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第四时期: 基因组和蛋白质组时期 1986 [美] Dulbecco首次提出了“ 人类基因组 工程”
(1986 ~ 至今) 1986 [美] Dulbecco首次提出了“ 人类基因组 工程” 月美国宣布人类基因组测序工作的5 年计划。 Stepken Fodor 把基因芯片的设想第一 次变成了现实. 月[美]Vollrath D.等分别完成人类Y染 色体染色体的物理图谱.
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月 美国公布了1993-1995年的人类基 因组测序工作计划,并预计2005年完成 整个的测序工作。 Smith,H.O等第一个细菌基因组—流感嗜 血杆菌(H.influenzae)全基因组序列发表。 月美、法科学家公布了有15000个标记 的人类基因组的物理图谱。 1996 Dietrich W.F等绘制了小鼠基因组的完整 遗传图谱。 月Goffeau等完成了酵母基因组的测序 1996 DNA芯片进入商业化
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1997 Wilmut 完成了体细胞克隆 月,第一个多细胞真核生物线虫的 基因组在Science上发表。 1999 Cate J.H第一次绘制出完整核糖体的 晶体结构,揭示了其中的很多细节。 1999 国际人类基因组计划联合研究小组完成 了人类 第22号染色体测序工作。 2000 3月塞莱拉公司宣布完成了果蝇的基因 组测序。
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2000 完成了人类第21号染色体的测序 ,26 人类基因组草图发表 ,14 英美等国科学家宣布绘出拟南 芥基因组的完整图谱 ,12 中、美、日、德、法、英等国科 学家 (Nature,15日) 和美国塞莱拉公司 (Science,16日) 各自公布人类基因组图 谱和初步分析结果。约3万基因。
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遗传学发展的新动态 1.基因组(genome)学 2.后基因组学 3.蛋白质组学(Proteomics) 4.生物信息学(Bioinformatic) 定义为分子生物学和计算生物学的交叉. 包含三个重要的内容: (1) 基因组信息学; (2)蛋白质的结构模拟; (3)药物设计.
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第二节 遗传学在国民经济中的作用 遗传学与工业的关系 遗传学在能源的开发和环境保护中的应 用 遗传学在医疗卫生工作中的应用
遗传学与农牧业的关系 遗传学与工业的关系 遗传学在能源的开发和环境保护中的应 用 遗传学在医疗卫生工作中的应用 遗传学在其他领域中的应用
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第一部分 遗传信息的传递规律和物质基础 第一章 孟德尔定律
第一部分 遗传信息的传递规律和物质基础 第一章 孟德尔定律 第一节 孟德尔实验 孟德尔的功绩: 采用32个品种 观察了7对性状, 经8年研究, 发现了2个定律:独立分配和自由组合 定律,创立了“ 遗传学 ”
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表 1-1 孟德尔的豌豆杂交实验7对性状的结果 2.84:1 277矮 787高 高植株 高植株×矮植株 3.14:1 207顶生
表 1-1 孟德尔的豌豆杂交实验7对性状的结果 2.84:1 277矮 787高 高植株 高植株×矮植株 3.14:1 207顶生 651腋生 腋生 花腋生×花顶生 2.82:1 152黄 428绿 绿色 绿色×黄色豆荚 2.95:1 299瘪 882鼓 鼓胀 膨大×缢缩豆荚 3.15:1 224白 705紫 紫花 紫花×白花 3.01:1 2001绿 6022黄 黄色 黄叶×绿色子叶 2.96:1 1850皱 5474圆 圆形 圆形×皱缩子叶 F2比例 F2 F1 豌豆表型
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二、孟德尔植物杂交实验 (一)设计严密,层次分明 1.亲本(parental generation )杂交
(1) 选材 (2) 选择研究的性状 (3) 采用正反交(reciprocal cross) (4) 设立对照实验
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2. 杂种1代的观察: (filial generation 1,F1 ) 确定了:显性(dominate)性状
隐性 (recessive) 性状 3. F2 代的观察 进行统计处理; 采用大样本; 将矮株进行移植; 通过自交来研究其遗传结构。
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4. F3代的研究 经观察统计: AA (1〕 表型为显性(A) Aa (2〕
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(二)科学推论: (1)遗传因子成对存在,形成生殖细胞 时彼此分离; (2)以A代表显性性状,a代表隐性性状 ,Aa表示杂合类型,那么在F2代中 后代的构成可用公式: 1A+2Aa+1a 表明了各种类型的基因型以及比例。
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(三)精确验证 创用测交方法对推论加以验证 测交(test cross): 是指将杂种后代和隐性亲本进行杂交, 回交(back cross): 是指杂种后代和任一亲本杂交。
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第二节 孟德尔定律(Mendel’s laws)
对一对性状的观察得出了三条规律 (1)F1代的性状一致,通常和一个亲 本相同。得以表现的性状为显性, 未能表现的性状称隐性,此称F1一 致性法则。 (2)在杂种F2代中,初始亲代的二种 性状(显性和隐性)都能得到表达; (3)这两性状的比例总为 3:1。
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表1-2 六位学者重复孟德尔植物杂交实验的结果
3.01:1 44892 134737 黄色×绿色子叶 总数 36186 109090 Darbishire 2.80:1 514 1438 Lock 3.05:1 3903 11903 Bateson 2.94:1 445 1310 Hurst 1190 3580 Tschermak 3.08:1 453 1394 Correns 2001 6022 孟德尔 绿 黄 F2比例 F2 亲 代 实 验 者
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一 分离律(Law of segregation)
1.分离律的实质 控制性状的一对等位基因在产生配子时 彼此分离,并独立地分配到不同的性细 胞中。 2.分离律的意义 (1)具有普遍性 遗传病约有4344种(1988年) 侏儒(先天性软骨发育不全) 显性 裂手裂足 舞蹈病(Huntington)
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白化 半乳糖血症 隐性 苯丙酮尿症 全色盲 早老症 自毁容貌综合征 (2)杂合体是不能留作种子
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人类家谱分析中常用的符号 男 男女患者 女 男女携带者 不知性别 ⊙ 性连锁携带者 婚配 流产儿或死胎 近亲婚配 已故家庭成员
男 男女患者 女 男女携带者 不知性别 ⊙ 性连锁携带者 婚配 流产儿或死胎 近亲婚配 已故家庭成员 生育子女 先证者 同卵双生 I 人类家谱谱系 II 异卵双生
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二 自由组合定律 (law of independent assortment)
1.自由组合律的内容: 即在配子形成时各对等位基因彼此 分离后,独立自由地组合到配子中 2.自由组合律的实质: 配子形成时非同源染色体自由组合
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2.自由组合的解释
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3.测交验证
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4.多对基因的杂交
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(五) 孟德尔自由组合定律的意义 (1)自由组合定律广泛存在,如蜜蜂 的腐臭 病(foul brood);
(2) 使生物群体中存在着多样性, 使得生物 得以生存和进化 ; (3)可应用于育种。
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第三节统计学原理在遗传学中的应用 一.概率的概念 概率(probability) nA 概率的公式为:P(A)=lim n→∞ n
P(A):A事件发生的概率。 n :群体中的个体数或测验次数。 nA:A事件在群体中出现的次数。
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二 概率规则 1. 相乘定律: 独立事件: (independent events) P(A·B) = P(A) × P(B) 2.相加定律
1. 相乘定律: 独立事件: (independent events) P(A·B) = P(A) × P(B) 2.相加定律 互斥事件(matually exclusive events) P(A或B) = P(A) + P(B) 3. 组合事件(combining probability rule) P=1/2×1/2+1/2×1/2=1/2
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4. 条件概率 (conditional probability)
若事件B与早先出现过的事件A有列联关系,则在A条件下B的概率称为条件概率. 记为: p(B/A) =p(AB)/p(A)
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表1-4 事件A、A’、B 和 B’频数表 Aa×Aa
P(A’)=1/4 P(A)=3/4 合计 P(B’)=1/2 P(A’B’)=1/4 P(AB’)=1/4 纯合(B’) P(A)=1/2 P(AB)= 0 P(AB)=1/2 杂合(B) 白化(A’) 正常(A)
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求:表型正常的孩子中杂合体的概率? P(B|A)=P(AB)/P(A) P(A)=3/4; P(B)=1/2; P(AB)=1/2 P(A|B)=P(AB)/P(A)=(1/2)/(3/4)= 2/3 反之如要求杂合体中表型正常的概率为: P(A|B)=P(AB)/P(B) =(1/2)/(1/2)= 1
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三. 概率的计算和应用 棋盘法(Punnett square)
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1. 分枝法(branching process)
AAbbCc ×aaBbCc AA×aa bb×Bb Cc×Cc × CC= 1AaBbCC 1Bb × Cc= 2AaBbCc × × cc= 1AaBbcc Aa × × 1CC= 1AabbCC 1bb × Cc= 2AabbCc × cc= 1Aabbcc
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3.利用概率来计算 AA Bb cc DD Ee×Aa Bb CC dd Ee
P AA×Aa Bb×Bb cc×CC DD×dd Ee×Ee ↓ ↓ ↓ ↓ ↓ 要求的基因型 AA BB Cc Dd ee ↓ ↓ ↓ ↓ ↓ 概率 P = 1/2 × 1/4 × × × 1/4 = 1/32 要求的表型 A B C D e ↓ ↓ ↓ ↓ ↓ 概率 P = × 3/4 × × × 1/4 = 3/16
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四 .二项分布和二项展开法 1. 对称分布: 第一个 第二个 概率 分布 孩子 孩子 男 男 1/2×1/2=1/4 P(pp)=1/4
1. 对称分布: 第一个 第二个 概率 分布 孩子 孩子 男 男 1/2×1/2=1/ P(pp)=1/4 男 女 1/2×1/2=1/ P(pq) = 1/2 女 男 1/2×1/2=1/4 女 女 1/2×1/2=1/ P(qq)=1/4 (p+q)2 = p2 + 2pq + q2 = 1/4 +1/2 +1/4, 分布是对称的。
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1. 不对称分布 第一个 第二个 概率 分布 孩子 孩子 正常 正常 /4×3/4=9/ P(pp)=9/16 正常 患儿 /4×1/4=3/ P(pq)=6/16 患儿 正常 /4×1/4=3/16 患儿 患儿 /4×1/4=1/ P(qq)=1/16
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正常 白化 [n!/x! (n-x)!] pxqn-x P 4 0 1×(3/4)4(1/4)0 81/256
3.计算单项概率 二项分布概率密度函数公式: 组合公式 Cmn =m!/n!(m-n)! [n!/x! (n-x)!] pxqn-x 正常 白化 [n!/x! (n-x)!] pxqn-x P ×(3/4)4(1/4) /256 ×(3/4)3(1/4) /256 ×(3/4)2(1/4) /256 ×(3/4)1(1/4) /256 ×(3/4)0(1/4) /256
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图1-11 杨辉三角 1 代数 1 1 ………………………1 1 2 1 …………………2 1 3 3 1 …………………3
图1-11 杨辉三角 代数 ………………………1 …………………2 …………………3 ………………4 ………………5 ……………6
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五.好适度的测验(goodness of fit)
(一) 实际数和理论数的符合程度 “点估计 ” 存在一些缺点: (1)单项的概率很小 (2)样本越大,单项概率越小 “ 段估计 ” 计算实得比数的概率和比实得比数偏 差更大的比数概率的总和
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紫花(Aa) ×白花(aa) 紫花(Aa) 白花(aa) : 实验结果: 14株 株 问实得比数是否符合理论比? (20!/14!6!) ×(1/2)14 ×(1/2)6 = 0.037
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点估计:P = 0.037 段估计:P= 0.116 P> 0.05 符合1:1
后代个体数 符合1:1 的概率 [ (1/2)+(1/2)]20 组合 20:0 19:1 18:2 17:3 16:4 15: :6 13:7 12:8 11:9 10:10 概率 组合 9:11 8: :13 6;14 5: : :17 2:18 1: :20 合计 概率 点估计:P = 0.037 段估计:P= P> 0.05
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1.统计的标准: P>0.05 结果与理论数无显著差异,实 得值符合理论值。 P<0.05 结果与理论数有显著差异,实 得值不符合理论值。 P<0.01 结果与理论数有极显著差异, 实得值非常不符合理论值。
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2. χ2(Chi square method)测验
χ2=Σ(d2/e) e : 为预期值 d:预期值和观察值之差 (1) χ2测验应用于大样本 (2) 预期数不得小于5 (3) 所取数值不用百分比表示。
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查卡方表(表1-7): 自由度 N=2 – 1=1 当 X2=10 P< 有极显著差异,结果不符合理论比。 当X2= 0.05< P < 0.30 无显著差异, 结果符合理论比。
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