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第十一章 细胞核与染色质.

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1 第十一章 细胞核与染色质

2 1781年 Trontana发现于鱼类细胞; 1831年,Brown发现于植物。 大小:植物1-4μm,动物5-10μm。正常细胞核质比NP≈0.5,分裂期细胞NP>0.5,衰老细胞NP<0.5。

3 形状:圆形,胚乳 (网状)、蝶类丝腺 (分支状)。
位置:细胞中央 ,成熟植物细胞的边缘。 数目:通常一个,成熟的筛管和哺乳动物红细胞(0)、肝细胞、心肌细胞(1-2)、破骨细胞(6-50)、骨骼肌细胞(数百)、植物毡绒层细胞(2-4)。

4 结构:①核被膜、②核仁、③核基质、④染色质、⑤核纤层。
功能:①遗传、②发育。

5 第一节 核被膜

6 一、核被膜是双层膜结构 外核膜:来源于内质网,附有核糖体。 核周隙:宽20-40nm,与ER腔相通。
内核膜(核纤层):内核膜内表面的纤维网络,支持核膜,并与染色质、核骨架相连。

7 核被膜 外核膜 核孔 核纤层 凝聚染色质 细胞核

8 核纤层由核纤肽构成,属中间纤维,分A、B、C三种.
作用: 1.保持核的形态: 2.参与染色质和核的组装:M期核纤层被磷酸化,核膜解体。B型核纤肽与核膜残余小泡结合,A型溶于胞质。分裂末期,核纤肽去磷酸化重新组装,介导核膜重建。

9 A型核纤层蛋白的结构

10 二、核孔复合物 由至少50种,450个不同的pr构成,称为核孔复合体(nuclear pore complex,NPC)。
一般哺乳动物细胞约3000个核孔。 电镜下观察核孔呈圆形或八角形。

11 抽提后核孔胞质面的结构

12 抽提后核孔质面的结构

13 胞质纤维 核孔复合体 中心栓 胞质环 外核膜 内腔 核被膜 内核膜 核质环 核篮纤维 核篮 终环

14 三、物质运输与信号序列有关 核定位信号(NLS,nuclear localization signal):引导蛋白进入细胞核,受体蛋白为核转运蛋白importin,4-8个氨基酸组成,含Pro、Lys和Arg。完成核输入后不被切除。 第一个被确定的NLS是病毒SV40的T抗原,其NLS为: Pro-Pro-Lys-Lys-Lys-Arg-Lys-Val

15 核输出信号(NES,nuclear export signal
),引导RNP输出细胞核,受体蛋白为核转运蛋白exportin。 Ran蛋白(ras related nuclear protein ) ,属G蛋白,调节货物复合体的解体或形成。 蛋白输入过程参见下图:

16 核孔蛋白质输入过程 核质 细胞质

17 核孔蛋白质尾部包裹的金颗粒进入细胞核 细胞核 Mitochondrion 核孔 金粒 细胞质

18 第二节 染色质 1848年,Hofmeister发现于鸭跖草的小孢子母细胞。 1879年,Flemming提出Chromatin。
1888年,Waldeyer提出Chromosome。

19 染色体与染色质 染色质是指间期细胞核内由DNA、 组蛋白、非组蛋 白及少量RNA组成的线性复杂结构,是间期细胞遗传 物质存在的形式。
染色体是指细胞在有丝分裂或减数分裂过程中,由 染色质聚缩而成的棒状结构 。

20 一、染色质的化学组成 组成:DNA、组蛋白、非组蛋白、少量RNA。 比例:1:1:(1-1.5):0.05。

21 (一)染色质DNA 基因组(genome) DNA一级结构的多样性 DNA二级结构的多形性

22 (1)基因组 生物体的单倍体基因组所含DNA总量称为C值。 C值悖论:生物基因组的大小同生物在进化上所处的地位高低无关:
生物基因组中的遗传信息 : 编码序列 调控序列

23

24 (2)DNA一级结构的多样性 非重复DNA序列 中度重复DNA序列 高度重复DNA序列

25 非重复DNA序列 一类是负责蛋白质氨基酸组成的信息,以三联体密码(triplet)方式进行编码,巧妙地解决了在有限的小空间贮存大量遗传信息的矛盾。

26 中度重复DNA序列 另外一类是中度重复序列DNA,一般指10份到几百份拷贝的DNA序列,通常是非编码序列。它包括一些蛋白质基因和RNA基因 短分散重复元件(short interspersed elements,SINEs) 长分散重复元件(long interspersed elements,LINEs)

27 串联重复排列的组蛋白基因簇

28 高度重复DNA序列 卫星DNA(satellite DNA),重复单位长5~100bp ,主要分布在染色体着丝粒部位
小卫星DNA(minisatellite DNA)重复单位长12~100bp,重复3000次之多,每个小卫星区重复序列的拷贝数是高度可变的 微卫星DNA(microsatellite DNA)重复单位序列最短,只有1~5bp,串联成簇长度50~100bp的微卫星序列

29 DNA双螺旋3种构像:①B-DNA、②Z-DNA、③A-DNA。
                                                    DNA的构象现已知有 A,B,C,D,E,T,Z 7种。

30 3种构像:①B-DNA、②Z-DNA、③A-DNA。 3种基本元素:
①自主复制序列(ARS);②着丝粒序列(CEN) ;③端粒序列(TEL)。 YAC 和 BAC含上述3种成分,用于转基因。 YAC :酵母人工染色体(yeast artificial chromosome, YAC) BAC:细菌人工染色体(Bacteria Artificial Chromosome BAC)

31 染色体的三个关键区域 端粒序列 自主复制序列 着丝粒序列 着丝点 复制泡 姊妹染色体

32 (二)组蛋白 带正电荷,含Arg,Lys,属碱性蛋白,共5种,分为两类:
核心组蛋白(core histone):H2A、H2B、H3、H4; 连接组蛋白(linker histone):H1。

33 结构:高度保守,尤其是H4。 H1多样性,具有属和组织特异性。
核心组蛋白由球形部和尾部构成,球形部借Arg与磷酸二脂骨架间的静电作用使DNA分子缠绕在组蛋白核心上,形成核小体,尾部含有大量Arg和Lys,为转译后修饰的部位。 H1多样性,具有属和组织特异性。

34 功能:帮助DNA折叠、复制;调节基因表达。
(三)非组蛋白 序列特异性DNA结合蛋白。特性: 带负电,属酸性蛋白。 整个细胞周期都合成,组蛋白只在S期合成。 能识别特异DNA序列,结合籍氢键和离子键。 功能:帮助DNA折叠、复制;调节基因表达。

35 二、从DNA到染色体 1.核小体(nucleosome):一种串珠状结构,由核心颗粒和连结线DNA两部分组成,通过酶消化实验建立。
核小体单位包括约200bp的DNA、一个组蛋白核心和一个H1。

36 由H2A、H2B、H3、H4各两分子形成八聚体,构成核心颗粒;
DNA分子以左手螺旋缠绕在核心颗粒表面,每圈80bp,共1.75圈,约146bp,两端被H1锁合; 相邻核心颗粒之间为一段60bp的连接线DNA。

37 在低盐亲水介质中展开的染色质,示串珠状的核小体(JA,Gall 1981)

38 通过核小体长度压缩7倍,形成11nm纤维。 2.螺线管 电镜下观察用温和方法分离的染色质是直径30nm的纤维构成的螺线管,由核小体螺旋化形成,每6个核小体绕一圈,长度压缩6倍。

39 螺线管 核小体核心颗粒 核小体

40 30nm 11nm

41 染色体多级螺旋模型 DNA H2A、H2B、H3、H4 压缩7倍 核小体 螺旋化 + H1 压缩6倍 螺线管 超螺旋化和卷缩 压缩40倍
超螺线管 压缩5倍 折叠螺旋化 染色单体

42

43 对更高级染色体包装方式,至今尚不明确。 目前多认为30nm的纤维折叠为一系列的环(loop)结合在核骨架上(或称染色体骨架),结合点是富含AT的区域 。

44 三、异染色质和常染色质 常染色质是具有转录活性的染色质,结构疏松,电子密度低。 异染色质的特点: ①凝缩状态,无转录活性、是遗传惰性区。
②在细胞周期中表现为晚复制、早凝缩。 ③分为两类:结构异染色质、兼性异染色质

45 巴氏小体(barr body) 箭头示巴氏小体 雌性哺乳动物细胞中一条异固缩化的X染色体。 人胚胎发育16天后出现巴氏小体。

46 第三节 染色质的复制与表达 一、染色质的复制与修复 1、复制
电镜照片显示一个刚复制的DNA 区段,其两条子链上都已包装成核小体,说明DNA的复制和核小体的复制是偶联的。

47 异染色质复制过程模式图

48 2、修复与基因组的稳定性 裸露的DNA容易突变,需要对其修复. 修复好的DNA必须及时与组蛋白结合,防止DNA断裂。

49 二、染色质的激活与失活 (一)、染色质的激活 1、染色质重塑 (DNA结构与核小体相位 的变化) SWI/SNF

50 2、组蛋白修饰 改变染色体结构,影响转录活性 核小体表面改变,便于调控蛋白结合

51 2、组蛋白修饰 磷酸化 乙酰化 甲基化 甲基化 甲基化 泛素化 51

52 2、组蛋白修饰 组蛋白修饰种类 乙酰化-- 一般与活化的染色质构型相关联,乙酰化修 饰大多发生在H3、H4的 Lys 残基上。
甲基化-- 发生在H3、H4的 Lys 和 Asp 残基上,可以 与基因抑制有关,也可以与基因的激活相关,这往往取 决于被修饰的位置和程度。 磷酸化-- 发生H1的 Ser 残基,一般与基因活化相关。 其他修饰 组蛋白乙酰 转移酶 组蛋白组乙酰化酶

53 2、组蛋白修饰 组蛋白修饰种类 甲基化-- 发生在H3、H4的 Lys 和 Asp 残基上,可以 与基因抑制有关,也可以与基因的激活相关,这往往 取决于被修饰的位置和程度。 磷酸化-- 发生H1的 Ser 残基,一般与基因活化相关。 其他修饰

54 二、染色质的激活与失活 (二)、染色质的失活 1、X染色体的失活
在雌性哺乳动物中,两条X染色体有一条是失活的,称为X染色体的剂量补偿(雄性H4发生乙酰化,雌性不发生乙酰化)。

55 X染色体失活的机制

56 二、染色质的激活与失活 (二)、染色质的失活 因靠近异染色质而造成 的基因表达沉默。
2、位置花斑效应(position effect variegation, PEV) 因靠近异染色质而造成 的基因表达沉默。 果蝇眼睛的有些区域没有颜色,而另一些区域则呈红色,因为有些细胞中的 white基因位于异染色质旁边而失活,而另一些细胞中的基因仍是有活性的

57 二、染色质与基因调控 (一)染色质模板的转录(真核生物) 基因转录的模板不是裸露的DNA,染色质 是否呈疏松结构,即是否处于活化状态是决
定转录功能的关键 RNA聚合酶被认为是用“核小体犁”(SWI /SNF复合物)来解除组蛋白和DNA间的相互 作用。

58 转录开始被激活 乙酰化 染色质解凝聚,露出组蛋白尾巴 形成转录起始物 SBF与介导因子结合 SBF与近启动子结合
与增强子结合 乙酰化 染色质解凝聚,露出组蛋白尾巴 形成转录起始物 SBF与近启动子结合 转录的激活与转录起始物的形成

59 (二)转录因子介导的调控 通用转录因子(非特异转录因子) 参与转录 调控的因子 特异转录因子 转录激活因子 (DNA-蛋白质) 转录抑制因子
调控的因子 特异转录因子 转录激活因子 (DNA-蛋白质) 转录抑制因子 特点: 至少含3个功能结构域:DNA结合功能域,转录活性功能域,其他转录因子结合功能域; 能识别并结合上游调控区中的DNA元件(顺式作用元件)结合; 对基因表达有正性或负性调控作用,即激活或阻遏基因表达。 目前研究较广泛的有:识别TATA区的TFⅡD,识别CAAT区的CTF,识别GGGCGG的SP1,识别热激蛋白启动区的HSF。

60 (三)DNA甲基化的调控 DNA甲基化(methylation)是指在甲基化酶(methylase)的作用下,将一个甲基 (methyl)添加在DNA分子中的碱基。基上,最常见的是加在胞嘧啶上,形成5-甲基胞嘧啶,用mC来表示。 。 SAM : S -腺苷甲硫氨酸

61 CpG岛(CpG island) CpG常成簇存在,人们将基因组中富含CpG的一段DNA称为GC岛(GC island)。
5'-mCpG-3' 3'-GpCm-5' 甲基化改变了DNA各构象间的平衡,从而影响了DNA专一序列与相应蛋白的结合; 将转录因子识别的DNA序列,转变为转录抑制物的结合位点。

62 (四)组蛋白修饰的调控 组蛋白中被修饰氨基酸的种类、位置和修饰类型被称为组蛋白密码(histone code)。 松散 紧密
H3,H4的乙酰化 H3,H4的去乙酰化

63 组蛋白修饰 63

64 四、染色质与表观遗传 基因组含有两类遗传信息 一类是传统意义上的遗传信息,即DNA序列所提供的遗传信息; 另一类是表观遗传学信息,它提供了何时、何地、以何种方式去应用遗传信息的指令。

65 在外界影响下基因组在表达水平上的不同导致了双胞胎 分道扬镳。
通常到了老年,双胞胎相似性会减弱 双胞胎男孩一样爱零食 在外界影响下基因组在表达水平上的不同导致了双胞胎 分道扬镳。 主要原因DNA的甲基化和组蛋白的乙酰化作用让基因的 表达增强或者减弱

66 表观遗传学 1. 概念:基因的DNA序列不发生改变的情况下, 基因的表达水平与功能发生改变,并产生可遗传 的表型。
3. 表观遗传学的现象: (1) DNA甲基化 (2) 组蛋白修饰 (3) MicroRNA (4) 染色体重塑

67 第四节、染色体 一、染色体相关的术语 随体 次缢痕 短臂 主缢痕 长臂 端粒

68 染色单体:中期染色体由两条染色单体组成,两者在着丝粒的部位相结合。
核仁组织区(NORs):构成核仁,位于染色体的次缢痕区,但并非所有的次缢痕都是NORs。

69 核仁组织者中心形成核仁 10个染色体伸展展出的rDNA环互相接触甚至融合的区域构成核仁 隔离的细胞核是由破坏了的染色体环构成 机械剪切
核被膜

70 端粒(telomere):由高度重复的短序列组成。
作用: 维持染色体稳定性。 起细胞分裂计时器的作用。DNA每复制一次端粒减少50-100bp。 人类 四膜虫 拟南芥

71 (二)染色体的数目 性细胞染色体为单倍体,用n表示;
体细胞为2倍体,以2n表示,还有一些物种的染色体成倍增加成为4n、6n、8n等,称为多倍体。 染色体的数目因物种而异。

72 (三) 着丝粒的结构 着丝粒(centromere)和着丝点(kinetochore)是两个不同的概念。 着丝粒包含3个结构域:
1. 着丝点结构域(kinetochore domain) 位于着丝粒的表面,包括三层板状结构和围绕外层的纤维冠(fibrous corona)。

73 着丝粒 纤维冠 着丝点结构 中央结构域 配对结构域

74 2 . 中央结构域 位于着丝点结构域的下方,含α卫星DNA。 3 . 配对结构域 位于着丝粒内层,中期连结染色单体。 4 . 着丝点蛋白 用ACAs发现的着丝粒蛋白主要有6种(CENP A-F)

75 (四)核型与带型 1. 核型:物种中期染色体特征的总和(染色体数目、大小、形态)。
2. 带型:染色体经理化因素处理后染色,呈现稳定的带纹(band)。 分带技术分两类:一类是产生的染色带分布在整个染色体的长度上如:Q、G和R带,另一类是局部性的显带,如C、Cd、T和N带。

76 人类雌性G带型 G带显示的湿染色体三富含AT的区域

77

78 人类雌性C带型

79 人类雌性C带型 显示的着丝粒异染色质

80 (五)几类的特殊的染色体 1. 多线染色体: Balbiani(1881)发现于摇蚊幼虫唾腺细胞,特点:
①体积巨大,是由于核内有丝分裂的结果; ②多线性; ③体细胞联会; ④横带纹; ⑤膨突和环。在幼虫发育的某个阶段,多线染色体的某些带区疏松膨大,形成膨突(puff),或巴氏环(Balbiani ring)。用H3-UdR处理细胞,发现膨突被标记,说明膨突是基因活跃转录的区域。

81 多线染色体

82 2. 灯刷染色体 见于鱼类、两栖类、爬行类双线期卵母细胞,双线期是卵黄合成的旺盛期。染色体主轴两侧有侧环,状如灯刷,故名。侧环是转录活跃的区域。 3 . B染色体 Randolph (1928 )把生物的正常染色体叫做A染色体,把形态和行为不同为A染色体的超数染色体称B染色体。

83 2. 灯刷染色体

84 3. B染色体

85 第五节 核仁 间期细胞核内呈圆球形的结构,一般1-2个。功能是转录rRNA和组装核糖体亚单位。
第五节 核仁 间期细胞核内呈圆球形的结构,一般1-2个。功能是转录rRNA和组装核糖体亚单位。 蛋白合成旺盛和分裂增殖较快的细胞有较大和较多的核仁,反之核仁很小或缺失。 核仁在分裂前期消失,末期又重新出现。

86 一、核仁形态 1 纤维中心区域(FC):是致密纤维包围的低电子密度的圆形结构,主要成分为RNA聚合酶和rDNA。
2 致密纤维组分(DFC) :呈环形或半月形包围FC,由致密纤维构成,是新合成的RNP。 3 颗粒组分区域(GC) :由直径15-20 nm的颗粒构成,是不同加工阶段的RNP。

87 蛋白质液体物质,悬浮着纤维成分,包含有酶和蛋白质等
4、核仁相随染色质 核仁相随染色质分为两部分, 一部分位于核仁周围,称为核仁周染色质,属异染色质, 一部分位于核仁内,为常染色质,即核仁组织区,是 rDNA所在的位置。 5、核仁基质 蛋白质液体物质,悬浮着纤维成分,包含有酶和蛋白质等

88 核仁结构

89 二、核仁的功能 (一)结构 含40%蛋白、60%RNA,2亚单位构成。分为70S和80S两类。
大小亚单位只在合成蛋白时结合在一起,合成终止后解离。 多个核糖体结合在一条mRNA上,称多聚核糖体。

90 (二)、核仁的功能 核糖体的生物发生从核仁纤维组分开始, 再向颗粒组分延续。 这一过程包括rRNA的合成、加工和核糖体亚单位的装配。
45SRNA的转录 rRNA前体的加工 核糖体亚单位的组装

91 45SRNA的转录 RNA聚合酶I 合成方向 外部的转录间隔序列 ETS 内部转录间隔序列 ITS

92 转录时RNA聚合酶沿DNA分子排列,产物排列呈羽毛状。rRNA首先出现在纤维部,而后转向颗粒部。

93 rRNA前体的加工

94 rRNA前体的加工 ①切除5′端的前导序列,即外部的转录间隔序列(ETS),使45S的初始转录变成41S的中间产物; ②从41S的中间产物中18S和5.8S之间的内部转录间隔序列(ITS),产物分别为20S(含18S rRNA片段)和32S; ③部分rRNA前体的加工 :两种途径中的32S中间产物中的5.8S和28S之间进行退火,形成发夹结构. ④最后修正:通过外切酶等将20S中残余的ITS切除,还要将已退火的32S中的ITS切除掉.

95 5SrRNA定位在常染色体,合成后被转运至核仁区参与大亚基的装配 。
细胞核 20SRNA 32SRNA 核糖体蛋白

96 第六节 核基质 nucleoskeleton
核基质(nuclear matrix )或称核骨架,为真核细胞核内的网络结构,是指除核被膜、染色质、核纤层及核仁以外的核内网架体系。

97 (一)核基质的组成 ①非组蛋白性纤维蛋白,10多种次要蛋白,包括肌动蛋白和波形蛋白,后者构成核骨架的外罩。已知三种支架蛋白(SCⅠ、SCⅡ、SCⅢ),SCⅠ是DNA拓朴异构酶Ⅱ。 ②少量RNA(0.5%)和DNA(0.8%,) 。 ③少量磷脂(1.6%)和糖类(0.9%)。

98 (二)核骨架的功能 1. DNA复制:提供DNA聚合酶结合位点 。 2. RNA复制:提供RNA聚合酶结合位点。 3. 与染色体构建有关
30nm的染色质纤维就是结合在核骨架上,形成放射环状的结构,在分裂期进一步包装成光学显微镜下可见的染色体。

99 染色质结合在核骨架上


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