座標系統與圖形介面分子結構的建立.

座標系統與圖形介面分子結構的建立

建立分子結構是化學計算的首要工作直角坐標 (每個原子的 x, y, z) 分子內部座標 (鍵長，鍵角，二面角)
圖形介面 (應用軟體的圖形工具) GaussView, Spartan, Chem3D 等　

直角坐標適用於直線、高對稱分子、晶體結構
直角坐標適用於直線、高對稱分子、晶體結構 CO2 O C O PtCl42- Pt Cl Cl Cl Cl

分子內部坐標中小型分子最直覺的結構指定方式 (鍵長，鍵角二面角)
分子內部坐標中小型分子最直覺的結構指定方式 (鍵長，鍵角二面角) H2O H O 1 0.97 H 2 0.97 1 104.0 CH3Cl Cl C H H H

分子內部坐標一個鍵長二個鍵角方式 NH3 (C3v) N H 1 R H 1 R 2 A H 1 R 2 A 3 A 1 R = 0.95 A = 107.0 1 2 4 3

分子內部坐標搭配虛擬原子方式 X X C2H2 (Dh) H C 1 RCH X C 2 RCC X H 4 RCH RCH = 1.06 RCC = 1.20

圖形介面便於建構大分子，與計算軟體整合

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