科研工具SciFinder® Scholar使用培训 突破信息检索壁垒 科研工具SciFinder® Scholar使用培训 CAS中国代表处 袁黎亚 Tel:021-64453167 Email:Kathy@igroup.com.cn
提纲 科研人员对于数据库的要求 SciFinder Scholar 数据库背景介绍 SciFinder Scholar检索介绍 SciFinder Scholar检索Tips SciFinder Scholar安装与使用常见问题
研究过程 文献调研 提出 创新点 设计研究方案 实施研究路线 产生 新问题 在图书馆一小时胜过在工作台边一个月! 关键是在图书馆怎样找到所需要的文献?
化学家所需要的科研信息分布于几十家出版社的数百种期刊,或专利以及其他出 版物或数据库当中 化学家所需要的科研信息分布于几十家出版社的数百种期刊,或专利以及其他出 版物或数据库当中 ACS 美国化学学会 RSC 英国皇家学会 Elsevier (四面体,无机化学评论……) John Wiley (德国应用化学) Thieme (synthesis, synlett……) USPTO 中文期刊 (无机化学学报,化学通报……) Beilstein/Gemlin ……
Web of Knowledge (Thomson) Scopus (Elsevier) 化学相关的主要检索数据库平台 Web of Knowledge (Thomson) Scopus (Elsevier) Beilstein (Elsevier) SciFinder/Scholar (CAS)
科研人员对数据库的要求 检索范围全面 检索命中率高 时效性高 操作界面直观、简单 完全满足上述要求!
提纲 科研人员对于数据库的要求 SciFinder Scholar 数据库背景介绍 SciFinder Scholar检索介绍 SciFinder Scholar检索Tips SciFinder Scholar安装与使用常见问题
SciFinder 是CAS创建的研究工具 CAS Editorial caffeine bioactive CAS RN CAS scientists Searchable entity To begin, what is CAS? It is our scientists and skilled people. It starts with various forms of scientific information which comes into CAS. Our scientists then create searchable information – such as connection tables for structures and indexing for documents. They have to translate documents in over 50 languages, from ober 100 countries , and from over 9500 journals and over 50 patent authorities– to give us tools such as SciFidner. *********************************** We acquire scientific research through a variety of original. through the efforts of our Scientific editorial staff, we create searchable entities – like CAS connection tables in CAS Registry or index entries to a document – which are accessed via tools like STN and SciFinder. Monitor literature from over 9,500 journals Cover patents from over 50 active issuing patent authorities Abstract and index, in English, documents originally published in 50 languages Serve scientists in more than 100 countries Scientific research Original publications Scientists CAplus Registry CASReact ChemCATs ChemList 。。。。。。
CAS 是美国化学会(ACS)的一个分支机构 Washington, D.C. ACS 是一个超过 125年历史的非 盈利性学会组织 最大的科技学会,会员超过160,000 名 以“促进化学知识的增长和传播”为使命,造福于行业和教育事业
Chemical Abstract Service 美国化学文摘社的今天 本部拥有600多名专业博士从事文献编辑工作 为全球超过1400多个学校提供SFS桌面检索平台 CAS 的宗旨是创建世界上最大最好的搜索、获取、分析并连接到化学和相关科学信息的数字环境
SciFinder Scholar数据库历史 跨世纪工程 SciFinder Scholar 光盘 纸本 1907年 1977年 1997年 2007年 2002年 SciFinder Scholar 2007
SciFinder Scholar包含的六大数据库 CAplus Medline Registry CASReact Chemcats Chemlist 物质数据库 化学反应数据库 管制品物质数据库 商品来源数据库 文摘数据库 最全
两个主要数据库 CAS Registry CAplus 最全的 物质数据库 时效性最高 文摘数据库 - 3300多万物质和5900多万序列 通过名称、分子式、结构式检索物质或者用 BLAST检索序列 通过实验或者计算得到的物质性质数据 CAS RN 每日新增4000多个物质或序列 - 摘自9500多种期刊、50多个专利组织以及其他学术题录信息(2800多万条信息) 通过作者/公司/全文/期刊/专利号/文件类型和出版年检索 CAS RN 每日新增3000篇期刊和专利 2天内收录9大专利局公开的专利 最全的 物质数据库 时效性最高 文摘数据库
四个独特数据库 CASReact Medline 时效性高 实用性强 ChemCats Chemlist 1400多万条单步或多步反应(尤其专利中的反应) 结构和亚结构检索 CAS RN 每周新增600~1300新反应 70多个国家4780多种医学类期刊1600多万条文摘记录 美国国家医学图书馆出品 每周更新4次 时效性高 实用性强 ChemCats Chemlist 24万多备案或管控物质 CAS RN 每周新增约50种物质 世界900家厂商1000类目录 1700多万种化学品商业来源物质 CAS RN
今天的最新数据
SciFinder 覆盖的学科(5大类80小类) 生物化学-遗传学、免疫学、药理学、毒理学、发酵和生物工业化学等 有机化学-普通有机化学、有机金属和有机金属化学、氨基酸,缩氨酸, 蛋白质等 高分子化学类—聚合物、塑料、纺织、橡胶粘合剂、表面活性物质和 清洁剂等 应用化学和化学工程—矿物学和地质化学、工业化学、金属/合金、陶瓷、 环境科学等 物理化学、无机化学和分析化学-普通物理化学、无机化学制品和反应、 无机和有机分析化学
SciFinder 是化学,材料科学,生命科学,医药等相关领域研究工作的 信息研究工具,几乎覆盖了这些领域科技文献的98% 数据库每天更新,为科研人员提供了最新的科研进展信息 主要适用于研究者的研究工作,比如研究选题,定题,论文撰写,实验 中具体的合成方法研究,基金项目申请,研究项目论证等等。
提纲 科研人员对于数据库的要求 SciFinder Scholar 数据库背景介绍 SciFinder Scholar检索介绍 SciFinder Scholar检索Tips SciFinder Scholar安装与使用常见问题
检索界面 参数设定 检索历史 开始新任务 检索分类
主检索界面 对于不确定的信息,我们一般通过Explore检索 对于确定信息的检索,我们一般用Locate检索 浏览,可以让科研工作者,浏览核心期刊的内容
Locate-确定信息的检索 输入苯的名称benzene
Browse- 浏览核心期刊
主检索界面
Explore-不确定信息的检索 文献检索 物质检索 反应检索
Explore- 主题检索
SciFinder Scholar查询举例----主题检索 提出问题 中国在纳米材料的应用方面的研究报道 我们来看一下这些问题,在SFS中是如何解决的。 存在问题 中国有那些机构在研究? 常见的应用领域在哪里?在这方面发表的专利有那些? ……
Explore-主题检索 “Closely associated with one another” 表示在同一个句子当中出现
我们注意到所列文献中出现了nanoporous 这样的词 那是SciFinder能够 自动识别同义词,近义词,缩写,单复数,并有截词,断词等功能 获取文摘 链接全文
对于大量的文献结果,SFS提供强大的二次检索和分析功能 系统分类
一共11种分析手段 作者: 发现某一领域中发文章最多的研究者 索引词: 帮助分析该领域中文献的内容 CAS No: 了解文献出现的物质及应用 来源期刊: 发现相关的学术期刊 学科领域: 了解在不同学科的分布情况 文献语种 : 了解有关文献的语种分布情况 机构 发现某一领域研究最多的研究机构 出版年: 了解该领域的研究历史和发展 数据库 分析是来自CAPLUS还是MEDLINE 辅助索引词: 帮助分析该领域中文献的内容 文献类型 : 了解文献的种类 排序: 可以选择按照字母顺序也可以按照出现频率顺序
一共7种限定手段 主题: 对初次结果用其它的主题再作2次检索 文献类型: 直接获得关心的文献类型 机构: 直接获得自己关心的机构的参考 文献语种: 直接获得关心的语种的参考 作者: 直接获得自己关心的作者的参考 来自数据库: 可以限定文献的出处 出版年: 直接获得自己关心的年份的参考
得到来自中国的纳米材料应用方面的研究报道1283篇 用China再次限定主题 得到来自中国的纳米材料应用方面的研究报道1283篇
用组织机构名分析中国哪些研究机构在研究这个主题 中国从事这个主题研究 的机构很多
得到东华大学的9篇有关于纳米材料应用方面的研究
SciFinder Scholar 2007 新功能之一: 系统分类 Categorize功能帮您提供系统分类方法 系统分类帮助你 寻找新的科研方向
分析来自中国的报道中有多少是专利,然后根据需要查看
SciFinder Scholar文献检索小结 可以通过SciFinder Scholar的Analyze/Refine功能来不断的修正我们的检 索思路 可以通过SciFinder Scholar的Analyze/Refine功能来缩小检索的范围 可以通过SciFinder Scholar的Analyze/Refine功能来获取新的知识点和灵 感 尝试将不同的Analyze/Refine功能组合起来用,会有更多的收益 通过Get Related来获得更多的信息
Explore----物质结构检索
结构检索的界面 铅笔 元素周期表 碳链工具 可变基团 常用基团 重复基团工具 R基团定义工具 可变位置连接工具 结构模版 多元环工具 橡皮 索套选择工具 选择工具 旋转工具 正电子 负电子 原子锁定工具 环锁定工具
(1)精确结构检索
得到物质的盐,同位素,配合物,聚合物或者其他的混合物形式
(2)亚结构检索
得到物质的修饰信息 33246种修饰信息
强大的物质结构后处理功能 我们做科研 往往是希望得到我们不知道的信息 那么对于这33246种物质,我们如何去分析来获得我们需要的信息呢?
物质结构的分析方法 6大分析功能 真实原子附属性: 帮助分析某一特定原子上的修饰 精确结构: 帮助分析结构中存在的互变异构或者兼性离子 环骨架分析: 帮助分析结构中存在所有环骨架 可变基团分析: 帮助分析结构定义中的定义的某一类基团 R基团分析: 帮助分析结构定义中的R基团 构象分析: 帮助分析结构中存在构象问题
物质结构的二次检索方法 7大限定功能 对于上面的3万多种物质,如果我只想获得具有红外光谱数据的物质,那么,我应该选择什么呢? 结构再次限定: 帮助对结构再次限定 7大限定功能 性质限定: 通过物质的理化性质对物质进行限定 同位素限定: 帮助获得结构中含有同位素的物质 提供性质限定: 对可提供的物性数据分析 金属包含限定: 帮助获得结构中含有金属的物质 提供参考分析: 帮助获得至少含有1篇参考的物质 商业化限定: 帮助获得可购买的物质 对于上面的3万多种物质,如果我只想获得具有红外光谱数据的物质,那么,我应该选择什么呢?
或得具有红外光谱信息的物质
实际上 我们有的时候,更多关注的是结构上面的信息 修饰信息? 修饰上某一特定原子后该原子的修饰信息? ……
修正结构
对所得结果再次使用真实原子附属性分析
(3)相似结构检索
得到相似结构信息
SciFinder Scholar结构检索小结 需要查询什么样的结构 聚合物,混合物 相似结构 修饰结构 设计的结构 精确结构检索 相似结构检索 亚结构检索
SciFinder Scholar的3种结构检索包容关系 A=亚结构检索,B= 相似结构检索,C=精确结构检索 A B C A B C A B C A B C
SciFinder Scholar的3种结构检索包容关系 亚结构检索 相似结构检索 精确结构检索
Explore----反应检索
反应检索工具条 反应位置标记工具 反应角色工具 反应箭头 反应原子标记工具 反应官能团列表
(1)精确结构反应检索
一共10种分析手段 了解有关文献的语种分布情况 了解该领域的研究历史和发展 催化剂: 了解反应中出现的催化剂 反应步数: 了解反应步数的情况 溶剂: 了解反应中可能出现的溶剂 产率: 了解产物的产率 期刊名称 : 可以帮助发现相关的期刊 作者: 了解在不同学科的分布情况 机构 发现某一领域研究最多的研究机构 语种: 了解有关文献的语种分布情况 发表年限: 了解该领域的研究历史和发展 文献类型 : 了解文献的种类 排序: 可以选择按照字母顺序也可以按照出现频率顺序
一共4种限定手段 结构限定: 反应步数限定: 可以进一步限定反应物,产物,催化剂等 可以对反应的步数事先进行限定 反应类型限定: 产率限定: 可以限定反应的类型是什么 产率限定: 可以对反应的产率事先进行限定
反应步数分析 溶剂分析
拓展思路的反应检索 通常 我们需要一些对我们科研有参考意义的反应 官能团之间的反应 亚结构反应检索 对反应位置和原子有特定要求的反应
官能团之间的反应
假如我们只想得到一步反应 683条反应
假如我们规定反应物必须是乙酰氯
那么如何获得不是从乙酰氯出发的反应呢? 我们知道是683-16=657条,但是我们通过何种手段去得到呢? 用结构限定?太复杂了 让我们先返回初次检索到的683条反应。
SciFinder Scholar 2007年新功能介绍之二 可将检索的答案集保存成书签格式 *.sfr格式 好处是: 1.可以方便我们在在下次打开SFS的时候从当前页面开始 2.进行答案集的组合
保存到英文目录下
SciFinder Scholar 2007 新功能之三 再按照上面的检索获得从乙酰氯出发的反应,一共16条
运用Combine功能将不需要的答案集排除
检索思路回顾 获得1步从酰卤到醛的反应 限定反应物获得反应物是乙酰氯的反应 运用Combine功能将乙酰氯是反应物的反应去除
COMBINE-----SciFinder Scholar2007新功能 可以对于任意两个同类型的集合进行AND,OR,NOT的操作 AND O R NOT
(2)亚结构反应检索 想获得1步合成该物质的反应
亚结构反应检索 必须的条件: 羟基接的C必须是CH2 整个C链不允许是某个环结构的部分结构 其余的4个C原子链接什么基团对反应没 有影响 有影响 据此,我们修改我们的检索方式
亚结构反应检索 用环锁定功能,锁定C链,保证其不成为环结构的一部分 用原子锁定功能,锁定C原子,保证C 原子上两个H不被取代
对反应位置和原子有特定要求的反应 O原子反应前后必须配对 C=O键必须发生反应 除已有的吡啶环外,不能成环
SciFinder 反应检索小结 多用Analyze/Refine,来获得催化剂,溶剂,产率等信息 如果反应只涉及基团之间的变化,用官能团反应可以获得更多的参考 信息 当无法找到具体反应,或者检索结果并不满意,尝试用亚结构反应查 询,可以获得更多的参考信息 更多关于物质和反应检索培训请查看 http://www.igroup.com.cn/cas/ 资料下载中心
SciFinder Scholar检索Tips Explore by Research Topic Explore by Document Identifier Explore by Substance Identifier Explore by Molecular Formula
Explore by Research Topic ----Tips 一般最佳在2-3个Concepts(关键词),最多不超过5个 最好使用介词而不用Boolean运算符,如AND 、OR、NOT;介词能被识别; 识别常用缩写、单复数、过去式等; 支持同意词,近义词检索; 不能用!或*(删减字符或通配符) 可用括号,括号内为前词的同义词; 修饰语不能自行分配,需各自写明;
Explore by Document Identifier----Tips
Explore by Substance Identifier----Tips 最多输入25条; Read File必须是 .txt文件; 每个条目输入<200字符; 可以有空格,不区分大小写; 如果检索结果不理想,也可在主题检索中再检; 支持俗名,商品名检索
Explore by Molecular Formula----Tips 区分大小写; 输入必须规范,否则会自动要求重输; 输入时不同元素之间可用空格隔开,系统也会自动分割; 输入盐类,可分为酸碱组分以 . 相连; 如:H3 O4 P . 3 Na;H3 O4 P . 2 Na;H3 O4 P . Na 分别代表不同的物质 聚合物则输入单体组成以括号加X,如(C4H6)X; 对于复杂的有机物质,可以通过分子式查询,并通过亚结构限定获得
SciFinder Scholar的程序安装,请及时更新到2007版 SciFinder Scholar2007.exe 安装过程中,提示: Do you have a disk labeled Custom Site Files? (选择 No) site.prf (site)文件 只需将 site.prf 文件复制粘贴到 X:\ScholarCHLR目录下 还可安装 ViewerLite用于查看3D结构
运行SciFinder Scholar
可能1:(并发用户数限制,4个并发) 解决方法:请耐心等候 !
可能2:(网络故障,可能需要关闭防火墙) 解决方法:检查网络
可能3:网络故障 解决方法:点击OK,再次运行SciFinder/Scholar
可能4: IP地址未被授权 解决方法:确认IP地址是否在校内, 并与图书馆管理员联系。
合理使用 CAS会监控与每个授权IP地址相关联的日常的检索和下载活动,目的是 (1)确定授权IP地址之间的平均使用标准; CAS可能会要求主要联系人和相关的授权用户对CAS提出质疑的使用状况进行讨 论,如果有必要,与CAS一起针对已发现的问题找出解决办法。此类使用问题 包括但不限于: 用作商业目的,非授权用户的使用,超出限定,大量的下载和储存数据。CAS会 积极和获许可人以及成员单位配合解决任何过量或非正常使用的问题。如果这样 的过量或非正常使用的状况继续发生,CAS会要求成员单位禁止滥用者使用 SciFinder/Scholar。 如果滥用的情形仍旧继续,在经过所有的努力和解决方法 都尝试无效时,CAS将禁止该成员使用SciFinder/Scholar。
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