Download presentation
Presentation is loading. Please wait.
1
Homework (10/19 0:30AM前交)
2
根據以下條件，利用Protein Data Bank的Advanced Search，並列出所搜尋到的PDB ID。
Name Text Search X-ray Resolution Has Ligands Source Organism Browser (NCBI) Release Date 陳建頴 Hemoglobin 0.5~1.5 Yes Homo sapiens ~ 胡庭斳 Insulin 1.5~2.5 No ~ 王靖崴 Crambin 0.5~2.5 Crambe hispanica ~ 林昭翰 Green Fluorescent Protein Aequorea victoria ~ 葉卓森 Deoxyribonucleotidase 1.0~2.5 Homo sapiens ~ 胡 媗 HIV integrase 2.0~2.5 Human immunodeficiency virus 李宗禧 Endonuclease VII 1.0~2.0 Enterobacteria phage T4 sensu lato 林羿萱 Serine racemase 1.5~3.0 ~ 余紹瑋 Myosin 1.5~2.0 Dictyostelium discoideum ~
3
根據以下條件，利用Protein Data Bank的Advanced Search，並列出所搜尋到的PDB ID。
Name Text Search X-ray Resolution Has Ligands Source Organism Browser (NCBI) Release Date 陳品賢 Colicin E9 1.5~2.0 Yes Escherichia coli ~ 許富善 Hemoglobin 0.5~2.0 Homo sapiens ~ 陳 新 RANKL 1.5~3.0 ~ 蔡政融 D-amino acid oxidase 1.0~3.5 Sus scrofa ~ 李炘杰 Zinc finger 1.5~2.5 Drosophila melanogaster ~ 唐 榕 Plastocyanin Phormidium laminosum ~ 張旭欣 Desulfoferrodoxin Desulfovibrio desulfuricans 謝亦嘉 Deoxyribonucleotidase 1.0~2.5 Homo sapiens ~ 林靖雅 Green Fluorescent Protein 2.0~2.5 No Aequorea victoria ~
4
利用下列PDB ID : 2. 請擷取PDB網站上的圖形化的Sequence Chain View並依照DSSP圖示計算各種二級結構所佔的序列全長的百分比是多少。 3. 利用PDBsum裡的Procheck分析 Name PDB ID 陳建頴 1BZ0(A) 胡 媗 1EMV(A) 胡庭斳 1BJE(A) 李宗禧 1HYZ(A) 王靖崴 1OEM(X) 林羿萱 1E7L(A) 林昭翰 1CRN(A) 余紹瑋 3L6B(A) 葉卓森 1C4F(A)
5
利用下列PDB ID : 2. 比較在DSSP與STRIDE的二級結構差異(請用表格方式呈現)。 3
利用下列PDB ID : 2. 比較在DSSP與STRIDE的二級結構差異(請用表格方式呈現)。 3. 利用PDBsum裡的Procheck分析 Name PDB ID 陳品賢 3BQV(A) 唐 榕 1EPW(A) 許富善 1DFX(A) 張旭欣 1AKL(A) 陳 新 1MH9(A) 謝亦嘉 1JQG(A) 蔡政融 1VE9(A) 林靖雅 1DOS(A) 李炘杰 4U77(A)
Similar presentations
