Pubmed数据库检索

网址 http://www.pubmed.org OR http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/m/pubmed/ （手机版）

一、概述 （一）数据来源 MEDLINE (1966~至今) PreMEDLINE Publisher supplied citations OldMedline(1951~1965)

MEDLINE 收录了全世界70多个国家和地区1950年以来的8946余种生物医学期刊（其中约1400多种免费期刊），目前文摘条目2200多万篇，年报道量近40万条，英文刊物约占90%；75%的文献有英文摘要，每周更新。 内容涉及：医学、药学、牙医学、护理学、卫生保健、兽医学等专业。 记录标注[PubMed - indexed for MEDLINE]

PreMEDLINE PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据，可为用户提供基本的文献条目和文摘，其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移动一次。 记录标注[PubMed - in process]

Publisher Supplied Citation 出版商直接向PubMed递送的电子文献。 每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送，但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围，将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代，例如在综合性的科学杂志（Science或Nature）上发表的地理学文章等。 记录标注[PubMed - as supplied by publisher]

常用字段标识符（共50个） Affiliation [AD] Article Identifier [AID] All Fields [ALL] Author [AU] Book [book] Volume [VI] Corporate Author [CN] Create Date [CRDT] Completion Date [DCOM] EC/RN Number [RN] Editor [ED] Entrez Date [EDAT] Filter [FILTER] First Author Name [1AU] Full Author Name [FAU] Full Investigator Name [FIR] Grant Number [GR] Investigator [IR] ISBN [ISBN] Issue [IP] Journal [TA] Language [LA] Last Author [LASTAU] Location ID [LID] MeSH Date [MHDA] MeSH Major Topic [MAJR] MeSH Subheadings [SH] MeSH Terms [MH] Modification Date [LR] NLM Unique ID [JID] Other Term [OT] Pagination [PG] Personal Name as Subject [PS] Pharmacological Action [PA] Place of Publication [PL] PMID [PMID] Publisher [PUBN] Publication Date [DP] Publication Type [PT] Secondary Source ID [SI] Subset [SB] Supplementary Concept[NM] Text Words [TW] Title [TI] Title/Abstract [TIAB] Transliterated Title [TT] UID [PMID] 格式： 检索词[字段标识符] smith jc[au] lancet[ta] therapy[ti] kidney failure[MH] fudan university[AD] Comment Corrections e.g., Comment in: hascommentin Comment on: hascommenton comments or errata Version e.g., 20029666.4. Owner owner + the owner acronym, e.g. ownernasa.

PubMed的特点 能获取到当月当日甚至还未正式出版的最新文献；以及1966年以前的文献。 具有强大的词语自动匹配转换功能，能对意义相同或相近的词或词组进行全面搜索，并自动转换后再检索。 把相关的期刊文献、数据、事实、图书连接在一起，形成相互贯通的信息链，方便进行追溯性检索。 能在线获取部分免费电子版全文。

二、检索规则-词汇自动转换 1、 MeSH Translation table 包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词（题名词和文摘词）进行检索。 Vitamin c 转换为: "ascorbic acid"[MeSH Terms] OR ("ascorbic"[All Fields] AND "acid"[All Fields]) OR "ascorbic acid"[All Fields] OR "vitamin c"[All Fields] 想要查验检索词的转换情况，并进行调整和保存检索策略，可参考网页右边的“search details”部分

二、检索规则-词汇自动转换 2、Journals Translation table 包括刊名全称、缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE的标准缩写+[Journal Name]"后进行检索。 New England journal of medicine 转换为 “N Engl J Med”[Journal] Clin Lung Cancer. 2010 Jan;11(1):51-6转换为： "Clin Lung Cancer"[Journal] AND 2010[PDAT] AND 11[VOL] AND 1[ISS] AND 51-6[PAGE]

二、检索规则-词汇自动转换 3、Phrase List 该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统（UMLS: Unified Medical Language System）和补充概念（物质）名称表[Supplementary Concept (Substance) Name]。如果PubMed 系统在MeSH词表和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词，就会查找该短语表。 Cold compresses ("pulmonary disease, chronic obstructive"[MeSH Terms] OR ("pulmonary"[All Fields] AND "disease"[All Fields] AND "chronic"[All Fields] AND "obstructive"[All Fields]) OR "chronic obstructive pulmonary disease"[All Fields] OR "cold"[All Fields] OR "common cold"[MeSH Terms] OR ("common"[All Fields] AND "cold"[All Fields]) OR "common cold"[All Fields] OR "cold"[All Fields] OR "cold temperature"[MeSH Terms] OR ("cold"[All Fields] AND "temperature"[All Fields]) OR "cold temperature"[All Fields]) AND compresses[All Fields]

二、检索规则-词汇自动转换 4、Author Index 当一个短语在前三个表中都找不到匹配词，并且有1或2个字母在词后时，PubMed就会自动到作者索引中查找。 姓前（全称）、名后（首字母缩写） smith jc自动转化成： Smith, Jc[Full Author Name] OR smith jc[Author]

二、检索规则-词汇自动转换 如果仍然找不到匹配词，PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程，直到找到与键入的词语相匹配词语为止。若仍然没有匹配词，单个词会被联一起（用AND）在全部字段中检索。 例：pressure point转换为("pressure"[MeSH Terms] OR "pressure"[All Fields]) AND point[All Fields]

二、检索规则-短语检索 例如： “single cell” “oxygen free radicals” 如果在短语上加半角双引号后，系统将只在 Phrase List中查找，不再进行自动转换。 例如： “single cell” “oxygen free radicals”

二、检索规则-布尔逻辑运算 逻辑词符（AND、OR、NOT）必须大写。 lung AND apoptosis; vitamin c OR ascorbic acid；Lead poising NOT children 运算优先级为: ()> NOT > AND > OR。 例如：drug therapy AND （asthma OR hay fever） 布尔逻辑检索允许在检索词后面附加字段标识 例如：dna[mh] AND crick[au] AND 1993[dp] 查带文摘的文献（1975年以后出版的文章） 检索词 AND hasabstract 例如，Neoplasms AND hasabstract

二、检索规则-截词检索 无限截词符：* 在词的末尾加*号，PubMed就会检索出以该词为词根的所有词，但不包括*号后有一个空格的词组，譬如，infection*包括infections， infectious，infective，infectivity，infector等，但不包括infection control。 截词检索将关闭自动词语匹配功能，也不能进行扩展检索。如：heart attack* （心脏病发作）不会匹配MeSH词，也不会扩展检索myocardial infarction（心肌梗死）、myocardial stunning（心肌顿抑，缺血后心肌功能障碍）、shock、cardiogenic等这些方面的文献。

三、检索途径与方法 基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 限定检索 - Limits Search 期 刊 检 索 – Journal Search 主题词检索 - MeSH Databases

检索步骤：输入检索词，点[search]按钮或按回车键 检索词的输入形式： 输入单词或短语或表达式，也可用*及双引号 著者姓名：weng xz OR weng xz [au] 刊名标题：刊名全称、缩写、ISSN Journal of leukocyte biology，J leukoc biol，0741-5400

单个词刊名的期刊刊名后需要附加字段标识符。 如：Scanning[ta] 备注： 当刊名与主题词相同时，刊名后需要附加字段标识符。如：gene therapy[ta]、science[ta]、cell[ta] 单个词刊名的期刊刊名后需要附加字段标识符。 如：Scanning[ta] 带括号刊名的期刊，录入时应将括号省略。 J Hand Surg[Am]输入格式为J Hand Surg Am

基 本 检 索 直接输入检索词或检索式

限定检索

高级检索

期 刊 检 索 基本检索状态下，直接输入刊名 在限定或高级检索状态下，在All Fields中选择Journal字段，然后 输入刊名 输入格式：刊名全称、ISSN、刊名缩写（MEDLINE、ISO）、NLM ID

期刊编目信息浏览页

主 题 词 检 索 《医学主题词表》(Medical Subject Headings，简称MeSH)，是美国国立医学图书馆于1960年编制的权威性主题词表。它是一部一部动态词表，为了保持与科学发展同步，每年都有一定数量的词汇增删变动。它既是NLM对医学文献标引的依据，也是用户检索《医学索引》的入口。（2013年26853个mesh词”Ascorbic Acid”，199,000入口词” Vitamin C”） 《MeSH》在文献检索中的重要作用主要表现在两个方面：准确性（准确揭示文献内容的主题）和专指性。标引（对文献进行主题分析，从自然语言转换成规范化检索语言的过程）人员将信息输入检索系统以及检索者利用系统内信息情报这两个过程中，以主题词作为标准用语，使标引和检索之间用语一致，达到最佳检索效果。 在进行检索时，用户输入一个主题词后，系统会自动显示该主题词所能组配的副主题词。《MeSH》有一个副主题词表，1989-1990年IM使用的副主题词是77个，1991-1994年是80个，每年略有变化。目前使用的副主题词是92个。 副主题词(Subheadings)又称限定词(Qualifiers)，与主题词进行组配，对某一主题词的概念进行限定或复分，使主题词具有更高的专指性。如诊断（Diagnosis，DI）、药物治疗（Drug Theray，DT）、血液供给（Blood Supply，BS）等。正确选择副主题词也很关键。例如肺发育不全，输入主题词“肺”后，在副主题词菜单中选择“畸形”表示发育不全。

主 题 词 检 索 在《医学主题词注释字顺表MeSHAAL》中，对每个范畴类目的主题词和副主题词的组配原则进行了严格规定，组配时要按照规则进行。 例如，副主题词治疗therapy与疾病主题词组配，可用于综合疗法。例如，消化性溃疡的心理疗法，用消化性溃疡/治疗；心理疗法。 副主题词治疗应用therapeutic use 与药物、生物制品和物理作用物主题词组配。指用于预防和治疗疾病，包括兽医用药。例如，红霉素治疗链球菌感染，用红霉素/治疗应用；链球菌感染/药物疗法。 在检索中，主题词与副主题词的组配（主题词/副主题词）两者间须有必然的逻辑关系，善于分析两者之间的关系（因果关系、应用关系等）是正确组配的关键。例如，眼结核引起失明，用结核，眼/并发症；盲/病因学。牛奶引起动脉硬化，用牛奶/副作用，动脉硬化/病因学。阿司匹林治疗感冒，用阿司匹林 /治疗应用；感冒/药物疗法。 MeSH 附有各种参照和注释，它是对生物医学文献进行标引和检索的依据。例如，在《医学主题词注释字顺表MeSHAAL》中， 该表的参照系统： ①用代参照，用 “See”表示。指引检索者将非正式主题词用正式主题词。例如，Cancer See Neoplasms。通过用代参照处理，从若干同义关系的词或词组中，选定一个科学而通用的名称作为主题词，供检索文献用。 ② 相关参照：用相关参照“See related”表示。目的是指引检索者从一个主题词去参考有关的其他主题词，以扩大选词范围。例如，检索 Alopecia（脱发）这一概念时，要把它的相关参照Alopecia Mucinosa（斑秃）、 Baidness（脱发）、 Hair Diseases（毛发疾病） Hypotrichosis（毛发稀少）等4个相关参照词下的内容看清楚，才能达到查全的目的。

主 题 词 检 索 输入检索词，点“search”后会自动转换为相应的MeSH词供选择。 MeSH入口

主 题 词 检 索 组配副主题词 可组配一项或多项 仅作为主要主题词 不对下位主题词进行扩展检索

主 题 词 检 索 树状结构表 用逐级缩格的形式显示所选主题词（黑体）的学科隶属关系，由总到分、由大类到细类逐级展开，清晰地体现主题词间的隶属、派生、平行关系，满足族性检索的需要，也便于扩大或缩小检索范围。

四、检索结果

五、链接功能 Related citations- 链接相关文献 Links - 链接NCBI其它数据库 Necleotide、Protein、Genome、Structure、Popset、Taxonomy、OMIM、Books、Probeset、3D Domains Books - 链接相关图书 Linkout – 链接外部资源，期刊全文的链接；校园网内可以直接点此打开已经购买的电子资源。（注意默认状态不显示此链接，需要显示单篇带摘要的格式时才会出现）

这里的全文链接最多可显示2个图标，超过两个时可以看左下方的linkout部分

直接点击该链接即可打开ovid数据库内的全文

gopubmed http://gopubmed.com GoPubMed本身并没有数据库，其数据源跟美国国立医学图书馆的PubMed完全一样。其原理是将读者检索提问词提交给PubMed，接收PubMed的检索结果，利用GO（gene ontology）和MESH（医学主题词表）对检索结果进行提炼，利用算法从中提取GO术语和MESH主题词，自动生成临时基因本体和医学主题词表，从而对检索检索进行分类，读者可以根据这些分类快速找到自己需要的文献，而不需要将检索到所有文献进行阅读，节省时间！ gopubmed主要分析功能：What，Who，Where，和When。

Pubmed中文版 http://pubmed.cn/ PubMed.CN是一个实验性项目，旨在生命科学医药检索领域做一些探索，希望能够为中国乃至全球的用户提供一些前所未有的应用。加入大量MedLine数据库以外的数据，包括对图库、全文及NSFC数据进行了分析和整合。 中文版pubmed信息检索平台可用期刊影响因子分值过滤，可以任意选择你需要的期刊影响因子分值检索选择文献，还可按影响因子输出检索结果。

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