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环系转换 (Ring Transformations) ——基于构效关系的变换思路

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1 环系转换 (Ring Transformations) ——基于构效关系的变换思路
主讲人:刘营营 资料查找:黎献桦 PPT制作:谢虞清

2 ·何为环系转换? ·研究环系转换有何意义?
所谓的环系转化,即是当活性分子含有环状体系时,环状结构可以被打开、扩大、缩小,也可以有其他多种修饰方式,甚至删除。相反,非环状体系可以关环、连接或包含在环状体系中。

3 分子变换 同系物变换 生物电子等排 构象变换 环系变换 光学异构 挛药合成 先导化合物 分子变换 首创药物 模拟创新 /优化 ………..

4 ·何为环系转换? ·研究环系转换有何意义?
对环系进行修饰——环链转换、缩环扩环、重组环系等方法是设计新型的药物类似物和阐明药物-受体相互作用的高效方法。因此,系统的总结环系转换的基本思路,有助于在模拟创新和先导化合物优化中提高衍生物结构的筛选效率。

5 环系转换的三种基本思路: 一、模拟法(analogical) 二、剖裂法(disjunctive) 三、拼接法(conjunctive)

6 一、模拟法(analogical) 不影响环状体系的整体复杂性,通常得到与母体化合物非常接近的类似物(me-too化合物)。包含环链转换,环缩小或扩大和其他的环转换。 1.开环模拟(analogy by ring opening): 设计合成环状活性分子的开环类似物。 2.关环模拟(analogy by ring closure): 在一个指定的结构中,将开链化合物环合在已有的环系基础上,产生另一个环状体系,得到指定构象的刚性化合物,是寻找生物活性构象的有效方法。 3.其他模拟方法(other analogies): 用于避开专利保护,得到新的me-too产物。

7 开环模拟: 模拟法·开环模拟·潜在环系 (1)潜在环系
开链化合物可能经代谢酶的氧化或脱水作用关环,在体内转换为有活性的环状衍生物,那么开链化合物是一个潜在的环状化合物,其实质上是前药。 代谢 氯胍 环氯胍 (在肾脏中的排出速率太快)

8 开环模拟: 模拟法·开环模拟·假环状物 (2)假环状物 不可逆开链化合物在体内并不环合,但是它的构象与环状活性分子的构象具有一定的相似性。
a,雌二醇的开环类似物: 雌二醇 双脱氢道益酸 阿仑雌酚 己烯雌酚

9 关于芳香开环类似物的报道很少。设计假环化合物模拟母体化合物的芳香性和平面性具有一定的难度,这限制了其在药物设计中的应用。例如:
模拟法·开环模拟·假环状物 关于芳香开环类似物的报道很少。设计假环化合物模拟母体化合物的芳香性和平面性具有一定的难度,这限制了其在药物设计中的应用。例如: 双芳基萘酚 水杨醛肟 蒽醛肟

10 Maximal decrease in blood pressure(%)
模拟法·开环模拟·假环状物 b,克罗卡林(Cromakalim): 克罗卡林的开环类似物,采用柔性大的开链化合物替代吡咯啉酮,所得化合物的活性是克罗卡林的1/3 Cromakalim Open-chain analog Dose mg/Kg,p.o. 0.3 1.0 Maximal decrease in blood pressure(%) 39±4 22±5

11 模拟法·关环模拟 关环模拟: 在一个指定的结构中,将开链化合物环合在已有的环系基础上,产生另一个环状体系,得到指定构象的刚性化合物,是寻找生物活性构象的有效方法。 关环模拟可能会引入额外的手性中心,或者环合化合物的构象与开链化合物构象不一致。

12 模拟法·关环模拟 a,舒必利(Sulpiride)侧链: 苯甲酰胺类药物,一些含有二乙基氨基乙基侧链,其他一些含有N-乙基吡咯甲基侧链(如舒必利sulpiride),它可以看做是硫必利的侧链环合类似物。 舒必利 硫必利 构象限制性类似物 IC50=1.6μM 瑞莫必利,IC50=1.6μM

13 模拟法·关环模拟 b,GABA样激动剂: 从γ-氨基丁酸(GABA)到反式-4-氨基-巴豆酸,再经环合生成四氢吡啶甲酸,最后生成稠环化合物THIP,使得柔性GABA分子最终转化为刚性分子THIP,THIP是代谢稳定的强效GABA激动剂。 GABA 反式-4-氨基-巴豆酸 四氢吡啶甲酸 THIP

14 模拟法·关环模拟 c,β-阻断剂的环状类似物: 传统的β-阻断剂具有许多的药理活性,如β-阻断作用、奎尼丁样活性、局部麻醉活性和降血压活性。通过对两个方向的关环,得到具有单一药效的构象限制性衍生物。 克罗卡林 降血压活性: 钾离子通道激活剂 传统β-阻断剂 强效β阻断作用 苯并恶唑

15 模拟法·关环模拟 d,利莫那班(Rimonabant)类似物: 利莫那班是研究最前沿的一个大麻受体(CB-1)拮抗剂,用于治疗肥胖症。将构象限制引入到四取代的吡唑环中,由于可能产生有利的生物活性构象,从而有可能提高化合物的结合力和对CB-1亚型的选择性。 mCB-1 Ki =1.8nM mCB-2 Ki =514nM Selectivity CB1/CB2=285/1 mCB-1 Ki =2050nM mCB-2 Ki =0.34nM Selectivity CB1/CB2=1/6000 利莫那班 mCB-1 Ki =14.8nM mCB-2 Ki =227nM Selectivity CB1/CB2=15/1 mCB-1 Ki = nM mCB-2 Ki =21nM Selectivity CB1/CB2=60000/1

16 其他模拟: 模拟法·其他模拟·扩环和缩环 (1)扩环和缩环 扩环和缩环可以看做环状化合物的同系物衍生。
a,巴比妥类(Barbiturics)和阿片类(opioids): 环巴比妥 哌替啶 乙庚嗪 庚巴比妥

17 模拟法·其他模拟·扩环和缩环 b,伊诺加群(Inogatran)和美拉加群(melagatran): 凝血酶抑制剂的典型序列是D-Phe-Pro-Arg,模拟了凝血酶的天然底物——纤维蛋白原。在开发候选药物时,将脯氨酸的吡咯环分别替换为它的扩环和缩环等价物。 美拉加群 脯氨酸 伊诺加群

18 模拟法·其他模拟·扩环和缩环 c,氧化震颤素(oxotremorine): 氧化震颤素和它的开环类似物Oxo-2是毒覃碱部分激动剂,有很强的M2受体激动剂样作用。但哌啶类似物Oxo-Pip具有预期的拮抗活性,因此,将吡咯环变成哌啶环,能够将部分激动剂转变成拮抗剂。 Oxo-2 激动剂 Oxotremorine 激动剂 Oxo-Pip 拮抗剂

19 其他模拟: 模拟法·其他模拟·环系重组 (2) 环系重组
下面介绍的4种分子修饰方法是更奇异的设计和修饰起始环系的方法,它们也许可以产生一些有用的衍生物,避开过于拥挤的研究领域。 1)简单环系转变为螺环、双环或三环类衍生物 2)裂分苯并稠环化合物 3)重建环系 4)环拆分

20 1)简单环系转变为螺环、双环或三环类衍生物
模拟法·其他模拟·环系重组 1)简单环系转变为螺环、双环或三环类衍生物 螺环变换 桥环变换 胍乙啶 Takeda Lumiere

21 1)简单环系转变为螺环、双环或三环类衍生物 现已运用类似方法设计合成了许多抗惊厥药物加巴喷丁(gabapentin)的类似物。
模拟法·其他模拟·环系重组 1)简单环系转变为螺环、双环或三环类衍生物 现已运用类似方法设计合成了许多抗惊厥药物加巴喷丁(gabapentin)的类似物。 Gabapentin X = O,S,SO,SO2,NR2

22 拆分一个稠环化合物,尤其是苯并稠环化合物,有时可以提高化合物的溶解度,但对化合物的药代性质和长期毒性影响很小。
模拟法·其他模拟·环系重组 2)裂分苯并稠环化合物 拆分一个稠环化合物,尤其是苯并稠环化合物,有时可以提高化合物的溶解度,但对化合物的药代性质和长期毒性影响很小。 Benperidol Spiroperidol

23 模拟法·其他模拟·环系重组 3)重建环系 驱虫药物噻苯咪唑的苯并咪唑环被拆分后,再将两个五元环连接,得到了四咪唑,也是一个强效驱虫剂。D1-选择性多巴胺激动剂DPTI到SKF38393的转变包含了苯并稠环部分,二者均能被多巴胺D1-受体识别。 四咪唑 噻苯咪唑 DPTI SKF38393

24 模拟法·其他模拟·环系重组 4)环拆分 从天然产物凯林(khellin)出发,设计合成了两种心血管药物,一种是苯并吡喃酮,另一种是苯并呋喃,两种类型化合物均有抗心律失常和抗心绞痛活性。 Khellin Benzofuran 3-Methychromone Chromonar Amiodarone

25 环系转换的三种基本思路: 一、模拟法(analogical) 二、剖裂法(disjunctive) 三、拼接法(conjunctive)

26 二、剖裂法(disjunctive) 模拟法·剖裂法
从多环化合物(常常是天然产物)出发,不断地简化起始活性分子,以提取化合物活性所要求的最小结构信息。 a,可卡因衍化的局部麻醉药: 从可卡因到普鲁卡因(procaine),保留了局部麻醉活性,没有了致幻副作用。 Cocaine Eucaine Procaine

27 天然产物阿斯利辛(Asperlicin)是强效CCK拮抗剂,其中苯并二氮卓和四氢吲哚环是产生CCK拮抗活性的重要结构因素。
模拟法·剖裂法 a,缩胆囊素拮抗剂: 天然产物阿斯利辛(Asperlicin)是强效CCK拮抗剂,其中苯并二氮卓和四氢吲哚环是产生CCK拮抗活性的重要结构因素。 Indolylcarboxamide Asperlincin

28 环系转换的三种基本思路: 一、模拟法(analogical) 二、剖裂法(disjunctive) 三、拼接法(conjunctive)

29 三、拼接法(conjunctive) 模拟法·拼接法
基于产生或添加辅助环系限制分子的方法,限制起始柔性分子的构象,强加于分子一个指定的构象和构型,设计出比先导结构更复杂的分子。 a,谷氨酸NMDA和AMPA受体拮抗剂: AMDA 受体拮抗剂 (S)-Glutamic acid NMDA 受体拮抗剂 D-AP5 CGS 19755 PD

30 自从1980年氟哌酸(Norfloxacin)作为抗菌药物上市以来,合成了大量的衍生物。其中,拼接方法发现了强效的四环类似物。
模拟法·拼接法 b,氟哌酸类似物: 自从1980年氟哌酸(Norfloxacin)作为抗菌药物上市以来,合成了大量的衍生物。其中,拼接方法发现了强效的四环类似物。 Norfloxacin Tetracyclic analog

31 模拟法·拼接法 c,褪黑素类似物: 褪黑素中吲哚环分别与二氢吲哚、四氢异喹啉苯并氮杂卓稠合,生成四环类似物,相对于MT1受体而言,具有选择性。从六元环到七元稠环体系的变化,化合物由激动剂活性转变为拮抗活性。 激动剂 褪黑素 拮抗剂 激动剂

32 环系转化 剖裂法 模拟法 开环模拟 潜在环系 假环状物 关环模拟 其他模拟 扩/缩环 环系重组 拼接法

33 什么都不会消失,什么都不会创造,一切都在转化中。
“ Rien ne se perd, rien ne se crée, tout se transforme. ” ——Antoine Lavoisier (1743–1794) Yes it is! 2-{2,6-Bis(3,3-dimethyl-1-butyn-1-yl)-4-[3,5-di(1-pentyn-1-yl)benzyl]phenyl}-5,5-dimethyl-1,3-dioxane

34 THANK YOU!


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