图书馆文献检索教研室 信息管理系信息管理教研室 杜志银

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图书馆文献检索教研室 信息管理系信息管理教研室 杜志银 2008.11.20

主要内容 一、Pubmed的简介 二、Pubmed的检索方法(重点) 三、检索结果处理(包括全文获取) 主题词检索 基本检索 高级检索 预览与索引检索 限制检索 高级检索 三、检索结果处理(包括全文获取)

一、PubMed的简介 由美国国立医学图书馆开发,面向全球免费开放,并提供免费期刊全文和部分收费全文的链接。 收录1950年以来的来自Medline数据库和部分生命科学期刊的生物医学期刊论文1800多万篇。 PubMed是生命科学领域权威的检索工具。

二、PubMed检索 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/ http://www.pubmed.org http://www.pubmed.gov http://www.pubmed.com

PubMed的主界面 NCBI平台的部分数据库 检索区域(重点) 检索辅助区域

例1:检索抑郁症的蛋白质组学和肽组学研究相关文献

分析主题: 抑郁症的蛋白质组学和肽组学研究相关文献 蛋白质组学(proteomics) 抑郁症(depressive disorder , Major depressive disorder :重度抑郁症) 肽组学(peptidomics)

(一)基本检索 直接输入topics,authors,journals等进行检索

(1)输入“depressive disorder ” 2 5 4 3

(2)、输入“proteomics”

(3)、输入“peptidomics”

问 题 1、接下来该如何怎么办? 2、这种检索方式是否合适?

(二)、主题词检索 2 1

(1)、“depressive disorder”的主题词检索 2 1 3

(1)、“depressive disorder”的主题词检索 4

(1)、“depressive disorder”的主题词检索 主题词的注释 5 可与之组配的副主题词

(1)、“depressive disorder”的主题词检索 6

(1)、“depressive disorder”的主题词检索 7

(1)、“depressive disorder”的主题词检索 抑郁症的 检索结果

(2) “proteomics”的主题词检索

(2) “proteomics”的主题词检索 蛋白组学 主题途径 检索结果

(3) peptidomics 肽组学不是主题词 用肽组学的相关自由词进行检索

问 题 我们用了自由词和主题词分别对“抑郁症的蛋白质组学和肽组学”课题中相关主题分别进行了检索,如何从这些分散的文献中找到满足课题要求的文献呢? 抑郁症和蛋白质组学 抑郁症和肽组学 History中进行逻辑组配

(三)History 利用检索历史进行组配的方式有: 直接检索输入框输入逻辑表达式(如:#1 AND #2) 用鼠标进行操作

(三)History——直接输入序号 (1)抑郁症与蛋白组学的逻辑组配 #8 and #6

(三)History——直接输入序号 (1)抑郁症与蛋白组学的逻辑组配

(三) History——鼠标输入 在本页除了可以进行逻辑组配之外,还可以对检索结果进行删除、打开、保存、看详细的检索过程(detail),我们主要讲如何在history 中进行逻辑组配,我们这里选择AND

(三)History ——鼠标输入 选择and 后页面变化

(三)History ——鼠标输入 再点击#6,选择AND ,我们会看到在检索输入框中出现了#8 and #6,在检索式中出现

(三)History ——逻辑组配结果 框框显示的是#8 and #6 的检索结果 抑郁症的蛋白组学相关内容

(三)History——检索结果查看 查看检索结果

三、History 抑郁症的蛋白组学相关文献

三、History (2)抑郁症与肽组学的逻辑组配

三、History (2)抑郁症与肽组学的逻辑组配 抑郁症的肽组学相关内容

问 题 大家觉得这样的检索是否能满足实际需要? 蛋白组学(proteomics) 蛋白组(proteome、proteomic) 问 题 大家觉得这样的检索是否能满足实际需要? 蛋白组学(proteomics) 蛋白组(proteome、proteomic) 肽组学( peptidomics ) 肽( peptide ) 多肽( polypeptide )

知识扩展:抑郁症的蛋白组学 先前,我们用proteomics和proteomics[MeSH]和抑郁症主题词检索得到4记录,我们知道蛋白质组还有proteomic,proteome等词,可以用这些词语来进行检索。

知识扩展:抑郁症的肽组学

辅助检索者将检索提问限定在指定字段,进行逻辑组配,索引检索是其主要功能 (四)Preview/Index (一)界面及其功能介绍 辅助检索者将检索提问限定在指定字段,进行逻辑组配,索引检索是其主要功能 检索历史 主要功能就是可以直接进行字段组配检索以及进行索引检索 添加检索词到检索框或查看索引

(四)Preview/Index (二)具体操作 1 3 2 HIFU

(四)Preview/Index (1)Index 2 1 这里显示的经直肠聚焦超声主题词 3

(四)Preview/Index (2)Preview

(五)Limit(限制检索) (1)界面介绍

(五)Limit(限制检索) (1)界面介绍

(五)Limit(限制检索) (2)检索示例 检索作者(Wu F)发表有关聚焦超声,实验对象为人的有全文或免费全文以及摘要的文献

(五)Limit(限制检索) (2)检索示例 一共检索到4篇文献

(六) Advanced Search(高级检索)

(六) Advanced Search界面 1 检索输入框 2 3 4 5

(六) Advanced Search界面

(六) Advanced Search界面

(七)检索结果处理 检索结果处理 显示 排序 全文获取 保存

(七)、检索结果处理 (1)显示 有全文 默认显示格式为Summary 有文摘

文摘格式

设定每一个页面显示的记录数

(七)检索结果处理 (2)排序

(七)检索结果处理 (3)保存

(七)检索结果处理 (4)全文获取

从pubmed获取全文途径

部分内容未讲,如果大家有时间,可以自己去试一试这些功能

可以到图书馆网上下载读者服务栏目下载今天的讲座内容

谢谢大家!