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FitHAS: FITS 头分析入库系统 于建军 中科院网络中心 yujj@cnic.cn
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主要内容 背景 FitHAS 体系结构 下一步工作 总结
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背景 虚拟天文台环境 海量天文数据的存储和访问 e-Science/ 网格技术
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虚拟天文台( Virtual Observatory ) 定义: – 利用先进的信息技术将各种天文研究资源以统一的服 务模式无缝透明地汇集到一起,形成一个统一的数据 密集型的网络化天文研究与科普教育平台 – 虚拟天文台吸收了网格等先进技术,将集成海量天文 资源,提供丰富的服务 核心问题是数据处理 – 海量天文数据是向天文学家和社会各界提供天文数据 服务的重要基础 – 需要在 VO 环境下有效地组织数据资源,挖掘海量数据 的潜力,从而使这宝贵的资源能为国内外的天文学家 乃至社会各界所更好地使用,真正发挥其巨大的作用
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海量天文数据 目前: – 国际上公开的天文数据已经达到上百 TB 量级 – 一些观测项目的数据日产出数量甚至以十亿甚 至十万亿的量级来计算 未来: – 将达到 PB 量级 传统的数据存储和管理的方式已很难满足 海量天文数据的存储和访问要求
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天文数据处理 在虚拟天文台环境下 – 如何对海量数据进行有效存储成为一个亟待解 决的问题 – 如何对海量数据进行快速有效的访问,也是关 系到虚拟天文台服务能力的重要课题
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e-Science 技术 定义 –e-Science is about global collaboration in key areas of science, and the next generation of infrastructure that will enable it.” –By 英国 e-Science 倡导者 John Taylor, 2001
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为什么要引入 e-Science 技术 解决现代科学研究的巨大挑战 – 科学研究问题空前复杂化 – 科学研究对象不是简单孤立系统,而是涵盖更 大的范围,跨学科 – 科研信息、数据的实时获取与处理,仿真与大 规模计算成为分析、发现和预测的主要手段 – 科学家之间密切的合作与交流
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e-Science 的意义 使得全球性的、跨学科的、大规模科研合 作,跨越时间、空间、物理障碍的资源共 享与协同工作成为可能 将改变科学家们从事科研活动的方法和模 式,极大地促进交流合作,推动科学研究 的发展 科研信息化是整个社会信息化的前卫,是 下一代互联网络技术及信息基础设施在科 研领域的率先应用
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网格技术 网格技术的最终目标: – 把整个互联网整合成一台巨大的超级计算机 – 实现计算资源、存储资源、数据资源、信息资 源、知识资源、专家资源的全面共享 – 为用户提供一步到位的服务 e-Science 的核心就是网格技术
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e-Science 发展为 VO 提供技术支持 VO 的最终目的: – 实现全球天文数据的高级共享 – 提供一整套的智能化工具 –TB 量级甚至 PB 量级大型天文数据产出项目的不断涌现 VO 的技术需求: – 对数据存储、管理、传输、检索等技术提出了更高的 要求 – 在海量分布式数据的基础上进行科学研究, 就必须有全 新的数据共享、互操作、作业调度、可视化、统计分 析、数据挖掘、安全管理等模型。 VO 的这些需求正是 e-Science 要实现的目标!!!
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VO 是 e-Science 的试验床 天文数据有着其他学科数据所无法比拟的特点: – 天文数据绝大部分是开放数据 天文数据很少有商业价值 不存在保密问题,数据和结果可自由共享,非常适合国际性的联 合研究与试验 – 天文数据是海量的数据 例如美国正计划建造的 “ 暗物质望远镜 ” ,每天观测数据高达 18TB – 天文数据是真实而归档完好的数据,并提供在线访问服务 – 天文数据是高度复杂的数据 对数据处理、数据挖掘、可视化等研究提出了挑战。 –VO 要实现对海量天文数据的融合 从 e-Science 网格基础设施的构建,到中间件的开发,最 后到 e-Science 天文应用工具的实现, VO 为 e-Science 提供 了一整套的应用需求
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天文数据现状 天文数据 – 包括星表、图像、光谱 – 天文方面的文献和观测日志 – 这些数据一般以文件或数据库形式保存 天文数据文件格式 – 有普通文本文件、 FITS 、 VOTable – 目前很多观测数据以 FITS 文件保存 – 很多数据查询服务将结果包装成 VOTable 形式 – 这些大多是直接处理文件而且是少量文件的应 用
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FitHAS 介绍 天文学灵活图像传输系统 FITS –Flexible Image Transport System – 美国 D.C.Wells 等人于 1979 年提出的 –1982 年国际天文协会 (IAU) 接受并推荐将其作为天文台之间 进行图像数据交换的标准格式。 – 在 FITS 的一般结构中,含有若干使用 ASCII 码编写的描述信 息,用于描述数据数组的结构、坐标系统以及附加参数等 –FITS 描述了数据定义和数据编码的一般方法,对一维、二维、 多维的数据类型都提供了合适的转换,不仅适用于天文数据, 还可用于其他学科的图像处理。 目前 FITS 对综合孔径、甚大阵、 CCD 观测记录,以及 CDS 发表的天文星表和 CD-ROM 星表,都提供了较好的 支持
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Fits 文件格式 基本结构 – 包含一系列逻辑记录( logical record ),逻辑记录的长 度总是 2880 字节,因此一个 FITS 文件的大小是 2880 的 整数倍。 – 一个逻辑记录中,一般会包含一个或多个头部数据单 元( Header and Data Unit , HDU ) – 每个 HDU 是由一个头部以及其所描述的数据数组所组 成。 – 在一个 FITS 文件含有多个 HDU 时,第一个头部数据单 元也就是主头部数据单元 – 基本 FITS 文件包含主头部和一个主数据数组。 Fits 文件中图像数据 – 以 FORTRAN-77 规则存储,低字节在前
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Fits 头部 FITS 的头部是通过一组卡片映象( Card image )来描述数据数组 – 每一个卡片映象都是一个 80 字节长的使用 ASCII 编码的字符串 – 这些卡片映象的最后需要以 “END” 关键词作为 结束标志,其后直到头部结束都用空格填满
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Fit 头 - 元数据 Fit 文件中包含的元数据 –FITS 和 VOTable 具有一定的结构化 特征 – 比如 FITS 文件中会出现以 ASCII 编码的用于描述图像位 置信息等的部分 – 在天文学领域,元数据是用于描述档案、档案提供的 服务、其中的数据集合、每个数据集合的结构和语义 以及数据集合中每个数据集的结构和语义。 元数据包含了一些重要描述信息 – 典型的元数据可以是用来描述星表、图像或光谱等数 据对象的信息 – 包括天文学家在检索和筛选数据文件时所需要的判断 依据,如坐标信息等; – 同时还有一些可以作为简单数据处理所使用的输入信 息
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Fits 头元数据示例
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FitHAS 需求 已初步积累数据 –China-VO 通过多年的天文观测以及与其他国家的交流,已 获得大量的天文数据,并且数据的总量还将随着各巡天项目 不断的数据产出而增长 需要整理和归档 – 为 China-VO 的海量天文数据管理的规划和决策提供理论依 据,并为进一步发布天文数据和开发数据访问服务打下良好 的基础 自动化工具支持 – 开发通用天文数据的归档和管理工具,以解决目前 China- VO 面临的海量数据归档和管理中遇到的问题,并为未来大 天区多目标光纤光谱望远镜( LAMOST )等项目的数据管理 提供有效易用的工具,提高我国天文研究工作的效率和技术 水平。
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FitHAS 意义 必要性 – 改变靠遍历访问大量的数据文件的做法 可行性 –FITS 有标准的格式约定,并且其头部记录部分采用 ASCII 格式编写, 因此可以方便地提取,也十分适于在数据库中进行灵活的查询 经济性: –FITS 头元数据占用空间较小。 – 以天文台已归档的部分 SDSS 的光谱数据为例, 1T 的 FITS 文件,存 入数据库的元数据所占用的空间仅几百 M 易用性 – 数据库 SQL 语句和结构查询方法,满足用户在海量数据的检索结 果和检索时间上的要求。 关联性 – 在入库的元数据中,还可以扩充其他重要信息,例如文件的位置, 这样就构成了元数据和对应文件之间的一一映射
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e-Science 虚拟实验室的重要工具 LAMOST 数据归档 数据中心天文数据归档 e-Science 天文协同环境的第一步 FitHAS LAMOST 数据处理 系统 LAMOST 数据分析 系统 China- VO 天文 e- Science 虚拟 实验室
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FitHAS 体系结构
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FitHAS 主要功能 FITS 头部浏览 数据库元数据表的浏览 单一 FITS 文件的归档处理向导 FITS 文件的批量归档管理向导
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FitHAS Feature FITS 头部解析和浏览 FITS 元数据和数据库中表模式的自动映射 存储 FITS 元数据的数据库表模式自动生成 单一 FITS 文件的入库归档 FITS 文件批量入库归档 数据库中元数据表的浏览 数据管理的可视化界面和完整归档管理流程 的用户向导 归档文件的过滤器筛选
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FitHAS Feature ( 续 ) 元数据记录的冲突检测与处理 – 跳过冲突记录,其他照常导入 – 更新原有记录,其他照常导入 – 全部清空再导入记录 国际化支持 文件归档参数设置 数据库统一配置
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FitHAS 目标 屏蔽不同 FITS 文件的差异 向用户提供统一的接口 对大量的 FITS 文件进行快速有效的访问和 方便的管理 有效满足 China-VO 对于海量数据存储和访 问的需求,同时具有很强的可扩展性
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FitHAS 示例 - 主界面
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FitHAS 示例 - 数据库配置
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FitHAS 示例 - 数据浏览
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FitHAS 示例 - 数据导入
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FitHAS 导入效率
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总结 FitHAS 有效解决 China-VO 所面临的从海量 数据中构造元数据层的难题 FitHAS 是实现天文 e-Science 协同环境的第 一步
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下一步工作 年底 FitHAS 2.0 正式发布 FitHAS 2.0 开发 –Grid Service 接口 – 命令行接口 – 完整性检验 – 文档压缩
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致谢 FitHAS 1.2 是由天津大学和国家天文台共同 完成开发 FitHAS 2.0 是在 1.2 基础上的进一步开发
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谢谢!
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