分子生态学 Molecular Ecology

教师简介 廖万金 生命科学学院117室 liaowj@bnu.edu.cn 010 58802936

参考书 Freeland et al. 2011. Molecular ecology. Oxford, John Wiley & Sons. Beebee TJC & Rowe G. 2004. An introduction to molecular ecology. Oxford, Oxford University Press. Avise JC. 2004. Molecular markers, natural history, and evolution. Massachusetts, Sinauer Associates, Inc. Publishers. Li WH. 1997. Molecular Evolution. Massachusetts, Sinauer Associates, Inc. Publishers. Nielsen R & Slatkin M. 2013.An introduction to population genetics: theory and applications (3rd). Massachusetts, Sinauer Associates, Inc. Publishers. Yang ZH. 2006. Computational molecular evolution. Oxford, Oxford University Press. Yang ZH. 2014. Molecular Evolution: a statistical approach. . Oxford, Oxford University Press. Link WA & Barker RJ. 2010. Bayesian inference with ecological applications. Oxford, Academic Press. Lemey P et al. 2009. The phylogenetic handbook. Cambridge, Cambridge University Press. Baum DA & Smith SD. 2013. Tree thinking: an introduction to phylogenetic biology. Colorado, Roberts and Company publishers.

课程简介 实验方法 基本原理 实际应用 PCR, SSR, AFLP, Sequencing, NGS …… Phylogenetic reconstruction Population genetics 实际应用

课程简介 教学目的：培养科学素质 教学方式 考核方式 科学知识 科学方法 科学精神 讲授、讨论、作业、学生讲授 平时成绩：30% 期末成绩：70% 耶鲁校长：理查德·莱文 无用性的通识教育，赋予学生更广阔的视野，培养他们批判性思维。也是培养学生承担公共责任的能力和公民意识。 有用性的教育，只专注于某一专业的教育，只重视知识的传授，从长远来讲没太多价值。

学生简介 姓名 研究生专业 导师姓名 本科专业 想在北师大生科院读研期间学到什么？ 今后想做什么样的工作？

分子生态学的研究内容 某些特定的基因或蛋白质本身的属性 如：基因组或蛋白质的突变率、基因在发育、生理和代谢过程 中的功能 利用DNA或者蛋白质分子作为基因谱系标记分析系统发育、生 活史进化等生态和进化问题

分子生态学的地位 科学研究的一般过程 1.要研究的问题是什么？ 通过观察或者描述性研究发现的一些规律和现象

分子生态学的地位 科学研究的一般过程 1.要研究的问题是什么？ 【现象】入侵植物在入侵地通常比原产地生长更旺盛，即个体更大、繁殖投 入更多。

分子生态学的地位 科学研究的一般过程 1.要研究的问题是什么？ 2. 为什么会出现这样的现象？ 原因1：…… 原因2：…… 原因3：…… 【现象】入侵植物在入侵地通常比原产地生长更旺盛，即个体更大、繁殖投入更多。 2. 为什么会出现这样的现象？ 原因1：…… 原因2：…… 原因3：…… ……

分子生态学的地位 可能的入侵机制 ERH 天敌 资源环境和天敌共同作用 EICA 资源

分子生态学的地位 科学研究的一般过程 1.要研究的问题是什么？ 2. 为什么会出现这样的现象？ 【现象】入侵植物在入侵地通常比原产地生长更旺盛，即个体更大、繁殖投入更多。 2. 为什么会出现这样的现象？ 【假说】原因1：ERH；原因2：EICA；原因3：环境与天敌；…… 3. 到底是哪一个或者哪几个原因导致了这样的现象？

同质生物园实验

分子生态学的地位 规律或现象 假说 实验验证 科学研究的一般过程 1.要研究的问题是什么？ 2. 为什么会出现这样的现象？ 【现象】入侵植物在入侵地通常比原产地生长更旺盛， 即个体更大、繁殖投入更多。 2. 为什么会出现这样的现象？ 【假说】1：ERH；2：EICA；3：环境与天敌；…… 3. 到底是哪一个或者哪几个 原因导致了这样的现象？ 【实验】当前绝大多数实验证据支持EICA 规律或现象 假说 实验验证

分子生态学的地位 分子生态学 规律或现象 假说 实验验证 科学研究的一般过程 1. 观察、描述性研究 2. 理论研究 数学模型、逻辑推理 3. 实验研究 规律或现象 假说 实验验证

Potentilla simulatrix Wolf. 1. 描述性研究 分子生态学

3. 实验研究 分子生态学 Alpinia mutica

Locus CPD MPD PR AAT AA BB SKD FS SS Sun et al. 2010 J Evol Biol

分子生态学是利用分子生物学技术研究生态和进化问题的一门学科。 工具