二十章.遗传资源的评估 组员： 傅诗洁 钟秀伶.

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1 二十章.遗传资源的评估 组员： 傅诗洁 钟秀伶

2  是畜牧业生产的基础，育种材料的直接来源，畜牧业可持续发展的保障，能够满足未来对畜产品类型、数量及质量不断变化的需求。(重要性)
 家畜遗传资源是指畜禽本身及其生殖细胞、胚胎和基因物质等遗传材料。  是畜牧业生产的基础，育种材料的直接来源，畜牧业可持续发展的保障，能够满足未来对畜产品类型、数量及质量不断变化的需求。(重要性)

3 2.家畜遗传资源的现状 少数性能高产但趋同的品种在生产中得到广泛应用，占据主导地位。
家畜遗传资源在全球范围内面临着利用与保护的不平衡状态 少数性能高产但趋同的品种在生产中得到广泛应用，占据主导地位。 大量生产性能不高，但某方面种质独特、遗传多样性非常丰富的家畜品种受到忽视，在生产中所占比重愈来愈少，规模呈萎缩趋势。 因此，对地方畜禽遗传资源进行合理地保护、评估和利用，是十分紧迫的。

4 遗传资源的评估： 分为两个方面 a.种质特性的评估 b.遗传多样性的评估

5 4.种质特性的评估： 种质特性即遗传特性，指作为遗传资源的某一种群所具有的有别于其他种群、并能稳定遗传的特性。
4.种质特性的评估： 种质特性即遗传特性，指作为遗传资源的某一种群所具有的有别于其他种群、并能稳定遗传的特性。 4.1家畜种质特性研究的意义 a.资源保护的基础和依据之一 b.有可能发现新的遗传资源或发掘出新的珍贵性状

6 c.有助于拓宽畜产品的开发种类或开发渠道，促进畜牧业的增产增效及农民增收。
d.种质特性的研究结果能增强我们加快资源保护工作的紧迫感，实际中贯彻保种措施的执行。 e.可为进一步进行同（品）种异名研究和对品种进行遗传分类提供重要依据，有助于揭示品种的起源、演化等。

7 4.2家畜种质特性的评估内容 表型特征 包括毛色（羽色）等外部特征及体型特征

8 主要包括对公、母畜的繁殖生理特点、繁殖性能和繁殖效率。如每头母猪年提供断奶仔猪数、牛群的受配率和产犊率等。
Ⅱ. 生长胴体及产品品质特征 Ⅲ. 繁殖特点 主要包括对公、母畜的繁殖生理特点、繁殖性能和繁殖效率。如每头母猪年提供断奶仔猪数、牛群的受配率和产犊率等。

9 抗病力包括一般抗病力、特殊抗病力及抗应激能力。
Ⅳ. 抗逆性和抗病力 抗病力包括一般抗病力、特殊抗病力及抗应激能力。 抗逆性包括家畜对各种逆境，如恶劣、极端的生态环境下的适应性、耐粗饲料能力和耐粗放管理能力等。

10 主要包括心血管形态机能特征、血液生理生化特征、淋巴系统特征、消化系统形态技能特征和呼吸系统特征。
Ⅴ. 机体解剖生理生化特征 主要包括心血管形态机能特征、血液生理生化特征、淋巴系统特征、消化系统形态技能特征和呼吸系统特征。 Ⅵ. 由上述研究内容所总结出的特色性状 Ⅶ. 特色性状相关基因 P242

11 5.遗传多样性的评估 遗传多样性即基因多样性，对家养动物而言，主要指种内不同品种与同一品种内的遗传变异程度。

12 5.1遗传多样性研究的意义 遗传多样性的丰富程度是遗传资源是否被卡住的重要指标。
有助于更好地摸清遗传资源家底，进一步明确品种是濒危或急需抢救的类型。 更好地明确品种的优先保护次序及可延缓保护或不予保护的品种。

13 5.2遗传多样性的评估方法 ⑴ 染色体多样性 指染色体结构特征的变异，包括染色体C带、G带、Q带带型多态以及银染核仁组织区多态和Y染色体多态等。 家畜中主要研究多态性明显的C带多态性及银染核仁组织区多态性上。

14 ⑵蛋白质多态性 家畜遗传多样性检测中，最常用一些遗传方式明确、多态性较丰富的红细胞抗原型、白细胞抗原型和血液蛋白质（酶）型。

15 主要通过各种DNA标记进行检测。常用微红星DNA、线粒体DNA、单核苷酸（SNPs）多态性等标记。
b. 线粒体DNA呈独特的母系遗传方式，利用单倍型序列能够追溯到种群起源及分化关系。 c. SNPs作为数目适中，结果可比性强，是家畜遗传多样性检测的主要工具。

16 公畜血统数检查法 理论依据：群体遗传学证明，若不存在选择、迁移的影响，遗传漂变与近交是导致基因丢失的主要原因。
除此之外，还有一种在实践中能立即应用并间接推断品种内遗传多样性程度的评估方法—— 公畜血统数检查法 理论依据：群体遗传学证明，若不存在选择、迁移的影响，遗传漂变与近交是导致基因丢失的主要原因。 而有效群体规模（有效群体大小、有效群体含量）是影响遗传漂变程度和近交增量（上下两代平均近交系数之差）的主要因素。

17 同时相关研究发现： 保种效果主要决定于头数较少的性别，即公畜的实际头数，即要有适当数量的公畜血统。
因此公畜血统数应是品种调查和经常性的品种遗传多样性检测的必要内容，也是衡量一个品种保种效果的重要指标之一，

18 5.3遗传多样性的评估指标 利用不同DNA分子标记检测得到的数据，统计方法也不同。数据类型主要分为：基于基因型多态的等位基因频率和基于核苷酸碱基差异的DNA序列数据。

19 又被称为短串联重复序列长度多态性，简单序列长度多态性。
下面对微卫星DNA多态性检测数据的评估指标加以说明。 何为微卫星：微卫星属于高度重复序列。是指重复单位为1-6bp，重复十数次至数十次的一类DNA序列，其排列按类似于小卫星的“数量可变的串联重复序列”方式，其长度一般不超过300bp. 又被称为短串联重复序列长度多态性，简单序列长度多态性。

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21 * pi= 𝒎 𝟐𝒏 m第i个等位基因在检测群体内出现的次数；n检测个体数。 5.3.1 微卫星DNA多态性检测数据的评估指标
1.品种内的遗传多样性 Ⅰ. 等位基因频率 又称基因频率。指特定基因座上，某一等位基因在该基因座上所有等位基因中所占比例。 pi= 𝒎 𝟐𝒏 * m第i个等位基因在检测群体内出现的次数；n检测个体数。

22 PIC=1— 𝒊=𝟏 𝒏𝒊 𝒑 𝒊 𝟐− 𝒊=𝟏 𝒏𝒊−𝟏 𝒋=𝒊+𝟏 𝒏𝒊 𝟐𝒑𝒊𝟐𝒑𝒋𝟐
即在连锁分析中一个遗传标记多态性可提供的信息量的度量。它是一个亲本为杂合子，另一亲本为不同基因型的概率。常用来衡量座位多态性高低的程度。 PIC=1— 𝒊=𝟏 𝒏𝒊 𝒑 𝒊 𝟐− 𝒊=𝟏 𝒏𝒊−𝟏 𝒋=𝒊+𝟏 𝒏𝒊 𝟐𝒑𝒊𝟐𝒑𝒋𝟐 𝑝i、 𝑝 𝑗 是等位基因频率; 𝑛 𝑖 为该基因座上等位基因数目。

23 多态信息含量应用于 估计连锁分析标志基因的多态性，反映了某一位点在相关群体中多态性的大小。
多态信息含量关系到该位点可用性及使用率，多态信息含量越大，在一个群体中，该位点杂合子比例就越大，提供的遗传信息就越高。

24 Ⅲ 杂合度（H） a. 实际杂合度（Ho） 指检测群体内杂合子所占比率 b. 期望杂合度(He)
在群体遗传学中，杂合度分为实际杂合度（Ho）和期望杂合度（He），后者也称为理论杂合度或基因多样性。 a. 实际杂合度（Ho） 指检测群体内杂合子所占比率 b. 期望杂合度(He) 指在检测群体内随机抽取两个等位基因，它们各不相同的概率。更适于群体遗传变异的度量。

25 h=1— 𝒊=𝟏 𝒏𝒊 𝒑𝒊𝟐 Ho= 𝒊=𝟏 𝒏𝒊 𝒉𝒊/𝒓
对于不同的基因座，杂合度可能不同，因此多以所有检测基因座杂合度的平均值 ，作为群体的总体杂合度的表示。 h=1— 𝒊=𝟏 𝒏𝒊 𝒑𝒊𝟐 （期望杂合度） Ho= 𝒊=𝟏 𝒏𝒊 𝒉𝒊/𝒓 （总体杂合度） 其中，hi为某座位的期望遗传杂合度，r为所检测的座位数目。

26 与前面所讲的多态信息含量相比，杂合度H反映对进化因子的效应的分析和评价。
多态信息含量反映某一位点在相关群体中多态性大小，而杂合度则指处于Hardy-Weinberg平衡（P251）的整个群体某座位等位基因杂合形成的多态性。

27 ne=1 / 𝒊=𝟏 𝒏𝒊 𝒑𝒊𝟐 Ⅳ.有效等位基因数 ne 在实际计算中多用遗传纯合度的倒数来衡量，即(1—He)的倒数。
指理想群体中（所有等位基因频率相等），一个基因座上产生与实际群体中相同杂合度所需的等位基因数目。 公式如下 ne=1 / 𝒊=𝟏 𝒏𝒊 𝒑𝒊𝟐 ne 在实际计算中多用遗传纯合度的倒数来衡量，即(1—He)的倒数。

28 G1= 𝒊=𝟏 𝒓 （ 𝒋=𝟏 𝒏𝒊 𝒒𝟒𝒊𝒋+𝟒 𝜮𝜮𝒒𝟐𝒊𝒋𝒒𝟐𝒊𝒌)
Ⅴ. 同一群体的个体相似概率 从同一群体内随机抽取两个个体，两者所有基因型相一致的概率。主要用来衡量群体遗传纯合程度的高低。 G1= 𝒊=𝟏 𝒓 （ 𝒋=𝟏 𝒏𝒊 𝒒𝟒𝒊𝒋+𝟒 𝜮𝜮𝒒𝟐𝒊𝒋𝒒𝟐𝒊𝒌)