The Structure and Function of Large Biological Molecules Chapter 5 The Structure and Function of Large Biological Molecules
一. 聚合物原理 聚合物(Polymer) : 以共價鍵相連單體所構成的長分子。 單體(Monomers) : 聚合物中的小分子單位。 縮合反應(Condensation reaction) : 單體連結反應,過程 中需要時去水分子以完成新的鍵結,故又稱脫水反應 (Dehydration reaction)。 水解(Hydrolysis) : 藉由水分子打斷聚合物分子間的鍵結, 為縮合的逆向反應。 酵素(Enzymes) : 加速細胞內化學反應的特殊蛋白。
二. 醣類(carbohydrates) 碳數: Mono- 單醣(Monosaccharides) : 醣類最小單位。 Di- Tri- Tetra- Penta- Hexa- Hepta- Octa- Nona- Deca- 單醣(Monosaccharides) : 醣類最小單位。 雙醣(Disaccharides) : 兩個單糖脫水形成糖苷 鍵(glycosidic linkage)組 合而成。 多醣(Polysaccharides) : 大分子的儲存(storage) 性醣類。 化學平衡有利於環狀的 形成。
醛糖 酮糖 The number of carbons in the carbon skeleton Dihydroxyacetone 二氫基丙酮 Ribulose核酮糖 Fructose 果糖 Glyceraldehyde 甘油醛 Ribose核糖 Glucose 葡萄糖 Galactose半乳糖 Hexoses (C6H12O6) Pentoses (C5H10O5) Trioses (C3H6O3) 醛糖 酮糖 The number of carbons in the carbon skeleton (with hydroxyl group (-OH) in each C except one) Location of “Carbonyl group” 幾何異構物 結構異構物 單醣種類(羧基、含碳數)
乳糖(lactose) : 由葡萄糖與半乳糖縮合而成。 蔗糖(sucrose) : 由葡萄糖和果糖縮合而成。 麥芽糖(maltose) : 由兩個葡萄糖縮合而成。 Maltose 麥芽糖 Glucose 雙醣種類
肝醣(glycogen) : 動物性多醣體,組成類似澱粉但分支成 度高。 澱粉(starch) : 植物性多醣體,葡萄糖單體由1碳→4碳串 聯而成螺旋狀(helical),內含直鏈與支鏈,以顆粒的形式 儲存於質粒體(plastids)中。 纖維素(cellulose) : 構成植物細胞壁的主要成分,與澱粉 組成相似但核苷鍵不同,鍵結為直鏈狀(straight)。 幾丁質(chitin) : 構成節肢動物外骨骼、真菌細胞壁的成分, 類似纖維素的結構但其單體多了氮附加物。 多醣種類
Glucose Glucose (a) and glucose ring structures The two interconvertible forms of flucose differ in the placement of the hydroxyl group (blue) attached to the no. 1 Carbon. Glucose Glucose (b) Starch: 1–4 linkage of glucose monomers (b) Cellulose: 1–4 linkage of glucose monomers Same position Opposite position 澱粉與纖維素((1碳→4碳+3碳→6碳)。)的差異
三. 酯質(Lipids) 脂肪(Fats) : 由一個甘油分子與三個脂肪酸縮合而成,依 其碳原子間雙鍵有無可分為飽和與不飽和兩種。 非極性 Fatty acid (palmitic acid) Glycerol 非極性
磷脂質(phospholipids) : 由一個甘油分子與兩個脂肪酸縮 合而成,第三個羥基連著一個磷酸基,是形成細胞膜的主 要成分。 (b) Space-filling model (a) Structural formula Fatty acids Choline 膽鹼 Phosphate 磷酸 Glycerol 甘油 Hydrophobic tails Hydrophilic head
類固醇(steroids) : 碳骨架由4個相連的碳環形成,膽固醇 (cholesterol)為組成其他類固醇的前驅物。
四. 蛋白質(Proteins) 由數百個成列的20多種胺基酸構成,在生物體內可幫助支 持、儲存、運輸、傳遞訊息、運動、防禦等重要機能,占 生物內乾質的50%以上。
變性(Denaturation) : 受到環境物理或化學變化,導致蛋 白質失去其原本結構,進而失去其生物活性。 復性(Renaturation) : 當環境因子恢復後,蛋白質可能會 回復其結構。 伴護蛋白(Chaperonins) : 協助蛋白質摺疊的分子。 X光晶體會圖技術(X-ray crystallography) : 利用X光繞射, 分析電子密度而得到分子結構的方法。
1. 酵素性蛋白(enzymes proteins) : 選擇性的加速化學反應(消化)。 2. 防禦蛋白(defense proteins) : 抵禦病毒與細菌(抗體)。 3. 儲藏性蛋白(storage proteins) : 胺基酸的儲存(酪蛋白)。 4. 運輸蛋白(transport proteins) : 運送所需物質(血紅素)。
5. 激素蛋白(hormonal proteins) : 幫助生物活性之調節(內分泌)。 6. 受體蛋白(receptor proteins) : 幫助細胞對化學性刺激給與反應(神經)。 7. 收縮蛋白(contractile proteins) : 運動(肌動蛋白)。 8. 結構蛋白(structural proteins) : 支撐作用(膠原蛋白、角質蛋白)
蛋白質結構(球、纖維蛋白) 1. 一級結構(primary structure) : 多肽鏈所構成之長鏈狀 結構。。 2. 二級結構(secondary structure) : 受到R支鏈影響導致疏 水性作用、雙硫鍵形成、氫鍵、凡得瓦力等特性。 3. 三級結構(tertiary structure) : 由單一條多肽鏈摺疊形 成,依其結構可分為螺旋結構、摺板結構 4. 四級結構(quaternary structure) : 兩條或兩條以上不同 的多肽次單元組成(三級結構混組)。
五.核酸(Nucleic acids) 核苷酸所構成之聚合物。 去氧核醣核酸(Deoxyribonucleic acid) : 內含基因複製的 指令,2號碳連接一顆氫原子。 核醣核酸(Ribonucleic acid) : 主要功用是製造蛋白質,2 號碳連接氫氧基。
核苷酸(Nucleotide) : 分別以含氮鹼基、五碳糖、磷酸基 組成。
嘧啶類(Pyrimidines) : 由碳原子組成之六員環結構 (cytosine, thymine, and uracil) C,T,U 嘌呤類(Purines) : 由碳原子組成之六員環+五員環結構 (adenine and guanine) A,G
轉錄 轉譯
DNA複製過程 : C和G、A和T會形成氫鍵。 DNA轉錄為RNA的過程 : C和G會形成氫鍵,然而因為RNA沒有 T,所以A會轉錄為U,但T還是可以轉錄為A。 (例 : 一段DNA如果是ATTGAC,轉錄的mRNA就會是UAACUG) mRNA訊息作用 : 攜帶DNA的基因原始密碼 tRNA轉運作用 : 對比相對應的密碼子連接胺基酸。 rRNA轉譯作用 :是一種具有催化能力的核糖酶,但其單獨存在 時不能發揮作用,僅在與多種核糖體蛋白質共同構成核糖體後 才能執行其功能。