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第二章 酶的生物合成与发酵生产 提取分离法 微生物细胞发酵产酶 酶的生产方法 生物合成法 植物细胞发酵产酶 化学合成法 动物细胞发酵产酶
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第一节 酶生物合成及调节 一、酶的生物合成 遗传信息传递的中心法则 DNA 复制 转录 逆转录 蛋白质 RNA 翻译
第一节 酶生物合成及调节 一、酶的生物合成 遗传信息传递的中心法则 转录传递给RNA,再由RNA 蛋白质 翻译 转录 逆转录 复制 DNA RNA
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(一)RNA的生物合成--转录(transcription)
定义 以DNA为模板,以核苷三磷酸为底物,在RNA聚合酶(转录酶)的作用下,生成RNA分子的过程。 .
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转录模板 反意义链:指导转录作用的一条DNA链 有意义链:无转录功能的一条DNA链. DNA 5´ 3´ 3´ 5´
模板链(template strand)反意义链(antisense strand) 启动子(promotor) 终止子(terminator) 5´ 3´ 3´ 5´ DNA 编码链 (coding strand) 有意义链(sense strand) 反意义链:指导转录作用的一条DNA链 有意义链:无转录功能的一条DNA链.
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RNA在DNA模板上的生物合成 有意义链 反意义链 RNA聚合酶 PPi UTP RNA GTP ATP CTP UTP 5’ 5’ 3’
T C G A G T A C A G C T C A T G 反意义链 RNA聚合酶 C G A G U A C G C A U 3’ PPi UTP RNA 5’ GTP ATP CTP UTP RNA在DNA模板上的生物合成
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RNA的转录过程(三步) 1.起始 2.延长 3.终止
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E. coli的RNA聚合酶是由四种亚基组成的五聚体( 2 )
原核生物的RNA聚合酶(DDRP) E. coli的RNA聚合酶是由四种亚基组成的五聚体( 2 ) 起始因子
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RNA合成过程 离开 起始 双链DNA局部解开 5 5 磷酸二酯键形成 3 5 延长阶段 5 3 3 5
启动子(promotor) 终止子(terminator) RNA聚合酶 起始 双链DNA局部解开 5 5 磷酸二酯键形成 离开 3 5 延长阶段 5 3 3 5 解链区到达基因终点 终止阶段 5 3 RNA
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RNA链的延伸图解 3´ 5´ RNA-DNA杂交螺旋 聚合酶的移动方向 新生RNA 复链 解链 有义链 模板链(反义链) 延长部位
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(二)蛋白质的生物合成--翻译(translation)
定义 以mRNA为模板,以氨基酸为底物,在核糖体上通过各种tRNA、酶和辅助因子的作用,合成多肽链的过程。
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酪 酪氨酰- tRNA 5’ 反密码 AUG GUU UAC ACA mRNA 5’ 3’ 密码与反密码的碱基配对
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给 位 (P位) 受 位 (A位) 蛋 苏 大亚基 小亚基 UGU 5’ AUG ACA GUU 3’
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蛋白质的合成过程 (大肠杆菌) 氨基酸的活化 肽链合成的起始 肽链的延伸 肽链合成的终止与释放
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氨基酸的活化与转运 反应式: AA + tRNA + ATP 氨酰-tRNA+AMP+PPi
对于E.coli而言,肽链合成时的第一个氨基酸都是甲酰甲硫氨酸(fMet)。
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在核糖体上合成多肽(三阶段) 1、起始阶段 2、延伸阶段 3、终止阶段
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肽链合成的起始阶段 1.mRNA与小亚基结合:形成30S-mRNA-IF3复合物 2.AUG与蛋氨酰-tRNA结合: 3.大小亚基结合
fMet-tRNA-IF2-GTP fMet-tRNA正好位于mRNA的起始密码子上(AUG)。 3.大小亚基结合 IF1 30S起始复合物
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肽链合成的起始阶段 mRNA 小亚基 蛋氨酰tRNA 给位 受位 蛋 蛋 大亚基 GTP GDP+Pi AUG ACA 5’ 3’ UAC
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肽链合成的延伸阶段 1.进位:氨基酰-tRNA进入受位; 2.转肽:形成肽键,在转肽酶作用下,给位与
受位结合; 3.移位:核蛋白体向3’端移动一个密码子的 位置,空出受位,不断地进位、转肽、 移位,使肽链延长。
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苏 蛋 蛋 苏 起始复合体 进位 蛋 蛋 苏 苏 移位 转肽 GTP GDP+Pi Mg+ K+ GDP+Pi GTP UGU UAC
AUG ACA AUG ACA GUU 3’ 5’ 3’ GTP GDP+Pi 5’ 起始复合体 进位 Mg+ K+ 蛋 蛋 苏 苏 UGU UAC UGU AUG ACA GUU AUG ACA GUU 3’ 5’ 3’ GDP+Pi GTP 5’ 移位 转肽
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肽链合成的终止阶段 1.出现终止密码并与终止因子结合; 2.肽键水解,多肽释放; 3.tRNA,mRNA,大小亚基解离.
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肽链 终 终 终 终 UAC UAC AUG UAA AUG UAA 5’ 3’ 5’ 3’ 5’ 3’ UAC UAC AUG UAA
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二、酶生物合成的调节 定义:通过调节酶合成的量来控制微生物代谢速度的调节机制,是在基因转录水平上进行的。 意义:通过阻止酶的过量合成,节约生物合成的原料和能量。
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(一)基因调控理论 Jacob and Monod的操纵子学说(operon theory)
操纵子——基因表达的协同单位 操纵子 结构基因(编码蛋白质, structural gene, S) 控制部位 操纵基因(operator gene, O) 启动子(promotor gene, P)
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基因操纵子调节系统示意图 操纵子 调节基因 启动基因 操纵基因 结构基因 DNA 控制区 信息区 转录 (-) RNA聚合酶 (+) 转录
调节基因 启动基因 操纵基因 结构基因 DNA 转录 (-) RNA聚合酶 (+) 转录 翻译 mRNA 翻译 阻遏蛋白 蛋白质 诱导剂 操纵子 控制区 信息区
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调节基因(regulator gene):
可产生一种组成型调节蛋白(regulatory protein) (一种变构蛋白),通过与效应物(effector) (包括诱导物和辅阻遏物)的特异结合而发生变构作用,从而改变它与操纵基因的结合力。 调节基因常位于调控区的上游。
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启动基因(promotor gene)(启动子):
有两个位点: (1)RNA聚合酶的结合位点 (2)cAMP-CAP的结合位点。 CAP:分解代谢产物基因活化蛋白(catabolite gene activator protein),又称环腺苷酸受体蛋白(cAMP receptor protein,CRP)。 只有cAMP-CRP复合物结合到启动子的位点上,RNA聚合酶才能结合到其在启动子的位点上,酶的合成才能开始。 cAMP-CRP复合物的作用示意图
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结构基因(Structural gene):
操纵基因(Operater gene): 位于启动基因和结构基因之间的一段碱基顺序,能特异性地与调节基因产生的变构蛋白结合,操纵酶合成的时机与速度。 结构基因(Structural gene): 决定某一多肽的DNA模板,与酶有各自的对应关系,其中的遗传信息可转录为mRNA,再翻译为蛋白质。
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(二) 酶合成调节的类型 1.诱导 (induction) 组成酶:细胞固有的酶类。 诱导酶:是细胞为适应外来底物或其结构类似
物而临时合成的一类酶。 2.阻遏 (repression) 分解代谢物阻遏(catabolite repression) 反馈阻遏(feedback repression)
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(三)酶合成的调节机制 1. 酶合成的诱导 加进某种物质,使酶生物合成开始或加速进行。 酶合成诱导的现象:
(三)酶合成的调节机制 酶合成的诱导 加进某种物质,使酶生物合成开始或加速进行。 酶合成诱导的现象: 已知分解利用乳糖的酶有: -半乳糖苷酶; -半乳糖苷透过酶;硫代半乳糖苷转乙酰酶。 实验:(1)大肠杆菌生长在葡萄糖培养基上时,细胞内无上述三种酶合成; (2)大肠杆菌生长在乳糖培养基上时,细胞内有上述三种酶合成; (3)表明菌体生物合成的经济原则:需要时才合成。
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诱导 A、乳糖操纵子的结构 B、乳糖酶的诱导 基 因 关 闭 启动子 乳糖结构基因 调节基因 操纵基因 R P O LacZ LacY
Laca 基 因 关 闭 mRNA 阻遏蛋白(有活性) B、乳糖酶的诱导 P LacZ LacY Laca 调节基因 操纵基因 乳糖结构基因 启动子 O R mRNA mRNAZ mRNAY mRNAa 基 因 表达 阻遏蛋白(无活性) 乳糖 阻遏蛋白(有活性)
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2.末端产物阻遏 由某代谢途径末端产物的过量累积引起的阻遏。 酶合成阻遏的现象: 实验: (1)大肠杆菌生长在无机盐和葡萄糖的培养基上时, 检测到细胞内有色氨酸合成酶的存在; (2)在上述培养基中加入色氨酸,检测发现细胞内色氨酸合成酶的活性降低,直至消失。 (3)表明色氨酸的存在阻止了色氨酸合成酶的合成,体现了菌体生长的经济原则:不需要就不合成。
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色氨酸操纵子——酶的阻遏 代谢产物与阻遏蛋白结 合,使之构象发生变化 与操纵基因结合,结构基 因不能表达 阻遏蛋白不能与操纵基因结合,
结构基因 结构基因 操纵基因 操纵基因 调节基因 调节基因 mRNA 辅阻遏物 酶蛋白 代谢产物与阻遏蛋白结 合,使之构象发生变化 与操纵基因结合,结构基 因不能表达 阻遏蛋白不能与操纵基因结合, 结构基因表达
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代谢产物与阻遏蛋白结合,从而使阻遏蛋白能够阻挡操纵基因,结构基因不表达
A.有活性阻遏蛋白 操纵基因 启动基因 调节基因 结构基因 阻遏蛋白(有活性) 阻遏蛋白阻挡操纵基因结构基因不表达 酶的诱导和阻遏操纵子模型 B.有活性阻遏蛋白加诱导剂 诱导物 诱导物与阻遏蛋白结合,使阻遏蛋白不能起到阻挡操纵基因的作用,结构基因可以表达 酶蛋白 mRNA C.无活性阻遏蛋白 阻遏蛋白不能跟操纵基因结合, 结构基因可以表达 阻遏蛋白(无活性) 酶蛋白 mRNA D.无活性阻遏蛋白加辅阻遏剂 代谢产物与阻遏蛋白结合,从而使阻遏蛋白能够阻挡操纵基因,结构基因不表达 代谢产物
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酶合成的诱导与阻遏操纵子模型调控作用对比
调控方式 阻遏蛋白 添加物 与操纵基因结合 阻遏效应 举例 酶的诱导 有活性 - + 不转录, 继而不翻译 诱导物 转录, 继而翻译 乳糖操纵子 酶的阻遏 无活性 阻遏物 色氨酸操纵子
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3.分解代谢物阻遏 指细胞内同时有两种分解底物(碳源或氮源)存在时,利用快的那种分解底物会阻遏利用慢的底物的有关酶合成的现象。
分解代谢物的阻遏作用,并非由于快速利用的甲碳源本身直接作用的结果,而是通过甲碳源(或氮源等)在其分解过程中所产生的中间代谢物所引起的阻遏作用。
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分解代谢物阻遏现象: 实验:细菌在含有葡萄糖和乳糖的培养基上生长,优先利用葡萄糖。待葡萄糖耗尽后才开始利用乳糖,产生了两个对数生长期中间隔开一个生长延滞期的“二次生长现象”(diauxie或biphasic growth)。 这一现象又称葡萄糖效应,产生的原因是由于葡萄糖降解物阻遏了分解乳糖酶系的合成。此调节基因的产物是环腺苷酸受体蛋白(CRP),亦称降解物基因活化蛋白(CAP)。
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CAP:降解物基因活化蛋白(catabolic gene activation protein)
分解代谢物阻遏 CAP基因 CAP结合部位 结构基因 R T P O LacZ LacY Laca T 基 因 表达 RNA聚合酶 mRNAZ mRNAY mRNAa mRNA CAP cAMP -CAP 葡萄糖 分解代谢产物 腺苷酸环化酶 磷酸二酯酶 ATP cAMP 5'-AMP 抑制 激活 葡萄糖降解物与cAMP的关系 降低cAMP浓度 cAMP 使CAP呈失活状态 CAP:降解物基因活化蛋白(catabolic gene activation protein)
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三、提高酶产量的策略 (一)菌种选育(一劳永逸) (1) 使诱导型变为组成型——选育组成型突变株 (2)使阻遏型变为去阻遏型
1.诱变育种 (1) 使诱导型变为组成型——选育组成型突变株 (2)使阻遏型变为去阻遏型 选育营养缺陷型突变株 解除反馈阻遏 选育结构类似物抗性突变株 解除分解代谢物阻遏——选育抗分解代谢阻遏突变株 2. 基因工程育种
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(二)条件控制 1. 添加诱导物 2. 降低阻遏物浓度 酶的底物类似物最有效。 产物阻遏 添加阻止产物形成的抑制剂 避免使用葡萄糖
除去终产物 产物阻遏 添加阻止产物形成的抑制剂 避免使用葡萄糖 分解代谢物阻遏 避免培养基过于丰富 添加一定量的cAMP
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3.添加表面活性剂 4. 添加产酶促进剂 表面活性剂 Tween-80 非离子型 增加细胞通透性 TritonX-100
离子型 对细胞有毒害作用 表面活性剂 Tween-80 非离子型 增加细胞通透性 TritonX-100 4. 添加产酶促进剂
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第二节 酶发酵动力学 一、细胞生长动力学 在分批培养(batch culture)过程中,细胞生长一般要经历延迟期、指数生长期、减速期、静止期和衰亡期5个阶段。
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细胞生长曲线 O-A 延迟期 A-B指数生长期 B-C减速期 C-D 静止期 D-E 衰亡期
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营养物浓度(生长限制基质浓度)和生长速率之间的动力学关系:Monod模型
µ:比生长速率(1/h) (specific growth rate) µmax:最大比生长速率(1/h) S:营养物浓度(生长限制基质浓度) 克/L Ks:莫诺德常数或饱和常数或营养物利用常数 克/L,或 mol/L
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二、产酶动力学 (一) 酶生物合成的模式 根据酶的合成与细胞生长之间的关系,可将酶的生物合成分为3种模式,即: 同步合成型 生长偶联型——
中期合成型 部分生长偶联型——延续合成型 非生长偶联型 —— 滞后合成型
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1. 生长偶联型(又称同步合成型) 特点:酶的合成可以诱导,但不受分解代谢物阻遏和反应产物阻遏。
酶的生物合成与细胞生长同步。 特点:酶的合成可以诱导,但不受分解代谢物阻遏和反应产物阻遏。 当去除诱导物、细胞进入平衡期后,酶的合成立即停止,表明这类酶所对应的mRNA很不稳定。
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生长偶联型中的特殊形式——中期合成型 酶的合成在细胞生长一段时间后才开始,而在细胞生长进入平衡期以后,酶的合成也随着停止。
特点:酶的合成受产物的反馈阻遏或分解代谢物阻遏。 所对应的mRNA是不稳定的。 枯草杆菌碱性磷酸酶合成曲线
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2.部分生长偶联型(又称延续合成型) 酶的合成在细胞的生长阶段开始,在细胞生长进入平衡期后,酶还可以延续合成较长一段时间。
特点:可受诱导,一般不受分解代谢物和产物阻遏。 所对应的mRNA相当稳定。 黑曲霉聚半乳糖醛酸酶合成曲线
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3. 非生长偶联型(又称滞后合成型) 只有当细胞生长进入平衡期以后,酶才开始合成并大量积累。许多水解酶的生物合成都属于这一类型。
特点:受分解代谢物的阻遏作用。 所对应的mRNA稳定性高。 黑曲霉酸性蛋白酶合成曲线
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总结:影响酶生物合成模式的主要因素 2)培养基中阻遏物的存在 高:可在细胞停止生长后继 1)mRNA的稳定性 续合成酶
差:随着细胞停止生长而终 止酶的合成 2)培养基中阻遏物的存在 不受阻遏:随着细胞的生长而开始酶的合成。 受阻遏:细胞生长一段时间或平衡期后,酶才开始 合成。
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酶生产中最理想的合成模式: 延续合成型:发酵过程中没有生长期和产酶期的明显差别。细胞开始生长就有酶的产生,直至细胞生长进入平衡期后,酶还可以继续生成一段时间。 对于: 同步合成型:提高对应的mRNA的稳定性,如降低发酵 温度 。 滞后合成型:尽量减少甚至解除分解代谢物阻遏,使 酶的合成提早开始。 中期合成型:要在提高mRNA稳定性以及解除阻遏两方 面努力。
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(二) 产酶动力学 一般产酶动力学方程可表达为: 式中 X——细胞浓度(g /L) ——细胞比生长速率(h-1)
——生长偶联的比产酶系数(IU/g) ——非生长偶联的比产酶速率(IU/(gh)) E——酶浓度(IU/L) t——时间(h)
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生长偶联型 部分生长偶联型 非生长偶联型
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第三节 微生物发酵产酶 一、产酶微生物的分离和选育 1.优良产酶菌种应具备的条件 (1)酶产量高 (2)易培养(生长速率高、营养要求低)
(3)遗传性能稳定,不易退化 (4)易分离提纯 (5)安全可靠(不是致病菌)
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2.常用的产酶微生物 Escherichia coli Pseudomonas Bacillus subtilis Micrococcus
Streptococcus Streptomyces Aspergillus niger Aspergillus oryzae Monascus Penicillium Trichoderma Rhizopus Mucor Absidia Saccharomyces cerevisiae Candida
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3. 产酶微生物的分离和筛选 1)样品的采集:从富含该酶作用底物的场所采集样品 2)富集培养: 投其所好,取其所抗
3)分离获得微生物的纯培养(pure culture)。 4)初筛:选出产酶菌种,以多为主。 5)复筛:选出产酶水平相对较高的菌株,以质为主。
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-淀粉酶的筛选
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蛋白酶产生菌的获得方法 应用含酪蛋白的培养基
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4.产酶微生物优良菌种的选育 诱变育种 原生质体融合育种 基因工程育种
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二.微生物发酵产酶方法 1.固体培养:特别适合于霉菌培养 2.液体培养:目前酶发酵生产的主要方式
3.固定化细胞 :需要特殊的固定化细胞反应器
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三.微生物酶的类型 1.胞外酶:大多是水解酶(如淀粉酶、蛋白酶、 纤维素酶、果胶酶),是微生物为了利用环境中的大分子而释放到细胞外的,即使胞外浓度很高,胞内也能维持较低水平,受到的调节控制少。 2.胞内酶:指合成后仍留在细胞内发挥作用的酶,酶活性和浓度受到中间产物和终产物的调控。
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酶发酵生产的一般工艺流程
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第四节 动、植物细胞培养产酶 与微生物细胞相比,动物细胞和植物细胞具有各自不同的特性,需采用各自不同的培养工艺。
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动物细胞模式图
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植物细胞结构
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植物、动物、微生物细胞的特性比较 细胞种类 植物细胞 微生物细胞 动物细胞 细胞大小/um 200~300 1~10 10~100
倍增时间/h ﹥12 0.3-6 ﹥15 营养要求 简单 复杂 光照要求 大多数要求 不要求 对剪切力 敏感 大多数不敏感 非常敏感 主要产物 色素、药物、香精、酶等 醇、有机酸、氨基酸、抗生素、核苷酸、酶等 疫苗、激素、单克隆抗体、酶等
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三者之间的差异主要有: 植物细胞>动物细胞>微生物细胞。 动物细胞、植物细胞的生产周期比微生物长。
植物细胞和微生物细胞的营养要求较简单。 植物细胞的生长以及次级代谢物的生产要求一定的光照。 植物细胞和动物细胞对剪切力敏感。 植物、微生物和动物细胞的主要目的产物各不相同。
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一、植物细胞培养产酶 1.植物细胞培养的特点 2.培养基特点 应用最广的是MS培养基和LS培养基
MS培养基是1962年由Murashinge和Skoog为烟草细胞培养而设计的培养基。LS培养基是在其基础上演变而来的。
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3.培养方法:——悬浮细胞培养 ①细胞株的建立;外植体与愈伤组织 ②扩大培养; ③大罐培养;
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外植体: 愈伤组织: 从植株取出,经过预处理后,用于植物组织培养的植物组织(包括根、茎、叶、芽、花、果实、种子等)的片段或小块。
将上述外植体植入诱导培养基中,于25℃左右培养一段时间,从外植体的切口部位长出小细胞团。
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外植体 水稻的外植体(幼胚)和愈伤组织 愈伤组织
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4. 培养条件的影响与控制 (1)温度 (2)pH (3)通气与搅拌 (4)光照的控制 (5)前体的添加(饲喂)
(6)诱导子(elicitors)的应用
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5.植物细胞培养产酶实例 (1)大蒜愈伤组织的诱导
以大蒜细胞培养生产超氧化物歧化酶(SOD)为例 (1)大蒜愈伤组织的诱导 选取结实、饱满、无病虫害的大蒜蒜瓣,去除外皮,先用70%乙醇消毒20s,再用0.1%升汞消毒10min,然后无菌水漂洗3次。 在无菌条件下,切成0.5cm3的小块,植入含有3mg/L 2,4-D和1.2mg/L 6-BA 的半固体MS培养基中,在25℃,600lux,12h/d光照条件下培养18d,诱导得到愈伤组织,每18天继代一次。
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(2)大蒜悬浮细胞培养 将上述在半固体MS培养基上培养18d的愈伤组织,在无菌条件下转入含有3mg/L 2,4-D和 1.2mg/L 6-BA (苄基腺嘌呤) 的液体MS培养基中,加入灭菌的玻璃珠,25℃,600lux,12h/d光照条件下震荡培养18d,使愈伤组织分散成为小细胞团或单细胞。 然后在无菌条件下,经过筛网将小细胞团或单细胞转入含有3mg/L 2,4-D和1.2mg/L 6-BA 的液体MS培养基中,25℃,600lux,12h/d光照条件下震荡培养18d。
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(3)酶的分离纯化 细胞培养完成后,收集细胞,经过细胞破碎、提取、分离得到超氧化物歧化酶。
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二、动物细胞培养产酶 1.动物细胞培养的特点 细胞生长速度慢。(需添加抗生素) 细胞体积大,无细胞壁保护,对剪切力敏感。
二、动物细胞培养产酶 1.动物细胞培养的特点 细胞生长速度慢。(需添加抗生素) 细胞体积大,无细胞壁保护,对剪切力敏感。 反应过程成本高,产品价格贵。 细胞具有锚地依赖性。 原代细胞一般繁殖50代。
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2.培养基 ①天然培养基 ②合成培养基 ③无血清培养基
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3.培养方法 (1)悬浮培养(suspension culture)
(2)贴壁培养(anchorage-dependent culture) (3)贴壁-悬浮培养(pseudo-suspension culture) 微载体培养(microcarrier culture) 包埋(entrapment)和微囊(microencapsulation)培养 结团培养(aggregate culture)
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4.培养条件的影响与控制 (1)温度:一般控制在36.5℃. (2)pH值:一般控制在7.0-7.6的微碱性范围内。
(3)渗透压: 应与细胞内渗透压相同。 (4)溶解氧:根据情况随时调节。
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