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基 因 芯 片 刘 琴 7 号 03 生物科学
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当夜深人静时我们会沉思 我是谁? 自己的家庭遗传了什么? 将来的癌症的危险有多大? 哪些环境因素对自己影响最大?
或许 当夜深人静时我们会沉思 我是谁? 自己的家庭遗传了什么? 将来的癌症的危险有多大? 哪些环境因素对自己影响最大? 体内生理代谢的 总体状况如何? 基因芯片技术将会帮助人类很好的回答
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生物芯片 概念: 生物芯片是将大量生物识别分子按预先设 置的排列固定于一种载体(如硅片,载玻片及高
聚物等)表面,利用生物分子的特异性亲和反应, 如核酸杂交反应,抗原抗体反应等来分析各种 生物分子存在的一种技术. 类型: 芯片实验室、基因芯片、蛋白芯片 特点:高通量、微型化、自动化
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基因芯片 概念:基因芯片又称DNA芯片,是最重要的一种 生物芯片。它是指将大量基因探针分子固定于支 持物上,然后与标记的样品进行杂交,通过杂交 信号的强弱判断靶分子的数量。 意义:用该技术可将大量的基因探针同时固定于 支持物上,所以一次可对大量核酸分子进行检测 分析,从而解决了传统核酸印迹杂交技术操作复 杂、自动化程度低、检测目的分子数少、效率低 等不足。 应用:基因表达谱测定、突变检测、多态性分析、 基因组文库作图及杂交测序、
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基因芯片研制的主要关键技术包括: 合适基因载体的选择、 高精密度点样仪器的研制 靶基因扩增、 基因与载体的偶联和固定技术、 杂交探针的制备与高效标记、 杂交动力学研究 基因芯片的工作原理:芯片上集成的成千上万的 密集排列的分子微阵列,也就是许多已知碱基顺 序的DNA片段,根据碱基互补序列的单链DNA片 段相结合,能够在短时间内分析大量的生物分子, 使人们快速准确地获取样品中的生物信息。
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意义:基因的结构或种类决定物种,基因的功能
或表达则决定生命,即生物的生、老、病、死。 通过基因芯片技术可准确识别异常蛋白等,可以 在短时间内观察病变细胞并分析出数十种由于基 因异常引发的疾病。 特点: A高度并行性:有利于基因芯片所示图谱的快速 对照和阅读,效率大为提高。 B多样性:提供了样品的多指标测定。 C微型化:对样品的需要量非常少,而且还能节省 试剂用量,降低成本 D自动化:减少人力投入,并保证了质量。
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基因芯片的优点: 1采用了平面微细加工技术,可实现大批量生产。 通过提高集成度,降低单个芯片的成本。 2结合微机械技术,可把生物样品的预处理,基因 物质的提取、扩增,以及杂交后的信息检测集成为 芯片实验室,制备成微型、自动化、无污染、可用 于微量试样检测的高度集成的智能化基因芯片。
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基因芯片的应用: 一、基因芯片在临床医学方面的应用 二、基因芯片在药物研究中的应用 三、芯片在测序及基因绘图方面的应用 四、基因芯片在军事、司法方面的应用 五、基因芯片在农林业中的应用 六、基因芯片在其他方面的应用
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用途:生物芯片具有可同时并行分析各种生物分
子的优点,非常适合于基因表达分析和基 因分型分析。 生物芯片是一项高新技术,主要是指通过微 加工技术和微电子技术在固格体芯片表面构建的 微型生物化学分析系统,以实现对细胞、蛋白质、 DNA以及其他生物组分的准确、快速、大信息的 检测。 芯片上集成的成千上万的密集排列的分子微 阵列,能够在短时间内分析大量的生物分子,使 人们快速准确地获取样品中的生物信息,效率是 传统检测手段的成百上千倍。
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历史: 基因芯片的创意来自于计算机芯片,是在 美国硅谷开始出现的另一种芯片。它和计算机芯 片一样,具有超微化、高度集成、信息贮存量大 等特点,所不同的是,计算机芯片采用的是半导 体集成电路,而基因芯片是以基因片段作为“探 针”进行工作。 基因芯片将改变生命科学的研究方式,革新 医学诊断和治疗,极大地提高人口素质和健康水 平。
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中国基因芯片的研究现状与发展策略 中国生物芯片主要研究生产单位情况 1清华大学生物芯片研发中心(北京)程京博士 研究方向:胎儿脑发育基因表达系统的生物芯片和 关于水稻器官发育的基因芯片。 2第四军医大学与陕西超群科技股份有限公司 (西安) 研究方向:肽芯片和基因芯片,用于胃病、 性病、 肝病等常见病和多发病的临床检验健康人群检查。 3联合基因科技公司与第一军医大(上海) 是中国目前规模最大的基因组研究、应用和产品 开发企业。
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中国在生物芯片领域取得成就 1开展了多种方法玻片修饰技术、固定技术的研究, 以满足cDNA在不同修饰玻片上的高效率固定、杂 交的需要,成功地制作了每平方厘米超过25000点 的DNA芯片。 2多病毒基因检测芯片的研究,主要完成了4﹣6种 病毒基因的PCR共扩增、DNA探针的固化和简易 信号检测技术研究。 3高灵敏度的DNA芯片检测系统研究,现已初步建 立了DNA芯片检测仪,包括成像系统、软件和样品 平台等
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4完成了光敏保护试剂的全合成、对胸腺核苷 (T)5′﹣羟基的光敏保护N﹣酰基化和2′﹣脱 氧核苷的制备。 5开展了微型PCR装置、毛细血管电泳微芯片等方 面的研究工作,包括毛细血管制作、光学检测系统 温度控制系统等方面的研究工作。
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中国的基因芯片的发展方向 1发展具有自主知识产权的高密度基因芯片制备的 关键技术,发展一个可进行高密度基因芯片加工基因芯片的加工设备和工艺。 2发展和研制的基因芯片设计和分析软件。 3发展出高集成度的生物活性单元微阵列芯片,包括DNA、PNA、多肽、蛋白质、病毒、细胞组和细胞以及微小生物组织等生物活性微阵列芯片。
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中国的基因芯片发展规划 1成为国际上最大的cDNA阵列制造者。 2成为一个cDNA阵列的研究和服务中心。 3把生物芯片技术产业化。
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中国生物芯片计划上市公司 (一)上海医药和张江高技 (二)复星实业 (三)哈高科 (四)河池化工 (五)友好集团和上海实业联合公司 (六)星湖科技
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中国发展生物芯片产业具有的优势与存在的问题
优势: 1丰富的基因资源储备。 2中国生物芯片的市场空间巨大。 问题: 1目前国内的生物芯片产品技术壁垒偏低,尚未 体现基因芯片高通量检测的主要技术优势。 2基因芯片本身在加工工艺、技术要求方面仍不 完善。 3由于基因研究水平限制,国内诊断芯片存在重复 开发的问题。
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存在问题: 4受成本的限制,目前国内在研的针对肝炎等疾病 的诊断芯片的市场空间有限。 5国内生物芯片开发的政策性风险。 6生物芯片的产业化基础仍很薄弱。
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人类所有疾病都直接、间接与基因有关 人类疾病可分为 一、单基因病:其主要病因是某一特定基因的结构 发生改变,如白发病、多指病、早老症。 二、多基因病:这类疾病的发生涉及两个以上基因 或表达调控的改变,如高血压、冠心病、糖尿病。 三、获得性基因病:这类疾病由病原微生物通过感 染将其基因入侵到宿主基因引起。 随着越来越多的遗传病和其他疾病的相关致病 基因的发现,通过生物芯片进行疾病的诊断、预防 和设计针对性的治疗方案将越来越明显。
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一、疾病预防 A:利用基因芯片对结婚的男女双方和怀孕三个月 以上的胎儿进行检测,能非常准确而有效地诊断 出各种传染疾病和遗传疾病,从而有效地预防新 生儿的出生缺陷,保护母婴健康。 B:利用基因芯片对婴儿进行DNA检验,这样可以 确定这个婴儿将来最可能得什么病,发病期在什 么时间,可能对什么药物过敏。有了这些信息, 就可以根据这个新生命的具体情况进行一系列的 预防措施,从而达到使之健康长寿的目的。 C:微芯片技术能帮助人类检查和预防癌症
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二、临床诊断 基因芯片在感染性疾病、遗传性疾病和肿瘤 等疾病疾病的临床诊断上有着巨大应用前景和市 场。基因诊断芯片是进行高通量、大规模、灵敏 准确的诊断和检测技术 基本运作过程:将基因片段固定于载体上制 成基因芯片,然后将其与荧光标记产物一起放入 自动杂交系统,让两者按碱基配对的原则进行固 相杂交,然后通过激光共聚焦扫描仪对芯片上的 荧光信号进行扫描,最后用计算机系统对每一探 针上的荧光信号作比较和检测,并显示出有关的 信息。在这个过程中,基因芯片就犹如一面超高 倍率放大镜,映射出被测患者基因结构与正常人 基因结构上的细微差异,从而诊断出疾病。
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一药物筛选 A 通过基因芯片的筛选,可以了解中药在基因水平 的调控机制,为中药的应用奠定坚实的理论基础。 B 通过基因芯片的筛选,能为中药的进一步开发和 设计提供理论指导,有利于研制单位重新组织中 药复方中的有效组分,得到专一性更强、疗效更 显著、毒性更低的新药。 C 基因芯片技术可以筛选药物的毒副作用和致畸 致突变作用。 意义:应用生物芯片来进行药物筛选寻找,查检药 物的毒性或副作用,用芯片做大规模的筛选研究可 以省略大量的动物试验,缩短药物筛选所用的时间 从而带动创新药物的研究和开发。
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二 靶标的确立 人体是一个复杂的网络,疾病的发生发展必 然牵涉到网络中很多环节。很多疾病都是多因素 作用的结果,往往不能归结于单一因素变化的结 果上来。选择合适的靶标是基于机理药物筛选乃 至定向合成的关键因素之一。 基因芯片可以从疾病及药物两个角度对生物 体的参量同时进行研究以发掘筛选靶标即疾病相 关分子并同时获取大量其他相关信息。 利用基因芯片可比较正常组织(细胞)及病变 组织(细胞)中大量相关基因表达的变化,从而发 现一组疾病相关基因作为药物筛选靶标。
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三 合理用药 临床用药中常可见到这样的现象:患同种疾病 的患者对同一种药物产生不同的反应。如药物在某 些患者身上产生应有的疗效,有的则发生各种形式 的变态反应、药物耐受及不良反应。 缘由:生命演化过程中基因的趋异进化和遗传多态 性为药物的临床应用添加了复杂性。一方面,小分 子药物在体内作用的靶分子不可能具有绝对专一性, 另一方面,不同个体内所含结合药物的载体蛋白、 代谢药物的酶存在差异,因而机体对药物的处理也 会不同。 因此,根据基因型为病人选择特定的药物将是 药物治疗上一次质的飞跃。
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过程:因人施治 a 合理用药的基础是对病原菌有明确的诊断。 基因芯片检测技术不仅能够迅速报告是何种病原 体感染,而且能测定病原体是否产生耐药性、对 哪种抗生素产生抗性,医生可以据此有的放矢制 定科学治疗 方案。 b为减少由于个体差异对治疗带来的不良反应, 利用基因芯片,通过研究与药物相对应的特殊靶向 基因,寻找能够预示个体对于药物敏感性的基因, 从而制定出个人药物敏感谱。 c影响药物体内效应的一个重要因素是肝脏的代 谢酶系统,而造成酶功能差异的则是决定其结构几
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及功能的DNA序列。如果将与药物代谢有关的主
人之间肝代谢酶的基因学差异,从而有助于临床 新药的开发和临床指导用药,因人施治。 四在微生物菌种鉴定及致病机制中的作用 a用于研究感染病毒基因组。如分析感染病毒的 多态性,了解病毒抗药基因机制 b监测感染宿主基因表达改变,研究病毒致病机制, 进行细菌基因分型与菌种鉴定,筛选监测细菌抗药 性基因等。
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一杂交测序 A 未知序列的DNA与大量的寡核苷酸集合的杂交、 B 形成完整的双链体(具有目标DNA)的寡聚物的 鉴定与分析。 C 重建DNA序列 二基因绘制 基因组的物理性图谱有助于建立基因座与克隆文 库中运载它们的DNA片段的关系。通过测定基因与 基因连接图谱和它们相关的染色体界标,如带型、 染色体重排间的物理性关系,生物上相关的基因和 它们的产物能够快速地被分离用于进一步研究。
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a在军事方面的应用: 在战场上对人体的残骸的鉴定 b在司法领域的应用: DNA指纹鉴定——破案 亲子鉴定
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利用基因芯片技术,对有重要经济价值的农作
物和水果等的基因组进行大规模高通量的研究,筛 选农作物的基因突变,并寻找高产量、抗病虫、抗 干旱、抗冷冻的相关基因,以开发高科技含量,高 附加值的新品种。也可利用基因芯片技术筛选、开 发高效低毒的生物农药。 a基因表达的检测 b发现新基因 c基因多态性的检测 d作物杂交优势预测 e鉴别假冒伪劣种子
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a在空间科学上的用途 采用生物芯片技术,许多研究工作就可以在太空 中进行,成本低,研究效果却非常好. b商品检验、检疫 针对商检的内容和对象的不同,检验、检疫基 因芯片可分为四种:食品卫生检验芯片、植物检验 芯片、动物检验芯片、转基因植物检测芯片。 c环境保护 检测污染微生物或有机化合物对环境、人体、 动植物的污染和危害,同时也能够通过大规模的 筛选寻找保护基因、制备防治危害的基因工程药品 或能够治理污染源的基因产品。 d基因表达分析 e寻找新基因和基因功能研究
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谢谢欣赏
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