D1 Prokaryotic chromosome structure

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1 D1 Prokaryotic chromosome structure
E. Coli chromosome 4.6Mb Nucleoid区：含有DNApolymerase, repressor等 大肠杆菌基因组编码3000个蛋白质

2 染色体的形态

3 每一个结构域就是一个DNA环 每一个基因组约有100个这样的结构域 每一个结构域约有40kb（50-100kb）长的DNA组成的紧密的纤丝结构

4 DNA结构域 支架蛋白 4.6Mb 个环 每个环 kb 超螺旋结构域

5 拟核的结构（DNA结合蛋白） 类组蛋白 Histone-like protein 压缩DNA HU蛋白，碱性二聚体蛋白，H-NS单体蛋白

6 体外分离出来的压缩小体DNA，根据它对溴乙锭的反应可以判定它是闭合的双链体结构。 溴乙锭能够插入碱基对之间，之后由负超螺旋（∆Lk/Lk。=-0.06）变成正超螺旋而形成闭环DNA分子，也就是双链均共价整合的DNA分子） 6

7 正超螺旋闭环DNA分子 负超螺旋（∆Lk/Lk。=-0.06） 含17圈超螺旋

8 DNA结合蛋白的定义： 1. 与周围DNA发生非特异形结合， 2
DNA结合蛋白的定义： 1.与周围DNA发生非特异形结合， 2.约束着约半数的DNA超螺旋 包括HU蛋白以及H-NS蛋白（H1蛋白，类组蛋白histone-like protein）

9 返回 能够浓缩DNA的二聚体蛋白，能够将DNA裹成一个念珠结构。如果其亚基hupA，hupB都失去功能，那么DNA的一些超螺旋也会消失。
1.一种中性的单体蛋白 2.倾向与DNA内部弯曲区域发生非特异结合 3.具有压缩DNA的作用，对DNA被包装进入类核以及稳定和限制染色体超螺旋十分必要 4.亦称类组蛋白 返回

10 The Structure of Chromatin
长度为几个厘米 占50%

11 组蛋白: 有20-30%的碱性氨基酸（Lys and Arg),
带正电，可与带负电的DNA结合

12 Histone 的种类：5个家族 核心组蛋白：H2A,H2B,H3,H4 (10-20 kDa) H1:23kDa，同一组蛋白在不同的物种之间很保守。

13 组蛋白的空间结构：所有的组蛋白都有相似的三级结构

14 核小体：八聚体核心组蛋白加一个松散结合的H1
保护20bpDNA 左手方向环绕1.8圈，形成负超螺旋 8.6 nm 2.8 nm 核小体核心：146bp

15 组蛋白H1: 连接作用，容易提纯，不同物种间的差异很大
200 bp 染色小体 连接DNA:55bp 在有些细胞类型中，H5替代H1与不进行转录的DNA结合

16 由核小体形成30nm纤丝 提高盐浓度

17 每圈由6个核小体通过左手螺旋形成核纤丝

18 染色质的高级结构 100bp环状结构

19 30nm核纤丝形成染色体的环状结构 300 nm 蛋白质构成的核基质

20 chromatin to a nuclear matrix

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22 chromosome

23 Chromatin during interphase

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