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翻译(translation):mRNA分子中的遗传信息转变为蛋白质的氨基酸排列顺序
基因表达(Gene expression):转录与翻译 中心法则 转录 翻译 DNA RNA 蛋白质 反转录 复制 复制
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第一节 蛋白质的生物合成体系 原料:20种氨基酸 模板:mRNA 场所:核蛋白体 氨基酸的“搬运工具”:tRNA
酶与蛋白质因子:启动、延长、终止因子 能量:ATP、GTP 无机离子 一、模板——mRNA 1、遗传密码(genetic code)
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密码子(codon):mRNA从5ˊ端→3ˊ端,每3个核苷酸组成一组,代表相应的氨基酸或翻译起始、终止信号,统称为遗传密码。其中的单个密码字,称为密码子
2、遗传密码的特点 通用性:部分线粒体、叶绿体密码子除外 方向性:5ˊ端→3ˊ端 连续性:mRNA链上碱基的插入或缺失可导致移码 不重叠性 起始密码:5ˊ端第一个AUG表示起动信号,并代表甲酰蛋氨酸(细菌)或蛋氨酸(高等动物)
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终止密码:UAA、UAG或UGA(不编码氨基酸)
简并性(degenerate):一个以上密码子体现一个氨基酸遗传信息(Trp和Met除外,仅有1个密码子 )。其原因是由于密码子与反密码子之间存在不稳定配对(摆动性或摇摆性)。 摇摆性(wobble): mRNA密码子的第三个核苷酸(3ˊ端) 与tRNA反密码子第一个核苷酸(5ˊ端)配对时,有时不遵守严格的碱基配对原则,除A-U、G-C外,还可有其它配对方式。 I是最常见的摆动现象
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二、氨基酸的搬运工具——tRNA 一种tRNA可携带一种氨基酸;而一种氨基酸可由数种tRNA携带 1、tRNA的功能区 氨基酸臂……与氨基酸结合 DHU环………与氨酰-tRNA合成酶结合 反密码环……识别密码子 TψC环…….与核蛋白体结合 2、反密码子(anticodon) tRNA反密码环中间的3个核苷酸,可与mRNA密码子配对 反密码子的第一位核苷酸(5ˊ端)常为I
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受位(A位):位于大、小亚基结合处,结合AA-tRNA
三、多肽链的"装配机"——核蛋白体 1、组成:蛋白质+rRNA 真核核蛋白体(40S+60S=80S) 原核核蛋白体(30S+50S=70S) 2、功能区 受位(A位):位于大、小亚基结合处,结合AA-tRNA 给位(P位):主要位于大亚基,结合肽酰-tRNA和起始Met-tRNA 转肽酶、GTP酶:位于大亚基 3、多核蛋白体:1个mRNA和多个核蛋白体的聚合物,体现了蛋白质合成的高速、高效性
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第二节 蛋白质生物合成过程 氨基酸活化、起始复合物生成、肽链延长、终止 一、氨基酸的活化与转运
(1) 氨基酰tRNA合成酶:高度特异识别氨基酸、tRNA ;校对活性 (2)能量:1个ATP(2个高能键) 二、核蛋白体循环(ribosomal cycle): 起始、延长、 终止 1、起始复合物的生成 (1)起始因子 3种IF(原核):IF1、IF2、IF3 多种eIF(真核):eIF2是合成调控的关键物质
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(2) 能量:GTP(真核体系还需ATP) (3) 起始AA-tRNA fMet-tRNAfmet (原核) Met-tRNAmet (真核) (4) 起始复合物组成:大、小亚基、mRNA、起始因子、起始AA-tRNA (5)起始复合物形成过程:核蛋白体的拆离、mRNA就位、起始tRNA结合、大亚基结合 小亚基先与mRNA结合(原核) 小亚基先与起始AA-tRNA结合(真核)
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进位:EFTu、Ts或T1、GTP;进入A位 成肽:转肽酶;P位酰基与A位氨基反应
2、肽链延长 (1)延长因子EFT:真核为EFT1与T2,原核为EFTu、Ts与EFG (2)能量:GTP (3)过程 进位:EFTu、Ts或T1、GTP;进入A位 成肽:转肽酶;P位酰基与A位氨基反应 转位、脱落、移位:EFG(转位酶)或T2、GTP ;由A位移至P位,A位留空 方向:N端→C端(肽链);5′端→3′端(mRNA) 3、终止 (1)释放因子RF:3种(原核)或1种(真核)
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第三节 蛋白质合成的调节 (2)能量:GTP (3)转肽酶活性转变:转肽酶→酯酶(水解酶 ) 二、真核与原核蛋白合成的不同点
1、转录与翻译不偶联 2、合成体系复杂 3、合成起始AA-tRNA不同 4、通常需进行翻译后加工 5、合成的调控更为复杂 第三节 蛋白质合成的调节 一、蛋白质合成抑制剂:抗生素、干扰素、毒素
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1、抗生素 氯霉素 原核生物 50S大亚基 抑制转肽酶 四环素(金霉素等) 30S小亚基 阻碍氨基酰tRNA与小亚基结合 红霉素
抑制转肽酶,防碍移位 链霉素、新霉素(卡那霉素) 抑制起动,造成误译 抗生素 抑制对象 作用环节 作用原理 放线菌酮 真核生物 60S大亚基 嘌呤霉素(AA-tRNA类似物) 原、真核生物 竞争结合A位 促使肽链提前终止
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2、干扰素(interferon,IF):抗病毒
<IFα—白细胞, IFβ—成纤维细胞, IFγ—淋巴细胞> 降解模板RNA:干扰素与双链RNA(病毒)共同活化2’,5’-A合成酶,促使多聚2’,5’-A生成;2’,5’-A活化核酸内切酶,使mRNA降解 磷酸化起始因子eIF2,抑制蛋白合成的起始 3、毒素:抑制真核生物 (1)白喉毒素:共价修饰(ADP核糖化)延长因子EFT2,抑制肽链延长 二、其它调节方式
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第四节 翻译后加工 一、肽链合成后的加工 1、去除N-甲酰基(原核)或N-蛋氨酸(真核) 2、二硫键形成:生成胱氨酸 3、水解修剪
4、氨基酸侧链修饰:羟化(生成羟脯氨酸、羟赖氨酸)、乙酰化、磷酸化、甲基化与羟甲基化、加糖、加脂,等 5、亚基聚合 6、辅基结合
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解读密码 DNA分子中的核苷酸只有4种,而蛋白质中的氨基酸却有20种之多。DNA如何得以包含蛋白质中氨基酸排列的遗传信息呢? ? 1954年理论物理学家Gamov在“Nature”杂志中明确提出遗传“密码”的概念。认为在密码翻译时3个核苷酸决定1个氨基酸。4种核苷酸,如允许重复,则可有43=64种排列组合方式。
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解读密码
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密码特点 1、密码子不重叠 2、密码子的连续性与方向性
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刘新文,蛋白质生物合成 密码特点 3、密码简并性
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密码特点 4、密码配对的摇摆性
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密码特点 反密码子5’端的碱基 密码子3’端的碱基 G C或U C A U A或G I A、U或C
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搬运工具—tRNA
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搬运工具—tRNA
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搬运工具—tRNA
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核蛋白体
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核蛋白体
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核蛋白体
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核蛋白体
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核蛋白体 两类核蛋白体: 结合型:位于粗面内质网,合成分泌蛋白(含信号肽). 游离型:游离于胞质中,参与细胞固有蛋白的合成
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核蛋白体
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基本原理 DNA(遗传信息) 多个核蛋白体 核膜 (装配机) mRNA(模板) 多个tRNA 多核蛋白体 (搬运工具) 蛋白质(产品))
多个氨基酸(原料) 蛋白质(产品)) mRNA
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氨基酰-tRNA合成 氨基酸+tRNA 氨基酰-tRNA 氨基酰-tRNA合成酶 ATP AMP+ppi
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起始复合物 IF2-GTP IF3 IF2 2、起始tRNA结合 起始密码子 30S亚基 IF3 3、大亚基结合 1、mRNA就位 原核起始
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GTP-eIF2a eIF2b GDP GDP-eIF2a Met-tRNAi 三元复合物 40S亚基 eIF4c mRNA 前起始复合物
eIF4f 前起始复合物 60S eIF4D eIF5 起始复合物
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起始因子
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起始因子
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肽链延长 1、进位
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肽链延长 进位
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肽链延长 2、肽键生成
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肽链延长 转肽 移位 肽链延长
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肽链终止 1、终止因子识别、结合终止密码 2、转肽酶活性转变、肽链解离 3、终止因子、mRNA、tRNA脱离 4、亚基拆离
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肽链终止
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嘌呤霉素
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肽链终止 嘌呤霉素的作用机理
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eIF 9~10种,需ATP,小亚基先与tRNA结合,再与mRNA结合 IF1、IF2、IF3,仅需GTP,小亚基先与mRNA结合
真核生物与原核生物蛋白质合成的不同 真核 原核 核蛋白体 80S 70S 含蛋白数量 多于80 少于60 小亚基结构 无嘧啶区和互补区 含嘧啶区与互补 起始tRNA tRNAimet tRNAfmet 启动 eIF 9~10种,需ATP,小亚基先与tRNA结合,再与mRNA结合 IF1、IF2、IF3,仅需GTP,小亚基先与mRNA结合 延长 EF1,EF2 EFTu EFTs 终止 RF 需 GTP RF1、RF 2、RF3
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蛋白质合成的调节
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蛋白质合成的调节
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肽链的加工修饰 1、肽链水解修饰 【例1】酶原 水解 酶 【例2】胰岛素原 切除肽链 胰岛素 【例3】清蛋白原 水解5~6 清蛋白 2、修饰
【例1】酶原 水解 酶 【例2】胰岛素原 切除肽链 胰岛素 【例3】清蛋白原 水解5~6 清蛋白 2、修饰 磷酸化:磷酸化酶b 羟化:胶元蛋白前体中的Pro、Lys。 脂化:脂蛋白要加脂。 乙酰化:组蛋白进行乙酰化。 甲基化:细胞色素C,肌蛋白. 糖基化: 在粗面内质网糖苷化与肽链合成同时进行.
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肽链的加工修饰 3、亚单位的聚合、辅基结合 【例如】血红蛋白( 22) α链 β链 2血红素 αβ二聚体 血红蛋白
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糖蛋白的合成
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分泌蛋白质的合成 靶向输送(protein targeting):将合成后的蛋白质定向运送到行使功能的目标区域 一、信号肽
1、作用:使核蛋白体与内质网上的受体结合;肽链进入内质网腔后运至靶器官,由信号肽酶切除信号肽。 2、结构:约15~40AA构成;分三个区: N端为亲水区含碱性氨基酸, 提供正电荷。 疏水区含中性或疏水性氨基酸。 加工区是信号肽酶切割信号肽的部位。
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二、其它 参与转运的分子 1、信号肽识别粒子SRP(Signal recognition particles):由6种蛋白质与7S-RNA组成复合体。 与合成的分泌蛋白中的信号肽结合。 与内质网上的受体结合。 2、7S-RNA:305bp,提供SRP形成的结构骨架。 3、对接蛋白Dp(docking protein):Dp 是SRP的受体,与SRP共同催化转运携有肽链的核蛋白体到内质网上。
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SRP的结合使肽链合成减速或暂停。 三、分泌蛋白的转运过程 1、信号肽与SRP结合,SRP与Dp结合,核蛋白体与内质网膜结合。
2、信号肽被信号肽酶切割掉,蛋白质分泌到内质网腔。
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分泌蛋白质的合成
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移码突变
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机体自身合成蛋白质的必要性与可能性 刘新文,蛋白质生物合成 蛋白质是生命活动的物质基础 蛋白质具有种属及个体特异性
人体不能直接利用外源性蛋白质 遗传信息决定蛋白质氨基酸序列 细胞具有蛋白质合成体系
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第四节 蛋白质合成与医学的关系 二、糖蛋白的合成 三、蛋白分拣……细胞内运输与定位 一、分子病(molecular diseases)
刘新文,蛋白质生物合成 二、糖蛋白的合成 三、蛋白分拣……细胞内运输与定位 第四节 蛋白质合成与医学的关系 一、分子病(molecular diseases) 由于基因缺陷,导致蛋白质合成异常,最终引起机体某些结构与功能障碍,产生疾病,称分子病。 1、误义突变(missense mutation) :某一氨基酸的密码突变为另一氨基酸的密码的现象 2、移码突变(frame-shift):插入或缺失1个或2个核苷酸后,导致插入点后的所有密码子发生改变
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谢谢! 【经典举例】 血红蛋白β链N端第六个氨基酸残基由Glu变为Val 珠蛋白结构基因中第六个密码子由CTT变为CAT
1、镰刀状红细胞贫血 血红蛋白β链N端第六个氨基酸残基由Glu变为Val 珠蛋白结构基因中第六个密码子由CTT变为CAT 2、小儿麻痹症与翻译起动因子有关 谢谢!
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