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本地PubMed检索平台 ································································································ 扩展功能简介 张士靖 华中科技大学同济医学院 027-8362675 zhangsj9999@163.com.

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1 本地PubMed检索平台 ································································································ 扩展功能简介 张士靖 华中科技大学同济医学院

2 G&G PubMed 本地PubMed引文数据库,是济南泉方与华中科技大学,在PubMed的基础上结合SCI以及谷歌学术搜索开发而成。
索语法,检索界 面及检索结果 与PubMed一致 在期刊的影响因子上,参考了SCI发布 的期刊引证报告JCR G&G 在被引用的次数上, 参考了谷歌学术搜索 GS(Google Scholar) 在检索结果上增加了 数据分析,并参考了 GoPubMed统计功能

3 参考SCI影响因子 PubMed检索 参考谷歌学术搜索 各项数据分析 参考谷歌学术搜索 参考GoPubMed统计分析 引证和参考文献只有部分有数据

4 在检索结果界面,与美国官网PubMed相比, 具有以下特点:
⑴ 继承PubMed检索语法,检索界面及检索结果与PubMed一致; ⑵ 部分文献可以显示参考文献以及被引用的施引文献列表; ⑶ 增加了按源期刊的影响因子或按论文的被引频次过滤; ⑷ 增加了知识演进图谱、指纹共词分析等; ⑸ 参考了GoPubMed的统计分析功能; ⑹ 与本单位图书馆资源及馆际互借系统相关联,可在线申请全文。

5 扩展功能简介 举例: 糖尿病肾病方面的文献 糖尿病肾病(Diabetic nephropathy,DN)可谓是糖尿病患者的终极杀手。据中国之声《全国新闻联播》报道,中国目前糖尿病患者人数高达1.14亿,它是继肿瘤、血管病变之后第三大严重威胁人类健康的慢性非传染性疾病,具有高致死率、高致残率和高医疗花费的特征。 长期以来,在人们的印象中,2型糖尿病发病的两个关键因素一直是胰岛素抵抗和(或)胰岛素分泌不足,然而,严格控制血糖、血压水平以及阻断肾素-血管紧张素系统的传统治疗方法不能完全阻止DN的发生,说明还有其它因素。 那么还有那些因素呢?在本地PubMed中检索"Diabetic Nephropathies"[Mesh],在检索结果界面,点击右侧“知识图谱”

6 在检索结果界面,点知识图谱

7 知识演进图谱分X轴和Y轴,其中,X轴是年份,Y轴是发文数量,从图中可以看到各个研究方向(主题词)在各个年份的研究文献的数量。系统默认推荐50个主题词,我们可以点“更多主题词”来了解更多:

8 在更多主题词中,根据研究领域的不同,分为多个大类,我们点击“Amino Acids, Peptides, and Proteins”《氨基酸,肽类和蛋白质》

9 可以看到: Hemoglobin A, Glycosylated;
Glycosylation End Products, Advanced; Cholesterol, HDL; Serum Albumin; C-Reactive Protein等,目前研究者众多,而这些词基本上都与炎症相关。 从文献报道中可以看出,越来越多的研究表明炎症过程可能在DN的发病机制中占据重要地位,其涉及的致炎因子有望成为DN及其他炎症性疾病新的治疗靶标之一。 炎症以炎症细胞浸润,黏附分子、炎症趋化因子和致炎因子表达增强,C反应蛋白(C-reactive protein,CRP)水平升高为特征。我们通过知识演进图谱,可以了解一下C反应蛋白的研究历史:

10 C-Reactive Protein/metabolism
最早一篇关于 C反应蛋白/代谢的文献 从图中可以看到,主题词: C反应蛋白最早一篇文献,发表于1996年,是国际著名医疗机构丹麦Steno糖尿病研究中心的Myrup, B等,发表于《Thrombosis research》(血栓形成研究),该刊影响因子为3.13,2003年时,又有两篇文章发表,其中一篇发表于《Diabetologia》(糖尿病学),该刊影响因子为6.49,从此关于此方向的研究多了起来。 如果我们想进一步去了解,有关C反应蛋白的高影响因子的论文或者高被引次数的论文,那么,在本地PubMed的检索结果界面,我们还可以看到,高IF论文和高TC论文的按钮。

11 从图中可以看出,2004年的一篇发表于《Kidney International》(国际肾病学),该刊影响因子为7.92:
Potential cardiovascular risk factors in chronic kidney disease: AGEs, total homocysteine and metabolites, and the C-reactive protein. Kidney Int Jul;66(1): 随后又有一些高影响因子的期刊报道这方面的文献。 2004年发表的 一篇高影响因子文献

12 高被引次数论文,这里的被引次数,其数据来源于谷歌学术搜索,2003年的一篇发表于《Diabetologia》(糖尿病学)的文献,目前,已被引用了199次,是该领域内的经典文章,想了解该领域,不可不看:
Diabetic nephropathy is associated with low-grade inflammation in Type 1 diabetic patients. Diabetologia Oct;46(10): 2003年发表的 一篇高被引次数文献 被引次数更新周期为一个月

13 作为普通的一名临床大夫,如果您更关心的,目前就有哪些药物用于DN的治疗,那么,可以使用到知识演进图谱中的“设置”功能:
因为,我们要了解就有哪些药物可治疗该病症,因此,可以勾选“副主题词过滤”中的“therapeutic use”,然后再点击“更多主题词”勾选我们需要了解的相关药物:

14 从上图中可以看到,治疗DN的药物主要为Angiotensin-Converting Enzyme Inhibitors(血管紧张素转换酶抑制剂,ACEI);Antihypertensive Agents(抗高血压药);Insulin(胰岛素);Hypoglycemic Agents(降糖药);Angiotensin II Type 1 Receptor Blockers(血管紧张素Ⅱ1型受体拮抗剂,ARB)等,具体的药物有Losartan(洛沙坦);Captopril(卡托普利);Enalapril(依那普利)等。

15 从发文量来看,1965年就有了关于Insulin的报道,截止到目前的发文量为367篇,1987年出现了第一篇关于ACEI的报道,截止到目前的发文量为801篇,2002年出现了第一篇关于ARB的报道,截止到目前的发文量为199篇(上图加粗显示者),从时间上来看,Insulin持续的在研究和报道,而ACEI在2005年发文量大幅下降之时,正在ARB发文量大幅增长之时,而实际情况也正是,ARB为该系统的一类新药,与ACE I相比具有许多独到之处。 作为一种新药,如果想进一步了解,这种新药ARB与DN之间的更多研究和应用,那么我们还可以使用“指纹共词”来进一步了解。指纹共词是两个主题词共同出现在一组文献中的篇数,并将演进路径显示出来的一种方法。在检索结果界面,我们即可以看到这个按钮。

16 从图中可以看出,ARB与DN同时出现在一篇文献中的时间最早为2004年,2014年(截止到2014年3月份)共同出现在同一篇文章的数量为5篇,它们是:

17 这5篇文献均来源于大名鼎鼎的《N Engl J Med》(新英格兰医学杂志),该刊与《Lancet》(柳叶刀)、《JAMA》(美国医学会杂志)均属于世界医学权威期刊,如此多篇幅的报道ARB与DN,很有可能该方面将成为未来研究的热点。

18 致谢Acknowledgements 本地PubMed引文数据库,是济南泉方与华中科技大学,在PubMed的基础上结合SCI以及谷歌学术搜索开发而成。在开发的过程中也得到了很多专家的大力支持,尤其是重庆医科大学的赵老师、南方医科大学的张老师、山东大学医学院的易老师、广州医科大学的闫老师等等,在此表示致谢! 我们致力于为教学、科研、临床提供一套优秀的检索工具,但限于我们的水平,恳请在座各位给予我们指导,提出您宝贵的建议,包括在原有的基础上改进、完善,甚至提出全新的功能等,请于济南泉方的贾新志联系:

19 一个好的检索工具,让您的科研事半功倍 数据来源: (NSF)美国科学基金会统计数据 19

20 谢谢大家!Good Luck! 张士靖(贾新志代讲)
································································································ 欢迎批评指正!! 张士靖(贾新志代讲) 华中科技大学同济医学院


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