& Amino Acid Catabolism 第三十章 蛋白质的降解和 氨基酸的分解代谢 Chapter 30 Degration of Protein & Amino Acid Catabolism 欧阳红生 动物生物技术系 吉林大学畜牧兽医学院 Email:biotechs@vip.sohu.com Tel:0431-7836175 Copyright © 2005 by Ouyang Hongsheng. All rights reserved.
主要内容: 蛋白质怎样分解成氨基酸 氨基酸又怎样进一步分解 主要内容: 蛋白质怎样分解成氨基酸 氨基酸又怎样进一步分解
一、蛋白质的降解 活细胞内的组分一直在更新(Henry Borsook和Rudolf Schoenheimer, 1940) 蛋白质的存活时间(life time): 短到几分钟,长到几星期或更长 功能: (1)排除不正常的蛋白质,它们一旦积聚,将对细胞有害; (2)通过排除累积过多的酶和调节蛋白,使细胞代谢的井然有序得以维持。
(一)蛋白质降解的特性 细胞有选择地降解非正常蛋白质 在网织红细胞中 Hb-α-氨基-β-氯代丁酸(缬氨酸类似物)半衰期10min 因此α-氨基-β-氯代丁酸用于治疗溶血性贫血 不同酶有不同的半衰期(half-life)
降解最迅速的酶都位于重要的代谢调控位点,而较为稳定的酶在所有生理条件下都有较稳定的催化活性。
(二)蛋白质降解的反应机制 1. 溶酶体(lysosome)无选择的降解蛋白质 溶酶体是具有单层膜被的细胞器,它含有约50种水解酶,包括不同种的蛋白酶,称之为组织蛋白酶。 溶酶体对细胞内各组分的再利用是通过它融合细胞质的膜被点块,即自体吞噬泡,并随即分解其内容物来实现的。溶酶体还降解一些物质,这些物质是细胞通过胞吞作用来利用的。 溶酶体阻断剂:氯代奎宁 组织蛋白酶阻断剂:抗蛋白酶 溶酶体降解蛋白质是无选择性的 许多正常的和病理的活动经常随伴溶酶体活性的升高
(二)蛋白质降解的反应机制 2. 泛肽(ubiquitin)给选择降解的蛋白质加以标记 真核细胞中蛋白质的降解:需要ATP、泛肽 泛肽是一个有76个氨基酸残基的蛋白质单体,由于在真核细胞中含量丰富,且无所不在,因而得名。 泛肽氨基酸序列高度保守。如人、蟾蜍、鳟鱼及果蝇等氨基酸序列完全相同,人与酵母只有3个氨基酸残基不同。
White ribbon represents the polypeptide backbone
被选定降解的蛋白质先加以标记。即以共价键与泛肽连接。这个程序的目的是标记氨基酸的活化,分三步进行。 E1:泛肽活化酶(Ubiquitin-activating enzyme) E 2:泛肽携带蛋白(ubiquitin-carrier protein) E3:泛肽蛋白质连接酶(ubiquitin-protein ligase)
蛋白质half-life的长短与其N末端残基的性质有关。 N末端规则(N-end rule): N端为Asp、Arg、Leu、Lys和Phe残基, 蛋白质的半衰期只有2-3min。 N端为Ala、Gly、Met、Ser和Val残基: 原核生物中蛋白质的half-life超过10h。 真核生物中蛋白质的half-life则超过20h。 N末端规则既存在于原核生物,也存在于真核生物中。
原核生物中没有泛素,但有其他更复杂的信号在选择蛋白质降解时也很重要,例:带有富含Pro(P)、Glu(E)、Ser(S)和Thr(T)残基片段的蛋白质可很快地被降解,这些片段称PEST序列片段,如果删除PEST序列的片段,可以延长蛋白质的half-life。
泛素化蛋白质的降解: 依赖于ATP 26S蛋白酶体(26s proteasome) (大的多蛋白质复合物)
(三)机体对外源蛋白质的需要及其消化作用 胃:胃蛋白酶 小肠:胰蛋白酶,胰凝乳蛋白酶、弹性蛋白酶、 羧肽酶(A、B)、氨肽酶。
二、氨基酸的分解代谢 氨基酸的分解一般有三步: 第一步脱氨(脱氨基),这里脱下的氨基或转化为氨,或转化为天冬氨酸或谷氨酸的氨基。 第二步氨与天冬氨酸的氮原子相结合,成为尿素并被排放。 第三步氨基酸的碳骨架(由于脱氨基产生的α-酮酸)转化为一般的代谢中间体。
1.氨基转移反应(transamination) (一)氨基酸的脱氨基作用 1.氨基转移反应(transamination) (Accepter keto acid) (Donor amino acid) (New keto acid) (New amino acid)
谷丙转氨酶(glutamic pyruvic transaminase,GPT), 谷草转氨酶(glutamic oxaloacetic transaminase,GOT) Glu Pyruvate GPT Ala α-Ketoglutarate (α-KG)
2.葡萄糖-丙氨酸循环,氨运入肝脏 肌肉氨基转移酶,把丙酮酸当作α-酮酸的底物。即在它们的催化下得到的产物为丙氨酸。丙氨酸被释放进入血流,并被传送到肝脏。在肝脏中经过转氨基作用,产生丙酮酸,用于萄糖异生作用,形成葡糖又回到肌肉中,称之为葡萄糖-丙氨酸循环(glucose alanine cycle)。
(二)氧化脱氨基作用:谷氨酸脱氨
催化氨基酸氧化脱氨的酶: L-氨基酸氧化酶: D-氨基酸氧化酶: 专一性氨基酸氧化酶: L-谷氨酸脱氢酶(L-glutamate dehydrogenase)
L-谷氨酸脱氢酶: 结构:相对分子质量330 000,脊椎动物此酶由6个相同亚基构成。 分布:Liver,Kidney,Brain 不需氧脱氢酶,辅酶:NAD+ or NADP+ 别构抑制: GTP、ATP 别构 激活: GDP、ADP
(三)其他的脱氨基作用 (四)联合脱氨基作用
联合脱氨 通过转氨和氧化脱氨联合作用进行脱氨 联合脱氨 通过转氨和氧化脱氨联合作用进行脱氨 α-KG 谷氨酸脱氢酶 转氨酶 谷氨酸
嘌呤核苷酸循环 骨骼肌、心肌、肝脏以及脑的脱氨方式以嘌呤核苷酸循环为主。
(五)氨基酸的脱羧基作用
(六)氨的命运 氨对生物体有毒,因此氨的排泄是生物体维持正常生命活动所必需的。 微生物和某些水生或海洋动物排氨 绝大多数陆生动物将脱下的氨转变成尿素,排尿素。 鸟类和陆生爬行动物排尿酸。
Uric acid NH4+ Urea
(六)氨的命运 1.氨的转运 氨通常要与谷氨酸反应生成谷氨酰胺(中性,易通过细胞膜),经血液运输到肝脏。在肝脏再生成谷氨酸和氨,氨用于合成尿素。 在肌肉中,谷氨酸和丙酮酸生成丙氨酸和α-酮戊二酸,丙氨酸经血液运输到肝脏。在肝脏中,丙氨酸和α-酮戊二酸又生成谷氨酸和丙酮酸,丙酮酸转化为葡萄糖,谷氨酸氧化脱氨基,氨用于合成尿素。
(六)氨的命运 1.氨的转运 2.氨的排泄 (1)排氨动物由氨基酸的α-氨基形成的氨,经谷氨酰胺形式运送到排泄部位,如鱼类经鳃排氨. (2)排尿素动物在肝脏中合成尿素,经肾排出体外.
三、尿素的形成 氨的去路:合成酰胺、合成氨基酸、合成嘌 呤,合成嘧啶, 但绝大部分是排到体外。
Urea Biosynthesis 1932,德国学者Hans Krebs提出尿素循环(urea cycle)或 鸟氨酸循环(ornithine cycle)。 Urea Ornithine Citrulline Arginine
1. 氨甲酰磷酸的合成 2. 瓜氨酸的合成 3. 由瓜氨酸合成精氨基琥珀酸 4. 生成Arg 5. Arg的水解
(1)HCO3-被磷酸化而活化,形成一个假设的中间体,羰基磷酸; (2)NH3向碳基磷酸进攻,形成氨基甲酸酯 (3)氨基甲酸酯受ATP作用发生磷酸化反应,产生氨甲酰磷酸
尿素循环总结 总方程式
尿素循环的调控 氨甲酰磷酸合成酶 I 受N-乙酰-谷氨酸别构激活。
尿素循环的调节 尿素循环的第一步反应由氨甲酰磷酸合成酶催化,该酶是调控尿素循环的关键酶,其别构效应剂是N-乙酰谷氨酸。 N-乙酰谷氨酸是在N-乙酰谷氨酸合酶的催化下,由谷氨酸和乙酰-CoA合成的,体内氨的浓度增高时,谷氨酸的浓度会增高,引起N-乙酰谷氨酸合成的增加, N-乙酰谷氨酸激活氨甲酰磷酸合成酶,使尿素循环加速。
尿素循环的调控 氨甲酰磷酸合成酶 I 受N-乙酰-谷氨酸别构激活。 其余酶受底物浓度的调控 尿素循环的其他酶由他们的底物控制,除精氨酸酶外,其他酶的不足使底物增加,引起反应速度的增加,因此,尿素的生成量不会有很大的降低,但底物浓度过高,会使尿素循环逆行,血氨浓度增高,引起高血氨症。 高血氨症可能是α-酮戊二酸含量过低,影响了柠檬酸循环,另外,谷氨酸被转化为谷氨酰胺,使其含量下降,会影响神经传导(谷氨酸和γ-氨基丁酸是重要的神经递质)。 尿素循环的任何一种酶完全丧失,会使新生儿死亡。
酮酸的代谢去路 1. 合成新氨基酸 2. 转变成糖和脂肪 3. 直接氧化成H2O和CO2
四、氨基酸碳骨架的氧化途径 (一)形成乙酰-CoA的途径 (二)α-酮戊二酸途径 (三)形成琥珀酰-CoA的途径 (四)形成延胡索酸途径 (五)形成草酰乙酸途径
(一)形成乙酰-CoA的途径 (二)α-酮戊二酸途径 (三)形成琥珀酰-CoA的途径 (四)形成延胡索酸途径 (五)形成草酰乙酸途径
(一) 形成乙酰-CoA的途径 1. 经丙酮酸形成乙酰-CoA
由丝氨酸生成丙酮酸的机制
2. 经乙酰乙酰-CoA到乙酰-CoA的途径
异戊酰辅酶A Α-酮异己酸 β -羟基β-甲基戊酰辅酶A 戊酰辅酶A
尿黑酸症 苯酮尿症 酪氨酸血症 尿黑酸
(二) α-酮戊二酸途径 吡咯烷-5-羧酸
(三) 形成琥珀酰-CoA的途径
(四) 形成延胡索酸途径 (五) 形成草酰乙酸途径
五、生糖和生酮氨基酸 生糖氨基酸(Glucogenic amino acids): 生酮氨基酸 (Ketogenic amino acids): 生糖兼生酮氨基酸or生酮兼生糖氨基酸 (Glucogenic and ketogenic amino acids):
生糖生酮aa: Ile, Tyr, Trp phe
六、由氨基酸衍生的其他重要物质 (一)氨基酸与一碳单位 生物体内具有一个碳原子的基团称为“一碳单位”。如亚氨甲基、甲酰基、羟甲基、亚甲基(甲叉基)、次甲基、甲基 许多氨基酸都可作为一碳单位的来源。如甘氨酸、苏氨酸、丝氨酸和组氨酸 一碳单位参与嘌呤和嘧啶的生物合成以及S-腺甘甲硫氨酸的生物合成 一碳单位的转移靠四氢叶酸
六、由氨基酸衍生的其他重要物质 (二)氨基酸与生物活性物质
七、氨基酸代谢缺陷症
Phe、Tyr的代谢: Phe、Tyr的代谢是否正常和遗传病的关系十分密切,不少先天性代谢病就是由于这二种氨基酸代谢发生障碍的缘故,例如苯丙酮尿症、酪氨酸症、黑尿症和白化病。 分解代谢 : 合成代谢 :
苯丙酮尿症(phenyl ketonurin, Pku): 缺乏Phe羟化酶,Phe不能羟化成Tyr。
酪氨酸症:缺乏4-羟苯丙酮酸二氧合酶,造成尿 中有对一羟苯丙酮酸和它的还原产物 对羟苯乳酸及Tyr。 尿黑酸症:缺乏尿黑酸二氧合酶,造成尿黑酸的 积累。 白化病:缺乏Tyr酶,造成黑色素的缺乏。
(七)氨基酸代谢缺陷症
基本要求 1.熟悉蛋白质的降解途径。 2.掌握氨基酸脱氨基和脱羧基作用的途径。(重点) 3.掌握尿素的合成途径。(重点) 4.熟悉氨基酸碳骨架的氧化途径。 5.熟悉由氨基酸衍生的其他重要物质的合成。 6.熟悉重要的氨基酸代谢缺陷症。