外源基因的表达 主讲:李志红
外源基因在宿主细胞中表达 导入宿主细胞 外源基因 重组载体 表达载体 在宿主细胞中 表达出蛋白质 提取蛋白 宿主细胞: 原核细胞或真核细胞。
常见表达系统的类型 大肠杆菌表达系统 芽孢杆菌表达系统 原核生物基因表达系统 链霉菌表达系统 酵母表达系统 丝状真菌表达系统 昆虫表达系统 哺乳动物细胞表达系统 植物生物反应器 真核生物基因表达系统
大肠杆菌表达系统 优势: 一种成熟的基因克隆表达的受体细胞 繁殖迅速,培养代谢易于控制 易于进行遗传操作和高效表达
一、大肠杆菌表达载体的结构 除了含有与克隆载体相同的元件之外,还必须含有表达载体所需要的其它元件: 原核或噬菌体启动子 SD序列 MCS 终止子
-35 Box 和 -10 Box 1. 启动子 是DNA上的能与RNA聚合酶结合并能起始mRNA合成的序列。 1. 启动子 是DNA上的能与RNA聚合酶结合并能起始mRNA合成的序列。 大肠杆菌的所有启动子中都有两段一致顺序(consensus sequence)。 -35 Box 和 -10 Box TTGACA TATAAT 转录起始位点 17bp 5’ 核糖体结合位点
Shine-Dalgarno(SD) sequence 2. 核糖体结合位点( RBS) Shine-Dalgarno(SD) sequence 翻译起始阶段,与核糖体16sRNA的3’端相互作用,正确定位起始密码子 SD 5’—AGGAGGU——AUG—— UCCUCCA 16S rRNA3’ SD序列距离AUG的距离影响翻译
3. 转录终止子 在表达载体克隆位点的下游一般设计一段转录终止子,mRNA转录终止信号。
常用表达载体 pJLA50X系列; pcDNAII; etc pET系列 (T7 promoter, Novagen公司) pQE系列 (T5 promoter, Qiagen公司) pMAL系列 (周质表达, BioLabs公司) pGEX系列 (GST融合表达, Pharmacia公司) pBAD系列 (Arabinose诱导型) pTYB系列 (CBD融合, 可以自我切割, BioLabs)
工程化宿主菌的选择 某些特殊的启动子需要特殊的宿主菌 工程菌高密度发酵要解决的问题: 常用:BL21(DE3) 营养 供氧 pET系列载体 T7 RNA pol 工程菌高密度发酵要解决的问题: 营养 供氧 IPTG诱导:培养、诱导时间
IPTG(异丙基-β-D-硫代半乳糖苷, isopropylthiogalactoside) 极强的诱导剂 安慰诱导物:如果某种物质能够促使细菌产生酶而本身又不被分解,这种物质被称为安慰诱导物,如IPTG。
Z Y A O P 乳糖操纵子(lac operon) 调控区 结构基因 DNA 操纵序列 启动序列 CAP结合位点 Z: β-半乳糖苷酶 16
lac 操纵子与阻遏蛋白的负性调节
BL21(DE3) DE3溶源化的菌株如BL21(DE3)是最常用的表达菌株,构建好的表达载体可以直接转入表达菌株中,诱导调控方式和lac一样都是IPTG诱导。
为何? 二、原核表达系统的注意事项 1. 外源基因不能带有内含子 2. 一般用cDNA,不能直接用真核基因组DNA 1. 外源基因不能带有内含子 为何? 2. 一般用cDNA,不能直接用真核基因组DNA 3. 必须利用原核细胞的强启动子和 SD序列等调控元件控制外源基因的表达 4. 利用宿主细胞的调控系统,调节外源基因的表达,防止外源基因的表达对宿主菌的毒害
1. 细胞质中表达 三、外源蛋白在大肠杆菌中的表达部位 是存在于细胞质中的一种不溶性蛋白质聚集折叠而成的晶体结构物。 包涵体(inclusion body) 是存在于细胞质中的一种不溶性蛋白质聚集折叠而成的晶体结构物。 包含体(inclusion bodies)是无定形的蛋白质的聚集,不被任何膜所包围。细胞破碎后,包含体呈颗粒状,致密,低速离心就可以沉淀。包含体难溶于水中,在变性剂溶液(如盐酸胍、脲)中才能溶解。在这些溶液中,溶解的蛋白质呈变性状态,即所有的氢键、疏水键全被破坏,疏水侧链完全暴露,但一级结构和共价键不被破坏。因此当除去变性剂时,一部分蛋白质可以自动折叠成具有活性的正确构型,这一折叠过程称为蛋白质的复性。 包含体主要由蛋白质构成,其中大多是基因表达产物。这些基因表达产物没有生物活性。为此,欲获得天然活性态的目标产物,必需分离包含体后,溶解包含体并使其中的目标蛋白恢复应有的天然活性。 信号肽位于分泌蛋白的N端。一般由15~30个氨基酸组成。新合成多肽链中用于指导蛋白质的跨膜转移(定位)的N-末端的氨基酸序列(有时不一定在N端) inclusion body 包涵体形成的原因主要是蛋白高水平表达的结果。
① 优点 使重组蛋白易于分离、免受蛋白酶降解、不损害寄主细胞 ②缺点 回收的蛋白生物活性差。
包涵体的分离和溶解 包涵体的分离 包涵体的溶解 包涵体蛋白的复性 致密的颗粒 ,低速离心收获 强的变性剂 6 mol/ L 盐酸胍或6~8 mol/L 尿素 包涵体蛋白的复性 去除过量的变性剂和巯基还原剂,并把还原的蛋白转到氧化的环境中促使二硫键的形成 。
2. 周质中表达 周质(periplasm) 革兰氏阴性菌位于内膜和外膜之间的细胞结构部分。 优点: 容易被浓缩和纯化、有利于正确折叠、被降解的少。
3. 胞外表达 使在大肠杆菌细胞中表达的外源蛋白分泌到细胞外的培养基中。 由于需要穿过两层膜,大肠杆菌只能分泌极少的蛋白质到培养基中,效果不太理想。 外膜 内膜 细胞质 周间质 染色体 质粒
四、几种类型的原核表达载体 1.非融合型表达载体 表达的外源蛋白质不与其它蛋白质融合在一起。 S-D序列 ATG-外源基因-TAG 优点: 产物结构接近于真核细胞体内的蛋白质结构。 缺点: 容易被宿主菌的蛋白酶所破坏。
2. 融合蛋白表达载体系统 表达出的外源蛋白与质粒载体上的另一蛋白(常为标签蛋白)连接在一起。 (1) 优点 便于分离和纯化。
(2) 组成结构 ①启动子:tac ②操纵基因:lacP ③调节基因:lacI ④S-D序列 ⑤ori:pBR322 ori ⑥融合肽:GST(谷胱甘肽巯基转移酶) lacI tac lacP lac O S-D/ATG GST 插入位点 TGA
表达产物的纯化 凝胶层析 离子交换层析 亲和层析
亲和层析 亲和层析:利用生物分子间专一的亲和力而进行分离的一种层析技术
亲和层析的基本原理 将具有亲和力的两个分子中一个固定在不溶性基质上,利用分子间亲和力的特异性和可逆性,对另一个分子进行分离纯化。
(3) 产物提纯 GST融合蛋白用Glutathione Sepharose亲和层析柱 分离纯化。
(4) 产物分离 用凝血酶或Xa因子可以把外源蛋白从GST上切下来。
(5)其他融合蛋白系统 His-tag(组氨酸标签): 在外源多肽的N端或C端接上6 个组氨酸(6×His)。 His-tag能与Ni2+柱结合,但很容易被EDTA (或咪唑溶液)洗脱下来,可以纯化蛋白质。
ProBond™ 镍离子螯合树脂
亲和层析的特点 优点: 1.纯化过程简单、迅速 2.分离效率高 3.实验条件温和 缺点: 亲和吸附剂通用性较差。针对某一分离对象就需要制备专一的吸附剂和建立相应的实验条件
各种用于抗体识别的标记 His-tag (6-8 Histidine) T7-tag (MASMTGGQQMG) HSV-tag (QPELAPEDPED) S-tag (KETAAKFERQHMDS) VSV-G-tag (TTDIEMNRLGK) HA-tag (YPYDVPDYA) Flag-tag (DYKDDDDK) Myc-tag (EQKLISEEDL)
原核表达中的问题 缺乏转录后加工机制,只能表达cDNA 缺乏翻译后加工机制,不能折叠和糖基化 融合蛋白形成包涵体(inclusion body),复性后才有活性 很难表达大量的可溶性蛋白
五、实例—— 利用重组大肠杆菌生产人胰岛素 1. 胰岛素的结构及其生物合成 2. 人胰岛素的生产方法 3. 重组人胰岛素的大肠杆菌工程菌的构建
1. 胰岛素的结构及其生物合成 信号肽 B 肽 C 肽 A 肽 信号肽酶 B 肽(30) C 肽(31) A 肽(21) 1. 胰岛素的结构及其生物合成 N C 信号肽 B 肽 C 肽 A 肽 信号肽酶 S C N B 肽(30) C 肽(31) A 肽(21) R K 高尔基体内的特异性肽酶 胰岛素原 胰岛素最初是以一条单链分子的前体形式合成的,即胰岛素原(Proinsulin)。它可认为是由ABC三条肽链连接而成。具体是C肽的一端通过两个碱性氨基酸残基62、63与胰岛素A链的N末端相连,另一端通过另外两个碱性氨基酸残基31、32与胰岛素B链的C末端相连。在细胞高尔基体中,胰岛素原被贮存在储存颗粒内,并在肽酶的催化下,切去C肽而形成活性胰岛素。 胰岛素
2. 人胰岛素的生产方法 (1)直接提取法制备人胰岛素 2. 人胰岛素的生产方法 迄今为止,有四种大规模生产人胰岛素的方法: (1)直接提取法制备人胰岛素 早期人的胰岛素是从人的胰脏中直接分离纯化的,由于原料供应的限制,其产量远远不能满足日益增多的糖尿病人的临床需求。
(2)化学合成法制人胰岛素 根据人胰岛素A链和B链的序列,由单个氨基酸从头合成。这条化学全合成的路线从技术上来说是能够做到的,但其生产成本奇高,从而也限制了产品的广泛应用。
(3)化学转型法制人胰岛素 猪的胰岛素可从原料丰富的猪胰脏中提取获得,而且猪胰岛素与人胰岛素只在B链的C末端有一个氨基酸的差异,猪的为Ala,人的为Thr,因此将猪胰岛素在体外酶促转化为人胰岛素不失为一种选择。
(4)基因工程法制备人胰岛素 1982年,美国Ely LiLi公司首先使用重组大肠杆菌生产人胰岛素,成为世界上第一个上市的基因工程药物。1987年,Novo公司又推出了利用重组酵母菌生产人胰岛素的新工艺。 优点:上述由基因工程菌合成的重组人胰岛素在体外胰岛素受体结合性能、淋巴细胞和成纤维细胞的应答能力、降血糖作用、血浆药代动力学等指标上均与天然胰岛素没有任何区别,而且还具有无免疫原性、注射吸收迅速等优点,充分展示了基因工程在生物医药领域中的巨大潜力。
3. 重组人胰岛素的大肠杆菌工程菌的构建 (1)A链和B链分别表达法 3. 重组人胰岛素的大肠杆菌工程菌的构建 (1)A链和B链分别表达法 化学合成: A、B链的编码序列
表达产物的后处理路线:
生产技术的评价: 由于A链和B链上共存在六个半胱氨酸残基,体外二硫键的正确配对率较低,通常只有10% - 20%,因此采用这条工艺路线生产的重组人胰岛素每克成本高达100美元以上。 为了进一步降低生产成本,美国Ely LiLi公司随后又建立了第二条生产重组人胰岛素的工艺路线。
3. 重组人胰岛素的大肠杆菌工程菌的构建 人胰岛素原表达法
表达产物的后处理路线: 胰岛素原是胰岛素的前身,需要经过酶切去除C 肽,方成为有功能的胰岛素。
生产技术的评价: 二硫键的正确配对率相应提高,折叠率高达80%以上。虽然这条工艺路线并不比AB链分别表达法更为简捷,而且还要使用两种高纯度的酶制剂,但理想的折叠率在很大程度上弥补了工艺繁琐的缺陷,使得每克最终产品的成本仅50美元。 目前美国Ely LiLi公司采用此工艺年产十几吨的重组人胰岛素。
原核表达系统不能对表达的真核蛋白进行正确的折叠和翻译后加工!!! 第二节 外源基因在真核细胞中的表达 为什么建立真核表达系统? 原核表达系统不能对表达的真核蛋白进行正确的折叠和翻译后加工!!!
一、真核生物表达的优越性和必要性 1、真核生物具有转录后加工系统,可识别并删除基因中的内含子,剪切加工为成熟mRNA 2、具备完善的翻译后加工系统,可进行糖基化、乙酰化等修饰,使蛋白形成正确的天然构型,因而真核生物表达系统产生的蛋白更接近天然状态,有利于其功能、生物活性的研究。
3、某些真核细胞可将基因表达产物分泌到细胞培养液中,简化了纯化工艺,降低了生产成本。 4、另外,真核生物表达的调控方式非常复杂,有助于我们深入了解基因调控机制。
二、真核生物表达系统 (一) 酵母表达系统 (二)植物细胞表达系统 (三)昆虫细胞表达系统 (四) 哺乳动物细胞表达系统
外源基因 真核或病毒启动子 MCS PolyA信号 终止子 酵母菌、植物原生质体、动物培养细胞等。
外源基因在真核细胞中 的表达方式 依表达时间长短 表达方式 瞬时表达(Transient expression):外源基因不整合到宿主染色体中, 在细胞中的表达时间较短(2-3天),转染的方法相对简单,耗时较少,适用快速分析. 稳定表达(Stable expression):外源基因整合到宿主染色体,需要筛选,可获得稳定表达的细胞株,可复制,并可以稳定传代,耗时长,不宜成功. 表达方式 分泌表达、非分泌表达 融合表达、非融合表达
三、真核表达载体 真核表达载体的功能元件 原核DNA序列 启动子 增强子 剪接信号 终止信号和加poly(A)信号 筛选标记 新霉素抗性基因 neor 胸苷激酶基因tk
真核表达载体的种类 质粒型载体 病毒型载体 pcDNA系列 Invitrogen公司产品 pCMV-HA Clontech公司产品 逆转录病毒载体 腺病毒载体 昆虫杆状病毒载体
pcDNA3.1:由Invitrogen公司提供的目前应用最多的真核质粒表达载体之一: 有高效表达的CMV(巨细胞病毒,Cytomegalovirus)启动子:是启动真核基因表达的最有力的启动子; 有牛生长激素(bovine growth hormone,BGH)多腺苷酸化信号;
pFastBac:昆虫杆状病毒表达系统的载体,由Invitrogen公司开发:
表位标签 tag 方便蛋白的鉴定和纯化 GST FLAG(DYKDDDDK),由8个氨基酸残基组成的多肽,具有亲水性,可置于蛋白的氨基或羧基末端,专门设计用于融合蛋白质的免疫吸附纯化 HA (influenza hemagglutinin epitope-YPYDVPDYA),流感血凝素抗原决定簇 His
四、宿主细胞 哺乳动物细胞 癌细胞 易于传代培养 生长速度快而均一 转入外源基因后稳定性好 酵母 昆虫细胞
常用的哺乳动物细胞种类 鼠源性:NIH3T3 (小鼠胚胎成纤维细胞系 ), CHO(中国仓鼠卵巢细胞) 人源性:293(人肾上皮细胞系),HeLa(源自一位美国妇女 Henrietta Lacks 的子宫颈癌细胞的细胞系) ATCC(American Type Culture Collection )-1925年建立﹐是世界上最大的﹑保存微生物种类和数量最多的机构﹐保存病毒﹑衣原体﹑细菌﹑放线菌﹑酵母菌﹑真菌﹑藻类﹑原生动物等约 29000株 中国典型物种保藏中心(武大)
五、重组子导入宿主细胞的方法 磷酸钙介导的转染 阳离子脂质体介导的转染 DEAE-葡聚糖介导的转染 电穿孔转染 病毒转染 Gene Gun Lipofectamine invitrogen 公司产品 DEAE-葡聚糖介导的转染 电穿孔转染 病毒转染 Gene Gun
磷酸钙沉淀法 将外源DNA与CaCl2混合制成CaCl2-DNA溶液,逐滴加入到不断搅拌的HEPES-磷酸钙溶液中,形成DNA-磷酸钙共沉淀复合物。 然后用吸管将沉淀复合物加到培养的哺乳动物单层细胞表面,细胞可通过内吞作用将复合物吸收到细胞内。 转化率在10%左右。
脂质体介导的转染 脂质体(liposome)是由人工构建的磷脂双分子层组成的小球,DNA包裹在脂质体中,通过融合或吞噬作用被细胞吸收。
基因导入方法: 电穿孔法 (Gene transfer by electroporation)
外源基因在昆虫细胞中的表达 载体 质粒载体 杆状病毒表达载体 常用的昆虫细胞株 Sf9, Sf21, S2, Ea4
昆虫杆状病毒(Bac-to-Bac)表达系统 主要包括: 1)pFastBac受体质粒。目的基因可克隆到该质粒表达盒中,表达盒受到杆状病毒启动子的调控。 2)大肠杆菌DH10Bac。内含杆状病毒穿梭载体(Bacmid)和辅助质粒,在辅助质粒的帮助下,可以将pFastBac受体质粒中的重组表达盒转座到Bacmid中。 3)昆虫细胞。
Bac-to-Bac® Baculovirus Expression System
七、基因表达的检测 1.转录水平检测:RT-PCR,Real-time PCR,northern blot,基因芯片等。 2.翻译水平检测:western blotting, ELASA,免疫组化,原位杂交,免疫沉淀,免疫荧光抗体等。 3.直接检测,如报告基因、融合荧光蛋白等。
RT-PCR, Real-time PCR RT-PCR:通过电泳,EB(或EB替代品)显色,成像,再通过灰度分析软件进行分析,得出结果,一般用于相对定量分析。 Real-time PCR:通过实时检测PCR体系中的荧光基团,从而达到实时报告扩增结果,进行定量或相对定量分析。
RT-PCR,Real-time PCR原理示意图 首先提取总RNA或mRNA,反转录成cDNA,即互补DNA序列,再通过RT-PCR,real-time PCR 方法对cDNA进行定量分析。
电泳及图像采集与分析 RNA表达量的数据分析 RNA电泳 数据分析 数据分析
Western Blotting
主要基因工程表达体系比较 表达体系 产 物 产生部位 培养方式 提 纯 产物活性 潜在危性 表达体系 产 物 产生部位 培养方式 提 纯 产物活性 潜在危性 大肠杆菌 多肽蛋白质 菌体内 容易 一般 对原核好 不大 融合蛋白质 部分高产 对真核差 酵 母 多肽蛋白质 菌体内 容易 菌体内 真核的接近 不大 糖基化蛋白 外分泌 可高产 稍复杂 天然产物 哺乳动物 完 整 外分泌 较难,成本高 简单 可达天然 需注意 糖基化蛋白 可高产 产物 致癌
基因工程技术的应用 生产蛋白质和多肽类活性物质 制备基因工程疫苗 改造物种特性 疾病的基因诊断和基因治疗
重组DNA医药产品 产 品 功 能 组织胞浆素原激活剂 抗凝 血液因子VIII 促进凝血 颗粒细胞-巨噬细胞集落剌激因子 剌激白细胞生成 产 品 功 能 组织胞浆素原激活剂 抗凝 血液因子VIII 促进凝血 颗粒细胞-巨噬细胞集落剌激因子 剌激白细胞生成 促红细胞生成素 生长因子(bFGF, EGF) 刺激细胞生长与分化 生长素 治疗侏儒症 胰岛素 治疗糖尿病 干扰素( 1b, 2a, 2b, ) 抗病毒感染及某些肿瘤 白细胞介素 激活、剌激各类白细胞 超氧化物歧化酶 抗组织损伤 单克隆抗体 利用其结合特异性进行诊断试验、肿瘤导向治疗 乙肝疫苗(CHO, 酵母) 预防乙肝 口服重组B亚单位菌体霍乱菌苗 预防霍乱 81
思考题 名词解释 问答题 包涵体 融合型表达 瞬时表达,稳定表达 表达载体与克隆载体的区别? 如何利用大肠杆菌表达系统生产重组人胰岛素? 真核表达系统的优势?