Homework 1 (10/11 13:00前交) chlu@mail.cmu.edu.tw 學號：106xxxxx 姓名：ＸＸＸ.

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1 Homework 1 (10/11 13:00前交) 學號：106xxxxx 姓名：ＸＸＸ

2 根據以下條件，利用Protein Data Bank的Advanced Search，並列出所搜尋到的PDB ID。
Name Text Search X-ray Resolution Has Ligands Source Organism Browser (NCBI) Release Date 柯紹文 Hemoglobin 0.5~1.5 Yes Homo sapiens ~ 張景富 Insulin 1.5~2.5 No ~ 姚佳伶 Crambin 0.5~2.5 Crambe hispanica ~ 蕭廷怡 Green Fluorescent Protein Aequorea victoria ~  徐　綾 Deoxyribonucleotidase 1.0~2.5  Homo sapiens ~  王靖涵 HIV integrase 2.0~2.5 Human immunodeficiency virus  曾賀德 Endonuclease VII 1.0~2.0  Enterobacteria phage T4 sensu lato  戴若雲 Serine racemase 1.5~3.0 ~  柯廷揚 Myosin 1.5~2.0  Dictyostelium discoideum ~ 張哲綱 MrkH Klebsiella pneumoniae ~

3 根據以下條件，利用Protein Data Bank的Advanced Search，並列出所搜尋到的PDB ID。
Name Text Search X-ray Resolution Has Ligands Source Organism Browser (NCBI) Release Date  崔雁茹 Colicin E9 1.5~2.0 Yes Escherichia coli ~  鄭宇倫 Hemoglobin 0.5~2.0 Homo sapiens ~  許芯緁 RANKL 1.5~3.0 ~  許潔馨 D-amino acid oxidase 1.0~3.5  Sus scrofa ~  姚秉宏 Zinc finger 1.5~2.5  Drosophila melanogaster ~  劉守軒 Plastocyanin Phormidium laminosum ~  鍾妮津 Desulfoferrodoxin Desulfovibrio desulfuricans  柯宏欣 Deoxyribonucleotidase 1.0~2.5  Homo sapiens ~  黃翎瑄 Green Fluorescent Protein 2.0~2.5 No Aequorea victoria ~ 周昱吟 Hemagglutinin 2.0~3.0 Influenza A virus  ~

4 利用下列PDB ID : 2. 請列出該Protein Chain在SCOP與CATH兩個資料庫裡的分類。 3
利用下列PDB ID : 2. 請列出該Protein Chain在SCOP與CATH兩個資料庫裡的分類。 3. 利用PDBsum裡的Procheck分析 Name PDB ID 柯紹文 1BZ0(A)  王靖涵 1EMV(A) 張景富 1BJE(A)  曾賀德 1HYZ(A) 姚佳伶 1OEM(X)  戴若雲 1E7L(A) 蕭廷怡 1CRN(A)  柯廷揚 3L6B(A)  徐　綾 1C4F(A) 張哲綱 5KEC(A)

5 利用下列PDB ID : 2. 請列出該Protein Chain在SCOP與CATH兩個資料庫裡的分類。 3
利用下列PDB ID : 2. 請列出該Protein Chain在SCOP與CATH兩個資料庫裡的分類。 3. 利用PDBsum裡的Procheck分析 Name PDB ID  崔雁茹 3BQV(A)  劉守軒 1EPW(A)  鄭宇倫 1DFX(A)  鍾妮津 1AKL(A)  許芯緁 1MH9(A)  柯宏欣 1JQG(A)  許潔馨 1VE9(A)  黃翎瑄 1DOS(A)  姚秉宏 4U77(A) 周昱吟 1TI8(A)