（一）控訴及抗議 （二）認同的焦慮 （三）對原住民文化的重新審視 （四）女性／性別 （五）與自然為伍的職業 （六）傾聽自然 原住民文學的主題內容 （一）控訴及抗議 （二）認同的焦慮 （三）對原住民文化的重新審視 （四）女性／性別 （五）與自然為伍的職業 （六）傾聽自然
（一）控訴及抗議： 原住民文學的基調，表達出原住民在這塊島上所遭遇的各種不公平待遇，尤其是殖民的慘痛經驗及不平等的漢原關係，成為重要的書寫焦點所在。 以最早用漢語發表詩歌的莫那能的《美麗稻穗》堪稱最具代表性，直接的控訴成為早期原住民文學最鮮明的存在。書中的詩句簡單明白卻深具震撼力︰在＜燃燒＞一首詩對中國民族神話抱持著質疑；＜回答＞則毫不保留地控訴原住民被殖民的不平等遭遇。
控訴的內容，隨著時代演進而有更多新的面向：田雅各的文章不強調對立，並時時流露人道精神，引起的是更多深沉的自省；瓦歷斯．諾幹以後殖民論述去談論，將抗議的層面提到理論的層次。
（二）認同的焦慮： 由於漢文化的強勢入侵，部落文化不得不面臨沒落的處境，促使原住民去正視認同的問題，成為原住民文學創作者反思的所在，孫大川《久久酒一次》、《山海世界》、《夾縫中的族群建構》等書，對此議題有深刻的思考。
（三）對原住民文化的重新審視： 在島嶼的山海環繞之下，學會和大自然和平共處是原住民文化最重要的一個特徵。然而強勢的主流文化帶來部落文化的消逝，受過現代教育洗禮的原住民作家處於這兩個文化之下，開始重新去面對及體驗原住民文化背後所帶來的意義，及其與原住民存在的關係。 夏曼．藍波安《冷海情深》中以作者本身返回部落的經驗為故事主題，是為最佳代表。書中以「我」在不顧眾人反對回歸最原初的生活模式作為起點，開始了作家對達悟族海洋文化的省思，另外對於現代生活之反省，更突顯出主流文化對環境破壞的視而不見。
（四）女性／性別： 原住民女性作家屬於少數，孫大川於2003年編選的《台灣原住民族漢語文學選集》頭收錄的原住民女性作家也僅僅有︰劉武香梅、里慕伊‧阿紀、利格拉樂‧阿女烏、董恕明四位，而真正持續發表作品只有利格拉樂‧阿女烏一人而已。
她們的出現為原住民文學帶來更多複雜的議題，提供出有別於男性原住民創作者的視角。 以利格拉樂‧阿女烏為例，一半排灣族一半外省的女性身分，使她成為台灣社會的邊緣弱勢者，散文集《誰來穿我織的美麗衣裳》對排灣族母親的生命歷程及對童年不愉快記憶的著墨，充分見證出原住民女性的生活境況。除此之外，一段婚姻的經歷更讓她思考在原住民不同文化之間的衝突，及原運背後可能隱藏的性別階級的差異，這種深入性別與女性議題的開發，皆是原住民男性創作者所未觸及的領域。
（五）與自然為伍的職業 1、與山為伍： 林二郎（巴代，卑南族）〈薑路〉 林二郎（巴代，卑南族）〈薑路〉 「一群人，各自揹負著生薑與希望，沿山路一步步走下山，距離時而拉開又偶而貼近，在整片的綠色山坡上，看起來就像是移動在褐色絲線上的小蟲蟲，那樣的安靜與認份，那樣的堅持與努力。」
2、與海為伍： 林俊明（阿美族） 〈輓歌〉 「漸漸地他聽到小波浪拍在筏邊的打水聲；輕輕地拍，他亦隨著輕晃，拍在筏邊的海聲像海草似地搖曳，輕輕地在浮力中舞蹈；像ina拍著wawa的背，口中吟唱著生活的歌調；更像部落中巫師夜裡對月的喃喃自語。半明迷濛的東海岸遠遠地映在層層霧氣阻隔的金黃揮灑中……。 」
（六）傾聽自然 1、排灣族戴志強(亞榮隆‧撒可努) 〈走風的人〉 〈走風的人〉 「讓吹來的風流動，灌進，我們叫替風開路的人；凡經過的地方，讓風跟進追流，我們叫風的路；替風開路的那個人，我們叫走風的人。黃昏老獵人說著，雙手張開，讓風聞著、親著，那是自然跟人感覺的文字和語言，風是自然的語言，人的感覺，是對自然的回應。」
2、賽夏族根阿盛〈朝山〉 「你知道嗎！這山裡，每一棵樹都有魂，草也有，石頭上也有，你要是靜下來，就能聽到它們在唱歌、在咳嗽，深夜更可以聽到他們在打鼾。」