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第三章 酶 (enzymes) 制作人:05技术(2)班吕达
主要内容:主要讲解酶的化学本质、结构和特性;酶促反应动力学;酶的作用机理;酶活性的调节;酶的应用;还介绍了别构酶、共价调节酶、同工酶等的概念、性质、生物学意义。 制作人:05技术(2)班吕达
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一、酶的发展史 二、酶的概念 酶是一类由活细胞产生的,具有催化活性和高度专一性的生物分子,大多数酶主要是蛋白质。
酶是一类由活细胞产生的,具有催化活性和高度专一性的生物分子,大多数酶主要是蛋白质。 酶的催化活性依赖于天然的完整蛋白质的构象,如果酶蛋白变性或解离为亚基,其催化活性通常会丧失。
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第一节 通伦 1 酶是生物催化剂 1.酶与一般催化剂比较 共性 (1)用量少而催化效率高:细胞内含量少;
第一节 通伦 1 酶是生物催化剂 1.酶与一般催化剂比较 共性 (1)用量少而催化效率高:细胞内含量少; (2)能加快化学反应的速度,但不改变平衡点,反应前后本身不发生变化; (3)降低反应所需的活化能
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2.酶作为生物催化剂的特性 (1)高的催化效率 就分子比(molecular ratio)而言, 以摩尔为单位进行比较,酶的催化效率比化学催化剂高107~1013倍,比非催化反应高108~1020倍。 例 :2H2O2→2H2O+O2 1mol H2O2酶能催化 5×106mol H2O2的分解 1mol Fe3+只能催化6×10-4molH2O2的分解
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(2)高的专一性 (3)温和的反应条件 (4)酶在体内受到严格调控:如酶浓度的调节、激素调节、反馈调节、抑制剂和激活剂的调节、别构调节、酶的共价修饰调节、酶原活化等。 (5)酶的催化活力与辅酶、辅基和金属离子有关
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20世纪80年代发现某些RNA有催化活性,还有一些抗体也有催化活性,甚至有些DNA也有催化活性,使酶是蛋白质的传统概念受到很大冲击。
1982年美国T. Cech等人发现四膜虫的rRNA前体能在完全没有蛋白质的情况下进行自我加工,发现RNA有催化活性 Thomas Cech, University of Colorado at Boulder, USA
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1983年美国S. Altman等研究RNaseP(由20%蛋白质和80%的RNA组成),发现RNaseP中的RNA可催化E
1983年美国S.Altman等研究RNaseP(由20%蛋白质和80%的RNA组成),发现RNaseP中的RNA可催化E. coli tRNA的前体加工。 Sidney Altman Yale University New Haven, CT, USA
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国际系统命名法 第二节 酶的命名和分类 1961年国际酶学委员会(enzyme commission)提出的酶的命名和分类方法。
第二节 酶的命名和分类 1961年国际酶学委员会(enzyme commission)提出的酶的命名和分类方法。 国际系统命名法 (1)标明底物,催化反应的性质 例: G-6-P→F-6-P G-6-P异构酶
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(2)两个底物参加反应时应同时列出,中间用冒号(:)分开。如其中一个底物为水时,水可略去。
例1: 丙氨酸+α-酮戊二酸 → 谷氨酸+丙酮酸 丙氨酸:α-酮戊二酸氨基转移酶 例2: 脂肪+H2O → 脂酸+甘油 脂肪水解酶
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国际系统分类法 2.习惯名称(recommended name) (1)底物 (2)反应性质 (3)底物,反应性质 (4)来源或其它特点
1.分类: 6大类酶,氧化还原、转移、水解、 裂合、异构、连接 注意顺序不能变!
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(2)酶的组成 1.单纯蛋白质酶类 2.结合蛋白质酶类 全酶=酶蛋白+辅助因子(辅酶、辅基或金属离子) 注意几个概念
辅酶(coenzyme) 辅基(prosthetic group) 单体酶(monomeric enzyme) 寡聚酶(oligomeric enzyme) 多酶复合体(multienzyme complex)
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(1)酶的活性中心(active center)
第三节 酶催化作用的结构基础 (1)酶的活性中心(active center) 1、活性中心的概念 酶是蛋白质,是大分子化合物,在这样一个大分子中只有一小部分是与底物结合,并与催化作用直接有关,这个部位称酶的活性中心。 组成酶活性中心的氨基酸侧链基团主要有Glu和ASP的-COOH,Lys的ε-NH2,His的咪唑基,Ser的-OH,Cys的-SH,Tyr的侧链基团。 酶活性中心 结合部位(结合位) 催化部位(催化位)
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酶的专一性(特异性,specificity)
1、绝对专一性(absolute specificity)
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1、溶菌酶(Lysozyme)
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(2) 酶原的激活
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第四节 酶催化作用的机理 酶依靠降低活化能加速化学反应 底物 substrate 产物 product
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3、酸碱催化(acid-base catalysis)
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酚 吡啶 α-羟基吡啶
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4、共价催化(covalent catalysis)
什么是共价催化? 共价催化 亲电子催化 亲核催化
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酶催化功能的几个实例 1、溶菌酶(Lysozyme)
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2、胰凝乳蛋白酶(chymotrypsin)
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3、羧肽酶A(carboxypeptidase A,CpA)
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第五节、酶的作用动力学(kinetics)
(一)底物浓度对酶反应速度的影响 1.米氏方程的提出 中间复合物学说: 第一步: E+S ES 第二步: ES→E+P V∝[ES]
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(二)酶浓度对酶反应速度的影响 (三)pH对酶反应速度的影响 1.反应速度与酶浓度成正比 2.V与[E] 关系的几点讨论
[S]>>[E] V∝[E] 2.V与[E] 关系的几点讨论 (三)pH对酶反应速度的影响 1.酶反应的最适pH(optimum pH) 2.pH影响反应速度的原因 ( 1 ) pH影响了酶分子、底物分子和ES复合物的解离状态。 ( 2 ) 过高、过低的pH导致酶蛋白变性。
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(四)温度对酶反应速度的影响 1.最适温度(optimum temperature) 最适温度与最适pH一样,也不是一个固定的常数,它随底物的种类、浓度, 溶液的离子强度, pH, 反应时间等的影响。 例: 反应时间短,最适温度高。 反应时间长,最适温度低。
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(五)激活剂对酶反应速度的影响 (六)酶的抑制作用和抑制作用动力学 1、不可逆抑制作用(irreversible inhibition)
(1)竞争性抑制作用(competitive inhibition)
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第六节 重要酶类及其活性调节 一、别构酶(也称变构酶,allosteric enzyme)
(一)别构酶结构上的特点 (二)别构酶性质上的特点 (三)别构酶的别构效应(allosteric effect) 1、什么是别构效应 2、同促效应与异促效应
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(四)别构酶的作用动力学 1、正协同效应(positive cooperative effect)
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2、负协同效应(negative cooperative effect)
3、正协同效应别构酶与米氏酶动力学比较
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4、负协同效应别构酶与米氏酶动力学比较
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二、同工酶(isoenzyme or isozyme)
(一)同工酶的概念 同工酶的概念 同工酶的性质
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第七节、酶的分离、纯化及活力测定 (一)酶的分离纯化 2.破碎细胞 3.抽提 4.去核酸、去多糖 5.纯化 6.保存
1.选材 2.破碎细胞 3.抽提 4.去核酸、去多糖 5.纯化 6.保存 由于酶的特殊性,在提纯过程中要注意 : 1.全部操作在低温0~4℃。 2.在分离提纯过程中,不能剧烈搅拌。 3.在提纯溶剂中加一些保护剂,如少量EDTA、少量β-巯基乙醇。 4.在分离提纯过程中要不断测定酶活力和蛋白质浓度,从而求得比活力,还要计算总活力。
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比活力= 酶活力 蛋白质浓度 总活力=单位体积的酶活力(U/ml)×分离溶液总体积(ml)
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(二)酶活力的测定 酶活力(enzyme activity, 也称酶活性) 酶活力的测定 1.测定酶活力时应注意几点
(1)应测反应初速度(initial velocity or initial speed) (2)酶的反应速度一般用单位时间内产物的增加量来表示。 (3)测酶活力时应使反应温度、pH、离子强度和底物浓度等因素保持恒定。 (4)测定酶反应速度时,应使[S]>>[E]。 产 物 浓 度 [P] (t)
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2.酶活力和比活力表示方式 (1)酶活力(enzyme activity)
(2)酶的比活力(specific activity,也称比活性) 比活力:指每mg蛋白质所具有的酶活力,一般用U/mg蛋白质来表示,比活力说明酶的纯度。 比活力= 酶活力(U/ml)/蛋白质浓度(mg/ml) (3)转换数(TN or kcat) (4)分子活性(molecular activity) (5)催化中心活性(catalytic center activity)
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3. 酶活力的测定方法 分光光度法(spectrophotometry) 优点: 该法要求酶的底物和产物在紫外或可见光部分光吸收不同。
3. 酶活力的测定方法 分光光度法(spectrophotometry) 该法要求酶的底物和产物在紫外或可见光部分光吸收不同。 优点: 简便、迅速、准确。 一个样品可多次测定,有利于动力学研究。 可检测到10-9mol/L水平的变化。
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