生物医学信息综合利用 李春英 北京大学医学图书馆 医学图书馆

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1 生物医学信息综合利用 李春英 北京大学医学图书馆 医学图书馆
Peking University Health Science Library 生物医学信息综合利用 李春英 北京大学医学图书馆

2 主要内容 医学信息资源检索 文献信息分析与利用

3 中草药治疗慢性乙型肝炎随机对照试验的系统评价研究
1.分析题目概念之间的关系 中草药(chinese herbal drugs OR chinese herbal medicine OR Drugs, Chinese Herbal ) 慢性乙型肝炎 or 肝炎, 乙型, 慢性  ( chronic hepatitis B OR Hepatitis B, Chronic) 随机对照试验(Randomized Controlled Trial ) 系统评价(systematic review) 2.确定选择数据库 MEDLINE、EMBASE、BIOSIS Previews、Cochrane library CBM、CNKI、万方 3.选择检索途径 主题检索 自由词检索

4 CBM的检索结果

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6 万方的检索结果

7 PubMed的检索结果

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10 BIOSIS Previews的检索

11 BP 的检索结果

12 #3 “Randomized Controlled Trial ”/all subheadings(随机对照试验[扩展])
4.列检索式(不同数据库，检索式不同) NO. 检索词 #1 “Drugs, Chinese Herbal ”[MeSH] OR “ chinese herbal medicine ” OR “ chinese herbal drugs ” (中草药[扩展]) #2 “Hepatitis B, Chronic” [MeSH] OR “ chronic hepatitis B ” (慢性乙型肝炎[扩展] ) #3 “Randomized Controlled Trial ”/all subheadings(随机对照试验[扩展]) #4 systematic review(系统评价) 中文数据库结合分类途径，分类号R28 中药学 5.浏览检索结果 6.评价检索结果

13 科研过程中遇到的问题 如何确立科研选题？ 如何了解最新研究进展？ 如何把握研究前沿？ 怎样进行科学的研究设计？ 如何选择考查指标？
怎样进行严密的结果分析？ 如何判定研究成果的新颖性？ 如何做科研绩效分析？

14 医学信息资源检索类型 医学研究课题的查询 原始文献的获取 电子图书的查询 机构和人物的查询 试剂和药品信息的查询

15 医学信息检索策略 明确检索目的 针对不同的需要，采取相应的检索策略

16 信息源的类型 事实型信息 文摘题录信息 原始文献信息

17 事实型数据库

18 事实型数据库 事实型数据库也称指南型数据库,是将有关事实信息(如机构、人物、科技成果、产品/商品、事件等)作为存储和检索对象的数据库。 特点
提供的是事物实体的描述信息：描述人物、机构、产品（商品）、事件、地理位置等非文献信息，每个条目都是对一个事实确切、完整的描述。所以，事实数据库提供的是关于各类型事物实体的描述信息。 以事物名称为重要检索途径：名称检索途径

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20 文摘索引数据库特点 提供原文的摘要信息 摘要信息包括：题目、作者、刊名，或同论文相关信息 数据量大，文献类型多、信息量大 收录文献回溯年代长
收录文献期刊种类多 出版形式多样

21 原始文献数据库 期刊全文数据库 学位论文全文库 专利文献库 会议文献全文库 标准文献全文库 图书

22 如何进行科研选题信息查询及确定方向

23 检索策略(信息查询的方法与步骤) 1.分析查询信息内容 2.检索工具的选择及确定检索范围 3.确定检索途径和检索方法
4.评估检索结果，优化检索策略 5.保存检索结果及检索策略

24 课题查询中数据库的使用 一个课题专指数据库的利用 一个课题多个数据库的综合利用 某些数据库的特殊专题利用 加强特殊文献数据库的使用
电子图书的使用

25 一个课题专指数据库的利用 疾病专题数据库： 艾滋病专题：AIDSLINE 肿瘤专题：CANCER、CANCERLIT
运动医学：SPORT Discus、HERACLES(Fre) 、 CATALOGUE(Fre)、ATLANTES(Spa) 遗传性疾病：OMIM、PAH Database…

26 其它专题数据库 公共卫生管理：HealthSTAR 生物伦理学：BIOETHICSLINE Plus 计划生育：POPLINE
护理学：CINAHL 药学：CPA、IPA、DIF、IDIS、ID、RD 毒理学：TOXLINE、TOXNET 循证医学：EBMR、Cochrane Library

27 课题信息查询案例 1.早产儿视网膜病变防治的研究 2.新型抗耐药性拓朴替康长循环脂质体与抗肿瘤耐药性的研究

28 案例一 早产儿视网膜病变(ROP)防治的研究 (1)ROP临床流行病学研究； (2)ROP的临床数据库研究； (3)ROP的防治指南；
(5)卫生经济分析该防治模式的成本－效益和对早产儿视网膜病变患者生活质量影响的研究；

29 早产儿视网膜病变防治的临床和基础研究 (1)早产儿视网膜病变全程关护和分级管理的防治模式研究； (2)早产儿视网膜病变的临床数据库研究； (3)卫生经济分析该防治模式的成本－效益和对早产儿视网膜病变患者生活质量影响的研究； (4)北京ROP临床流行病学研究； (5)ROP易感基因的筛查研究； (6)利用造血干细胞治疗ROP的研究

30 案例二 新型抗耐药性拓朴替康长循环脂质体与抗肿瘤耐药性的研究 1.抗耐药性长循环脂质体
2.拓朴替康抗耐药性长循环脂质体对P-GP和BCRP过度表达引起的肿瘤细胞耐药性的药效学研究

31 多个数据库综合利用 注意以下几点： 先中文，后外文 先专业，后综合 先文摘，后全文

32 某些数据库的特殊专题作用 CNKI CBMdisc 可以做引文检索 SCI：可以做一般课题的检索分析
PubMed：可以做循证医学、遗传疾病、一般疾病的查询 可以做引文检索

33 加强特殊文献数据库的使用 专利文献：中外文专利数据库 学位论文：国内外学位论文数据库 会议文献：CMAC、ISTP
科技报告：航空医学科技报告 标准文献：中国国家标准数据库、ISO

34 原始文献的获取与利用 原文的获取方法及途经： 馆藏的充分利用 (1)首先到Google上查询是否有免费的
(2)利用本馆的馆藏目录，查询期刊是否订购 (3)若在没有，到PubMed查询该刊的馆藏信息 直接向原文作者索取 馆际互借

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36 电子图书的查询 超星电子图书 方正Apabi电子书 NetLibrary电子图书 MD Consult电子书 Thieme电子书
Clinical Evidence Cancer Handbook癌症手册 不列颠百科全书网络版 Encyclopedia of Life Science生命科学百科全书

37 电子图书的类型 教材 工具书 图片或图谱

38 查找人物和机构 公共搜索引擎：google、yahoo等直接输入人名+机构 专门网站：http://www.switchboard.com
WhoWhere( 机构导航系统 美国国家医学图书馆信息资源指南 Dirline (

39 查询Michigan reproductive William G，Doods

40 生物医学机构的信息查询

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42 试剂和药品信息的查询 Healthcare series(美国临床医生事实数据库) 药典 化工网
(中国试剂科学网)

43 检索技术的应用 如何扩展检索结果 如何缩小检索结果

44 如何扩展检索结果 三硝甲苯肝损伤早期生化指标的研究。 1.HbsAg(-)的蛋白含量下降和铜蓝蛋白的活性下降； 2.磷酸化酶a活性升高；
3.血清甘油三酯含量下降； 4.TNT是过氧化物小体增生剂。

45 如何扩展检索结果 运用逻辑运算符 扩展时间范围 运用同义词或近义词 1.对于毒物、药物、化合物等对疾病致病机理等方面的研究
2.专业知识：对代谢的影响

46 如何缩小检索结果 1.战后代谢综合征发生的分子机理及其防护措施研究 战后代谢综合征 分子机理 防护 胰岛素抵抗
战后代谢综合征 分子机理 防护 胰岛素抵抗 2.胃癌荧光标志物的确定及其临床意义的研究 胃癌 荧光标志物 肿瘤标志物 胃液

47 如何缩小检索结果 增加检索词 使用逻辑运算符 增加限定条件(时间范围、文献类型、文献种类)

48 文献信息的分析与利用

49 练习题 1.作者顾江于2005年发表在期刊JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE的第 202 卷第3期415～424页的论文，论文题名为“Multiple organ infection and the pathogenesis of SARS”，通过WOS数据库检索该文献的被引用情况，以及期刊的影响因子。 2. 检索2014年北京大学药学院发表的论文被SCI收录的情况。 3. 检索在期刊Energy或Energy Policy上发表的关于二氧化碳释放的文献。 说明：1-3题用Web of Science 数据库练习

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52 查看影响因子

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55 心律失常药物的国内核心期刊论文排名情况(发表论文最多作者、机构、期刊等)
心律失常药物的国外核心期刊论文国别排名情况 心律失常药物的国内外专利排名情况 在药学领域，全世界哪个研究机构最好？ 哪位学者最好？中国处于一个什么样的研究地位？北京大学处于一个什么样的研究地位? 慢性阻塞性肺疾病临床用药规律

56 心律失常药物的国内核心期刊论文排名情况

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61 心律失常药物的国外核心期刊论文国别排名情况

62 获得的文献整理分析

63 精炼检索结果 Web of Science 类别 文献类型 研究方向 作者 团体作者 编者 来源出版物名称 丛书名称 会议名称 出版年
机构扩展 基金资助机构 语种 国家/地区 开放获取

64 检索结果的分析

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66 心律失常药物专利在国际上数目及排名

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71 心律失常药物专利国别分布 序号 专利组织 数量 1 EP 5 2 FR 3 JP 4 US 11 WO 13

72 在药学领域， 哪位学者最好？全世界哪个研究机构最好？ 我们中国处于一个什么样的研究地位？ 北京大学处于一个什么样的研究地位?

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74 ESI数据库介绍 《基本科学指标》数据库（Essential Science Indicators, ESI），是由美国科技信息所（ISI）推出的衡量科学研究绩效、跟踪科学发展趋势的基本分析评价工具，是基于ISI《科学引文索引》数据库（简称SCI）和《社会科学引文索引》数据库（简称SSCI）所收录的学术期刊而建立的计量分析数据库。

75 ESI数据库介绍 收录了10余年的数据 22个学科 科学家、研究机构、国家/地区、期刊四个方面加以评价 高引用率论文和热门论文

76 ESI数据库简介 22个学科领域包含 Agricultural Science Mathematics
Biology & Biochemistry Chemistry Clinical Medicine Computer Science Economics & Business Engineering Environment/ Ecology Geosciences Immunology Materials Science Mathematics Microbiology Molecular Biology & Genetics Multidisciplinary * Neuroscience & Behavior Pharmacology Physics Plant & Animal Science Psychiatry/Psychology Social Sciences--general Space Science

77 ESI查询方法 4 种引文排序: 总被引次数和篇均被引次数按照如下字段进行排序: Scientists (取排名前1%)
Institutions (取排名前1%) Journals (取排名前50%) Countries/Territories (取排名前50%)

78 药学领域学者排名

79 学者排名

80 药学领域研究机构排名

81 研究机构排名

82 药学领域国家排名

83 国家/地区排名

84 药学期刊排名

85 期刊排名

86 北京大学药学的排名

87 北京大学药学排名

88 按发表论文数排名

89 高引用论文 高引用论文（highly cited papers）
某一科学家或科研机构在特定领域和年限中被引频次排名在前1%的论文，对于国家和期刊而言应该是排在前50%的论文

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91  January 1, 2004-August 31, 2014.

92  January 1, 2001-August 31, 2010.

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97 年北京大学发表高引用论文时间分布

98 热门论文 在最近两年里发表的论文中，按照最近两个月里某个学科领域中被引用次数最多的论文。

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100  January 1, 2012-August 31, 2014.

101  January 1, 2008-August 31, 2010.

102 年北京大学热门论文的学科分布

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104 信息分析概述 经过上述各种信息资源的加工，提炼，形成信息的新价值，信息的增值，这个过程就是信息分析
微观上，直接影响着学者及科研机构的发展方向，企业经济效益的提高和发展后劲 宏观上，信息资源开发利用的水平直接影响着一个国家生产力的发展和国际竞争力的增强

105 信息分析的概念 运用科学的理论、方法和手段，在对大量信息进行搜集、整理、鉴别、评价、分析、综合等系列化加工过程，形成新的、增值的信息产品，透过错综复杂的表面现象，把握其内容本质，从而获取对客观事物运动规律认识。

106 信息分析方法

107 信息分析的方法 逻辑思维方法 特尔菲法 文献计量学方法 回归分析法 时间序列分析 决策树法 模糊综合评价法 层次分析法 引文分析法

108 信息分析使用工具 Excel SPSS SAS Epidata Histcite Pajek Ucinet Citespace TDA
Aureka 付费

109 分析软件的选择 根据数据库的数据来进行选择
WOS 可使用的软件：Hiscite、NE、SATI、Bibexcel、Citespace、BICOMB等 PubMed 可使用的软件NE、SATI、Bibexcel、Citespace ，BICOMB、GoPubMed、PubMedplus等 CNKI或万方可使用的软件：NE、SATI、Citespace、BICOMB等

110 Histcite

111 HistCite介绍 history of cite 引文历史或者叫引文图谱分析软件 由加菲尔德研制，用图谱形式揭示不同文献之间的关系。
可以快速帮助我们绘制出一个领域的发展历史，定位出该领域的重要文献，以及最新的重要文献。

112 HistCite使用 安装http://www.pc6.com/softview/SoftView_78528.html
数据的获取：只能分析WOS数据，文本数据 自己在C盘下创建文件夹fakepath，数据下载到文件夹中 下载好的数据要修改一个字符ScienceTR Knowledge 导入数据： file add file 作图：graph maker 读图分析

113 软件功能和基本概念 GCS是global citation score，即总被引用次数
CR是cited references，文章引用的参考文献数量 LCS是local citation score，即本地引用次数 LCR是local cited references，是指某篇文献引用的所有文献中，有多少篇文献在当前数据库中

114 软件功能 一篇文献引用次数最多的必定参加价值更大？ GCS LCS
2003年发表在nature上的两篇文章 P1(GCS:580,LCS:12) 和 P2(GCS:36,LCS:24) p2的文章都在当前数据库，与你的研究方向相关

115 检索练习题目 艾滋病疫苗 甲状腺过氧化物酶抗体（thyroid peroxidase antibody ）

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117 注意以下两点： 1 记录内容的选择 2 文件格式保存为纯文本

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122 2223

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125 当数据为500条以内时

126 考核作业要求 1.选择自己专业的研究主题方向，进行文献检索，可以多个库，可以单个库 2.进行结果分析整理，写综述或分析报告
3.综述或分析报告在1月6日前上交，打印稿，送到图书馆信息咨询部306室，否则没有成绩

127 谢 谢！