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文摘数据库 (ISI、PUBMED).

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Presentation on theme: "文摘数据库 (ISI、PUBMED)."— Presentation transcript:

1 文摘数据库 (ISI、PUBMED)

2 目的 掌握ISI的检索 掌握PUBMED的检索

3 Science Citation Index(SCI) 科学引文索引

4 Web of Science检索项规则 检索项不区分大小写 输入单词或短语不带引号
用布尔逻辑运算符: AND、OR、NOT、SAME/SENT 当AND、OR、NOT等不是检索算符时加引号 截词符(右边或中间):*=零至多个字符 ?=1个字符 ? ?=2个字符 如“teach*”、“colo?r”等

5 逻辑算符 Same、sent 检索词出现在同一个句子或同一地址中 逻辑算符默认顺序: AND、OR、NOT、SAME/SENT
检索字符串包含上述逻辑算符时,为避免与逻辑算符的混淆,需用双引号将它引起来,如想检索“Willian Or”写的文章,需在著者字段输入“or” w

6 禁用词(stop word) 禁用词是指在Web of science中出现频率多的某些词
不能在检索字段中单独输入禁用词进行查找,否则将返回零结果 如名词(LAB、MED、PHYS、RES、SCH、SCI、ST、UNIV等)、冠词(如a、an、the等)、介词(如of、in、for、through等)、代词(如it、their、his等)和某些动词(如do、put等)

7 Web of Science 的检索方法 提供了两种检索信息的方式:
简易检索(Easy Search)和高级检索(Full Search)。 高级检索又分为: 普通检索(General Search)和引文检索(Cited Search)

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9 简易检索Easy Search 进入主页面后,用鼠标点击Easy Search 按钮出现简易检索画面
该检索方式提供了三种检索途径即主题、著者、著者单位。 该方式下检索,每条命令最多命中100篇文献。

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11 Topic Search 在文献篇名(Title)、文摘(Abstract)和关键词(Keywords)字段中选择主题词,通过主题途径检索文献。可选用逻辑运算符AND 、OR、NOT;邻近算符:SAME、SENT和截词和通配符:?、*、?*等进行检索。

12 Person Search 可以按论文作者、引文作者或论文中提及的人物进行检索。
在用论文作者及引文作者进行检索时,可以用全称、人物姓或使用截词符、空格等。

13 Place Search 按作者所在单位进行地址检索,包括大学、机构、公司、国家、城市等的名称和邮政编码等。
机构的名称或短语可采用缩写形式。 直接输入公司、或大学的名称。 可用same联接机构与地点或机构与系部。 Central China Normal Univ same math* 地理位置检索时可用国家、省或邮政编码,可采用逻辑运算符。 Peijing Med Univ, Peoples Hosp, Cent Lab, Beijing , Peoples R China

14 Full Search 普通检索(一般检索)General Search 引文检索Cited Referance Search
高级检索能够通过主题、刊名、著者、著者单位、机构名称检索,也能够通过引文著者(Cited author)和引文文献(Cited reference)检索,支持布尔逻辑检索、截词符和其它调整方法以提高查准率,还允许用户将检索限定在指定的时间段内。 主页用鼠标点击“Full Search”按钮即可进入检索画面。

15 General Search检索步骤 选择数据库和年份 输入相应的主题、作者、作者地址以及来源文献等内容 (一个字段或多个字段检索)
检索结果可以通过语种、文献类型进行限制; 通过入库时间、被引频次、相关度、第一作者以及来源文献对检索结果进行排序, 点击“Search”检索。

16 Cited Reference Search
提供了被引作者、被引文献的来源、被引文献的年代三个检索字段,进行检索。 Cited Auther 字段 :可使用运算符or Cited Works字段:可使用运算符or Cited Year字段:可使用运算符or

17 Cited Reference Search检索步骤
先输入被引文献的信息,包括被引作者、被引期刊、被引年份等 ; 点击“LOOKUP “ 出现“Cited reference selection”界面 检索结果的输出 检索结果一般有显示、打印、下载和 等形式输出。

18 标记、打印、下载及E-mail 点击sunmit 或mark all标记记录或unmark all 删除记录。 点击marked list
选择输出方式format for print、save to file export to reference software、 等。 点击format for print后显示文献的下载格式。 用浏览器命令可以打印或保存检索结果。 点击 the records to:在框中输入收件人的地址,点击send 可以发送结果。

19 Web of Science注意事项 注1: 数据的年代指文献信息进入ISI数据库的时间,不是文献出版的时间。
注2: 地址检索项中常采用一些缩写词。ISI规定,不允许单独用这些缩写词检索。例如:在地址字段中输入 UNIV一个词检索是无效的,输入 zhejiang univ有效。 注3: 最大显示结果数受系统设置的限定,一般为500条,所以当满足检索要求的结果数目太大,可能无法看到全部结果。

20 ISI数据库分析工具功能与使用 以BIOSIS PREVIEW为例

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22 可以缩小范围进行分析

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24 网络医药文献数据库 PubMed

25 PubMed ——NCBI网站简介 www.ncbi.nlm.nih.gov
1988年,美国的参议员 Claude Pepper 发起, 1988年11月4日通过立法建立国立生物技术信息中心(NCBI) NCBI的任务: 建立基于计算机信息处理的分子生物学、生物化学、遗传学知识的自动存储和分析系统,并进行先进方法的研究。 促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。 促进全世界范围内生物技术信息收集的合作

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27 PubMed主页 执行检索 基本检索输入框 特征栏提供辅助 检索功能 侧栏提供其他检索如期刊数据库检索、规范词数据库检索、特定文献检索

28 PubMed 基本检索规则 在检索栏中输入:
一个或多个检索词(系统默认空格为AND检索) 如:placenta growth oxygen genbacev o 著者姓名,姓在前,名首字母在后。 如: smith ab 刊名输全称或MEDLINE认可的标准缩写形式 如:clin exp immunol 布尔逻辑运算式: (运算符须大写) 如 :Stem [ti] AND neuroscience

29 Moore AM撰写的有关接触性皮炎的文章
多个检索词输入 Moore AM撰写的有关接触性皮炎的文章

30 刊名的输入 (字段限定来源出SO)

31 著者检索 moore am[au]

32 检索提问输入 仅检索有文摘的文献

33 PubMed 基本检索规则 截词检索:treat* 强迫短语检索:“brca 1”(不再自动转换匹配和扩展检索)

34 PubMed 基本检索规则 部分关键词自动转换检索词 (automatic term mapping)
自动对照规范词表,期刊名表,短语,著者名索引, 依次寻找转换 短语寻找转换 单词转换 单词在上述四个字段寻找转换 在所有字段中转换

35 如:输入stem[ti] AND neuroscience
Details显示: stem[ti] AND (("neurosciences"[TIAB] NOT Medline[SB]) OR "neurosciences"[MeSH Terms] OR neuroscience[Text Word])

36 非款目词 系统不自动转换规范词

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38 PubMed 基本检索规则 自动扩展检索 系统自动对主题词、副主题词进行扩展检索,如:
输入hypertension therapy,系统将自动检索高血压的药物治疗、饮食疗法等副主题词。

39 PubMed的辅助检索 Limits(检索限制选择) 字段限制:著者、刊名、篇名、滤过(filter原文收藏处)等
数据输入时间:默认检索可回溯到1950年,限制选择30天-10年 多种文献类型限制 多种语种限制 13种子文档

40 PubMed记录字段说明 文摘 第一著者单位地址 出版商提供文献识别号 著者群 版权说明 参考评论文献 合著者 文献参考评论 定稿版 校样版
输入日期 输入完成日期 电子出版日期

41 电子出版日期 文献出版日期 数据加入PubMed日期 文献勘误 参考文献勘误 全部著者姓名 全部调研者姓名 作为文章主题的著者全称 文献相关注释 基金编号 基因符号 期编号 资助调研者 资助调研单位 国际标准期刊号 美国立医学图书馆识别号 期刊全称

42 最后修订日期 规范词表词 规范词确立日期 系统组织的文摘 版权拥有者 题录提供机构的识别号 病史相关与原始记录 其他关键词 提供其他关键词的机构 数据提供者机构 文章总页数 出版商提供数据时间 期刊出版国 数据库文献编号

43 作为主题词的个人姓名 出版状态 文献类型 出版模式(纸张或电子) 参考文献数 已撤回的文献 酶或化学物质代码 正在撤消中的文章 初版文献 修订和再版的文章 子专题文档 太空署提供的数据 二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号 原文来源 引用了病例的文献内部处理代码 标准期刊缩写 文献标题 翻译标题 更新文献 文献正在更新 期刊卷号

44 清除限定 作者限定 添加作者姓名输入框 作者姓名索引选词 多作者逻辑匹配选项 期刊限定 全文、免费全文、摘要限定 日期限定

45 出版日期限定 入库日期限定 研究对象 人/动物限定 研究对象性别限定 语种限定 子文档限定 文献类型限定 研究对象年龄限定

46 检索字段限定 执行检索 清除所有限定

47 Previw/index(检索策略预览)
浏览检索式 改变检索式 (可用检索式编号#1 OR #2) 浏览索引(index)

48 检索预览 检索历史 索引加词检索

49 Index(索引字顺表) 选择限制字段 输入检索词(词根) 在字顺表中选择检索词 选用逻辑算符建立检索式 点击GO

50 步骤1 点击预览和索引 步骤2 输入待选词 步骤4 确定与检索栏中检索提问的逻辑关系 步骤3 索引选词

51 History(检索史) 检索式回顾 编辑检索式 如#3 AND child

52 检索式编号可替代检索式进行输入检索如:#5 AND #6
检索历史回顾 检索式 检索时间 检出篇数 检索式编号可替代检索式进行输入检索如:#5 AND #6

53 Details (匹配过程) 显示检索词转换匹配运算详细过程 用途:转换、确定规范词
如:liver cancer liver neoplasms 修改检索策略

54 检索明细 数据库匹配过程 检索词转换 显示用户输入的检索式

55 数据库匹配过程 词转换 你输入的检索式

56 修改检索策略 检索框中随时修改 “Limit” 、 “Preview/index”、 “History”、 “Details”功能实现。

57 其他检索 1.Mesh Database 功能: 确定规范检索词 查看词义注释、树状结构表 副主题词、扩展、主要主题词
例:欲查肾衰竭的饮食疗法相关文献?

58 基本检索肾衰竭的饮食疗法

59 结果中有些主要内容并非肾衰竭

60 MeSH Database 规范主题词数据库检索肾衰竭饮食疗法课题 1.输入检索词 2.执行浏览 3.点按规范词可获详细注解

61 主题词注释 可选副主题词 限定作为主要主题词匹配 不进行下位词扩检

62 主题词树形结构表:显示该词的学科隶属关系
该主题词所替代的非规范词形式 主题词树形结构表:显示该词的学科隶属关系

63 检出结果更为专指 通过MeSH Database 检索的结果,其中41篇综述文献

64 检索结果输出 显示检索结果 保存检索结果 保存检索策略 打印检索结果

65 显示字段选择(Display) Abstract report:来源期刊、标题、著者、著者地址、记录性质、文献类型、勘误、评论、PMID或UI、摘要。 Citation Report: 显示除上述内容外,加MeSH叙词、化学物质名称、资助项目号等字段。 MEDLINE Report: (最完整,有标识符)

66 显示格式选择

67 显示记录选择 单一记录:著者姓名 所有记录:选display旁的格式,及每页显示记录数 选定记录: 方框内打钩

68 可获电子全文的链接

69 输出格式选择(send to) 选中题录(或文摘)后 Text当前网页文本格式,用浏览器文件保存
File所有记录纯文本格式保存,用对话框保存 Clipboad 剪贴板,暂存需下载记录,多项检索后一起保存。 最多允许存储500条,保留8小时。 通过邮件发送 RSS Feed:检索结果的RSS订阅,通过安装网络聚合器可接收最新检索结果,不必再次检索。 Other:全文传递服务等申请,需帐号、收费 new

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71 保存检索策略 Details 中的URL ,可以让检索匹配的详细策略放入检索框,该检索页面可以存储入浏览器收藏夹。
My NCBI(Cubby)灰色栏中的功能按钮,存储在数据库的个人文档中。

72 打印检索结果 1 浏览器打印(当前显示的网页) 2 show功能键,增加网页显示的记录数 3 保存后一起打印(word)


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