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主要内容:介绍新陈代谢的概念和研究方法,生物能力学的基本内容和高能化合物的概念和特点。
第十九章 代谢引论和生物能学概述 主要内容:介绍新陈代谢的概念和研究方法,生物能力学的基本内容和高能化合物的概念和特点。 思考
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目录 第一节 新陈代谢通论 第二节 新陈代谢研究方法 第三节 生物能学简介 第五节 高能化合物
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第一节 新陈代谢通论 一、新陈代谢概念 二、能量代谢在新陈代谢中的重要地位 三、新陈代谢的调节 四、代谢中常见的有机反应
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一、新陈代谢的概念 新陈代谢(metabolism)是生命最基本的特征之一,泛指生物与周围环境进行物质交换、能量交换和信息交换的过程。生物一方面不断地从周围环境中摄取能量和物质,通过一系列生物反应转变成自身组织成分,即所谓同化作用(assimilation);另一方面,将原有的组成成份经过一系列的生化反应,分解为简单成分重新利用或排出体外,即所谓异化作用(dissimilation ),通过上述过程不断地进行自我更新。 特点:特异、有序、高度适应和灵敏调节、代谢途径逐步进行
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新陈代谢的概念及内涵 小分子 大分子 合成代谢(同化作用) 需要能量 释放能量 分解代谢(异化作用) 大分子 小分子 新陈代谢 能量代谢
小分子 大分子 合成代谢(同化作用) 需要能量 释放能量 分解代谢(异化作用) 大分子 小分子 新陈代谢 能量代谢 物质代谢 信息交换
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生物界能量传递及转化总过程 太 阳 ATP ADP ADP ATP 自养细胞 光合作用 电子传递 合成 (CH2O) CO2 +O2
太 阳 (光 能) 自养细胞 光合作用 电子传递 (电 能) ATP ADP (化 学 能) 合成 生物界能量传递及转化总过程 (CH2O) +O2 CO2 +H2O 分解 呼吸作用 (化 学 能) 电子传递 异养细胞 (电 能) ADP ATP 生命现象 (化 学 能) 生物合成 机 械 功 主动运输 生物发光 生物发电 生物发热
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三、新陈代谢的调节 分子水平 细胞水平 整体水平
生物机体的新陈代谢是一个完整的整体,机体代谢的协调配合,关键在于它存在有精密的调节机制。代谢的调节使生物机体能适应其内、外复杂的变化环境,从而得以生存。这种精密的调节机制是生物在长期演化中获得的。 代谢调节可分为三个不同水平: 分子水平 细胞水平 整体水平
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四、代谢中常见的有机化学反应机制 基团转移反应 氧化-还原反应 消除、异构化和重排反应 碳-碳键的形成与断裂反应
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第二节 新陈代谢研究方法 一、同位素示踪法 二、酶抑制剂的应用 三、气体测量法 四、核磁共振波谱法 五、利用遗传缺陷症研究代谢途径
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第三节 生物能学简介 一、有关热力学的一些基本概念 二、自由能的概念 三、化学反应中自由能的变化和意义 四、生物体的能流和能量产生的三个阶段
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一、有关热力学的一些基本概念 体系、环境、状态 能的两种形式 — 热与功
热力学第一定律和内能(internal energy)、焓(enthalpy) 热力学第二定律和熵(entropy) 自由能(free energy)
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二、自由能(free energy) 物理意义:-ΔG=W* (体系中能对环境作功的能量) 自由能的变化能预示某一过程能否自发进行,即:
自由能的概念对于研究生物化学过程的力能学具有很重要的意义,生物体用于作功的能量正是体内化学反应释放的自由能,生物氧化释放的能量也正是为有机体利用的自由能。它不仅可以用来判断机体内某一过程能否自发进行,而且还可以利用自由能这个函数来计算反应的其它有用参数。
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三、 化学反应中自由能的变化和意义 1、化学反应的自由能变化的基本公式 2、化学反应自由能变化与平衡常数和电势的关系
ΔG=ΔH-TΔS 2、化学反应自由能变化与平衡常数和电势的关系 3、偶联化学反应ΔG°′变化的可加性 4、能量学用于生物化学反应中的一些规定
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化学反应自由能的变化和平衡常数的关系 假设有一个化学反应式:aA + bB = cC + dD 恒温恒压下:ΔG′=ΔG°′+ RTlnQc
式中:ΔG°′= - RTlnKeq ΔG′ — 某一化学反应随参加化学反应物质的浓度、发生化学反应的pH和温度而改变的自由能变化。 Qc - 浓度商: ΔG°′ — 标准条件(T=298OK,大气压为1atm,反应物和生成物浓度为1mol/L,pH=7.0)下,化学反应自由能的变化。 Keq - 平衡常数: 例:计算磷酸葡萄糖异构酶反应的自由能变化
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化学反应自由能的变化和氧化-还原电势的关系
任何一个氧化-还原反应,在理论上都可以构建成一个原电池。 氧化-还原物质连在一起,都可以有氧化-还原电势产生,任何氧 还电对都有其特定的标准电势原(E0),电池的标准电动势可用下 式计算: 0( ΔE0 ) = E0正极-E0负极 生物体内的氧化还原物质在进行氧化-还原反应时,基本原理 和原电池一样。 氧化-还原反应自由能的变化与标准电势的关系如下: ΔG°′=-nFΔE°′ 氧化-还原反应自由能的变化与标准电势的关系如下: 0( ΔE0 ) = (RT/nF)lnKeq = 2.3 (RT/nF)lgKeq 例:计算NADH氧化反应的ΔG°′
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ΔE0 = E0正极-E0负极=+0.34V -(-0.76V)=+1.10V
检流计 盐桥 ZnSO4 CuSO4 e + - 原电池示意图 负极反应: Zn=Zn2++2e E0 Zn2+/ Zn= V 正极反应: Cu=Cu2++2e E0 Cu2+/ Cu=+ 0.34V ΔE0 = E0正极-E0负极=+0.34V -(-0.76V)=+1.10V
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计算磷酸葡萄糖异构酶反应的自由能变化 解:
例题: 反应G-1-PG-6-P在380C达到平衡时, G-1-P占5%,G-6-P占95%,求Δ G0。如果反应未达到平衡,设[G-1- P]=0.01mol.L, [G-6-P]=0.001mol.L,求反应的Δ G是多少? 达平衡时 =Keq=19 解: ΔG°′= - RTlnKeq =-2.3038.314 311 log19 =-7.6KJ.mol-1 未达平衡时 =Qc=0.1 ΔG′=ΔG°′+ RTlnQc (Qc-浓度商) = 8.314 311 log0.1 =-13.6KJ.MOL-1
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NADH+H++1/2O2====NAD++H2O 正极反应:1/2O2+2H++2e H2O E+°′ 0.82
例题:计算下反应式ΔG°′ NADH+H++1/2O2====NAD++H2O 正极反应:1/2O2+2H++2e H2O E+°′ 0.82 负极反应:NAD++H++2e NADH E-°′ -0.3 ΔG°′-nFΔE°′ -2×96485×[0.82-(-0.32)] -220 KJ·mol-1
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3、偶联化学反应ΔG°′变化的可加性 在偶联的化学反应中,各反应的标准自由能变化是可以相加的:例:
A = B+C ΔG°′= KJ/mol B = D ΔG°′= KJ/mol 则 A = C + D ΔG°′= KJ/mol 该规则表明一个在热力学上不利的反应,可以与热力学有利的反应偶联进行,即可以被热力学有利的反应所驱动而进行。这在生物化学反应中是很多的。
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4、能量学用于生物化学反应中的一些规定 1、在稀的水溶液系统中,如果有水作为反应物或产物时, 水的浓度(近似的即活度)为1.0。
2、生物体标准状况的pH规定为7.0。 3、 ΔG°′是 pH为7.0时的标准状况下的的标准自由能。 4、根据国际单位制(Le Systeme international Unut ,简称 SI单位),热和能量的单位用焦耳/摩尔(Joules/mol)。
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生物系统中的能流
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小分子化合物分解成共同的中间产物(如丙酮酸、乙酰CoA等)
生物体内能量产生的三个阶段 脂肪 多糖 蛋白质 大分子降解成基本结构单位 葡萄糖、其它单糖 脂肪酸、甘油 氨基酸 小分子化合物分解成共同的中间产物(如丙酮酸、乙酰CoA等) 乙酰CoA 共同中间物进入三羧酸循环,氧化脱下的氢由电子传递链传递生成H2O,释放出大量能量,其中一部分通过磷酸化储存在ATP中。 +Pi 磷酸化 三羧酸循环 e- 电子传递(氧化)
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第五节 高能化合物 生化反应中,在水解时或基团转移反应中可释放出大量自由能(>21千焦/摩尔)的化合物称为高能化合物。
第五节 高能化合物 生化反应中,在水解时或基团转移反应中可释放出大量自由能(>21千焦/摩尔)的化合物称为高能化合物。 一、高能化合物的类型 二、ATP的特点及其特殊作用
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高能化合物类型
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ATP的特点 在pH=7环境中,ATP分子中的三个磷酸基团完全解离成带4个负电荷的离子形式(ATP4-),具有较大势能,加之水解产物稳定,因而水解自由能很大(ΔG°′=-30.5千焦/摩尔)。 腺嘌呤—核糖— O — P — O — P — O — P — O- O O- + Mg2+ ATP4- + H2O = ADP3- + Pi2- + H G =-30.5kJ•MOL-1 ATP3- + H2O = ADP2- + Pi3- + H G =-33.1kJ•MOL-1
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ATP在能量转运中地位和作用 ~P ATP ★ ATP是细胞内的“能量通货” ★ ATP是细胞内磷酸基团转移的中间载体 2 10 8 6 4
2 10 8 6 4 12 14 磷酸基团转移能 磷酸烯醇式丙酮酸 3-磷酸甘油酸磷酸 磷酸肌酸(磷酸基团储备物) 6-磷酸葡萄糖 3-磷酸甘油
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