Untypable NPEV 腸病毒 月份無明顯差異 266/1444=18% 1.

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1 Untypable NPEV 腸病毒 月份無明顯差異 266/1444=18% 1

2 Untypable NPEV 266 untypable NPEV 第一階段 傳統RT-PCR ? 個陽性 ? 個陰性
CODEHOP (EV + HPeV) ? 個陰性 ? 個陽性 2

3 Untypable NPEV 266 untypable NPEV RT-PCR 陽性 177 sample 62無IFA試劑
實驗室 CA12 ECHO25 ECHO3 ECHO33 ECHO7 HRV 總計 三總 6 8 14 中榮 1 5 7 台大 成大 林口長庚 高長 4 2 12 19 慈濟 彰基 10 40 62 RT-PCR 陽性 177 sample 62無IFA試劑 115有IFA試劑 實驗室 CA10 CA2 CA21 CA4 CA5 CA6 CA8 CB2 CB3 CB4 ECHO11 ECHO30 總計 三總 5 4 2 1 17 中榮 台大 成大 7 16 林口長庚 18 22 高長 10 慈濟 11 12 6 45 彰基 20 3 9 115 中榮CA4確實為untype 3 CA21, CA8抗血清是2013年分送

4 Untypable NPEV 266 untypable NPEV 陰性 RT-PCR 89 sample 陽性
CODEHOP (EV + HPeV) 177 sample 62無IFA試劑 115有IFA試劑 28 陰性 27無IFA試劑 34有IFA試劑 61 陽性 實驗室 CA10 CA16 CA21 CA2 CA4 CA6 CA6+HPeV1 CB2 ECHO30 ECHO3 EV68 HRV 陰性 總計 三總 1 5 3 14 26 中榮 2 4 成大 30 林口長庚 高長 10 13 慈濟 6 9 18 彰基 11 12 22 28 89 4

5 結論 Untypable NPEV (N=266)結果顯示： 56%有IFA試劑 (n=149)
腸病毒 結論 Untypable NPEV (N=266)結果顯示： 56%有IFA試劑 (n=149) 33%無IFA試劑(但可從分生檢驗得知) (n=89)，當中七成為HRV (n=62) 11%陰性 (n=28) 檢驗流程、病毒量 培養陰性/其他種類病原體 (ex: Saffold, Picornaviridae…) 5

6 基因定序進度報告 腸道及腹瀉病毒實驗室 （一）流感病毒 （二）腸病毒 6

7 WHO公布北半球2014-2015疫苗株 2014-2015 WHO 建議的疫苗與2013-2014 相同
H3 (Victoria/361 Texas/50) 抗原性考量 northern  It is recommended that A/Texas/50/2012 is used as the A(H3N2) vaccine component because of antigenic changes in earlier A/Victoria/361/2011-like vaccine viruses (such as IVR-165) resulting from adaptation to propagation in eggs. 7

8 流感病毒 8 8

9 Oseltamivir susceptibility
流感病毒 H3目前主要流行型別 比對分型皆屬於Victoria/361 抗原性/基因性無特殊變化 Antigenicity and Drug resistance of Influenza viruses in Taiwan, (according to tested date) Time (Week) Antigenicity Oseltamivir susceptibility pandemic H1N1 H3N2 Flu B (Vic) Flu B (Yam) pandemic H1N1 Flu B Tested No. LR* LR Resistant W9/2014 2 0　 3 1 W40/2013 ~ W09/2014 36 49 1　 12 11 4 7 5 製表日為2013/02/21 (依發病日製表) 9

10 Variation of Influenza A (H3N2) in Taiwan
A/Victoria/361/2011-like : Merged on May 2011 Y94H N145S 10

11 Oseltamivir susceptibility
流感病毒 H1流行幅度不高 比對分型皆屬於Pandemic(H1N1) 抗原性無特殊變化 Antigenicity and Drug resistance of Influenza viruses in Taiwan, (according to tested date) Time (Week) Antigenicity Oseltamivir susceptibility pandemic H1N1 H3N2 Flu B (Vic) Flu B (Yam) pandemic H1N1 Flu B Tested No. LR* LR Resistant W9/2014 2 0　 3 1 W40/2013 ~ W09/2014 36 49 1　 12 11 4 7 5 製表日為2013/02/21 (依發病日製表) 11

12 Oseltamivir susceptibility
流感病毒 Flu_B:Yamagata B流感流行幅度低 流行型別與抗原性出現變化 Antigenicity and Drug resistance of Influenza viruses in Taiwan, (according to tested date) Time (Week) Antigenicity Oseltamivir susceptibility pandemic H1N1 H3N2 Flu B (Vic) Flu B (Yam) pandemic H1N1 Flu B Tested No. LR* LR Resistant W9/2014 2 0　 3 1 W40/2013 ~ W09/2014 36 49 1　 12 11 4 7 5 製表日為2013/02/21 (依發病日製表) 製表日為2013/02/21 (依發病日製表) B型流感的流行型別有變化 (變回WISCONSIN?) 12 12

13 Yamagata lineage 2011-2012 Taiwan 13 (2013-2014, 2014-2015)
( ) ( ) 13

14 Yamagata lineage 14

15 Oseltamivir susceptibility
流感病毒 Updated: 2014/02/28 病毒抗原及抗藥性監視 Antigenicity and Drug resistance of Influenza viruses in Taiwan, (according to tested date) Time (Week) Antigenicity Oseltamivir susceptibility pandemic H1N1 H3N2 Flu B (Vic) Flu B (Yam) pandemic H1N1 Flu B Tested No. LR* LR Resistant W9/2014 2 0　 3 1 W40/2013 ~ W09/2014 36 49 1　 12 11 4 7 5 目前尚未偵測到抗藥性病毒株。 無檢測到克流感抗藥株 *LR: low reactor From W40/2013, the reference strains were updated to the components of the influenza vaccine for the Northern Hemisphere (A/California/7/2009(H1N1), A/Victoria/361/2011(H3N2), B/Massachusetts/2/2012-like). B/Brisbane/60/2008 was used for the reference strain of influenza B Victoria lineage. All the severe cases of influenza, and some of the sporadic and outbreak cases will be selected for antigenicity and drug resistance tests. 15

16 流感病毒---結論 2014-2015年的北半球WHO建議疫苗株並無異動。
2014年的流行以H3 (A/Victoria/361/2011)為主，其次為H1及少數的B型流感 (B/Brisbane/60/2008 (Vic), B/Wisconsin/01/2010(B/Yam))。 流感病毒的抗藥性基因監測並沒有發現抗藥株。 2013年流感病毒基因序列比對： H1屬於A/California/7/2009 (H1N1)pdm09,此病毒已持續流行5年( )，抗 原性與疫苗株A/California/7/2009相似。 H3屬於A/Victoria/361/2011, 此病毒自2011年5月後流行，至今累積有Y94H (site E) 、 N145S(site A)、N278K(site C)突變，但抗原仍未改變。 B型流感僅少數幾例，型別則包含B/Massachusetts/02/2012 (Yam)與 B/Wisconsin/01/2010(B/Yam)，以及B/Brisbane/60/2008 (Vic) 。 台灣流行株與疫苗株比較，H3與H1相符，而B型流感除了有B/Brisbane/60/2008 (Vic)與疫苗株不符外，2014年後流行Yamagata lineage 已轉換成 B/Wisconsin/01/2010-like，且抗原性偏離疫苗株，需密切注意。 16

17 已收到的腸病毒株型別與數量 同期數量 年度 目前流行幅度不大，今年以CA10占多數 2013年：CA6；2012年：EV71
通報型別 2012 2013 2014 CA10 8 1 25 CA2 27 2 6 CA5 4 CA4 9 3 CA16 NPEV 17 CA21 CA6 43 CB2 CB3 CB4 EV71 73 ECHO4 ECHO11 ECHO6 CB5 總計 129 87 42 目前流行幅度不大，今年以CA10占多數 2013年：CA6；2012年：EV71 CA10為主要流行型別之一，去年夏秋季出現較高幅度 2011 CA10 CA9 EV71 CA4 CB5 38.6% 14.6% 13.0% 8.7% 7.4% 2012 CA2 NPEV CA6 48.5% 21.7% 8.1% 5.4% 3.9% 2013 CB4 35.7% 18.4% 11.4% 5.5% 5.0% 2014 CA5 CA16 59.5% 14.3% 9.5% 7.1% 4.8%

18 CA10 不同地域CA10 親緣樹狀圖 lineage5 lineage4 lineage3 lineage2 lineage1 腸病毒
18 lineage1

19 CA10 1998~2014年 台灣地區CVA10 親緣樹狀圖 lineageC-1 lineageC-2 lineageB
腸病毒 1998~2014年 台灣地區CVA10 親緣樹狀圖 lineageC-1 lineageC-2 lineageB 台灣CA10可分為三大群 近年病毒株皆屬於同一群內 Endemic lineageA 19

20 EV-71 (2009-2013) 今年尚未監測到，但 EV-71於去年底仍有監測到，已有一年的低流行幅度，今年需密切注意
腸病毒 今年尚未監測到，但 EV-71於去年底仍有監測到，已有一年的低流行幅度，今年需密切注意 B5 (B5x), C4基因亞型 B5b 桃園/台中/彰化 1-2月，B5x 台中/彰化/嘉義/桃園/花蓮 5-12月，C4 桃園/台中 7/11月 B5b B5c B5x C5 C4 C2 20

21 腸病毒---結論 今年腸病毒的流行幅度不高，型別以CA10為最多，序列與近 年病毒株類似。
(2013年腸病毒以CA6 為最多，其次為NPEV, CB4, CA4) 今年尚未偵測到EV-71，需要留意。 (2013年亦僅少數幾例，屬於B5(B5cB5x)及C4基因亞型) 21

22 Thanks for your attention
22 22 22

23 未能分型腸病毒(28件) 腸病毒實驗室 第一階段PCR CODEHOP (-) Par-CODEHOP (-) Culture 27(-)
1.基因體 2.生材科 3.新與及HIV實驗室 第一階段PCR CODEHOP (-) Par-CODEHOP (-) Culture 27(-) 腸病毒實驗室 Culture Cell line RD MK2 HEP2-c MRC5 CPE 1 8 12 No CPE 3 2 Result: CA6(1件) Saffold-like virus(20件) CPE (-) : 7件

24 266：238 陽性，28陰性(11%) 89無IFA試劑(33%) 149有IFA試劑(56%) EV68 56% 69% 0% 40%
實驗室 CA10 CA16 CA2 CA21 CA4 CA5 CA6 CA6+HPeV1 CA8 CB2 CB3 CB4 ECHO11 ECHO30 CA12 ECHO25 ECHO3 ECHO33 ECHO7 EV68 HRV 陰性 總計 無IFA試劑+陰性 三總 6 5 1 4 2 11 14 57 56% 中榮 7 13 69% 台大 0% 成大 30 40% 林口長庚 19 8 35 31% 高長 22 42 74% 慈濟 12 18 3 9 70 20% 彰基 44% 16 23 28 62 266 2007 17 2008 3 2009 4 2010 18 2011 11 2012 2 2013 EV68

25 腸病毒 25

26 CB3 2百多bp 幾乎皆為GV-B(可使用自行開發的IFA試劑) CB4 2百多bp 沒有直接關聯 染不到，但卻沒有和最下面的通報NPEV在一群?

27 CB bp 無法從序列判斷

28 HPeV Thirty-eight HPeV isolates were identified from 575 untypeable isolates, including 23 HPeV type1 (HPeV1), 13 HPeV3, and 2 HPeV6. hpev1與hpev3感染者年紀無差異 Characteristics of cases infected with human parechovirus (HPeV), Type Gender Age Total Female Male <1 1-5 >5 HPeV1 9 14 6 17 23 HPeV3 4 2 8 3 13 HPeV6 1 24 27 38 HPeV1, HPeV3, HPeV6 性別年紀無顯著差異

29 No. of patients with symptoms/no. of patients (%)
HPeV HPeV1出現較多發燒與呼吸症狀 夏秋出現較多病例 Clinical symptoms of human parechovirus (HPeV) infection in Taiwan, Characteristic No. of patients with symptoms/no. of patients (%) HPeV1 HPeV3 P Fever 23/23 (100) 10/13 (77) 0.04a Respiratory symptoms 19/23 (83) 3/13 (23) <0.001a Gastrointestinal symptoms 4/23 (17) 0/13 (0) 0.27 aStatistically significant. HPeV infections was observed in summer and autumn, with the highest peak in September

30 HPeV

31 EV-71 (2013) B5a 外國 B5c after 2010, TW B5x 2009(?), 2013, TW
B5b , TW B5a 外國 B5x (?), 2013, TW 與中國近年來的同一群

32 EV-71 ( ) B5b 桃園/台中/彰化 1-2月，B5x 台中/彰化/嘉義/桃園/花蓮 5-12月，C4 桃園/台中 7/11月 B5b B5c B5x C5 C4 C2

33 製表日為2014/02/21 (依發病日製表) 流感病毒 收件暨定序狀況(統計日期: 102/10/23~103/1/27)
Pandemic(H1N1) INFAH3 INFB 總計 收件數 77 259 37 373 區域(北) 22 47 17 86 區域(中) 15 60 11 區域(南) 25 117 8 150 區域(東) 35 1 51 定序完成數 44 157 20 221 基因型(Vaccine Strains) A/California/07/2009(44) A/Victoria/361/2011(157) B/Brisbane/60/2008(Vic-9) B/Wisconsin/01/2010(Yam-9) B/Massachusetts/02/2012(Yam-2) 發病月份(2013/10) 2 7 9 發病月份(2013/11) 6 4 發病月份(2013/12) 27 104 13 144 發病月份(2014/1) 42 123 185 發病年齡(<4) 45 發病年齡(4~12) 81 109 發病年齡(13~18) 50 76 發病年齡(19~64) 38 124 發病年齡(>64) 16 19 其餘檢體狀況 直接入庫 PCR中 PCR失敗 製表日為2014/02/21 (依發病日製表)

34 Updated: 2014/03/02 國際間流感活動監測 中國大陸第8週全國流感陽性率20.9%(南方24.9%，北方14.4%)，流感活動呈下降趨勢，以H1N1型、B型病毒共同流行。 香港流感活躍度維持高水平，急診類流感就診率於2月初達高峰後持續下降，近期再度呈上升趨勢；流感病毒以H1N1型居多。 日本流感定點監測通報於第5週達高峰後呈下降趨勢，流感病毒以H1N1型為主。 歐洲流感活躍度維持高水平，今年第8週定點監測流感陽性率約33%；流感病毒以A型為主，其中H1N1型及H3N2型分佔58%、42%。 美國大部分地區流感活動持續減緩，今年第8週呼吸道檢體流感陽性率10.8%，陽性檢體中以H1N1型為主。 加拿大大部分地區流感活動持續減緩，今年第8週呼吸道檢體中流感陽性率14.3%，以H1N1型為主，B型病毒近期呈緩慢上升趨勢。 資料來源: 香港衛生防護中心、日本厚生勞働省、日本國立感染症研究所、 中國國家流感中心、ECDC、CDC，Public Health Agency of Canada

35 Updated: 2014/03/02 Summary for Influenza 上週新增121例流感併發症確定病例【40例H3N2、76例 H1N1、2例A未分型、3例B型】，新增10例經審查與流感相關死 亡病例【2例H3N2、7例H1N1、1例A未分型】；本流感季(自 2013/7/1起)累計共1189例流感併發症確定病例，其中381例需ICU 治療；經審查與流感相關死亡病例共60例(26例H3N2、32例H1N1 、 1例A未分型、1例B型)。 門急診類流感就診病例百分比連續兩週上升；第7週社區流感 病毒陽性率(38.4%)，較前一週(26.7%)上升，國內流感併發症個案 亦以H1N1感染為主，檢出之病毒型別為H3N2及H1N1均等(約各佔 4成)，B型流感有增加趨勢，近期鄰近國家流行病毒均以H1N1為 主，預期社區流行病毒將轉以H1N1為主。

36 附件二：疫情防治會議國際疫情簡報範例 Updated: 2014/03/02 H7N9流感疫情　 中國大陸廣東省、浙江省、湖南省、江蘇省共新增13例確診病例(其中1例死亡)，病例數以廣東省居多，其中11例(85%)具活禽接觸史、活禽市場暴露史。 入秋後(2013年10/1起)H7N9累計確認243例，其中浙江省92例、廣東省80例、福建省15例(其中1例浙江省移入)、江蘇省14例、上海市8例、湖南省15例、北京市2例、安徽省5例、廣西3例(其中1例廣東省移入)、貴州省1例(浙江省移入)、吉林省1例，香港5例(皆為廣東省移入)，馬來西亞1例(廣東省移入)，我國1例(江蘇省移入)。 全球自2013年迄今共378例確定病例，WHO於3/1公布115例死亡。 資料來源:廣東省衛生廳、湖南省衛生廳、浙江省衛生聽、江蘇省衛生廳 36 36

37 Updated: 2014/03/02 入秋後H7N9流感病例分布 全球自2013年迄今共378例確定病例

38 附件二：疫情防治會議國際疫情簡報範例 Updated: 2014/03/02 H7N9流感國內疫情　 國內疫情 上週國內新增9例H7N9流感通報病例，其中2例檢驗 中，餘H7N9均檢驗陰性(其中2例檢出H1N1流感、2 例檢出H3N2流感、餘陰性)。 國內自2013年4月3日起將「H7N9流感」列為第五類 傳染病，迄今累計共554例通報病例(其中56例為中國 大陸來台人士)，2例境外移入確定病例(含1例死亡病 例)，550例H7N9檢驗陰性(其中80例檢出H1N1流感、 56例檢出H3N2流感、13檢出B型流感)，2例檢驗中。 38 38 38

39 <4共 45位 通報 Gene_type Region Vaccination Inoculation year Number H1N1:INFAH3:INFB C7:A11:B60:BW:BM:N:P 北:中:南:東 1 100/10-101/09 2 0:1:1 0:0:0:1:0:0:0 1:1:0:0 101/10~ 7 0:7:0 0:7:0:0:0:0:0 4:1:2:0 0:2:0 0:0:0:0:0:0:2 1:0:1:0 Unvaccination 34 9:25:0 3:6:0:0:0:0:15 7:7:15:5 >64共 19位 0:1:0 0:0:0:0:0:0:1 0:0:1:0 18 2:15:1 2:10:1:0:0:0:5 6:3:8:1

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41 其他參考資料 H3 H1 2013年底出現K180Q, I251V, A273T的第四個族群。 而203則是ATA
主要族群轉為 Y94H。 以及144,142小變異。 H1 1 in 2012 2 3 4 2013年底出現K180Q, I251V, A273T的第四個族群。 而203則是ATA

42 其他參考資料 Flu_B:Yamagata Flu_B:Victoria 數量太少看不出其他變化，只有A229V。
2013年初以Massachusetts(疫苗株)為主， 交界時以Wisconsin株為主。但數量太少看不出大變化。

43 合約實驗室檢驗結果-腸病毒 腸病毒 流行幅度低，以CA10為最多 簡化修改圖 加入CA10 分析結果 (herpangina較多)

44 附件二：疫情防治會議國際疫情簡報範例 Updated: 2013/12/20 國際間腸病毒疫情監測 香港今年手足口病活躍程度有所下降，急診就診千分比於6月達 高峰後持續下降，較前兩年低。今年截至10月定點監測共累計 972件手足口病檢體，以克沙奇病毒為主(佔56%)。 日本今年手足口病定醫平均報告數於第30週達高峰後持續下降 ；累計分析共1,639例手足口病患者病毒型別，以CA6型為主。 新加坡今年第49週通報628例手足口病，高於前5年同期平均 (331例)，已低於預警值(691例)，每週通報數緩慢下降。 44 資料來源：香港衛生防護中心、日本國立感染症研究所、新加坡衛生部

45 Updated: 2013/12/20 Summary for EV 第51週新增1例腸病毒71型重症確定病例，2013年截至目前共10例腸病毒重症確定病例(感染病毒型別6例為EV71、3例為CA6、1例Echo 30)，其中1例死亡(Echo 30)；腸病毒急診病例千分比(3.28‰)較前一週上升，仍高於預警值；目前社區主要流行病毒株為Coxsackie A (約占83%) ，於花蓮縣新增檢出1件EV71陽性檢體，持續監測疫情及流行病毒株變化。

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47 CB2-2013 分析 157/282 amino acid of VP1 gene

48 Most recent CB2 isolates were reported as untypable NPEV.
Residue 110. Other mutations Prepare antiserum 分析 194/282 amino acid of VP1 gene