使用CGRD的前處理 2019/03/06 甘淑婷.

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1 使用CGRD的前處理 2019/03/06 甘淑婷

2 OUTLINE 申請CGRD 分析產出報表 研究構想 處理DATA 介紹CGRD檔案系統 Check & clean 資料處理流程
根據不同目的選擇檔案 串檔注意事項 研究構想 申請CGRD 處理DATA 分析產出報表

3 CGRD檔案清單 開刀房報告檔 出院病摘 急診SO歷史檔 急診護理記錄檔 泌尿外科報告 腦神經內科報告 開刀房間動態資料檔 死亡證明書
急診留觀時數 疾病分類統計檔 直腸肛門科報告 精神科報告 住院申報費用清單 住診醫囑檔 急診病患動態查詢檔 掛號明細資料檔 急診醫學科報告 整形外科報告 住院申報醫令清單 住診藥囑檔 急診診斷檔 解剖病理報告檔 胃腸肝膽科報告 微生物結果檔 門診處方歷史檔 呼吸照護記錄 急診檢傷分類 X光科報告 風濕過敏科報告 檢驗索引檔 門診醫令歷史檔 住院批價明細檔 急診醫囑基本資料檔 一般外科報告 核子醫學科報告 檢驗結果歷史檔 住出院異動檔 住院批價基本檔 急診醫囑檔 心內科報告 胸腔內科報告 檢驗藥敏歷史檔 每日床位資訊檔 門診批價主檔 急診醫囑藥囑檔 手術室報告 骨科報告 癌症登記治療檔 出生記錄檔 門診批價明細檔 急診生命徵象記錄檔 外傷急症外科報告 婦產科報告 癌症登記診斷檔 生命徵象記錄檔 門診診斷檔 急診身體評估記錄檔 皮膚科報告 眼科報告 住院護理醫囑處置 門診醫囑材料主檔 急診醫囑處置 耳鼻喉科報告 移植免疫室報告 身體評估記錄檔 門診醫囑基本資料檔 急診離院動態護理記 錄檔 血液腫瘤科報告 復健科報告 病患嗜好記錄檔 門診醫囑醫囑主檔 呼吸治療科報告 腎臟科報告 急診護理指導記錄檔 管路監控記錄檔 門診醫囑藥囑主檔 放射腫瘤科報告 新陳代謝科報告

4 [制定部門：行政中心資訊管理部 原訂日期：2014/01/15 新訂日期：2014/07/31]

5 介紹CGRD檔案系統 掛號作業系統 門診作業系統 檢驗作業系統 解剖病理報告系統 檢查報告系統 手術作業系統 急診作業系統 批價作業系統
申報作業系統 急診護理作業系統 癌症中心系統 住出院作業系統 住診作業系統 住院護理作業系統 疾病分類作業系統 掛號作業系統--就醫日期、醫師編號、保險類別、預約掛號 住出院作業系統--住出院異動檔 每日床位資訊檔 住診作業系統--出院病摘 、醫囑藥囑

6 常用檔案介紹 門診作業系統: 門診診斷檔 檢驗作業系統: 微生物結果檔 檢驗結果歷史檔 急診作業系統: 急診診斷檔 批價作業系統:
住院批價明細檔 門診批價明細檔 疾病分類作業系統: 疾病分類統計檔 住院護理作業系統: 生命徵象記錄檔 出生記錄檔 用藥跟材料也可以從醫囑藥囑檔，但是會有變更跟取消的問題，申報則是有健保碼才會有資料或是自費的問題

7 Check & clean Coding book: (院內網路)

8 Check & clean 丟棄 補值 高度MISSING 的欄位---找其他方式替代 檔案名稱 欄位名稱 Missing rate
SASERDAF 急診診斷檔 重大傷病 91.75% 主診斷 52.62% SASERDDRUG 急診醫囑藥囑檔 天數 41.31% SASERDHBASIC 急診檢傷分類 體重 54.46% SASERDOPDF 急診醫囑基本資料檔 54.59% SASICDSUM 疾病分類統計檔 身高 97.15% SASIPBCGDA 住院批價明細檔 73.46% SASOPBCGBA 門診批價主檔 79.39% SASOPDAF 門診診斷檔 法定傳染病註記 100.00% 重大傷病註記 SASOPDOPDF 門診醫囑基本資料檔 SASRESPMR141 呼吸照護記錄 體溫 66.12% 每次要做之前都要先確認1.有欄位 2.欄位的內容 3.missing rate

9 資料處理流程 disease drug Exclude: history of another disease

10 根據不同目的選擇檔案 診斷 檢驗 (生化檢驗&微生物) 生命徵象 醫囑 (用藥、材料、處置) 手術 出生紀錄
其他: ICU、科別、死亡、檢查報告、身高、體重…

11 查詢代碼

12 診斷 代碼 檔案 欄位 保留其診斷日期(IPDAT) or 住院日期(ADMDAT) 住院日&出院日計算住院天數 住院-疾病分類統計檔
ICD-9 ICD-10 檔案 住院-疾病分類統計檔 門診診斷檔 急診診斷檔 欄位 主診斷 次診斷 保留其診斷日期(IPDAT) or 住院日期(ADMDAT) 住院日&出院日計算住院天數 門診診斷檔/急診診斷檔 用”輸入日期”、疾病分類統計檔（住院）用”住院日期”.

13 診斷-疾病分類統計檔

14 診斷-門診診斷檔

15 檢驗 代碼 檔案 欄位 生化檢驗代碼有兩個欄位:(LABIT檢驗項目) (LABSH1IT檢驗單一項目)
微生物 生化檢驗 欄位 細菌代碼 檢驗值 生化檢驗代碼有兩個欄位:(LABIT檢驗項目) (LABSH1IT檢驗單一項目) 利用函數compress(val, ‘ ’,’k); 檢驗值有可能會發生>60 判讀成60，應該詢問臨床醫師的意見。 若有極小值(<XXX)/極大值(>XXX)時, 又需保留其數值的連續, 則先將該檔的檢驗結果值列出frequency, 參考該檔的最小值/最大值後, 在給予極小值(<XXX)/極大值(>XXX)一個數值.

16 檢驗-生化檢驗 Total cholesterol HDL LDL Triglyceride Sugar AC HbA1c
Creatinine Albumin AST ALT Total Bilirubin Platelet count ……

17 檢驗-微生物 細菌檢驗通常是細菌代碼，也可能是Mix flora、no growth，不一定是positive。

18 生命徵象 項目代碼 代碼 檔案 欄位 住院-生命徵象檔 急診-急診生命徵象檔 檢測值 處理時間: a=substr(IPDAY,1,8);
compress(val, ‘ ’,’k); 保留原始值檢查 處理時間: a=substr(IPDAY,1,8); b=substr(IPTM,1,4); if b="2400" then b="2359"; c=compress(cat(a,'T',b,"00")); check_date=input(a,yymmdd10.); check_time=input(c,ND8601DT.);

19 生命徵象項目代碼 0A16 RR OB09 ICP/ ICPm OC10 PaCO2 XA04 RESP/ RR OA01 BT OB10
RAP S OC15 PaO2 XA05 NBPs OA02 Pulse OB11 RAP D OD03 C.O. XA06 NBPd OA03 HR OB12 RAP M OD06 CCO XA07 NBPm OA04 OB16 LAP S OD07 C.I. XA08 SpO2 OA05 OB17 LAP D OD09 LCW1 XA13 Incubator Temp OA06 OB18 LAP M OD11 LVSW1 XA14 Warm Temp OA07 OB22 PAPs OD18 SV XA16 OA08 OB23 PAPd OD19 SI XB01 ABPs OA13 OB24 PAPm OD20 SVR XB02 ABPd OA14 OB25 AoS OD22 SVRI XB03 ABPm/ABPs OA16 OB26 AoD OE01 AWRR XB04 CVPs OB01 OB27 AoM OE02 etCO2/SpO2pr XB05 CVPd OB02 OB29 IUP S OE04 FIO2 XB06 CVPm OB03 OB30 IUP D OE05 PIP XB07 ICP S OB04 OB31 IUP M OE06 TV XB08 ICP D OB05 OB32 CPP OE09 PEEP XB09 OB06 OB33 P1 S XA01 XB12 OB07 OB34 P1 D XA02 XB16 OB08 OC01 OXIMETER/ SpO2pr XA03 XB17

20 生命徵象 CVPs: 4~12cmH2O

21 用藥、材料 代碼 檔案 欄位 計算用藥天數 住院: CSN 住院號 CHRGDAT 批價日期 FRTM 開始日期 ENDTM 結束日期
藥碼、材料代碼 檔案 住院批價明細檔 急診or門診-門診批價明細檔 欄位 RCFNO 收費編號 住院: CSN 住院號 CHRGDAT 批價日期 FRTM 開始日期 ENDTM 結束日期 門診: OPDNO門診號 DAT批價日期 CHRGDAT批價日期 PDBGNDAT 療程開始日期 PDENDDAT 療程結束日期 計算用藥天數

22 醫囑 代碼 檔案 欄位 代碼 檔案 欄位 健保編號 住院申報醫令清單 RCFNO 收費編號 收費代碼 門診醫令歷史檔 ODRNO 醫囑編號
急診醫囑醫囑檔 欄位 RCFNO 收費編號 ODRNO 醫囑編號 代碼 健保編號 檔案 住院申報醫令清單 住院批價明細檔 門診醫令歷史檔 門診批價明細檔 欄位 NHINO 健保編號 NHINO1-NHINO3 健保編號

23 手術 代碼 檔案 欄位 長庚代碼 開刀房報告檔 REGNO 手術編號 代碼 檔案 欄位 手術室時間
開刀房動態檔: 麻醉開始時間、麻醉完成時間、手術準備開始時間、手術開始時間、麻醉結束時 間、出手術室時間、離開恢復室時間、輸入等候室時間… 代碼 ICD-9-PCS  ICD-10-PCS 檔案 住院-疾病分類統計檔 門診or 急診-門診處方歷史檔 欄位 OPNO1-OPNO10 手術代碼 MORCD 主手術代碼

24 例子: 洗腎 長庚診療項目收費標準代碼 健保代碼: 手術代碼:
'M24-001' 'M24-031' 'M24-032' 'M24-033' 'M24-034' 'M24-039' 'M24-039A' 'M24-040' 'M24-042' 'M ' 'M24-045' 'M24-055' 'M24-057' 'M24-062' 'M24-064'; 健保代碼: 58002C 手術代碼: <ICD-9-PCS> 39.95 Hemodialysis 54.98 Peritoneal dialysis <ICD-10-PCS> 5A1D70Z, 5A1D80Z, 5A1D90Z Hemodialysis 3E1M39Z Peritoneal dialysis 利用健保代碼 利用收費編號 檔案名稱 欄位名稱 筆數 門診 門診醫令歷史檔 sasocrordf NHINO 187145 RCFNO 187143 門診批價明細檔sasopbcgda NHINO1-NHINO3 170754 門診批價明細檔 sasopbcgda 173053 急診 - 急診醫囑檔 saserdormf ODRNO 住院 住院申報醫令清單 sasicrordf 167515 住診醫囑檔 sasipdorbk OBKNO 178036 住院批價明細檔 sasipbcgda 173052

25 出生紀錄 IDCODE 歸戶代號_嬰兒 IDCODE_MA 歸戶代號_母親

26 死亡 代碼 檔案 欄位 4-死亡 DGSTS A-病危自動出院 出院狀況 低估 高估 未在長庚體系就醫的死亡無法被定義。
住院- 疾病分類統計檔 住院申報費用清單 欄位 DGSTS 出院狀況 低估 高估 未在長庚體系就醫的死亡無法被定義。 病危自動出院，有可能沒有死。 建議再串後續是否有再就診的紀錄。 追蹤in-hospital mortality，而不要看overall survival。 不要以死亡當主要的outcome。

27 其他 項目 檔案來源 欄位名稱 ICU 住診醫囑檔 OBKICU-ICU 註記 科別 疾病分類統計檔 ADMDPT-住院科別
OBKDEPT-科別 檢查報告 各科檢查報告檔 ITEM -檢查項目 (長庚代碼) REPORT01-15-文字報告 身高、體重 出院病摘 DSTFIND 體檢發現

28 串檔注意事項 歸戶鍵值: LOC+ IDCODE 門診號、病歷號 日期&時間

29 Thanks for your attention~

30 出院病摘

31 死亡證明書