科研工具SciFinder使用及检索介绍

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1 科研工具SciFinder使用及检索介绍
刘盈盈 CAS中国代表处 Tel： Ext801

2 提纲 1、SciFinder背景及内容介绍 2、SciFinder中的文献检索与分析 3、SciFinder中的物质检索与分析 4、SciFinder中的反应检索与分析 5、SciFinder Web介绍

3 Chemical Abstract Service化学文摘社今天：
全球最大的学协会组织 本部拥有1000多博士从事文献编辑工作 为全球超过1500多个学校提供SciFinder桌面检索平台

4 SciFinder中最重要的三个数据库 CA plus(1907-至今) 包含了CA纸本和光盘的所有内容。 涵盖了98%世界化学化工文献。
10000多种期刊和61个专利发行机构的专利（含专利族）。除此之外，会议记录、技术报 告、图书、学位论文、评论、会议摘要、电子期刊、网络预印本； 每天更新 Registry－－世界上最大的物质数据库 5500万个物质；6200万个序列 有机、无机、聚合物、混合物、核酸蛋白质序列 所有CAS Registry Number 物质 日更新12000多个物质

5 SciFinder中最重要的三个数据库 反应 物质 文献 CAS React（1840－至今）
期刊，专利中涉及的有机、有机金属、无机、生化反应。 2800万单步，多步反应。 周更新3万-5万条单步、多步反应。 反应 这三大数据库不是割裂的，是有机统一的。有机结合在一起的。 物质 文献

6 SciFinder中其他三个数据库 Medline(1950年以来） 美国国立医学图书馆出品 临床报告、期刊文献 免费数据库
ChemList 查询备案/管控化学信息的工具。 Chemcats 4400万化学物质提供商的联系信息、价格情况、运送方式、质量等级等信息。

7 提纲 1、SciFinder背景及内容介绍 2、SciFinder中的文献检索与分析 3、SciFinder中的物质检索与分析 4、SciFinder中的反应检索与分析 5、SciFinder Web介绍

8 SciFinder中的文献检索与分析 主题词、作者、机构 物质 文献 文献标识符 反应 浏览核心期刊

9 1、主题词检索 获得卟啉类化合物应用的参考文献 porphyrins with using
Curry powder with chemo-treatment 咖喱粉可提供化疗效果

10 “Concept”表示做了同意词的扩展 “Closely associated with one another” 表示同时出现在一个句子中 “were present anywhere in the reference”表示同时出现在一篇文献中

11 获取文摘 获取全文 分析限定 获得引文，被引文，文献中的物质，反应
用蓝色显示出现的是命中的词条，这里可以看到很多同义词，近意词都被检索出来；那是SciFinder能够自动识别同义词，近义词，缩写等功能 获得引文，被引文，文献中的物质，反应 分析限定

12 分类功能

13 作者、CAS号、期刊名称、索引词、出版年限等
Analyze下的分析工具 一共11种分析手段 作者、CAS号、期刊名称、索引词、出版年限等 在这些分析工具中， 索引词（Index Term）：可以帮助我们对文献的内容进行大致的了解 学科分析（CA Section Title）：可以帮助我们对文献进行学科分类

14 Analyze by------Author Name
可以选择不同的排列方式，可以看到该研究方向谁的研究成果最多

15 索引词可以帮助我们了解文献中出现的重要概念
Analyze-----Index Term 索引词可以帮助我们了解文献中出现的重要概念

16 Analyze-----Journal Name

17 Refine下的限定工具 通过使用限定工具，我们可以再次缩小查找文献的范围，比方说刚才我们要查多酸的文章一下查出那么多文献来，难道都要看吗？到底哪些是重要的呢？我们这时候就可以限定看XX老师的，或者是XX机构的，或者是XX年出版的等等都可以 7种限定工具

18 限定时间---- 获得来自2008年以后的文献 通过限定出版时间 用于查新了解最近几年的热点

19 Categorize-系统分类工具 一级目录 选中感兴趣的二级分类，在这里可以出现一些索引词条 二级目录

20 选中感兴趣的内容，点击Get Reference
金属卟啉类化合物 选中感兴趣的内容，点击Get Reference

21 保存

22 *.RTF Save As存储为*.rtf文件，可打印、修改类似word文档 单次存储文献数量要≤50，千万不要过量下载
存储文件名称，所属文件夹都要为英文

23 *.SFR格式 将结果保存成书签，可以使用SF再次打开，继续进行检索，也可以对同类的书签进行COMBINE操作

24 获得引文 获得被引文 文献中的物质 文献中的反应

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26 2、作者名检索举例

27 2010年诺贝尔化学奖得主之一Richard Heck 发表的文章
姓：写全； 首字母要大写 名：只写首字母 美国科学家理查德.赫克 ，79岁，特拉华大学名誉教授。三名科学家因在有机合成领域中“钯催化交叉偶联反应”方面的卓越研究而获得殊荣。这项研究成果已经广泛应用在制药、电子工业和先进材料等领域，让人类造出复杂的有机分子。

28 在列表中将所有的可能性的名字都选中

29 继续使用Analyze和Refine功能，依据该作者的工作学习经历来获得他所发表的文献

30 3、单位名称检索

31 继续使用Analyze和Refine功能，得到你想要的信息
中国所有机构的文章 继续使用Analyze和Refine功能，得到你想要的信息

32 4、通过文献标示符去找文献

33 5、浏览核心期刊搜索文献 51卷第24期

34 SciFinder文献检索小结 主题检索时，使用介词of with等作为连接
尽量选择包含Concept和Closely Associated with的候选项 通过SciFinder 的Analyze/Refine功能来缩小检索的范围 尝试将不同的Analyze/Refine功能组合起来用，会有更多的收益 使用Categorize可以让系统来实现自动分类 注意作者名检索时的输入规则 通过Get Related来获得更多的信息，可以实现从文献到物质，反应， 引文的链接

35 提纲 1、SciFinder介绍 2、SciFinder中的文献检索与分析 3、SciFinder中的物质检索与分析
5、SciFinder Web介绍 精确结构检索 亚结构检索 相似结构检索

36 SciFinder 物质检索与分析 物质名称、CAS登记号 文献 分子式 物质 结构 亚结构 相似结构 反应

37 可以输入物质名称、CAS号、俗名、商品名等
用SciFinder来搜索TBHQ 特丁基对苯二酚 （抗氧化剂） 可以输入物质名称、CAS号、俗名、商品名等

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40 通过这种方式，可以实现从物质到文献，或者从物质到反应的连接

41 一种快速获得物质结果的方法 在SciFinder中任意的有结构的界面，右击这个物质，都可以直接将这个物质复制到画图版中

42 2、通过结构式和分子式去找物质

43 结构检索举例

44 工具栏

45 铅笔 元素周期表 碳链工具 可变基团 常用基团 重复基团工具 R基团定义工具 可变位置连接工具 结构模版 多元环工具 橡皮 索套选择工具 选择工具 旋转工具 正电子 负电子 原子锁定工具 环锁定工具

46 精确结构检索 通过物质类别，来限定检索物质的种类，不选，则返回全部物质

47 最后这个结构就是我们想要的物质结构 精确结构检索，可以检索到物质的盐，聚合物，混合物，配合物等

48 查询包含以下通式结构的物质 R1、R2、R3=任意基团

49 亚结构检索

50 亚结构能帮您检索到所有的修饰物信息 得到297种物质的修饰信息 亚结构能帮您检索到所有的修饰物信息

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52 6大分析功能 分析功能提供6大功能，其中 真实原子附属分析（Real-atom attachments):能够分析出原子的修饰情况
可变基团分析（Variable Group composition）：能分析结构中定义的可变基团 R基团分析（R-Group Composition）：可以分析结构中定义的R基团 环骨架分析（Ring Skeletons）：可以分析结构的环结构，包括环上的原子和环上的单双键。

53 7大限定功能 限定功能提供结构再次限定，同位素是否包含限定，金属是否包含限定，理化性质限定等。
通常可以通过结构的再次限定（Chemical Structure）去对结构再次修饰 或者通过理化性质（Property Date）去找到符合理化性质要求的物质 实际上 我们有的时候，更多关注的是结构上面的信息 修饰信息？ 修饰上某一特定原子后该原子的修饰信息？ ……

54 使用Real-Atom Attachment分析衍生物的结构
分析完所有位点上的信息，要求6元环上的S没有修饰，同时羰基碳接碳的物质 可以通过分析工具来分析每个开放位点R1，R2，R3的修饰情况

55 使用Refine功能来修正结构 注意： 一般先使用分析工具，然后根据分析结果来修正结构 修正结构

56 对所得结果再次使用真实原子附属性分析

57 结构类似物查询举例 这是设计的一个全新的物质，无法通过SciFinder找到，可以通过查询它的类似物，预测一下这个物质可能的性质，或者应用

58 SciFinder只能给出与母体结构相似度在60分以上的物质，通过选择不同阶段的分数，来获得物质。

59 区别： 取代基不同 取代基位置不同 母体结构略有不同

60 SciFinder结构检索小结 精确结构检索，获得物质的盐，聚合物，混合物，配合物等；母体结构不能修 改，不能修饰
亚结构检索，所画的结构必须存在，母体结构可以被修饰，但不可以被修改 相似结构检索，获得相似度在60分以上的结构，母体结构可以修改，也可以被 修饰，用相似度来控制获得的结果

61 3、通过分子式检索检索物质

62 分子式输入规则 对于含C物质，CH写在前面，其他按照字母顺序。 对于不含C的物质，按照字母顺序书写。
对于多组分物质，用“.” 将不同的组分分开， 聚合物括号表示，括号外用n表示的是终产物的重复结构单元，括号 外用x表示起始物， 区分大小写 淀粉或纤维素成分（C6H10O5)n ABS树脂 (C8H8. C4H6.C3H3N)x

63 重点理解三种结构检索的异同点及使用条件 SciFinder中的物质检索小结 物质名称、CAS登记号、俗名、商品名等、 分子式（注意输入规则）
精确结构检索 亚结构检索 相似结构检索 重点理解三种结构检索的异同点及使用条件

64 提纲 1、SciFinder介绍 2、SciFinder中的文献检索与分析 3、SciFinder中的物质检索与分析 4、SciFinder中的反应检索与分析 5、SciFinder Web介绍

65 SciFinder 反应检索与分析 精确反应检索 物质 官能团 反应 结构 亚结构 文献

66 SciFinder 中的反应检索方式及分析

67 与反应有关的功能键 反应位置标记工具 反应角色工具 反应箭头 反应原子标记工具 反应官能团列表 反应检索的界面实际上和物质检索是一样的。

68 1、检索特定物质之间的反应 反应角色工具

69 使用精确反应检索获得特定反应 精确反应检索

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71 Analyze的分析工具 不同物质做溶剂的统计 共10种分析工具

72 Refine的限定工具 一共4种限定工具

73 获得符合要求的反应类型 点击，可以直接获得包含这条反应的记录 点击，可以直接获得这些反应的记录，实现从反应到文献的连接

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75 右击物质，可以直接进行物质结构或者反应检索，或者查看该物质的属性等等，实现从反应到物质的连接

76 2、官能团之间的反应 肟转化成胺的反应；贝克曼重排反应指醛肟或酮肟在酸催化下生成N-取代酰胺的亲核重排反应，
一个重要应用就是环己酮生产己内酰胺的反应，己内酰胺是制作尼龙的重要原料。碳氮双键变成碳氧双键

77 假如我们只想得到一步反应

78 假如我们规定反应物必须是苯乙酮肟

79 那么如何获得不是从苯乙酮肟出发的反应呢？
让我们先返回初次检索到的2284条反应。

80 再按照上面的检索获得从苯乙酮肟出发的反应，一共102条

81 运用Combine功能将不需要的答案集排除
这里可以看到保存过的标签的详细信息

82 选择集合操作类型

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84 COMBINE可以对于任意两个同类型的集合进行AND,OR,NOT的操作

85 *.SFR格式保存 将结果保存成书签，可以使用SF再次打开，继续进行检索，也可以对同类的书签进行COMBINE操作

86 3、反应检索举例-检索类似物的反应 想获得一步合成 该物质的反应

87 使用亚结构反应检索来扩大检索范围 必须的条件： 羟基接的碳必须是CH2 整个碳链不允许是某个环结构的部分结构
其余的三个碳原子链接什么基团对反应没有影响 据此我们修改我们的检索方式

88 亚结构反应检索 用环锁定功能锁定碳链， 保证其不成为环结构的一部份 用原子锁定功能锁定碳原子， 保证碳原子不被取代

89 看到类似的反应都查询出来

90 SciFinder 反应检索小结 多用Analyze/Refine，来获得催化剂，溶剂，产率等信息
如果反应只涉及基团之间的变化，用官能团反应可以获得更多的参考 信息 当无法找到具体反应，或者检索结果并不满意，尝试用亚结构反应查 询，可以获得更多的参考信息 更多有关结构和反应的说明，请参考

91 提纲 1、SciFinder介绍 2、SciFinder中的文献检索与分析 3、SciFinder中的物质检索与分析 4、SciFinder中的反应检索与分析 5、SciFinder Web介绍

92 SciFinder Web介绍 SciFinder Web是通过Web来访问SciFinder数据库的方式 友好的用户界面 更加详尽的文献信息和详尽的物质信息 即时跟踪特定研究领域的全球最新动态 永久的信息分享链接 ……

93 SciFinder通过帐号密码来控制用户使用
登陆网址：Scifinder.cas.org SciFinder通过帐号密码来控制用户使用

94 友好的用户界面 文献，物质，反应检索入口，默认开始检索文献

95 更加详尽的文献信息和详尽的物质信息 对于二茂铁这个物质，在哪些文献类型中有过报道
对于二茂铁这个物质以及它的衍生物，在专利和非专利文献中都存在那种研究报道

96 即时跟踪特定研究领域的全球最新动态 设定Email提醒，一旦有新的记录，会发邮件通知 可以通过历史导航条返回历史检索界面
设置提醒文件名和失效时间 96

97 永久的信息分享链接

98 提纲 1、SciFinder介绍 2、SciFinder中的文献检索与分析 3、SciFinder中的物质检索与分析 4、SciFinder中的反应检索与分析 5、SciFinder Web介绍

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102 请合理使用SciFinder !!! 一旦发生过量下载，CAS将视情节严重采取不同的限制措施
千万不要过量下载! 只下载自己要看 的记录（缩小范围） 不要用“迅雷”，“快车”之类的工具下载记录 不使用请关闭客户端程序 一旦发生过量下载，CAS将视情节严重采取不同的限制措施 全IP范围内取消全部下载功能，包括*.SFR 格式的下载 全IP范围内取消部分检索功能 情况严重的，将暂定SciFinder的使用

103 大量的记录的时候 思考一下： 这些记录都是我们想要的吗？ 如果我要全部看完的话需要多长时间？
所以希望大家能多用Analyze/Refine功能去分析限定文献； 遇到较多文献时请使用*.SFR格式保存。

104 可能1：（并发用户数限制） 解决方法：请耐心等候 ！

105 可能2：（网络故障） 解决方法：查看是否获得正确的site.prf文件并拷贝到正确的位置

106 可能3：网络故障 解决方法：点击OK，再次运行SciFinder/Scholar

107 可能4: IP地址未被授权 解决方法：确认IP地址是否在校内， 并与图书馆管理员联系。

108 Question/Answer 1、总结文献检索的注意事项 2、保存格式有哪几种？异同点？推荐的是哪一种？
3、请总结三种通过结构来检索物质的特点 4、反应检索小结

109 *.SFR *.RTF格式的异同 共同点：保存路径必须是全英文的 *.SFR 单次可以保持1万条记录；
还可以对同类型的格式进行Combine的操作。 *.RTF格式 类似word文档，可打印修改； 不必登陆SF就可以打开； 单次保存要不大于50篇记录， 保存较多时将引起过量下载。 共同点：保存路径必须是全英文的

110 SciFinder结构检索小结 精确结构检索，获得物质的盐，聚合物，混合物，配合物等；母体结构不能修 改，不能修饰
亚结构检索，所画的结构必须存在，母体结构可以被修饰，但不可以被修改 相似结构检索，获得相似度在60分以上的结构，母体结构可以修改，也可以被 修饰，用相似度来控制获得的结果

111 Thank You For Your Attention！
刘盈盈 美国化学文摘中国代表处 Tel： Ext801 文献检索都讲到这里。下面我来介绍一下；XXX讲完了； 物质讲慢一点；