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不一样的PubMed---Pubmedplus

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Presentation on theme: "不一样的PubMed---Pubmedplus"— Presentation transcript:

1 不一样的PubMed---Pubmedplus
郑友红 北京唯博赛科技有限公司

2 Pubmedplus的介绍 来自于Pubmed,从Pubmed官方授权的接口获取数据。认可Pubmed的所有检索模式,检索结果和Pubmed完全一样。 弥补Pubmed的缺憾,展示Pubmed不能实现的功能。 提供Pubmed站内大数据聚类分析的功能。

3 Pubmedplus与Pubmed相同点
PubMed支持限定检索,自由词自动转换主题词等功能;Pubmed认可的检索式都可以在系统检索,检索结果也与Pubmed完全一致。 读者使用中文检索式,由内部词典翻译为英文再检索;

4 一亿四千万引文与参考文献,数据可以分析

5 实现了:使用Pubmed数据库进行检索,检索结果按文献被引用次数排序。

6 一亿四千万引文与参考文献,数据可以分析

7 一亿四千万引文与参考文献,数据可以分析

8 引文范围:仅收集Pubmed收录的期刊文献。 Pubmedplus收录了一亿六千万条引文与参考文献,可以帮助读者更好的检索自己的课题。
引文的数量和来源 引文范围:仅收集Pubmed收录的期刊文献。 Pubmedplus收录了一亿六千万条引文与参考文献,可以帮助读者更好的检索自己的课题。

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12 中文主题词导航。

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15 本地馆藏库与Pubmed检索对接 实现了本馆资源整合:读者检索文献后,把读者导向本馆购买的、可以直接打开全文的链接。
万方,知网收录的文献,Pubmed没有提供链接;部分Springer,ACS,wiley等常规数据库收录的文献,Pubmed有遗漏链接; Pubmed提供了链接,读者不清楚本馆哪些有权限。

16 提供期刊链接,三大馆

17 期刊导航,免费+权限

18 概念的聚类分析 Pubmed收录了2470万文献目次,每天增加的文献超过1000篇,每个课题检索到的文献结果太多,对结果进行概念的聚类分析可以帮助读者检索,节约时间。 对检索结果进行聚类分析可以帮助读者了解研究热点、发现新的课题。

19 聚类分析 作者

20 聚类分析 作者

21 聚类分析 作者

22 聚类分析 作者

23 聚类分析 作者

24 聚类分析 作者

25 聚类分析 作者

26 聚类分析 作者

27 聚类分析 作者

28 聚类分析 作者

29 聚类分析:常用聚类 汇总的机构 作者缩写:提取作者缩写信息。 文献主题词:Mesh词。 城市:规范化的城市名称。
Substance:Pubmed自有的字段。 症状:规范化的 治疗方法:规范化的 分子功能:基因本体的一部分。 生物过程:基因本体的一部分。 基因蛋白:规范化处理的蛋白名称。

30 聚类分析 作者

31 聚类分析 作者

32 聚类分析:其他聚类 机构:未规范化的机构,用于查机构的异名。 单词:文献出现频率最高的单词。 词组:文献出现频率最高的词组。
物种:研究对象。 解剖:文献涉及到的解剖位置。 食品:文献涉及到的食物。 Chemical:药物,未规范。 Gene Ontology:基因本体,未规范。 Gene Protein:基因蛋白,未规范。

33 共词分析 共词聚类分析法采用聚类的计算方法,对文章中共现的词对(主题词或关键词)的关联性进行运算,将关系密切的词聚集归类,从而达到挖掘隐含信息的目的。聚类原理的分析方法具有客观性、科学性、敏感性的特点。 “主题词与主题词”,“主题词与作者”,“作者与作者”

34 主题词与主题词聚类:掌握领域内的研究热点
耐药性与肿瘤

35 共词性分析 数据巨大

36 聚类分析 作者

37 三个例子:利用Pubmed完成三个目标 本机构文献的时时在线跟踪,学科竞争力分析对比。 投稿前选刊。 矫正检索式,跟踪课题的最新研究。

38 聚类分析 本机构分析,异名

39 聚类分析 本机构分析,异名

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42 二:如何利用PubMedPlus进行选刊
举例: 一位神经科的大夫想发表一篇IF值2-3的病例报告,发表在哪些期刊上比较合适?

43 二:如何利用PubMedPlus进行选刊
思路: 1.搜索近3年发表在PUBMED上的文章; 2.通过过滤筛选①神经科学;②病例报告;③IF值, 得到与课题相关的所有文献; 3.通过聚类分析“期刊”,找出合适期刊。 4. 对期刊评估,最终选出适合的期刊

44 检索2011至2013年pubmed收录文章

45 影响因子2-3过滤

46 过滤病例报告

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48 聚类分析“期刊”

49 期刊信息

50 期刊信息

51 期刊信息 按收录各国家文献的百分比进行分析

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53 三种期刊分析对比表 某神经内科教授想发表一篇影响因子是2-3的病例报告,选哪些期刊投稿比较合适?
 The Journal of neuropsychiatry and clinical neurosciences Journal of the neurological sciences Muscle & nerve 中文名称 神经精神病学和临床神经科学杂志 神经科学杂志 肌肉与神经 学科排名 81 87 85 录用难易 较易 命中率约33.33% 容易 审稿周期 较慢,6-12周 平均4月 一般,3-6周 出版国家 United States Netherlands 年出版文献数 187 436 344 影响因子(2012) 2.397  2.243 2.314 国家文献百分比(近三年) 美国 % 中国 0.754% 美国 17.502% 中国 10.266% 美国 % 中国 2.548% 某神经内科教授想发表一篇影响因子是2-3的病例报告,选哪些期刊投稿比较合适? 思路:查找最近3年、影响因子是2-3、神经内科的病例报告方面的期刊

54 三、修正检索式,辅助检索查全 查准:优先主题词检索 并不是所有的词都有主题词 只能检索Medline数据(有主题词标引的数据) 不能检索:
出版商提供的数据:[PubMed - as supplied by publisher] 加工中的数据:[PubMed - in process]

55 三、修正检索式,辅助检索查全

56 非小细胞肺癌最后的检索式 ("carcinoma , non-small-cell lung"[MeSH Terms] OR "non small cell lung cancer"[tiab] OR "nsclc"[tiab] OR "squamous cell carcinoma"[tiab] OR "non small cell lung carcinoma"[tiab] OR "adenocarcinomas"[tiab] OR "lung adenocarcinoma"[tiab] OR "squamous cell carcinomas"[tiab]) 这样的检索式检索出的结果更加全面

57 谢谢大家! 敬请批评指正!


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