医学绘图与分析软件 基础应用 张妮妮 2015-6-2 19:00 图书馆二楼多媒体培训教室

简介 GraphPad Prism是一款集数据分析和作图为一体的数据处理软件，尤其适合生物医学类，可以直接输入原始数据获得高质量的科学图表。 它在统计分析上劣于SPSS 等统计软件。 不需要输入程序语言，只需输入原始数据。 容易操作，绘图美观。 可与ppt，word相链接。 Graphpad与origin的比较 Origin的数据分析主要包括统计、信号处理、图像处理、峰值分析和曲线拟合等各种完善的数学分析功能。准备好数据后，进行数据分析时，只需选择所要分析的数据，然后再选择相应的菜单命令即可。Graphpad的绘图是基于模板的，Origin本身提供了几十种二维和三维绘图模板而且允许用户自己定制模板。绘图时,只要选择所需要的模板就行。用户可以自定义数学函数、图形样式和绘图模板；可以和各种数据库软件、办公软件、图像处理软件等方便的连接。

大纲 统计图基本知识 GraphPad Prism5绘图界面 案例分析 统计图的排版与导出 案例分析各种统计方法所对应的统计图绘制

统计图的基本知识 统计图基本要素 常见统计方法的图形表达

统计图的基本要素 1.标题：一般位于图的正下方，简明扼要说明主要内容 2.X轴：有两种 分类轴：表示两种不同的类别 数据轴：表示一个数值概念 3.Y轴：一般为数值轴 4.图形区：二维平面内点、线、条表达数据 From www.drheart.cn

常见统计方法的图形表达 1.独立样本t检验 2.配对t检验

3.完全随机设计资料的方差分析 4.析因设计资料的方差分析 5.重复测量资料的方差分析

6.两组独立样本的秩和检验 7.多组独立样本的秩和检验 9.列联表分析 生存分析 简单线性回归和线性相关

GraphPad Prism5绘图界面 一、欢迎界面 二、软件主界面 三、目录树 四、快捷菜单栏 五、图像模块详解 六、坐标轴调整 七、图形设定界面

欢迎界面

欢迎界面要对统计方法进行选择 特定的统计方法→对应的数据录入格式和图像类型

设定统计类别、图像类型和数据输入格式后，进入软件主界面 1.统计类型 2.图形类型 3.数据输入格式

二、软件主界面

三、目录树 图形；当完成数据录入，点击该图标，则自动生成图像 布局 数据集；点击，进入数据录入窗口，在欢迎界面选择不同的统计类型，数据集的表格会有所不同 图形；当完成数据录入，点击该图标，则自动生成图像 布局

四、快捷菜单栏 文档操作模块，如打开、新建、保存、前进、后退、复制和粘贴。该模块与office软件操作一致。 分析模块。 图形模块，将对图形类型、坐标轴和图形本身进行分析，将重点解释。 文字修饰模块，可以绘制线条、添加文字，并对文字进行调整。 图形输出模块，包括图形导出，打印和一键输入至word，ppt中。

五、图形模块详解 相当于欢迎界面 中的统计方法和图形类型选择项，可以对统计方法重新选择，但一般只对图形类型进行选择。 对坐标轴进行具体设定，包括原点、X轴和Y轴。 对图形进行具体调整。 图表的配色方案，默认为黑白图表。

六、坐标轴调整 Frame and Origin 坐标框与原点

1. Frame and Origin 坐标框与原点 （2）Shape，Size and Position：绘图区的形状、大小和位置进行设定，一般不需要设定。

（4）Frame and Grid Line：对图形框和网格线进行设定 （3）Axes and Colors 绘图区的颜色 背景颜色 （4）Frame and Grid Line：对图形框和网格线进行设定 左侧有预览，可尝试使用

Gaps and Direction：只有XY图形，才能进行设定 2. X axis(X轴) Gaps and Direction：只有XY图形，才能进行设定 一般为线性，浓度选择logo刻度 X轴是否分段和方向 对刻度图示进行调整 添加辅助线，还可对两条辅助线内区域进行填色

3. Left Y axis(左Y轴) 4. Right Y axis(右Y轴) 软件默认无右Y轴 与X轴设定方法类似 Note：添加右Y后，所有图像仍跟随左Y,如果某些数据需要按照右Y,需要在Format Graph对话框中实现。 Note：添加右Y后，所有图像仍跟随左Y,如果某些数据需要按照右Y,需要在Format Graph 对话框中实现。

七、图像设定界面 Data Set Style:样式，不同的图形 Additional options 可以选择数据集是否依据左Y还是右Y进行显示，如果出现第二Y轴，此处应进行设定。

案例分析

* 配对t检验 适用情况（4种）： 配对的两组受试对象分别接受两种处理 同一受试对象处理前后的比较 同一受试对象两个不同部位的比较 同一样品用两种方法（仪器等）检索结果的比较

实例1 抽取15名某大学的学生进行了为期3个月的发展腿部爆发力的训练，运用实验的方法在训练前后分别测试了每一人的立定跳远成绩。统计15名学生训练前后的数据。

该实例的图像表达 应该采用单一研究对象前后值连线的方式表达 与独立t检验区别开来 若数据太多，则不适合用图形表达

图形绘制 Step 1：图形类型选择 1.Column → 适合t检验、ANOVA、秩和检验… 2.新建数据集 3.选择图形类型 4.绘制各点并连线

图形绘制 进入主界面

图形绘制 Step 2：数据录入 1.在data窗口，录入数据 2.点击左侧目录树中的Graphs，自动生成图形。

图形绘制

图形绘制 Step 3：坐标轴和图形调整 1. 点击快捷菜单栏change模块中 弹出坐标轴对话框 2.选择X轴，对X轴进行调整

图形绘制 Step 4：文字修饰 1. 不需要的文字点击删除即可 2.可通过Write插入文字 3.在Text菜单栏对字体进行调整

图形绘制 最后图形如下：

* 实例2 成组t检验

该实例的图形表达 1.散点图（图1）：清晰描述各点数据，易发现离群点，横线为均值，适合数据较少时。 2.误差图（图2）：箱顶为均数，触须线表示SD，也可表示SE,适合数据较多时。 3.误差图（图3）：点表示均数，直线表示两侧SD。

图形绘制 Step 1：图形类型选择 1.Column → 适合t检验、ANOVA、秩和检验… 2.新建数据集 3.选择图形类型 ---纵向散点图 4.选择Mean，用横线表示均数。

图形绘制 进入主界面

图形绘制 Step 2：数据录入 1.在data窗口，录入数据 2.点击左侧目录树中的Graphs，自动生成图形。

图形绘制

图形绘制 Step 3：坐标轴和图形调整 1. 点击快捷菜单栏change模块中 弹出坐标轴对话框 2.选择X轴，对X轴进行调整

图形绘制 Step 4：文字修饰 1. 不需要的文字点击删除即可 2.可通过Write插入文字 3.在Text菜单栏对字体进行调整

图形绘制 最后图形如下：

实例3 为了探讨雌激素预防骨质疏松症的作用，研究者将30只10月龄SD雌性大鼠随机等分到假手术组（组1）、卵巢切除组（组2）和卵巢切除后补充17β-雌二醇组（组3），12周后处死大鼠，取其股骨，测量股骨重量。

定量资料----统计方法选择 定量资料 正态：均值的比较 两组：t检验 多组：方差分析 非正态：中位数的比较 两组：非参（Mean-Whitney U检验） 多组：非参（Cruskal-Wallis H检验）

图形绘制 Step 1：图形类型选择 1.Column → 适合t检验、ANOVA、秩和检验… 2.新建数据集 3.选择图形类型 ---垂直柱状图 4.选择Mean with SD。

图形绘制

最终的图形

实例4 某医生将病人随机分为两组，分别以新疗法和传统疗法治疗。比较两种疗法的退热时间有无差别。

两组独立样本资料比较的秩和检验 两组独立样本资料比较的检验方法 --- 满足正态分布和方差齐性 -----可用t检验或完全随机设计的方差分析 --- 不满足正态分布或方差齐性 -----可采用Wilcoxn秩和检验（rank sum test） -----推断两独立样本分别代表总体分布位置是否不同。

二、图形绘制 Step 1：图形类型选择 1.Column → 适合t检验、ANOVA、秩和检验… 2.新建数据集 3.选择图形类型 ---纵向散点图 4.选择Median，用横线表示中位数。

图形绘制 Step 2：数据录入 1.在data窗口，录入数据 2.点击左侧目录树中的Graphs，自动生成图形。

图形绘制 最终的图形

实例5—折线图 研究进食量与体重增加的关系

二、图形绘制 Step 1：图形类型选择 1.XY → 线性回归，非线性回归，相关分析 2.新建数据集 3.选择图形类型 ---散点图 两变量的关联性分析 二、图形绘制 Step 1：图形类型选择 1.XY → 线性回归，非线性回归，相关分析 2.新建数据集 3.选择图形类型 ---散点图

二、图形绘制

图形绘制---添加拟合直线

图形绘制---坐标轴和图形调整

图形绘制---坐标轴和图形调整

统计分析---自动生成 Y＝1.977＋0.06479X R2＝0.899

最后的图形

统计图的排版与导出

统计图的排版与导出

统计图的排版与导出

统计图的排版与导出--投稿图片

导出后的图片

统计图的排版与导出—ppt、word

双击图片，返回到GraphPad程序

致谢

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