Reaxys 搜尋使用教學 MarvinSketch使用方式

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Reaxys 搜尋使用教學 MarvinSketch使用方式 May 8, 2019 May 8, 2019 Reaxys 搜尋使用教學 MarvinSketch使用方式

搜尋設定 設定欲搜尋化合物之角色 產物 起始物 任何位置 試劑/催化劑 忽略立體結構 排除同位素 不含電荷 不含自由基 不額外加環 May 8, 2019 搜尋設定 設定欲搜尋化合物之角色 產物 起始物 任何位置 試劑/催化劑 忽略立體結構 排除同位素 不含電荷 不含自由基 不額外加環 保持分離片段 忽略原子對應 部分結構搜尋 完全相符 次結構 於雜原子上取代 於所有原子上取代 May 8, 2019 Slide 2

為了消除一些不必要的結果可使用以下方法(尤其是在部分結構搜尋) 消除不必要搜尋結果 為了消除一些不必要的結果可使用以下方法(尤其是在部分結構搜尋) 控制取代基 對於高對稱性分子,畫反應時標記反應位置 指定開、閉環之位置 May 8, 2019 Slide 3

取代基控制 Reaxys選項: 不加取代基最快的方法就是直接加入氫。 取代基位置 取代基位置 取代基位置 ①選擇要加入取代基的原子 可以有取代基:Substructure / on all atoms 無取代基:As drawn 不加取代基最快的方法就是直接加入氫。 取代基位置 取代基位置 取代基位置 ①選擇要加入取代基的原子 ②依序鍵入” . ”, “ s ” 再鍵入取代數 取代數設定(MarvinSketch) *:鎖定不取代 6:該原子最大取代數 May 8, 2019 Slide 4

在反應中使用Mapping功能 點選在左側”1”的圖案 選擇“ Manual Atom Map” 點選反應物的原子並拖曳 3 2 4 點選在左側”1”的圖案 選擇“ Manual Atom Map” 點選反應物的原子並拖曳 拖曳至產物的選定原子 原子上會出現對應標記 5 May 8, 2019 Slide 5

選擇”Edit Bond” > “Reaction Center 指定開/閉環位置 在指定位置點擊右鍵 1 選擇”Edit Bond” > “Reaction Center 2 選擇 “Make or Break” 3 May 8, 2019 Slide 6

Reaxys Generic Group M:Metal X:Halogen 使用舉例:烷化反應 Any Group G O Alkoxy AOX N Heterocyclic CHC Acyclic ACY Carbacyclic ABC no carbon Cyclic, CXX Carbocyclic CBC Cyclic CYC Heteroaryl(6) HAR Alkynyl AYL Alkenyl AEL Alkyl ALK Cycloalkenyl CEL Cycloalkyl CAL Aryl ARY Heteroacyclic AHC with ring closure G* Reaxys Generic Group只能擺於末端 使用舉例:烷化反應 May 8, 2019 Slide 7

Reaxys Generic Group 在左側視窗點選此圖後,即出現右圖 選擇所需要的Group 按下Close關閉 May 8, 2019 Slide 8

多原子搜尋方式 點擊原子 點選上方圖案,出現左側圖示 選取”Atom List” 點選元素 按下Close關閉 May 8, 2019 Slide 9

鍵結種類設定 對任意鍵結按右鍵, ”Edit Bond”>”Type” 單鍵 / 雙鍵 / 参鍵 / 苯環雙鍵 單鍵朝上 / 單鍵朝下 / 單鍵朝上or下 / Cis or Trans / Cis or Trans or 不確定 單 or 雙鍵 / 單 or 苯環雙鍵 / 雙 or 苯環雙鍵 / 任何鍵結 配位鍵 May 8, 2019 Slide 10

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