医学信息相关标准介绍 张旭峰 上海生物信息技术研究中心
提纲 信息标准化基本概念 1 医学信息表达标准介绍 2 医学信息处理标准介绍 3
基本概念 信息标准化定义 狭义 指信息表达上的标准化,在一定范围内人们能共同 使用的对某类、某些、某个个体抽象的描述与表达。 广义 指对整个信息的处理,包括标准化的信息、信息传 递与通讯、数据流程、信息处理技术与方法、信息 处理设备等。 医学信息标准化 信息标准化在医学领域的应用。
基本概念 信息标准分类 信息表达标准化:是信息标准化的基础,如分 类、编码,名称和内涵的标准化、代码化。 信息交换标准化:解决不同系统和部门间信息 共享的问题。 信息处理与流程标准化:主要利于信息系统的 开发和推广。
基本概念 医学信息的特点 种类繁多 面广量大、更新快 量化困难 自然语言标准化的困难 医学信息标准化的基础 信息的分类和编码 医学术语和医学专业词汇汇编 医学信息硬件和软件的标准化 软件产品的标准化 生产和管理软件工程的标准化 软件开发环境的标准化
医学信息表达标准介绍
ICD— 国际疾病分类 (International Classification of Disease, ICD ) 是根据疾病的某些特征, 按照规则将疾病分门 别类, 并用编码的方法来表示的系统。 ICD 已有 110 年发展历史 : 1891 年第 1 版 ; 1940 年第 6 次修订, 首次引入疾病分类, 强调按 病因分类的思想 ; 1975 年 ICD-9, 得到推广 ; 1994 年 ICD10; 北京协和医院世界卫生组织疾病分类合作中心 负责有关疾病分类的中文事宜
ICD-10 分类原理 依据疾 病的四个主要特性, 即病因、部位、 病理和临 床表现, 形成一个多轴心的分类系 统。 ICD 分类的基础是对疾病的命名 ; 疾病的本质和表现特性正是分类的依据 ; 分类与命名之间存在一种内在的对应关系 ; 对指定疾病赋予一个编码, 编码是唯一的 ;
ICD 分类的方法 采用以病因为主、解剖部位、临床表现、 病理为轴心的基本原则。 前 3 位编码为 ICD-10 类目码,如急性阑尾炎 K35 前 4 位编码为 ICD-10 亚目码,急性阑尾炎伴腹膜 脓肿 K35.1 第 5-6 位数为扩展码, 5 位代码为细目编码,疾 病分类编码应当到 6 位数,每一个编码代表一个 具体的疾病,例如:原发性单侧髋关节病 M 双重分类 : 剑号 “†” 与星号 “ * ” ( 病因与临床表 现 ), 如 A18.8 † I32.0*
ICD 的应用和意义 标准化 : 使得疾病名称标准化、格式化, 这是 医学信息化、医院信息管理的基础, 也是电 子 病历等应用基础。 共享性 : 疾病信息得到最大范围的共享 有利医疗管理 : 医疗统计的基础, 便于了解各 病种的相关信息。 有利费用管理 : 疾病分类是医疗经费控制的 重 要依据之一, 而城镇职工医疗保险制度采 用按病种计费, 促使各种病种制定规范化治 疗方案 。
SNOMED -人类与兽医学系统术语 (Systematized nomenclature of human and veterinary medicine, SNOMED) 用于人、兽医 学的结构化术语集和术语的分类。 颁布于 1974 年。目前是第三版, 《人类与兽 类医学系统术语》, 也称《国际医学规范术 语全集》。
SNOMED RT 参考术语 (reference terminology): 多维、多层 次的标准医学术语集,强调临床术语语义 上的一致性。既可以满足用户结构化、智 能化录入临床数据的需要, 又能够用于优化 自然语言处理, 还能帮助完成医学信息的存 储、提取与分析, 把这种更高层次的满足广 泛医学信息处理需求的标准术语集成为参 考术语。
SNOMED CT 2002 年 1 月, SNOMED RT ( SNOMED Reference Terminology ,医学术语系统命名法-参考术语集) 与英国国家卫生服务部( National Health Service , NHS )的临床术语( Clinical Terms ,又称为 Read Codes )相互合并,并经过扩充和结构重组,从而 形成了 SNOMED CT 。 SNOMED RT 在历史上的优点就 是它的那些专业医学术语集以及所采用的分布式协 作开发方法,而第 3 版临床术语( Clinical Terms Version 3 , CTV3 )的优势则是它在全科医学方面的 那些术语集。通过把这两个体系组合起来, SNOMED CT 目前成为现有任何语言之中最为广泛全 面的临床词表,收录有超过 344,000 个概念,涵盖了 临床医学的大多数方面。
SNOMED (中文版)的结 构 SNOMED 是多轴编码的医学命名法, 有若干 独立的编码体系, 每一个轴可以用于描述同 一个诊断 全部术语分入 11 个独立的系统模块 ( 轴 ) 术语按照自然层次排列, 被分配 5 或 6 位代码 代码与术语一一对应, 标示术语的内在信息 组、上 下关系 通过使用 G( 链接词 / 修饰词 ) 模块, 可连接和 修饰每个模块术语、描述符及限定词。 词条的索引排列是按照编码顺序
SNOMED 的 11 个轴 轴定义说明 TMLCFJDPASGTMLCFJDPASG 局部解剖 形态学 微生物学 化学制品 功能 职业 诊断 过程 物理因素、力、作业 社会关系 一般状况 解剖术语 细胞、组织、器官 细菌和病毒 药物 体征和症状 描述职业的术语 诊断术语 管理、诊断和治疗过程 与疾病相关的设备和行为 医学上的社会条件和重要关系 语法连接和资格
例子 每一种疾病诊断包含局部解剖学代码、形 态学代码、微生物学代码和功能代码,确 切定义一种诊断需要 4 种代码复合。如诊断 代码 D - (链球性肺炎)等价于 T - 2800 (解剖代码、肺部), M - 4000 (形 态学代码、炎症), L - (微生物学 代码、链球菌)。
SNOMED 的应用 将人、兽医学术语进行结构化的分类和编 码, 使得原有的医学术语标准化, 为计算机处理 奠 定了基础 ; 标准化的、规范的应用医学术语将有利于 医学 信息共享和提高医疗质量 ; 术语代码拥有医学知识表达的许多特征, 具 开放式的数据结构, 可灵活地进行搭配、组 装、合成, 适用于电子病历, 并支持专家系统。
UMLS -统一的医学语言系统 美国政府投资,国立卫生研究院和国立医 学图书馆承担。 尝试从各种信息资源中提取和集成电子生 物医学信息。试图跨越病案系统、文献摘 要数据库、全文数据库及专家系统之间的 屏障。 提供了标准和其他数据和知识资源之间的 交叉参照,帮助解决许多医学信息交换中 的难题。
LOINC -观测指标标识符逻辑命名与编码系统 LOINC 数据库旨在促进临床观测指标结果的交换与 共享 LOINC 术语涉及用于临床医疗护理、结局管理和临 床研究等目的的各种临床观测指标。 LOINC 数据库实验室部分所收录的术语涵盖了化学、 血液学、血清学、微生物学(包括寄生虫学和病毒 学)以及毒理学等常见类别或领域;还有与药物相 关的检测指标,以及在全血计数或脑脊髓液细胞计 数中的细胞计数指标等类别的术语。 LOINC 数据库临床部分的术语则包括生命体征、血 液动力学、液体的摄入与排出等多类临床观测指标。
DRG -诊断相关分类系统 专门用于美国医疗保险预付款制度的分类 编码标准。它根据病人的年龄、性别、住 院天数、临床诊断、病症、手术、疾病严 重程度及转归等因素把病人划分到大约 500 个诊断相关组,然后决定给医院多少补偿。 由美国卫生保健财务管理署( HCFA )于 1983 年公布。 在医学经济学研究和医疗质量控制方面也 有应用。
HIPPA -医疗电子交换法案 美国联邦法律。 强制性标准。迫使美国医疗软件的大修改。 目的:改善病人、卫生服务部门和医疗保险部 门之间的信息交换,确保信息的可交换性、保 护病人的隐私权和数据的安全可靠。 HIPPA 具体包括: 电子化的病人医疗、管理和费用信息的标准化; 适用于个人、单位、健康计划和卫生保健服务供应 部门的唯一的标识符; 保护个人健康信息的隐私性和完整性的安全标准。
医学信息处理标准介绍
DICOM -医学数字成像和通信标准 在 DICOM 标准中详细定义了影像及其相关 信息的组成格式和交换方法,利用这个标 准,人们可以在影像设备上建立一个接口 来完成影像数据的输入 / 输出工作。 DICOM 标准以计算机网络的工业化标准为 基础,它能帮助更有效地在医学影像设备 之间传输交换数字影像,这些设备不仅包 括 CT 、 MR 、核医学和超声检查,而且还包 括 CR 、胶片数字化系统、视频采集系统和 HIS / RIS 信息管理系统等。
DICOM DICOM 标准中涵盖了医学数字图像的采集、 归档、通信、显示及查询等几乎所有信息 交换的协议;以开放互联的架构和面向对 象的方法定义了一套包含各种类型的医学 诊断图像及其相关的分析、报告等信息的 对象集;定义了用于信息传递、交换的服 务类与命令集,以及消息的标准响应;详 述了唯一标识各类信息对象的技术;提供 了应用干网络环境( OSI 或 TCP/IP )的服务 支持;结构化地定义了制造厂商的兼容性 声明( Conformance Statement )。
DICOM ACR (美国放射学会)和 NEMA (国家电子 制造商协会)联合组成委员会提出,它从 最初的 1.0 版本到 1988 年推出的 2.0 版本,到 1993 年发布的 DICOM 标准 3.0 ,已发展成为 医学影像信息学领域的国际通用标准。 目前,世界医学影像设备的主要供应商都 宣布支持 DICOM 标准。无论在提高医疗诊 断水平方面,还是在提高与医学影像及其 信息有关的经济效益方面, DICOM 标准的 出现为医疗机构带来全新的机会
HL7 HL7(Health Level Seven) 标准主要用于与卫 生保 健计算机系统有关的临床、银行、保 险、管理、行 政及检验等信息的交换。 HL-7 是由美国研究开发的一个专门用于医疗 卫 生机构及医用仪器设备数据信息传输的 标准, 是一种标准化的卫生消息传输协议。 HL7 组织参考 ISO, 采用开放式系统互联 (Open system interconnection, OSI) 的通信模式, 将 HL7 纳入通信最高层, 即第七层应用层。
HL7 -历史 1987 年 San Sohultz 提出 HL7, 成立 HL7 国际组 织,( 网站是 ) 1994 年美国 ANSI 承认 HL7 1996 年、 2000 年公布了 HL7 v2.3 和 v 年公布 HL7 v3.0 版
HL7 V3 HL7 V3 采用面向对象的建模技术 HL7 V3 考虑到信息交换过程中的安全性、 隐私性 HL7 V3 采用了多种信息表达技术如 XML , EDIFACT 等以增进系统间的互操作性。
HL7 -基本概念 HL7 规范包括两部分内容 信息模型定义 (RIM 模型 ) 信息如何封装、传递 (Infrastructure)
HL7 - RIM 模型
HL7 - Message Type 定义
HL7 - Infrastructure
HL7 -消息设计流程 ( 1 )建立用例( use case )模型; ( 2 )建立 RIM ; ( 3 )建立类之间信息交互模型; ( 4 )消息设计,获得等级消息描述; ( 5 )消息交换实现技术说明。
CDA - Clinical Document Architecture 是以临床文档交换为目的的,描述临床文 档的结构和语义的文档标记标准。 是 HL7 标准的一部分 分为 head 和 body 两部分
CDA R-MIM
openEHR OpenEHR 组 (Open Electronic Health Record Foundation , OpenEHR Foundation) 是成立于 2003 年的非营利组织。综合了英国、澳大利亚 及一些欧洲国家在电子健康档案方面的研究经 验,利用开源组件基于相关标准,设计可交互 操作的电子健康档案,并通过临床示例去验证 和完善。 OpenEHR 的主要目标有: 修正电子健康档案的规范; 改进和发布 OpenEHR 的信息架构和数据模型 ; 通过临床实践评价和确立 OpenEHR 原型; 实现互操作。
openEHR -框架
openEHR -两层模型
HER 领域模型
诊疗流程领域模型
IHE IHE ( Integrating the health enterprise )是工 作流程的标准,解决不同 IT 系统间的协同工 作问题,其应用将影响到整个医疗卫生行 业,是实现电子病历的关键性工具。 2002~2003 年,美国北美放射学会( RSNA ) 和美国卫生信息和管理系统协会( HIMSS ) 启动该项目,以集成不同的医疗 IT 系统 。
IHE 目前, IHE 主要应用在影像诊断和 PACS ,但 其方法学和实现技术正在被推广到整个行 业。 支持放射信息管理的 IHE 规则集( provision ) 有 14 个标准框架( profile )。
IHE
谢谢