制条件,如:“Search as / by”产物(Product)、反应物(Starting material)等;“Options”中包含互变异构体(Include tautomers)、忽略立体结构(Ignore stereo)等。
(4)反应路线设计: 输入产物结构,查询,在检索结果界面中,点击“synthesize”。
2.2 SciFinder SciFinder数据库是著名的检索工具刊——美国《化学文摘》的网络版,由美国化学学会(ACS)旗下的化学文摘服务社CAS(Chemical Abstract Service)出版。 囊括了自20世纪以来所有与化学相关的资料,以及大量生命科学及及其它科学学科方面的信息。学科领域覆盖普通化学、农业科学、医学科学、物理学、地质科学、生物和生命科学、工程科学、材料科学、聚合物科学和食品科学等。
2.2.1 SciFinder 各数据库 (1)CAplus:包含来自 150 多个国家、9000 多种期刊的文献,覆盖 1907 年到现在的所有文献以及部分 1907 年以前的文献, (2)CAS REGISTRY:化合物信息数据库 (3)CHEMLIST:关于管控化学品信息的数据库 (4)CASREACT:化学反应数据库 (5)CHEMCATS:化学品商业信息数据库 (6)MEDLINE:美国国家医学图书馆(NLM)建立的书目型数据库
2.2.2 SciFinder 注册 使用Web版的用户需要注册SciFinder的账号,使用企业版的用户用于注册的邮箱必须是本单位规定的统一邮箱,注册后系统将自动发送一个链接到您所填写的email邮箱中,在48小时内激活即可完成注册。 注册完成之后,进入https://scifinder.cas.org/scifinder/login,登录完成后即可进行检索。
2.2.3 SciFinder如何使用 文献检索 物质检索 反应检索
(1)文献检索(REFERENCES) SciFinder的文献检索中提供了: 主题检索(Research Topic)、 作者名检索(Author Name)、 机构名检索(Company Name)、 文献标识符(Document Identifier) 等途径获得文献。
重点 在主题检索中需要注意的是,SciFinder不支持逻辑运算符(and、or、not),检索词之间使用介词链接,如:with、at、of 、between等。 例:纳米材料与耐药基因
重点 17 17 56 56 同义词
(2)物质检索(SUBSTANCES) SciFinder的物质检索中提供了: 化学结构检索(Chemical Structure) Markush检索 分子式检索(Molecular Formula) 理化性质检索(Propety) 物质名称检索(Substance Identifier)
其中化学结构检索和Markush检索需要绘制出待查询的结构。 SciFinder的绘图板提供Java运行和Non-java运行两种方式。
C3H6O,C4H8, C5H7N2O
(3)反应检索(REACTIONS) SciFinder的反应检索: 精确反应检索(在特定的位点进行取代) 模糊反应检索(亚结构检索,允许有更多的取代情况)。
(4)主题检索:结果的筛选、分析
(4)主题检索:结果的筛选、分析
三、网络资源 (1)国家食品药品监督管理总局 (2)美国食品和药物管理局 (3)毒理学网络 (4)美国药物不良反应监测网 (5)PharmaWeb
1、国家食品药品监督管理总局(China Food and Drug Administration,CFDA) 国家食品药品监督管理总局是我国食品、药品、医疗器械、化妆品的监管机构,主要负责起草监管的相关法规,制定实施办法、管理制度、稽查制度并监督组织实施等。通过CFDA网站(www.sda.gov.cn/)可以查找我国有关药品食品的相关政策文件、注册/审批信息、公告等。 在CFDA网站首页的右上角列出了分类管理的入口。
点击“药品”,进入CFDA的专题专栏。在子网页的右上角,有“数据查询”,可查询国产药品、进口药品、药品生产企业等信息。在“数据查询”的下方,有药品注册进度查询的链接。
如:点击进入“国产药品”,网站提供了“快速查询”和“高级查询”两种检索方式。
2、美国食品和药物管理局(Food and Drug Administration,FDA) 是美国医疗审核机构,主要包括:食品安全和实用营养中心(CFSAN)、药品评估和研究中心(CDER)、生物制品评估和研究中心(CBER)、兽用药品中心(CVM)。FDA主要分测试和注册两个内容,主管食品、药品(包括兽药)、医疗器械、食品添加剂、化妆品、动物食品及药品等的测试、检验和出证。此外,还可以查到药物安全信息、药物特殊信息索引、药物短缺信息、用药错误信息等。
该网站提供快速检索功能(FAD Search),包括五个入口: 活性成分检索(Search by Active Ingredient)、申请人检索(Search by Applicant Holder)、商品名检索(Search by Proprietary Name)、申请号检索(Search by Application Number)、专利号检索(Search by Patent)。 还提供高频问题FAQS(Frequently Asked Questions), 以问答式列出一些常见问题帮助用户。另外网站中还提供常用的功能链接(如毒理学网站等),方便用户查找相关信息。
3、毒理学网络(http://toxnet.nlm.nih.gov)
毒理学网络(Toxnet , http://toxnet.nlm.nih.gov)提供了: 毒理学在线(TOXLINE)、有害物质数据库(HSDB)、 化学别名和结构数据库(ChemIDplus)、 基因突变毒理学(GENETOX)、发育和生殖毒理学(DART)、 化合物环境毒理学评价(TRI)等数据库。 其中,TOXLINE常用的药学文献数据库之一,包括药物和化学物质的毒理学、药理学、生理学等内容。联机检索TOXNET数据库时,可以选择某一个或全部数据库进行检索。
4、美国药物不良反应监测网(MedWatch) 由FDA建立,用于药品上市后的质量跟踪和监测,以便及时发现临床试验中尚未揭示的不良反应。 该网站提供医药产品安全信息查询,可以查看药物、医疗器械的安全信息。还可以通过直报系统向FDA提交药物的不良反应报告。
5、PharmaWeb(http://www.drugs.com/) PharmaWeb是第一个在互联网上提供药学信息的专业网站,其属于资源整合网站,信息较全面,包括药学、生物学、化学、世界各国药学网等。该网站提供多项服务,拥有庞大的用户群。
四、其它药学信息资源及工具书 (1)专利 (2)药典 (3)医药手册、索引 (4)医药学年鉴 (5)医药图谱
1、专利 2、医药手册、索引 药学专利内容包括 欧洲专利局(http://www.epo.org/)、 美国专利局(http://patft.uspto.gov/)、 中国专利局(http://www.sipo.gov.cn/)等。 2、医药手册、索引 手册是汇集某一学科或某一主题等需要经常查找参考的资料,供读者随时翻检的工具书。其特点是信息密集、内容具体,文字简洁、实用。 常用的医药手册包括:《默克手册》(Merck Manuals)、《美国药品索引》(American Drug Index,ADI)、《全球药物字典》(INDEX NOMINUM)、《中国新药实用全集》等。
3、药典 药典是一个国家记载药品标准、规格的法典,一般由国家药品监督管理局主持编纂、颁布实施,国际性药典则由公认的国际组织或有关国家协商编订。药典是从本草学、药物学以及处方集的编著演化而来。药典的重要特点是它的法定性和体例的规范化。 现在已有的药典主要有: 《国际药典》(The International Pharmacopoeia,IP)、 《中华人民共和国药典》、 《美国药典》(The United States Pharmacopoeia,USP)、 《欧洲药典》(European Pharmacopoeia,EP)、 《英国药典》(British Pharmacopoeia,BP)等。
4、医药学年鉴 年鉴是以全面、系统、准确地记述年度事物运动、发展状况为主要内容的资料性工具书。汇辑一年内的重要时事、文献和统计资料,按年度连续出版的工具书。 目前出现的医药学年鉴主要有:《美国医学会药物评价年鉴》、《中国卫生年鉴》、《中国医药年鉴》、《中国药品监督管理年鉴》、《中国中医药年鉴》等。 5、医药图谱 目前的医药图谱中,以医用图谱居多。药用图谱主要集中在中药方面,包括:《中国常用中草药彩色图谱》、《全国中草药汇编彩色图谱》、《中国中药材真伪鉴别图谱》等。
谢谢!