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细胞信号通路检测(二) Western Blot
病理生理学教研室 1
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定义: 印迹法(blotting)是指将样品转移到固相载体上,而后利用相应的探测反应来检测样品的一种方法。
1975年,Southern建立了将DNA转移到硝酸纤维素膜(NC膜)上,并利用DNA-RNA杂交检测特定的DNA片段的方法,称为Southern印迹法。 而后人们用类似的方法,对RNA和蛋白质进行印迹分析,对RNA的印迹分析称为Northern印迹法,对单向电泳后的蛋白质分子的印迹分析称为Western印迹法,对双向电泳后蛋白质分子的印迹分析称为Eastern印迹法
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Western Blot定义 Western Blot 应用: 研究检测样品中特异性蛋白质的存在 细胞中特异蛋白质的半定量分析
蛋白质分子的相互作用研究 3
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Western Blot实验流程 Step1 蛋白提取 Step2 蛋白定量 Step3 SDS-PAGE Step4 转膜
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PBS冲洗细胞(我们采用的细胞是E0771)3次(此步骤我们省略)
步骤一、蛋白样品的提取 总蛋白抽提程序: PBS冲洗细胞(我们采用的细胞是E0771)3次(此步骤我们省略) 加入裂解缓冲液(RIPA其中我们已加入PMSF)80ul(1.5*106个细胞大约加入100ul裂解液,或100ml培养皿中加入100ul裂解液),冰上放置20-30min 收集裂解液到EP管中 4度离心,12000转/分,2-10min 吸取上清,蛋白定量(实验条件所限我们不做),分装(也不做,直接用总体积上清即80ul与5X上样缓冲液20ul混合),加入5X上样缓冲液20ul,煮沸5-10min,保存在-80度备用。
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步骤二、SDS-PAGE电泳 SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳 聚丙烯酰胺凝胶作为支持介质的一种常用电泳技术。
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PAGE:聚丙烯酰胺凝胶 胺(acrylamide,简称Acr)和交联剂(crosslinker)
聚丙烯酰胺凝胶(polyacrylamide gel)是由单体丙烯酰 胺(acrylamide,简称Acr)和交联剂(crosslinker) N,N’-亚甲基双丙烯酰胺(N,N’-methylenebisacylamide, 简称Bis)在催化剂和加速剂作用下聚合交联而成的三维网 状结构的凝胶。化学惰性强,具有一定的机械强度和透明 度。是良好的电泳介质。
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SDS SDS与蛋白结合后,还可引起构象改变,复合物呈长椭 圆棒,SDS-PAGE只取决于蛋白分子量大小。
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SDS-PAGE凝胶成分 O ∥ CH2=CH–C–NH2 O O ∥ ∥ CH2=CH–C–NH–CH2–NH–C–CH=CH2
SDS-PAGE:SDS-PolyAcrylamide Gel Electrophoresis 丙烯酰胺 (A):形成聚合物链 N,N’-亚甲双丙烯酰胺 (B) :形成纵向架桥(cross-linkage) 过硫酸铵(APS) :助凝剂 TEMED:催化剂 ︱ CONH2 CONH2 CONH ︱ ︱ ︱ –CH2–CH–CH2–CH–CH2–CH–CH2–CH–CH– CONH CH2 CONH CONH2 CONH2 ︱ ︱ ︱ O ∥ CH2=CH–C–NH2 APS, TEMED A O O ∥ ∥ CH2=CH–C–NH–CH2–NH–C–CH=CH2 B (神经毒性) 9
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制胶 不连续系统 浓缩胶 分离胶 蛋白质在进入分离胶以前,先被浓缩成一条细线,使每个蛋白的起跑线相同,提高解析度。 特点: pH不连续
凝胶不连续 缓冲液成分不连续 特点: 蛋白质在进入分离胶以前,先被浓缩成一条细线,使每个蛋白的起跑线相同,提高解析度。 10
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制胶 12%分离胶(15ml) 双蒸水 4.8ml 30% Arc/Bis 6ml 分离胶缓冲液 (pH8.8) 4ml
10% SDS ul 10%APS ul TEMED ul 灌胶,待凝,约1小时
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灌制分离胶 隔绝空气 ddH2O 0.1%SDS:<8% 异丁醇:>8%
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4%浓缩胶(7.5ml) 双蒸水 ml 30% Arc/Bis ml 分离胶缓冲液 (pH6.8) ml 10% SDS ul 10%AP ul TEMED ul 灌胶,插梳子,待凝,约0.5小时
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灌制积层胶 插入梳子
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SDS-PAGE 电泳 上样前煮沸样品 上样量: μg 蛋白Marker 16
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准备样本 加2×Loading Buffer,混匀,煮沸3~5分钟, 10000g离心10分钟 取上清适量上样 电泳:5mA/胶 大约需时2小时
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蛋白样品的变性 SDS-PAGE上样缓冲液:
DTT可临用前以1:4比例混合加入,亦可全部配好分装,-20℃冻存。 按1:1比例与蛋白质样品混合,95~100℃加热5~15min,冰上冷却后再上样,上样量一般为20-25μl,总蛋白量20~50μg。 100mM Tris-HCl(pH6.8) 200mM DTT 4%SDS 0.2%溴酚兰 20%甘油 ddH2O 1M Tris-HCl(pH6.8) 10 ml 1M DTT 20 ml SDS 4 g 甘油 溴酚蓝 0.2 g 总体积 100ml
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步骤四、转膜 膜的选择: NC、PVDF、尼龙膜 转膜方法: 半干转、湿转 转膜确认: 立春红染色、蛋白预染Marker 3 19
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取出一块胶做考马斯亮兰染色 另一块胶转膜 转膜:负极到正极,依次放海绵,滤纸,凝胶,硝酸纤维膜, 滤纸,海绵 380mA 30分钟
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湿转系统
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转移操作 白色夹板(正极) 垫片 300mA 1h 2层滤纸 膜(左上角标记) 凝胶(Marker靠左) 2层滤纸 垫片
+阳极 -阴极 多孔垫片 滤纸 凝胶 膜 垫片 300mA 1h 2层滤纸 膜(左上角标记) 凝胶(Marker靠左) 2层滤纸 垫片 56mA /膜 1h 黑色夹板(负极) 22
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步骤五、封 闭 去除非特异结合位点: Blocking Buffer :3%BSA 5% Milk Room Temperature 1 h
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封闭 为避免作为检测试剂的特异性第一抗体与膜发生非特异性结合,使非特异性背景提高,需对膜上的潜在结合位点进行封闭处理。
5%脱脂奶粉或BSA(室温孵育1h) Western Blot 膜封闭液(生物试剂公司) Tween-20的作用:减少非特异性吸附,不影响抗体与抗原的结合。
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步骤六、抗体孵育 一抗的选择 : 注意:抗体的稀释倍数是由底物和待检测蛋白质的丰度决定的,
确定所研究的目的蛋白,根据目的蛋白名称查询相关抗体。 抗体选择: 单克隆抗体 或者 多克隆抗体 直接标记的抗体 或者 未标记的抗体 抗体的实验目的:对不同实验选用不同抗体 WB(免疫印迹)、IHC(免疫组化)、ELISA(酶联免疫反应)、FC(流式细胞检测)、 IP(免疫沉淀) 抗体所检测的种属:人、小鼠、大鼠等 注意:抗体的稀释倍数是由底物和待检测蛋白质的丰度决定的, 为了获得最佳实验结果,强烈推荐进行预实验,以确定具体的实验参数. 25
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二抗的选择: 根据标记物: 根据一抗物种: 抗小鼠 抗兔 抗大鼠 抗人 抗山羊 抗鸡 抗豚鼠 抗马 标记物
HRP、AP、Biotin、荧光标记、无标记
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一抗、二抗孵育 把NC膜放在密闭塑料袋或者培养皿中,根据膜面积以0.1mL/cm2的量加入一抗溶液,摇床上平缓摇动,于室温孵育1-2小时或4℃过夜。 回收一抗溶液,用TBST漂洗膜3次,每次10min。 加入用封闭液配制的二抗,摇床上缓慢摇动,于室温孵育1-2小时或4℃过夜。 回收二抗溶液,用TBST漂洗膜3次,每次10min。 最后用TBS漂洗膜2次,每次10min。
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二抗与底物反应显色 步骤七、检测方法 化学发光法: 化学显色法: 常用HRP酶标系统的显色底物为ECL鲁米诺(Luminol)
特点:无毒害、灵敏度高、速度快;特异性好、节省抗体、线性宽; 可重新剥离检测。 化学显色法: 常用酶标系统HRP的显色底物为TMB和DAB 酶标系统AP的显色底物为BCIP和NBT 特点:方便、便宜; 具有一定毒性、灵敏度较低、反应速度慢; 检测后的膜不可重新剥离检测。 28
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Western Blot Perfect Data Step1 蛋白样品制备 Step2 蛋白定量 Step3 SDS-PAGE
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讨论 根据实验结果判断相关信号通路活化情况,并作出讨论
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