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第三节 蛋白质的生物合成 biosynthesis of protein.

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1 第三节 蛋白质的生物合成 biosynthesis of protein

2 蛋白质的生物合成,即翻译: 以mRNA为模板形成蛋白质的过程, 将核酸中 4 种核苷酸序列编码的遗传信息, 通过遗传密码破译的方式, 解读为 蛋白质一级结构中20种氨基酸的排列顺序 。

3 主要内容 参与蛋白质生物合成的主要物质 蛋白质生物合成的过程 翻译后的加工

4 蛋白质生物合成体系 合成方向:N C端 mRNA和密码子、tRNA、rRNA n 氨基酸 蛋白质
酶、辅助因子、蛋白质因子、ATP、GTP、无机离子 合成方向:N C端

5 (一)、mRNA——翻译的模板 密码子 3/ 5 /
CAACUGCAGACAUAUAUGAUACAAUUUGAUCAGUAU -Gln-Leu-Gln-Thr-Tyr-Met-Ile-Gln-Phe-Asp-Gln-Tyr-

6 mRNA分子中,从5’-3’每三个相邻的 密码子: 碱基组成的三联体,代表某个氨基酸 共有64种 (codon) UAA、UAG、UGA
61种 代表20中氨基酸 3种 UAA、UAG、UGA 终止密码 AUG 起始密码 蛋氨酸 细菌中GUG表示起始的甲酰蛋氨酸

7 第一碱基 (5’ 端) 第 二 碱 基 第三碱基 (3’ -端) 终止 * *在mRNA起始部位的AUG为起始信号 遗传密码表

8 遗传密码 三联体, 不重复、 不间断

9 遗传密码的特点 方向性 通用性 简并性 连续性 摆动性 5’ ’ 绝大多数密码子对各种生物都适用

10 同义密码子 ——对应于同一种AA的不同密码子 Met 和Trp仅一个密码子 简并性的生物意义在于减少有害突变
简并性: 同一氨基酸具有多种密码子 第1、2位 第3位 决定密码的特异性 同义密码 摆动 同义密码子 ——对应于同一种AA的不同密码子 Met 和Trp仅一个密码子 简并性的生物意义在于减少有害突变

11 第一碱基 (5’ -端) 第 二 碱 基 第三碱基 (3’ -端) 终止 * *在mRNA起始部位的AUG为起始信号 遗传密码表

12 碱基的改变仍有可能编码原来的AA

13 摆动性: 反密码与密码间不严格遵守常见的 碱基配对规律 密码子与反密码子的配对 识别 反密码子 密码子 (mRNA) (tRNA)
摆动性: 反密码与密码间不严格遵守常见的 碱基配对规律 密码子与反密码子的配对 识别 反密码子 密码子 (mRNA) (tRNA) I A、C、U U A、G G C、U (摆动配对) 第1位 第3位

14 决定密码的 特异性 第1、2位 摆动性 第3位

15 连续性:无标点、不重叠 每三个核苷酸只编码一个氨基酸 沿5’-3’方向连续阅读 插入碱基 缺失碱基 移码 突变

16 5′…. UACGGACAUCUG….3′ 5′….UACCGGACAUCUG….3′ 半胱 5′…. UACGACAUCUG….3′ 异亮 插入 缺失

17 密码子在蛋白质中出现的频率

18 密码的防错系统 密码子在密码表中的分布有一定的规则: 通常情况: 第二位决定氨基酸的极性, 第三位决定密码子的简并性。 如 第二位的碱基
U 极性的氨基酸; C 非极性或不带电荷的极性侧链氨基酸; A或G 极性的氨基酸;

19 这样,合成的蛋白质功能差别不会太大。 第一位 A 或 C 第二位 A 或 G ——极性并具有碱性氨基酸 前两位的碱基是AG
(AGN) ——极性并具有酸性氨基酸 这样的分布规律 ? 使碱基的变化有时不会引起氨基酸的变化 ——编码相同的AA, 若引起氨基酸变化也是同类型氨基酸相互取代 ——理化性质接近的AA, 这样,合成的蛋白质功能差别不会太大。

20 第一碱基 (5’ -端) 第 二 碱 基 第三碱基 (3’ -端) 终止 * *在mRNA起始部位的AUG为起始信号 遗传密码表

21 (二)、tRNA——搬运氨基酸 1.结合氨基酸:由ATP供能,将氨基酸结合在tRNA3’-CCA位置. 一种氨基酸有几种tRNA携带;
2.反密码子: 决定所带氨基酸,并准确在mRNA上对号入座. ser 5’ tyr

22 氨基酰tRNA的表示方法 丙氨基酰tRNA: ala-tRNAala 精氨基酰tRNA: arg-tRNAarg 甲硫氨基酰tRNA: met-tRNAmet

23 (三)、核糖体——蛋白质合成的场所 rRNA + 蛋白质 不同的tRNA结合位点: 大亚基 小亚基
大亚基 小亚基 原核 50s s =70s 真核 60s s =80s P A 不同的tRNA结合位点: A位 -氨酰tRNA结合位; P位 -肽酰基tRNA结合位;

24 二 、翻译的五个阶段 氨基酸的活化 翻译起始 进位 转肽 脱落 移位 肽链延长 肽链终止 肽链折叠和加工

25 与翻译五个阶段有关的物质

26 参与翻译的蛋白质因子 阶段 原核 真核 功 能 IF1 IF2 eIF2 参与起始复合物的形成 IF3 eIF3、eIF4C
阶段 原核 真核 功 能    IF1    IF2   eIF 参与起始复合物的形成     IF3   eIF3、eIF4C 起始      CBP I 与mRNA帽子结合         eIF4A B F 参与寻找第一个AUG         eIF 协助eIF2、eIF3、eIF4C的释放         eIF 协助60S亚基从无活性的核糖体上解离    EF-Tu  eEF1 协助氨酰-tRNA进入核糖体 延长 EF-Ts  eEF1  帮助EF-Tu 、 eEF1周转    EF-G  eEF 移位因子    终止 RF eRF 释放完整的肽链    RF-2 RF-3

27 1. 氨基酸的活化——氨酰tRNA的生成 二 、翻译 氨基酸 + ATP+ tRNA 氨酰-tRNA合成酶
氨基酰-tRNA + AMP + PPi 氨基酸活化态

28 Gly tRNA 氨基酰tRNA 氨基酸+ATP+tRNA氨基酰 氨基酰-tRNA+AMP+ppi 氨基酰tRNA R O 合成酶
H2N-CH-C-AMP-E R O 氨基酰tRNA 合成酶 Gly H2N-CH-C-OH R O Gly PPi 氨基酰tRNA 合成酶 tRNA ATP Gly 氨基酰tRNA H2N-CH-C~O-ACC-tRNA R O

29 氨基酰tRNA的生成 氨酰-tRNA合成酶

30 两种氨酰-tRNA合成酶作用

31 (a) 氨酰-tRNA合成过程 (b) AMP—AA-—E

32  氨酰-tRNA合成酶:   特异性强,催化特定氨基酸与特异的tRNA结合, 每种氨基酸有特异的合成酶催化, 此种特异性保证了遗传信息翻译的准确性

33 关于tRNA 识别氨酰-RNA合成酶的位点: 倒L结构中 参与此作用 DHU环 反密码环 氨基酸臂
核糖体识别位点:倒L结构中 TψC环与此有关。 DHU环 反密码环 氨基酸臂

34 tRNA与酶结合的模型 tRNA ATP 氨酰-tRNA合成酶

35 大肠杆菌tRNAAla氨基酸臂是酶的辨认位点
辨认位点:73位 3位-70位碱基对 可变环-形成空腔

36 4种tRNA的辨认核苷酸

37 2、起始阶段 小亚基 IF-1,2,3 GTP 大亚基 mRNA Met-tRNA (fMet-tRNA) 起始复合体

38 起始复合物的形成过程(原核) 大亚基 小亚基

39 反密码子 密码子

40 肽链的延长动画

41 3. 肽链的延长阶段 条件: EF-Tu EF-Ts EF-T EF-G 1 延长因子(EF) 2 GTP

42 肽链延长过程中4个重复反应 肽链延长过程中的耗能 进位 移位 转肽 脱落

43 转肽反应:

44 4、终止阶段 A位 出现终止密码子 释放因子 进入A位 肽酰转移酶 变为水解酶作用 在GTP帮助下多肽链水解 大、小亚基分离。
肽酰转移酶 变为水解酶作用 在GTP帮助下多肽链水解 大、小亚基分离。 释放因子对终止密码子识别: RF1 识别UAA、UAG RF2 识别UAA、UGA, RF3 协助二者起作用。

45 三、蛋白质合成后的靶向输送 概念:蛋白质合成后定向到达其功能部位过程 信号序列(signal sequence)
靶向输送 蛋白质结构中存在分选信号 信号序列(信号肽)——指N末端特异氨基酸序列,可引导蛋白质转移到细胞的适当靶部位的序列。

46 (一)蛋白质运输——信号肽引导 信号肽结构特点: 碱性区 Ala 交界区(切点) 疏水区 有功能区 非螺旋C末端区

47 若干蛋白质信号肽特点: (切点)

48 四、蛋白质翻译后修饰 新生多肽链的需要加工才能转变为天然构 象的功能蛋白。主要包括: 肽链折叠为天然的三维结构肽链 一级结构的修饰
高级结构修饰

49 (二) 、多肽链折叠为天然构象的蛋白质 分子伴侣 (molecular chaperon)
分子伴侣是细胞一类保守蛋白质,可识别肽链的非天然构象,促进各功能域和整体蛋白质的正确折叠。 1.热休克蛋白(heat shock protein, HSP):     HSP70、HSP40和GreE族 2.伴侣素(chaperonins):      GroEL和GroES家族

50 多肽链折叠的三种形式 分子伴侣非依赖性折叠 依赖于热休克蛋白Hsp70的折叠; 依赖于热休克蛋白Hsp70 和分子伴侣复合体的折叠

51 伴侣素GroEL/GroES系统促进蛋白质折叠过程

52 折叠过程需要的酶 蛋白二硫键异构酶 (内质网活性高) 肽-脯氨酰顺反异构酶 催化 错配二硫键断裂,形成正确二硫键,
蛋白二硫键异构酶 (内质网活性高) 催化 错配二硫键断裂,形成正确二硫键, 使蛋白质形成热力学最稳定天然构象。 肽-脯氨酰顺反异构酶 在肽链合成需形成顺式构型时,可使多肽在各脯氨酸弯折处形成准确折叠。 ——是蛋白质三维构象形成的限速酶

53 (三)、一级结构的修饰 1. N端修饰 脱甲 酰基酶 氨基肽酶 fMet- Met- 真核细胞 原核生物

54 高级结构的修饰 2. 氨基酸残基的修饰: 磷酸化、羟基化、乙酰化、糖基化… 3. 水解加工:酶前体的活化 亚基聚合 Hb4亚基的聚合
辅基连接 疏水脂链的共价连接

55 五、蛋白质生物合成的干扰和抑制 Interference & Inhibition of Protein Biosynthesis
抗生素(antibiotics) 指微生物产生的能够杀灭或抑制细菌的一类药物。 抗代谢药物 指能干扰生物代谢过程,从而抑制细胞过度生长的药物,如:6-MP。 某些毒素 也作用于基因信息传递过程。

56 (一)、抗生素类 抗生素抑制蛋白质生物合成的原理 抗生素 作用点 作用原理 应用 四环素族(金霉素 新霉素、土霉素)
链霉素、卡那霉素、新霉素 氯霉素、林可霉素 红霉素 梭链孢酸 放线菌酮 嘌呤霉素 原核核蛋白体小亚基 原核核蛋白体大亚基 真核核蛋白体大亚基 真核、原核核蛋白体 抑制氨基酰-tRNA与小亚基结合 改变构象引起读码错误、抑制起始 抑制转肽酶、阻断延长 抑制转肽酶、妨碍转位 与EFG-GTP结合,抑制肽链延长 氨基酰-tRNA类似物,进位后引起未成熟肽链脱落 抗菌药 医学研究 抗肿瘤药

57 氯霉素 放线菌酮 嘌呤霉素 链霉素和卡那霉素 四环素族

58 (二)、其他干扰蛋白质生物合成的物质 毒素(toxin) 干扰素(interferon)

59 白喉毒素(diphtheria toxin)的作用机理
+ 延长因子-2 (有活性) 白喉毒素 延长因子-2 (无活性) +

60 干扰素的作用机理 1. 诱导eIF2磷酸化而失活 dsRNA 干扰素诱导的蛋白激酶 eIF2 eIF2-P(失活) 磷酸酶 ADP ATP
Pi 磷酸酶 起始因子

61 2.干扰素间接活化一种核酸内切酶,此酶使病毒mRNA降解,从而阻断蛋白质合成
dsRNA 干扰素 A P PPP 2 5 2- 5A ATP 2-5A合成酶 RNaseL 活化 降解mRNA

62 谢谢!


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