PubMed資料庫 時間：2011年10月7日(13:30-16:30) 主講：醫教部淡水圖書組劉淑容 分機：(淡)2509.

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1 PubMed資料庫 時間：2011年10月7日(13:30-16:30) 主講：醫教部淡水圖書組劉淑容 分機：(淡)2509

2 PubMed的課程 PubMed簡介 PubMed檢索技巧 篩選實證醫學資料方法 MyNCBI個人化設定

3 PubMed的課程 PubMed簡介 PubMed檢索技巧 篩選實證醫學資料方法 MyNCBI個人化設定

4 PubMed 簡介1 PubMed National Institutes of Health (NIH)
National Library of Medicine (NLM) 美國國家醫學圖書館 National Center for Biotechnology Information (NCBI) Entrez retrieval system(資訊檢索系統)

5 PubMed 簡介2 2.OLDMEDLINE (1950~1960沒有摘要)
其學科領域含括:生物醫學,基礎醫學,臨床醫學, 護理,獸醫學,牙醫學,健康照護系統,保健醫學 medicine, nursing, dentistry, veterinary medicine, health care system, and the preclinical sciences 2.OLDMEDLINE (1950~1960沒有摘要) 3.In Process Citations （尚未用標題分類的最新文獻) 4.Publisher Supplied Citations （e+未分類+可能未出版）

6 PubMed 簡介3 收錄有5200多種生命醫學期刊 全球性資料庫，除美國外另收有80多國期刊
自1948年至今已有2000多萬筆資料,且每日 更新加入最新資料 可直接聯結電子全文,並可利用內建機制找 到相關性資料 全球免費檢索 MeSH詞彙控制

7 資料庫檢索機制 自由詞彙 free text 代表作:UpToDate、Google
資料庫自動比對使用者輸入之關鍵字，字與篇名、刊名、摘要…吻合之所有文獻就會被檢索出。 ◎優點：檢索方法容易、適用新名詞或較地區性的用詞。 ◎缺點：未經嚴謹分析、語意容意模糊(ex.字與字分開出現) 、要盡可能列舉同義詞及狹義 stroke≠CVA ≠cerebrovascular accident 控制詞彙controlled vocabulary 代表作:PubMed之MeSH 索引專家預先為每篇文章分析歸類，當user輸入之關鍵字意義與該類別相同時，該批文獻就會被檢索出。 ◎優點：解決同義字問題、可彈性檢索廣/狹意詞、使用得宜可提高精確率及回收率。 ◎缺點：user需學習使用、不適用新概念及local用詞、部份用語容易受限不彈性。 diabetes mellitus type2＝NIDDM＝diabetes mellitus type II ≠type2 DM

8 MeSH—Medical Subject Heading 控制辭彙;樹狀結構;有標準;會更新的分類表
controlled vocabulary(控制詞彙) used for indexing articles for PubMed Medline. MeSH terminology provides a consistent way to retrieve information that may use different terminology for the same concepts. Ex. HIVD Anesthesia V.S Anaesthesia 若您的關鍵字都不在MeSH中 PubMed會以自由詞彙檢索

9  善用MeSH term做為關鍵字 用錯檢索詞 “差”很大喔!! 多個MeSH term + HIVD 全寫且為MeSH term

10 如何進入PubMed 因為PubMed為全世界免費檢索之資料庫 所以 利用google、yahoo…都可以找到該網站 但是

11 如何進入PubMed 好康1.標示出該篇文獻,馬偕有無電子全文可用. 好康2.標示出該次檢索結果,馬偕總共可用之電子全文篇數.

12 PubMed首頁介紹 個人化服務 NCBI有30多種資料庫 進階檢索； history MeSH詞彙檢索 找特定已知資料之文獻
馬偕紀念醫院 淡水圖書館 2010/6/25 PubMed首頁介紹 個人化服務 NCBI有30多種資料庫 進階檢索； history MeSH詞彙檢索 找特定已知資料之文獻 實證醫學資料檢索

13 PubMed的課程 PubMed簡介 PubMed檢索 篩選實證醫學資料方法 MyNCBI個人化設定

14 末期病人利用音樂治療 使疼痛緩解改善生活品質
實做範例PICO 末期病人利用音樂治療 使疼痛緩解改善生活品質

15 由問題建立搜尋模式 疾病末期病人 音樂治療 與不使用音樂治療 緩解疼痛改善生活品質 P I C O 1 2 4 3 找出關鍵字
Patient/Problem 疾病末期病人 I Intervention 音樂治療 C comparison 與不使用音樂治療 O Outcome 緩解疼痛改善生活品質 1 2 4 3 找出關鍵字 依重要性標示順序

16 PICO檢索示範 –關鍵字 (初級班) end of life music therapy
Patient/Problem end of life I Intervention music therapy C comparison O Outcome pain relief OR quality of life

17 初級檢索技巧 如果只想快速找到一篇文章看看… 直接利用AND整合查詢 P AND I AND O
end of life AND music therapy AND (pain relief OR life quality) 或 #1 end of life #2 music therapy #3 pain relief #4 life quality #5 #3 OR #4 #6 #1 AND #2 AND #5 逐字檢索 可瞭解個別結果 再靈活整合

18  PICO分別檢索可靈活運用，並得知關鍵字需修正否 O ？ I P PIO分別檢索，可靈活整合 PIO分別檢索後再用AND交集

19 PICO檢索示範 –關鍵字 (中級班) P Patient/Problem end of life OR hospice care OR palliative care OR terminally ill I Intervention music therapy OR music OR melody OR sing OR song C comparison non-music therapy OR placebos OR O Outcome pain relief OR analgesia OR life quality OR functional well-being 關鍵字及同義詞的擬定，可參考上層EBM資料庫、Textbook、藥學資料庫或PubMed的MeSH表(醫學詞彙表) 底線字表示為 MeSH Term

20 life quality functional well-being
中級檢索技巧 如果想找到比較完整的文獻 PICO分別逐次檢索 一次檢索一群同義詞（用 OR 聯集） 再將所有群組結合（用 AND 交集） AND AND AND end of life palliative care hospice care terminal ill end stage of… P：end of life music therapy music sing song Melody alternative therapy I：music therapy Un-music therapy C： pain relief analgesia life quality functional well-being O：pain relief

21 熟練布林邏輯：同義詞用OR聯集.PICO間用AND交集
 PI PIO O I P 同義詞及相關詞彙越完整 資料獲得率就提升

22 PubMed的課程 PubMed簡介 PubMed檢索技巧 篩選實證醫學資料方法 MyNCBI個人化設定

23 篩選實證醫學資料（進階班） 方法一：Clinical Queries檢索介面 PubMed根據Haynes RB理論，為實證醫學專設的搜尋介面，內建系統會將檢索條件自動設限在較具實證研究的文獻中。 方法二：limit 利用limit中的”Type of Article”將檢索條件限制在clinical trial、Randomized Controlled Trial 、meta-analysis或review中。 方法三：限定實證醫學期刊或資料庫 在Advance Search介面中執行，可限定有被收錄在 Cochrane Database of Systematic Reviews或Evidence Based Nursing期刊中的文獻。

24 PubMed根據Haynes RB理論，為實證醫學專設的搜尋介面，內建系統會將檢索條件自動設限在較具實證研究的文獻中。
篩選實證醫學資料（進階班） 方法一：Clinical Queries檢索介面 最好有前面的中級檢索結果，例如 #38 下 拉 PubMed根據Haynes RB理論，為實證醫學專設的搜尋介面，內建系統會將檢索條件自動設限在較具實證研究的文獻中。

25 方法一：Clinical Queries檢索介面
#38 與PICO問題面向有關 ※etiology:探討病因 ※diagnosis:診斷問題 ※therapy:治療或處置 ※prognosis:預後 與質量有關 Narrow:精準篇數少 Broad:敏感篇數多

26 方法一：Clinical Queries檢索介面
#38 AND #38 AND

27 My NCBI 個人化設定 PubMed的 檢索details

28 方法一：Clinical Queries檢索介面

29 方法一：Clinical Queries檢索介面 (2011/5/11)
馬偕圖書館員至PubMed註冊的 電子全文標示 PubMed用該筆文獻到2000萬筆資料比對相關文獻  ◎用一篇文獻的MeSH Term 回推正確的檢索詞 ◎用一篇文獻的Publication type 判斷文獻類型 ◎用一篇文獻的Related articals滾雪球

30 篩選實證醫學資料（進階班） 方法二：limit 利用limit中的”Type of Article” 可用前面的中級檢索結果，例如 #39
也可直接下關鍵字後再選 Limits 可用前面的中級檢索結果，例如 #39

31   方法二：limit 利用limit中的”Type of Article” 使用Limit檢索可抓取到 證據等級較優，設計較好的文獻
  使用Limit檢索後就無法抓取到 尚未被分類整理的最新文獻    

32 篩選實證醫學資料（進階班） 方法三：限定實證醫學期刊或資料庫 AND "Cochrane database of #38
systematic reviews #38

33 Clinical Queries/Broad Clinical Queries/Narrow
方法三：限定實證醫學期刊或資料庫 限定期刊檢索 Clinical Queries/Broad Clinical Queries/Narrow Limit  欄位檢索亦可用於檢索特定作者、機構…所發表文獻

34 特定欄位檢索—手動 作者背景 Affiliation[AD] 作者姓名 Author [AU] 期刊名Journal [TA] MeSH Major Topic [MAJR] PMID [PMID] Publication Type [PT]任何關鍵字Text Words [TW] 篇名任一字Title [TI] Title/Abstract [TIAB] Mackay memorial hospital[AD] Lin C C[AU] nursing outlook[TA] pain[MAJR] [PMID] 文獻類形[PT] nursing care[TW] chemotherapy[TI] 篇名或摘要任一字[TIAB]

35 Display、Save、Email 及其應用

36 Display My NCBI 個人化設定 檢索得篇數 篇名 作者 刊名 年月 卷(期):頁數 PubMed的 檢索details

37 檢視摘要 (2010/9)

38 PubMed用該筆文獻到2000萬筆資料比對相關文獻
檢視摘要 (2011/5/11) 馬偕圖書館員至PubMed註冊的 電子全文標示 PubMed用該筆文獻到2000萬筆資料比對相關文獻  文獻類型 ◎用一篇文獻的MeSH Term 回推正確的檢索詞 ◎用一篇文獻的Publication type 判斷文獻類型 ◎用一篇文獻的Related articals滾雪球

39 Save – clipboard(剪貼簿)    

40 Save – clipboard(剪貼簿) Clipboard可在該電腦存8hr，最多可存500筆

41    

42

43 Single Citation Matcher
特定單篇文獻 Single Citation Matcher

44 主任給的作業中有一篇文章為 PMID: 18321903 作者：Luks AM, Swenson ER.
篇名：Medication and dosage considerations in the prophylaxis and treatment of high-altitude illness. 刊名：Chest 年代：2008 Mar1 卷期：133(3) 頁數：744-55 PMID: 只要有其中任一或 二條件 就可找到該篇文章

45

46 chest 133 744

47 刊名、年月、卷(期) 、頁數 作者 MeSH詞彙 可作為修正 檢索關鍵字參考

48 Skills of Searching 搜尋現有的最佳實證之檢索技巧 複習

49 PubMed檢索技巧—基礎 確立問題，建立PICO模式，找出關鍵字 找出同義詞或相關詞 ◎利用MeSH資料庫檢索MeSH term
◎display時展開MeSH term回推關鍵字 ◎利用detail檢視策略及關鍵字 布林邏輯運算概念要清楚熟練 同義詞用OR聯集.PICO間用AND交集 善用history介面靈活組合檢索策略 適時修改檢索策略，不厭其煩多次檢索

50 PubMed檢索技巧– 篩選實證文獻 Clinical Queries 先選擇面向，再選擇質量 Limit 限定特殊文獻類型
不論用初級檢索或中級檢索都可再利用方法篩選實證文獻 Clinical Queries 先選擇面向，再選擇質量 Limit 限定特殊文獻類型 Advance Search 指定實證期刊或資料庫 MyNCBI個人化設定

51 PubMed的課程 PubMed簡介 PubMed檢索 篩選實證醫學資料方法 MyNCBI個人化設定

52 MY NCBI個人化設定 可將檢索結果自動分群 Highlight 關鍵字 儲存檢索結果 儲存檢索策略 自動 有興趣的最新文獻

53 MY NCBI帳號 註冊 可申請新帳號 或利用Gmail帳號

54 MY NCBI帳號 註冊 ◎請務必用筆記下帳密 Username 3個以上英數字 Password 6個以上英數字
Security Question及Answ 忘記帳密時要用的通關密語 請提供常用的，最好以HTML檢視信件。 ◎請務必用筆記下帳密 sjliutest mmh123 mmh123 pooh F6B6A

55 MY NCBI帳號 註冊

56 MyNCBI設定 Popular： LinkOut： Properties： 常用分群 馬偕圖書館或其他圖書館
limit、clinical queries中之細項皆可獨立分群 ex.年齡、出版年、 RCT、reviews…

57 MyNCBI設定--Popular   

58 MyNCBI設定--LinkOut Mackay memorial  

59 MyNCBI設定--Properties
 

60 MyNCBI設定--建立客製化篩選條件 馬偕 + 免費全文 "loattrfree full text“ [Filter] OR
“loprovitwmmhlib” [Filter] 例1:篩選馬偕+免費電子全文 “loattrfree full text"[Filter] OR “loprovitwmmhlib”[Filter] 例2:篩選出英文與中文 “english”[LA] OR “chinese”[LA] 例3:篩選出特定期刊 “lancet” [TA] OR “JAMA”[TA] 需用特定語法

61 MyNCBI設定—個資及底色 NCBI Site Preferences 個人資料修改 關鍵字底色

62 MyNCBI設定—preference底色

63 MyNCBI設定—preference display
設定 display abstract時 自動展開 Publication type 及MeSH terms

64 MyNCBI設定—preference display

65 登入個人My NCBI 設定結果 底色 分群

66 從馬偕圖書館網頁聯結 且未登入My NCBI

67 MyNCBI運用 可將檢索結果自動分群 Highlight 關鍵字 儲存檢索結果 儲存檢索策略 自動以 傳送有興趣的最新文獻

68 MyNCBI運用—儲存於雲端

69 MyNCBI運用—儲存於雲端 可修改檔名 Music therapy

70 MyNCBI運用—儲存檢索策略並寄送新知
需在Advanced Search 介面中執行 於檢索號碼上按左鍵

71 MyNCBI運用—儲存檢索策略並寄送新知
Music 可修改檔名 Report Format： 建議選擇abstract Send at most： 依個人習慣設定 建議以HTML模式看信

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73 Any question？