REAXYS New Reaxys…. RAEXYS 教育訓練PPT

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1 REAXYS New Reaxys…. RAEXYS 教育訓練PPT Karen.liu@elsevier.com
How you think How you work RAEXYS 教育訓練PPT New Reaxys….

2 CONTENTS REAXYS化學資料庫簡介 收錄內容 & 界面更新 資料庫建置原理 個人化功能 Searching in REAXYS
主題1 :化合物搜尋 主題2 :反應搜尋 主題3 :合成計畫 主題4 :文獻搜尋 Analyzing in REAXYS 視覺化分析工具 – Analysis View 多樣化結果輸出功能 – Enhanced Report 自動合成工具 – Autoplan 相關資源

3 REAXYS 化學資 料庫 簡介

4 REAXYS化學資料庫收錄內容 收錄自1771年起的16,000筆化學相關出版品，涵蓋有機化學、無機化學及有機金屬三大資料庫及專利!!!
內容涵蓋學科領域已從核心400本嚴選化學期刊到以下學科： Agricultural and Biological Sciences Biochemistry, Genetics and Molecular Biology Chemical Engineering Chemistry Dentistry Earth and Planetary Sciences Energy Engineering Environmental Science Immunology and Microbiology Materials Science Medicine Neuroscience Pharmacology, Toxicology and Pharmaceutics Physics and Astronomy Veterinary

5 REAXYS操作介面更新及功能新增 REAXYS化學資料庫使用介面簡單且不受使用人數限制！
三大新功能讓您不僅作搜尋也能同時進行分析和 出搜尋到的資料！

6 REAXYS資料擷取方式 從文獻中擷取出化學結構、物理化學特性、藥理資訊以及化學合成反應式，再將這些資訊分成三大類（Substances、Reactions 及 Citations），一共 個參數（如下兩張投影片）！讓您以化合物的角度輕鬆獲取相關資訊！

7 Reaxys Datastructure Sub- stances Physical Properties
Structure and Energy Parameters Physical State Crystals Liquids Gases Other Physical and Mechanical Properties Transport Phenomena Viscosity Thermochemical Data Enthalpy Heat Capacity Optical Properties Spectroscopic Information Magnetic Properties Electrical Properties Electrochemical Behaviour Safety Data Solution Behaviour (MCS) Liquid/Vapour Systems (MCS) Pharmacological and Ecological Data Quantum chemical data Compound Labels INCHI code Catalyst Investigation Derivative Isolation from natural products Purification Conformation Interatomic Distances and Angles Electrical Moment Electrical Polarizability Molecular Deformation Energy Barriers Dissociation Energy Ionization Potential Electron Binding Crystal Property Description Melting point Decomposition Sublimation Crystal Phase Triple Point Transition Point(s) of Cystalline Crystal System Space Group Density of the Crystal Boiling point Liquid Phase Transition Point(s) of Liquid Modification Critical Temperature Critical Pressure Critical Density Critical Volume Vapour Pressure Gas Phase Density of the Liquid Mechanical Properties Compressibility Sound Properties Surface Tension Dynamic viscosity Kinematic viscosity Bulk Viscosity Self-diffusion Chromatographic Data Transport Data Thermal Expansion Enthalpy of Combustion Enthalpy of Formation Enthalpy of Hydrogenation Enthalpy of Fusion Enthalpy of Vaporization Enthalpy of Sublimation Enthalpies of Other Phase Transitions Heat Capacity Cp Heat Capacity Cp0 Heat Capacity Cv Other Thermochemical Data Refractive index Optics Optical rotatory power Mutarotation Circular Dichroism Optical Rotatory Dispersion NMR Spectroscopy ESR Spectroscopy NQR Spectroscopy Rotational Spectroscopy IR Spectroscopy Raman Spectroscopy UV/VIS Spectroscopy Luminescence Spectroscopy Fluorescence Spectroscopy Phosphorescence Spectroscopy Other Spectroscopic Methods Mass spectrum Magnetic Susceptibility Magnetic Data Static Dielectric Constant Dielectric Constant Electrical Data Electrochemical Behaviour Dissociation Exponent Isoelectric Point pH Electrochemical Characteristics electrolytic conductivity electrochemistry data Cross-Sections Flash Point Autoignition Explosion Limits Further Information Solubility (MCS) Solubility Product (MCS) Solution Behaviour (MCS) Critical Micelle Concentration (MCS) Henry Constant (MCS) Partition coefficient Liquid/Vapour Systems (MCS) Azeotropes (MCS) Complex Phase Equilibria (MCS) Liquid/Liquid Systems (MCS) Liquid/Solid Systems (MCS) Mechanical and Physical Properties (MCS) Transport Phenomena (MCS) Energy Data (MCS) Electrical Data (MCS) Optical Data (MCS) Boundary Surface Phenomena (MCS) Adsorption (MCS) Association (MCS) Pharmacological Data Use Quantum chemical calculations

8 Reaxys Datastructure Reactions & Citations Reactions Citations
Reactant Product Reaction Transforms Bin Reaction Details Multistep Reaction ID Number of Reaction Steps Multistep Reaction Description Reaction classification Yield Optical yield No. of Stages Reagent Name Catalyst Solvent Time Temperature Pressure pH Reaction conditions Reaction Type Subject Studied Prototype Reaction Named reaction Citation Document Type Authors Patent Assignee Article Number Patent Country Code Patent Number Patent Year Patent Language Code CODEN Journal Title Journal/Review without CODEN Country Code Language code Editor Publisher Location of Publisher (Series) Volume Number Publication Year Page DOI ISSN Title Abstract Language Keywords Patent Bibliography Date of publication Application number Date of filing Filing year Inventor Priority number Priority date Main IPC Secondary IPC Family member: Patent number

9 REAXYS資料篩選和資料庫建置示意圖 Excerption 選/收錄和組織化 化學領域相關出版品 化合物 化合物和反應 化合物相關的
Scientific Model 化合物 化合物相關的 物化特性 實驗數據,Facts 製備方法 反應 文獻資料 化合物和反應 實驗數據, Facts 另外還增加 其他相關資訊,如:摘要, Markush等… 選/收錄和組織化

10 REAXYS搜尋結果資料呈現方式 書目資料 化學結構 反應資訊 實驗數據

11 REAXYS化合物資料擷取實例

12 REAXYS化合物物理化學特性資料擷取實例
Color / habit Color Dark red NMR Spectroscopy Nucleus 1H Solvent CD2C12 Signals / Intensities available Mass Spectroscopy Diagram (MS. DGM) Molecular park (MS. PEAK) Fragmen- tation (MS. FRAG) Description (MS. DESCR) available

13 REAXYS反應資料擷取實例

14 REAXYS書目資料擷取實例

15 REAXYS全方位支援您的化學研究流程 豐富的資訊:以化學人的邏輯，將化合物結構、反應式、物理化學特性、光譜資料等資料從化學文獻資料中取出！
最後提供ELN / MSWord / Excel / PDF / API / SFF等方式讓化學研究人員將最佳工作流程解答輸出！ 註

16 REAXYS 聯結多種資料庫，資訊獲取更便利
為了讓使用者能容易查找相關資訊，Reaxys 聯結到許多Elsevier 內部或外部資料庫，讓使用更加便利。 PubChem — 在Reaxys 介面在您搜尋資料結果時可以連到NCBI開放的資料庫，以 獲取小分子生物活性資料。 eMolecules —可以獲取國外原料藥的購買資訊，包含廠牌、容量與價格，以幫 助“合成或購買”的決策過程。 Reaxys Medicinal Chemistry —根據分子標靶、藥理作用和標靶相互作用數據 之主要資料來篩選和優先考慮候選藥物 PharmaPendium —深入臨床和臨床前數據，並能搜尋FDA內的藥品審查資訊及 相關歷史資料。 Scopus —享有使用重要的文獻計量學的資訊結果，包含引用資訊及期刊分析等。 ScienceDirect — 可獲取Elsevier 文章和電子書全文資料下載及使用多種便利 的應用程式。

17 依結構搜尋、非依結構搜尋及文獻搜尋，方便不同領域使用者選擇進入！
REAXYS 首頁 新版資料庫入口有三種入口： 依結構搜尋、非依結構搜尋及文獻搜尋，方便不同領域使用者選擇進入！ 依結構搜尋（Structures & Reactions）：可輸入化學結構來搜尋反應式、化合物及文獻，並可按下Reaction Data加入附加搜尋條件。 非結構搜尋（Names & Formulas）：可輸入化學名稱等方式來搜尋特定化合物，並可按下Physical、Spectra、Bio Activity及Natural Product加入附加搜尋條件。 文獻搜尋（Literature）：可選擇欄位並輸入關鍵字來搜尋相關文獻。 附加搜尋條件設定

18 SEARCH in REAXYS

19 非依結構搜尋：適用於初學者一開始進行化學搜尋或任何不易以畫結構方式做搜尋的分子，如：無機分子。
主題 1 :化合物搜尋_非依結構搜尋 非依結構搜尋：適用於初學者一開始進行化學搜尋或任何不易以畫結構方式做搜尋的分子，如：無機分子。

20 主題 1 :化合物搜尋_非依結構搜尋

21 依結構做搜尋：使用者可利用繪圖軟體繪製要搜尋的分子或反應式，或是藉由化合物名轉換成結構的方式做搜尋！
PRESENTER NAME | DATE | TITLE 主題 1 :化合物搜尋_依結構搜尋 依結構做搜尋：使用者可利用繪圖軟體繪製要搜尋的分子或反應式，或是藉由化合物名轉換成結構的方式做搜尋！

22 主題 1 :化合物搜尋_依結構搜尋 反應搜尋條件：基本設定 搜尋項目：可使用繪圖軟體以結構的方式來搜尋反應、化合物及文獻。
另可依據化合物名稱、InChI-Key及Smiles來做搜尋。 若要增加搜尋條件可按下 Physical、Spectra、Bio Activity及Natural Product加入附加搜尋條件。

23 MarvinSketch Reaxys Generics Template Library Periodic System

24 主題 1: 搜尋範例 - Thalidomide Thalidomide是最早上市的非處方鎮定劑，很多國家曾用於懷孕婦女的噁心、嘔吐症狀，卻也造成在1960年代上千位畸形兒的產生，因此而聲名狼藉! 抗血管新生作用(Anti-angiogenesis Activity) (1) 血液腫瘤 (2) 多發性骨髓瘤(Multiple Myeloma) (3) 肝癌 (Hepatocellular Carcinoma, H.C.C.) 不良反應 (1)致畸胎 (2)週邊神經病變 (3)副作用：嗜睡，暈眩等 最近幾年讓一些研究學者更感興趣的是Thalidomide的： 1.抗發炎作用(anti-inflamatory) 2.免疫調節(Immunomodulatory) 3.抑制血管增生(anti-angiogenic) 參考網站：

25 主題 1 : 化合物搜尋_結果畫面 Bioactivity/Ecotox

26 主題 1 : 化合物搜尋_結果畫面 Physical Data/Spectra

27 主題 1 : 化合物搜尋_輸出 Report November 24, Slide 27

28 多樣化結果輸出功能 Enhanced Report
Analyzing in REAXYS 多樣化結果輸出功能 Enhanced Report

29 多樣化結果輸出功能（Report）：只要有 圖示處皆可輸出至Report，
如：搜尋條件、搜尋結果及合成計畫等。

30 依結構做搜尋：使用者可利用繪圖軟體繪製要搜尋的分子或反應式，或是藉由化合物名轉換成結構的方式做搜尋！
主題 2 :反應搜尋_依結構搜尋 依結構做搜尋：使用者可利用繪圖軟體繪製要搜尋的分子或反應式，或是藉由化合物名轉換成結構的方式做搜尋！

31 主題 2 :反應搜尋_依結構搜尋 搜尋畫面 搜尋：反應、化合物 & 文獻搜尋 搜尋項目：可使用繪圖軟體以結構的方式來搜尋反應、化合物及文獻。
啟用線上繪圖軟體MarvinSketch/Elemental來畫結構 反應搜尋條件 提供Elemental、MarvinSketch等讓使用者選擇繪製分子結構或反應的軟體；預設為MarvinSketch（需JAVA支援），可點擊空白處兩下以啟動。 另可依據化合物名稱、InChI-Key及Smiles來做搜尋。 搜尋：反應、化合物 & 文獻搜尋

32 主題 2 :反應搜尋_附加搜尋選項 Reaction data November 24, Slide 32

33 Elemental 利用Elemental線上繪圖軟體繪製分子結構/反應式 Element Chooser Reaxys Generics

34 主題 2 :反應搜尋_ Thalidomide 沙利竇邁的合成 – Thalidomide 輸入化合物名稱Thalidomide並轉換成結構

35 主題 2 :反應搜尋_結果畫面 限縮項目：建議使用Analysis View以圖像的方式同時分析兩種欄位。 輸搜尋結果

36 主題 2 :反應搜尋_結果畫面 文獻連結

37 主題 2 :反應搜尋_結果畫面 匯出至報告 Report

38 Analyzing in REAXYS 視覺化分析工具 Analysis View

39 視覺化分析工具 - Analysis View

40 主題3 : 合成計畫 - Thalidomide 開啟合成計畫 - Synthesis plans

41 主題3 : 合成計畫 - Thalidomide 開啟合成計畫 - Manually 一步一步建立合成計畫

42 主題3 : 合成計畫 - Thalidomide 開啟合成計畫 - Manually

43 Analyzing in REAXYS 自動合成計畫 Auto Plan

44 主題3 : 合成計畫 - Thalidomide 開啟合成計畫 - Auto plan 一次開啟所有合成計畫

45 主題3 : 合成計畫 - Thalidomide 匯出至報告

46 主題3 : 合成計畫 - Thalidomide 報告內容 及時 寄送功能! ]

47 主題4 : 文獻搜尋 入口畫面

48 主題4 : 文獻搜尋 輸入關鍵字

49 主題4 : 文獻搜尋 附加搜尋選項

50 主題4 : 文獻搜尋 搜尋結果畫面

51 主題4 : 文獻搜尋

52 PRESENTER NAME | DATE | TITLE
主題4 : 文獻搜尋

53 多樣化結果輸出功能 - Enhanced Report
輸出結果 搜尋紀錄輸出 反應搜尋結果輸出 化合物搜尋結果輸出 文獻搜尋結果輸出

54 相關資源

55 相關資源 Reaxys info ：

56 Elsevier台灣官網: Reaxys資訊下載

57 如有相關問題請連絡 相關網頁 劉 惠 賢 Karen.Liu@elsevier.com 電話:(02)2522-5911
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