赋能科研176年 Empowering Science for 176 years

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赋能科研176年 Empowering Science for 176 years

介绍ANNA-PALM,一种使用人工神经网络快速定位宽视野图像重建超分辨率视图的计算策略. 生物技术和应用微生物学领域排名第一的研究 型期刊,收录范围涵盖生物学、生物医学、农 业及环境科学领域相关的商业、政治、伦理、 法律和社会等方面的研究。 超分辨率成像 介绍ANNA-PALM,一种使用人工神经网络快速定位宽视野图像重建超分辨率视图的计算策略. https://www.nature.com/nbt/ 基于单分子定位的超分辨率显微镜方法(例如PALM和STORM)的速度受限于需要记录数千个帧,每个帧中观察到少量的分子。在这里,我们介绍ANNA-PALM,一种使用人工神经网络从稀疏,快速获取的定位图像和/或宽视野图像重建超分辨率视图的计算策略。微管,核孔和线粒体的模拟和实验成像表明,高质量的超分辨率图像可以通过比通常需要的少两个数量级的帧重建,而不损害空间分辨率。超分辨率重建甚至可以单独应用宽视野图像,但添加本地化数据可以提高图像质量。我们展示了大于1000个视野的超分辨率成像,在〜3小时内包含> 1,000个细胞,产生跨越空间尺度从〜20 nm到〜2 mm的图像。 ANNA-PALM所提供的采集时间和样品照射的大幅减少使得高通量和活细胞超分辨率成像更加快速和温和。

关于 Springer Nature 1.0

见证近 150 年来 人类历史上的重大科学突破 1880:指纹用于刑侦技术 1896:首次发现 X 射线 1903:发现镭的放射性衰变 1925:发现非洲类人猿——人类的起源 1927:发现电子的波动性——电子显微镜的基石 1932:破解原子由质子、中子和电子组成——原子能时代的开端 1953:发现DNA的双螺旋结构——开启生物学的黄金时代 1958:首次确定蛋白质结构——蛋白质组学 1961:破解DNA到蛋白质的编码过程 1963:利用地磁证据证明大陆板块漂移学说 1978:合成第一个单克隆抗体——癌症的靶向治疗 1983:发现艾滋病毒 1985:在南极上空发现臭氧空洞——引发全球对环境问题的关注 1991:纳米碳管的合成——开启新材料时代 1992:发现30万年前的尼安德特人头骨残骸 1994:首次合成强力抗癌新药——紫杉醇 1995:首次发现太阳系外的行星 1997:克隆羊多莉诞生 2001:人类基因组计划 2006:破解安提基特拉机械装置 2012:ENCODE计划 "To the solid ground Of Nature trusts the mind that builds for aye." - WORDSWORTH

Founded: Breite Straße Today: Heidelberger Platz 出版社简介 Springer 于1842年始建于柏林,拥有176年的历史…… Founded: Breite Straße Today: Heidelberger Platz

施普林格(Springer)创立于1842年,是全球领先的科学、技术和医学出版机构,公司以创新的信息产品和服务让学术界、科研机构和企业研发部门的科研人员享有高品质的内容。施普林格拥有世界上最重要的科学、技术和医学类电子图书数据库和回溯图书档案文库之一,以及种类全面的开放获取期刊。 《自然》杂志(Nature)创刊于1869年,是全球被引用最多的科学期刊,年引用量超过50万次。作为全球首屈一指的多学科科学期刊,其影响因子高达41.456。《自然》的读者包括了数百万科学家和学生,遍及世界各地4000余家机构,每月有350万名独立用户在其网站上阅览超过800万页的内容。    麦克米伦教育(Macmillan Education)是全球第三大英语教材和课程资料出版机构,也是本地K12基础教育出版商,此外还通过帕尔格雷夫(Palgrave)出版和销售久负盛名的高等教育图书。他们共同服务于50个市场的客户,并为遍及全球120个国家的客户提供高质量的内容和创新的数字产品与服务。 BioMed Central是全球最大的开放获取出版机构,出版超过286种经同行评审的开放获取刊物,涉及生物学、生物医学和医学等领域。其注册用户超过180万,因而能够有针对性地为各种专长、职称和学科的人士带来机会。 Apress是一家致力于满足IT专业人士、软件开发者及程序员需求的技术出版机构。Apress以纸本和电子版形式出版1500余种图书,是全球IT专业人士、软件开发者和商业领袖的权威信息来源。 《科学美国人》(Scientific American)创刊于1845年,是美国持续出版历史最悠久的杂志,也是大众读者获取科技信息及政策的重要权威来源。其纸本在全球有350万读者,网站ScientificAmerican.com月平均阅览量达550万人次。 帕尔格雷夫·麦克米伦(Palgrave Macmillan)是一家面向人文及社会科学(HSS)的全球性学术与商业出版机构。作为首家不设边界的HSS出版机构,其出版篇幅不限,覆盖各种业务模式,让读者和作者从其一家出版机构就能获得最佳的专业学习和学术资料。

http://www.digibarn.com/collections/books/xerox-parc-1970-80/alto-article/

2016年出版约2700种英文期刊和超过 10000本新书,5大出版领域包括:科 学、技术、医学、商业和交通 eBook Collection with more than 200,000 titles available 电子图书文库拥有超过20万种图书 Largest open access portfolio worldwide, with over 500 open access journals 全球最大的开放获取期刊库,拥有超 过500种开放获取期刊 10000+ New Books every year Around 2,200 English-language journals and more than 8,400 new book titles in 2013, the vast majority of which are scientific Publishing partnerships with more than 500 scientific societies Growing presence in emerging markets SpringerLink One of the leading internet science portals, including more than 8 million documents, an eBook Collection with more than 160,000 titles, journal archives digitized back to the first issues in the 1840s and more than 30,000 Protocols and 290 Reference Works Open access activities Largest Open Access (OA) publisher with more than 450 OA journals, including BioMed Central, the pioneering OA publisher Pharma / Healthcare Includes portfolio of highly-regarded Adis scientific journals and newsletters in pharmacology and pharmacotherapy German-language content A leading professional medicine publisher in Germany, including renowned products such as Ärzte Zeitung, e.Akademie and springermedizin.de Leading publishing brands in business and technology such as Springer Gabler and Springer Vieweg

Springer Nature产品简介 2.0

期刊 图书 数据库 Springer Nature产品 Springer期刊 2156种 Nature品牌期刊 38种 Nature学术期刊 43种 Palgrave期刊 52种 图书 Springer Ebooks 21万册 20个学科 世界最大的STM & HSS出版社 数据库 Springer Protocols 实验指南4万多条 Springer Materials 25万种材料 zbMath 数据文摘(300多万条) Adis Insight 药学

Springer电子期刊 Springer SLCC期刊数据库收录期刊1900多种 60%以上被SCI和SSCI收录 随时出版,随时更新 IP控制,无并发用户限制 与Springer所有电子资源整合,充分实现链接功能 涵盖11个学科,部分期刊在相关学科有较高排名

Springer电子期刊—学科分类 学科组合 子学科 Science, Technology and Engineering (STE) 科技工程专辑 Chemistry and Materials Science 化学和材料科学 Computer Science 计算机科学 Earth and Environmental Science 地球环境科学 Engineering 工程学 Mathematics and Statistics 数学和统计学 Physics and Astronomy 物理学和天文学 Medicine and Life Science 生物医学专辑 Biomedical and Life Sciences 生物医学和生命科学 Medicine 医学 Social Science and Humanities 人文社科专辑 Behavioral Science 行为科学 Business and Economics 商学和经济学 Humanities, Social Sciences and Law 人文社科和法律

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SpringerLink平台检索:高级检索 AND: 与 ””:词组检索 OR:或 NOT: 非 标题检索 作者/编辑检索 选择出版日期 预览选项

在应用于推文的情感分析和情绪检测领域中,与构建自动分类器有关的主要问题之一是缺乏合适的训练集。考虑到手动注释训练集的繁琐以及直接从社交网络收集的数据中存在的噪声,本文中我们提出了一种迭代学习方法,它将远程监督与数据集修剪技术相结合。特别是,遵循“吃自己的狗食”的想法,我们已经将从不同的Twitter渠道获得的原始数据进行训练的分类器应用于相同的原始数据集,以便自动移除大多数情况。基于鹦鹉六种基本情绪模型,这种方法已经被用于获得更加优化的情感分类训练集。在取得的成果的基础上,我们认为训练集的自动过滤可以使远程监控方法在许多用例中更加有效。

SpringerLink平台检索:高级检索续 示例:美国或英国量子密码理论和 技术(非BB84) theory AND technology AND "quantum cryptography" AND (USA OR England) AND NOT (BB84) 多个检索框之间的关系为”AND” 优先级:NOT>OR>AND 布尔逻辑运算符不分大小写 如非指定,快速检索框中词与词之间 的默认关系为”AND”

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如何使用Nature.com和期刊主页 那么,接下来我们将简要介绍一下期刊主页。

那么,这就是我们的期刊主页,代表了典型范例,许多期刊主页都依循类似的模板。 分成几个部分: 点击——工具栏 点击——最新内容 点击——相关内容 点击——热门话题/热点文章/评论/最新研究 点击——想要转到最新一期期刊,您可以点击此处<点击>或此处<点击> ,那么假设我们已经点击了,您将会看到当前一期或最新一期期刊的页面。 想要访问最新一期期刊,用户只需点击所圈出的链接<点击>,我们现在将进行点击并在现实网站上进行查看。在页面上点击超级链接。

在当前期刊页面上,您将看到封面选项跳转到按类型划分的内容(点击),其中内容选项在下栏中列出(点击) 您还可以在侧栏(点击)上进行静态选择,以转到回溯内容或者期刊主页或nature.com的其他区域,从而注册期刊电子提醒(点击)或重新回到之前的期刊(点击) 好的,我们弄清楚了所有这些问题,接下来了解如何下载文章 ,这其实是一个非常简单的过程。 每篇文章都有“全文”或“pdf”选项<点击>。如果我们点击“全文”,就能够以html格式浏览文章,从而便于在线阅读。<点击>而这就是文章的全文格式,很明显您可以向下滚动页面<点击>,以查看文本主体。 如果我们点击此处用红色圆圈突出显示的pdf链接<点击>,我们就可以选择pdf或readcube<点击>。所以,用户可以选择并查看pdf(如果他们愿意可以打印出来),或者如果他们想要对文章进行注释,则他们可以在readcube上进行,Readcube当然是用来管理文章PDF的免费参考文献与引文管理器。我们点击pdf <点击>,这就是文章以PDF格式呈现的示例。 如果我们返回并点击Readcube形式,读者可以进行更多操作,点击到达下一张幻灯片。

首先,可以选择对文本进行突出显示和注释。 用户还可以通过(点击)点击右下角的红色符号来查看相关文章。(点击返回页面),正如您可以看到的,显示的是来自不同网站的内容,而不仅仅是来自《自然》的其他内容。 此外,还可以选择(点击)导出引文以供使用,(点击)查看替代计量得分,(点击)返回HTML文章页面,或(点击)创建pdf只读副本的可分享url。

值得注意的是,我们较新的期刊,如《自然-植物》,位于全新的网站上,而我们正在将所有刊物转换为这种观感。其功能与PDF和Readcube版本完全相同,然而您将注意到主页看起来略有不同,所以我将快速介绍这些内容,以展示这些网站的最佳浏览方式。

Search Functionality 那么,接下来我将会对高级检索功能进行简要介绍。

现在介绍来自新主页的检索功能。检索按钮在右上方,并为您提供了选项,您可以在这里快速检索主题词,或者进行高级检索(点击),现在我将为您演示高级检索。

ebola AND pandemic ebola OR pandemic “ebola” AND “west africa” “Smith” John Smith Smith, John Smith, J Nature Immunology 您可以通过术语<点击>、作者<点击>和标题<点击>来检索文章。您还可以通过利用发表日期参数<点击>、特定期刊<点击>,甚至卷号/页码<点击>进行检索来优化结果。 解释“术语”检索项选项 解释“作者”检索项选项 解释如果您希望在特定期刊中查找文章,您可以进一步细化,即如果您想在《自然-免疫学》中查找关于埃博拉病毒主题的文章,您可以在主题领域中保留“埃博拉病毒”,并在期刊领域中输入“自然-免疫学” 。如果您知道卷号或页码,您还可以在点击“检索”之前添加这一信息。 现在,我们来了解一下文章替代计量指标以及最后需要展示的相关内容。

期刊论文投稿简介 4.0

Publishing is an indispensable part of Scientific Research Cycle of Academic Research Researcher reads journals & books Article or books published Comes up with a research project Publishing is an indispensable part of Scientific Research Passes peer review Gets funding Writes article or books Does research

English is the international language of science Introduction Publishing in English allows you to reach the broadest possible audience(用英文发表能覆盖最广泛受众) English is the international language of science   \

Authors need to choose journals according to certain criteria Choosing a journal Authors need to choose journals according to certain criteria Factors considered are: Appropriateness of themes恰当的主题 Aims and scope期刊目标与范围 Target audience目标读者 Publishing frequency发表周期 Open-access or subscriber-based 开放获取或者订阅模式 Impact Factor影响因子 Cost版面费等花费 Publication type出版类型

影响因子 标题 实验方法 伦理审核 英语 抄袭 SCI 拒稿 摘要 图表 参考文献 实验结果 发表 投稿 Choosing a journal 影响因子 标题 实验方法 伦理审核 英语 抄袭 SCI 拒稿 摘要 图表 参考文献 实验结果 发表 投稿

Choosing a journal Choosing a journal Talk to colleagues Read the journals product page and READ THE JOURNAL Read the aims and scope of the journal, does your paper fit the aims and scope of the journal Read and follow the instructions for authors What are your priorities – e.g. speed of publication, impact factor, reach? 我们可以与自己身边的同学,导师聊聊,以得到他们宝贵的建议。从期刊的主页上找到相关的信息。仔细阅读期刊的作者须知。最后确定相关因素的优先顺序。

Choosing a journal 当选好目标期刊之后,作者可以通过期刊的网站对期刊相关信息进行了解,做最后的判断。这是Springer一本期刊的主页,上面可以看到期刊的介绍,作者须知,版权转让协议等。

Preparing your manuscript 接下来就开始根据期刊要求进行准备文章,这是一个常用的文章写作流程图,从构思开始,通过计划文章框架,初稿,修改稿,最后到成稿。 Derntl, M. (1999) Basics of Research Paper Writing and Publishing. Unpublished manuscript—Revision 2.1—September 2009, Faculty of Computer Science, University of Vienna, Austria.

Preparing your manuscript By linking, scientific writing evolves in the same way as telling a story Expanded IMRaD Title 题目 Abstract 摘要 Introduction 简述 Methods 材料与方法 Results 结果 Discussion 讨论 Conclusions 结论 Acknowledgements 致谢 References 参考文献 Appendices 附录 Fulfills reader expectations

Preparing your manuscript The order of writing your manuscript in the IMRaD format starts with the easiest The easiest to write is … 一个小小的经验分享给大家,尽管文章的顺序是图中所示,但是在实际写作中,我们可以在试验阶段就将方法与结果整理好,一边做试验,一遍整理试验方法及结果,选定目标期刊之后开始撰写讨论与简述,最后写文章的摘要和题目。这样做的好处是可以充分的节约时间,提高效率。 Methods and Results write during the research write after selecting target journal Discussion and Introduction 这里有一个小小的经验分享给大家,尽管文章的顺序是上图所示,但是在实际写作中,我们可以在试验阶段就将方法与结果整理好,一边做试验,一遍整理试验方法及结果,选定目标期刊之后开始撰写讨论与简述,最后写文章的摘要和题目。这样做的好处是可以充分的节约时间,提高效率。 Title and Abstract write last

Where to start? springer.com/authors

Springer Author Academy – Chinese version 期刊作者学院第1部分:文章撰写 期刊作者学院第2部分:投稿和同行评审 Springer英语学院 同行评审学院 书籍作者学院 开放获取学院

写好文章小诀窍——Cover Letter 文章中所阐述的问题是什么? 文章中的主要发现是什么? 该领域最近发表了哪些文章? 你的结果对该领域有何贡献? 该期刊的目标读者为何会对你的结果感兴趣? 你的结果对其他领域又和贡献? 写明通讯作者信息 如有公开数据须提供访问地址

写好文章小诀窍——标题 短小精炼 避免冗余信息 避免不必要的缩写 文章标题须与内容相符 仔细斟酌关键词! 好的标题是成功的开始!

写好文章小诀窍——摘要 摘要具体包括: 研究目的,该研究解决了什么问题 主要实验方法和材料 核心结果和结论 抓住读者的搜索习惯! 不当的摘要可能致使: 编辑忽视研究的重要性 审稿专家拒绝审稿

写好文章小诀窍——图表和图注! 图表必须搭配注解 许多读者会先看图表和图注,再看全文 排列顺序需合理 一律从上到下或一律顺时针 表头方向须保持一致 图注中要包括图中所有内容 详细的图注有利于读者对关键结果的理解 提交文章前将所有图表和图注发给同事 看是否能理解文章重点

The Life of a Journal Article Submission article will be read language polishing Research write an article submit to a journal accepted article will be published rejected revise article

“Peers?, I have no peers.”

Peer review

Peer review Journal publishing timelines can vary depending on editor and reviewer Submission to publication 3 months – 12 months Manuscript submitted Editor assigns reviewers Revise manuscript Editor elects rapid rejection OR peer review Reviewers evaluate accept, revise OR reject Article Publication!

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How do Editors deal with plagiarism? 编辑如何处理抄袭 Use plagiarism detection software 使用抄袭检查软件 During submission 投稿过程中发现抄袭 Ask authors for explanation 要求作者解释 Authors may be allowed to re-write 重写 Manuscript may be rejected 拒稿 Editor may contact authors’ institution 报告学校 After publication 发表后发现抄袭 May publish retraction or correction 撤稿或修正

How do Editors deal with plagiarism? 编辑如何处理抄袭

8 Tips for writing a good paper

Before you begin Research topics can be identified by exploiting opportunities 一开始时,你可以查阅本领域的文献。最初可以先看一些大家都感兴趣的期刊,看一些优秀的综述;当然,不要把自己的关注点局限在期刊里,看一本该领域内的书籍也是很有必要的,可以让你对该课题的历史及发展状况做一个全面的了解。 随着知识的积累,开始寻找一些令人困惑的现象 ,关于世界的未解之谜 ,新技术 ,亟需更佳解决方案的问题等。 带着准备好的问题与导师,师兄师姐交流,更可以参加一些学术会议,与该领域内某篇重要文献的作者直接进行交流。

Tip 1 Read many papers 多读文章 Know the field Join a journal club Read outside of your area to develop broad scope – think about quality of work 阅读自己研究领域以外的文献,拓宽知识面——注重研究质量 Be aware of reporting guidelines

.......Editors and reviewers will be  Tip 2 Be objective about your work 客观对待自己的研究 .......Editors and reviewers will be 

Tip 3 Write in good English 用英语好好写 Complex language is not needed. Best science is where complex ideas are expressed in a way that people not in that field can understand 用非专业人士也能看懂的方式来表述复杂的想法 Poorly written manuscripts get rejected – reviewers or editors lose patience or can’t ‘see’ the results or advance 表述不明的文章会被拒稿——审稿人和编辑会对该研究的结果丧失兴趣 Use a professional copy-editing service

The ABC of writing style

Be accurate (准确)

Be brief (简要)

Brevity (简短)

Be clear (清晰)

Be clear (清晰)

Be clear (清晰) Too much information! Difficult to pull the main claim of the paper out from the jumble of information provided. We need to be able to glance at the figures and understand them The axes labels of this graph can’t be understood without referring to the text Trend lines: add more information to an already busy graphic Reference to a previous graphic (‘Vostock’ and ‘GRIP’)

Tip 4 Decide early on where to publish 提前决定投哪本期刊 This will help shape your study, based on the goals needed for publication in your target journal. Will help define the form of study and advance required. 针对期刊对文章的要求进行研究,有助于把握研究方向和创新性。 Look at journal’s aims and scopes page 仔细阅读该期刊所涵盖领域及对文章的要求 Think about how you will structure your papers when you design your experimen 在设计实验时就开始思考文章架构 What controls and statistical tests are needed? 设置哪些对照组,使用何种统计方法 What collaborators / co authors should you work with to complete study? 需要和哪些共同作者合作才能完成该研究 What is your aim with study? What are you trying to show / prove? 研究目的是什么?想要表现或证明什么?

Tip 5 Quality is everything 质量决定一切 尽可能发表在质量最高的期刊上 Try to publish in as high a quality journal as you can. 尽可能发表在质量最高的期刊上 One great study is better than several lesser quality ones 一篇高质量的文章>多篇内容相似的一般文章 Avoid trying to publish lots of research papers that provide small amounts of new data from a single research project. 切勿将一项完整的研究分割成若干篇文章发表

Tip 6 Become a reviewer! 珍惜审稿的机会! Get used to how to critically assess science – it will help you to assess your own study 了解如何批判地评估科研成果,有助于准确评估自己的工作 Ask your supervisor if you can help with the next review they do 向导师申请帮其完成下一次的审稿工作 You’ll become familiar with issues that reviewers raise as you see other reports 看别人的审稿报告,熟悉审稿人如何提问

Tip 7 Respond to reviewers and editors 如何回复编辑和审稿人 Ensure you understand what reviewers and editors are asking for (if unsure make an informal query to the editor prior to submitting your response). 明白评审和编辑提出什么要求 Provide a full, and concise point-by-point response to the reviewers and editors. 提交完整的回复,将评审和编辑的要求逐点说明 If you disagree with an issue, provide a clear rationale for your argument within the response. Back up with references where possible. 如果对评审提出的问题有异议,需在回复中提供详细的论证,最好 附有参考文献 Give clear indication where revisions in the manuscript have been made (tracked changes, highlighted etc). 指明对文章的哪些部分进行了修改

Tip 8 Learn to live with rejection! 正确看待被拒稿 All scientific careers are faced with rejection 被拒稿是每个研究人员的必经之路 Take reviewers advice and improve the study / manuscript 根据审稿人的意见进行修改 If you are invited to resubmit, do the revisions that the reviewers request. Don’t argue for the sake of it 如果有重投的机会,一定要根据审稿人的意见进行修改,切勿进行过多争论 There are other journals 选择其他期刊 Try not to resent negative comments 不要给出负面回应和评论 You can appeal If there has been an error 如果有事实错误可以申诉 If you have new data to support your findings 用新数据来支持发现

I want to end my presentation with 2 pics. This is a typical look of reaching out to information nowadays.

翻拍自河出书房新社一九九三年的 《新文艺读本:寺山修司》 翻拍自河出书房新社一九九三年的《新文艺读本:寺山修司》 But please don’t forget, before internet, or even in today, this might be the way that inspiring great works. 翻拍自河出书房新社一九九三年的 《新文艺读本:寺山修司》

Thank you 徐希 Roger.xu@springernature.com