网络生物医学文献数据库 PubMed的简介与使用方法 小组成员：于达夫、郑宇、 李晓彤、张金伟、石玉杰

http://www. ncbi. nlm. nih. gov/sites/entrez. db=pubmed http://www http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=pubmed http://www.pubmed.org 1997年6月起提供全免费服务 347 providers, 8149 journals 19 million citations from MEDLINE, life science journals, and online books

一、概述 （一）数据来源 1. MEDLINE (1966~至今) 2. PreMEDLINE 3 一、概述 （一）数据来源 1. MEDLINE (1966~至今) 2. PreMEDLINE 3. Publisher supplied citations 4. Oldmedline(1951~1965)

数据库简介 PubMed是美国国立医学图书馆(NLM) 的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统。 收录1966年以来的包含医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统及前临床科学的文献。这些数据来源于70多个国家和地区的4000多种生物医学期刊。 数据类型：期刊论文、综述、以及会议论文等。

MEDLINE 收录了全世界70多个国家和地区1950年以来的5000余种生 物医学期刊，目前文摘条目1900万篇，年报道量近40万 条，英文刊物占90%、3/4的文献有英文摘要，每周更新。 内容涉及：医学、药学、牙医学、护理学、卫生保健、兽 医学等专业。 记录标注[PubMed - indexed for MEDLINE]

PreMEDLINE 临时性医学文献数据库，每天接收 新数据，经MeSH词表标引后，每 周向Medline库移加一次。 记录标注[PubMed - in process]

Publisher Supplied Citation 出版商直接向PubMed递送的电子文献。 其中有一部分在Medline中未收录。 记录标注[PubMed - as supplied by publisher]

字段标识符（54个） AB-Abstract LA-Language AD-Affiliation MH-MeSH Terms AU-Authors PMID-PubMed Unique Identifier CY-Country PT-Publication Type DP-Publication Date l SO-Source EDAT-Entrez Date TA-Journal Title Abbreviation GS-GeneSymbo TI-Title IS-ISSN UID-Unique Identifiers

格式：检索词[字段标识符] smith jc[au] lancet[ta] gene therapy[ti]

PubMed的特点 1. 能获取到当月、甚至当日发表的最新文献、以及 1966年以前的文献。 2

二、检索规则 （一）Automatic Term Mapping：词汇自动转换 1、MeSH Translation table Vitamin c 转换为: "ascorbic acid"[MeSH Terms] OR ("ascorbic"[All Fields] AND "acid"[All Fields]) OR "ascorbic acid"[All Fields] OR "vitamin c"[All Fields] 想要查验检索词的转换情况，并进行调整和保存检 索策略，可看右下角的“search details”按钮

（一）Automatic Term Mapping 2、Journals Translation table （一）Automatic Term Mapping 2、Journals Translation table . New England journal of medicine 转换为 “N Engl J Med”[Journal] Clin Lung Cancer. 2010 Jan;11(1):51-6. .三种不同表达方式 刊名全称、MEDLINE刊名缩写格式、ISSN

（一）Automatic Term Mapping 3、Phrase List （一）Automatic Term Mapping 3、Phrase List . Cold compresses 在前两个表中均未找到，便在短语列表中找到 这个词

（一）Automatic Term Mapping 4、Author Index （一）Automatic Term Mapping 4、Author Index .姓前（全称）、名后（首字母缩写）smith jc 当一个短语在前三个表中都找不到匹配词，并且 有1或2个字母在词后时，PubMed就会到作者索引 中查找。

如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的词时， PubMed就将短语劈开，用AND 将短语中的单个词连 接起来在全部字段中查找，直到找到相应的词为止。 例：pressure point转换为("pressure"[MeSH Terms] OR "pressure"[All Fields]) AND point[All Fields]

（二）短语检索 .如果在短语上加双引号，系统将只在Phrase List中查找，不再进行转换。 例如：“single cell” “oxygen free radicals”

（三）布尔逻辑运算： . AND、OR、NOT必须大写。 lung AND apoptosis; vitamin c OR ascorbic acid；Lead poising NOT children . 运算优先级为: ()> NOT > AND > OR。 例如：drug therapy AND （asthma OR hay fever） . 布尔逻辑检索允许在检索词后面附加字段标识 例如：dna[mh] AND crick[au] AND 1993[dp] . 查带文摘的文献（1975年以后出版的文章） 检索词AND hasabstract 例如，Neoplasms AND hasabstract

（四）截词检索：* .例：输入infect*，可检出infection、 infectious,infective,infectivity,infector等 截词检索只限于单词，对词组无效，

三、检索途径与方法. 基本检索- Basic Search. 高级检索- Advanced Search 三、检索途径与方法 . 基本检索- Basic Search . 高级检索- Advanced Search . 限定检索- Limits Search . 期刊检索– Journal Databases . 主题词检索- MeSH Databases . 引文匹配- Citation Matcher . 临床查询– Clinical Queries

PUBMED检索途径 一、基本检索区 二、辅助检索区 三、个性化检索区

PubMed主页 基本检索区 辅助检索区提供辅助检索功能 个性化检索区

一、基本检索 可对任何具有实质意义的词都可以进行检索，如: 1.词语检索 自动匹配功能 2.精确检索 用“ ”进行强制短语检索 1.词语检索 自动匹配功能 2.精确检索 用“ ”进行强制短语检索 3.截词检索 用通配符 ？，*检索 4.逻辑组配检索 AND OR NOT 5.作者检索 6.期刊检索

一、基本检索 1.词语检索 自动匹配转换.

自动匹配转换功能 主题词索引 作者索引 期刊索引 自动匹配转换过程.

一、基本检索 2.精确检索 强制将其作为一个词组检索

一、基本检索 3.截词检索 无限截词检索

一、基本检索 3.截词检索 有限截词检索

一、基本检索 4.逻辑组配检索 逻辑组配检索

（1）通过“limit”的”search by author” 一、基本检索 5.作者检索 （1）通过“limit”的”search by author”

一、基本检索 5.作者检索 （2）用字段限定[au]检索

一、基本检索 5.作者检索 （3）通过系统自动匹配功能自动检索

一、基本检索 6.期刊检索 （1）用字段限定[ta]检索

一、基本检索 6.期刊检索 （2）通过系统自动匹配功能自动检索

（3）通过“limit”的“search by journal” 一、基本检索 6.期刊检索 （3）通过“limit”的“search by journal”

一、基本检索 6.期刊检索 （4）通过“期刊数据库”检索

一、基本检索 6.期刊检索

一、基本检索 6.期刊检索 发送至检索恇 点击选中

一、基本检索 6.期刊检索 点击执行检索

一、基本检索 6.期刊检索 检索结果

二、辅助检索区 1.Limit （限定检索） 2.Preview/index（预览/索引） 3.History（检索史） 4.Clipborard（剪贴板） 5.Detail（检索式详览）

1.Limit 对检索结果进行多重限定 清除限定 作者限定 添加作者姓名输入框 作者姓名索引选词 多作者逻辑匹配选项 期刊限定 全文、免费全文、摘要限定 日期限定

出版日期限定 入库日期限定 研究对象 人/动物限定 研究对象性别限定 语种限定 子文档限定 文献类型限定 研究对象年龄限定

检索字段限定 执行检索 清除所有限定

2.Previw/index（检索策略预览） 浏览检索式 改变检索式 （可用检索式编号#1 OR #2） 浏览索引（index）

检索预览 检索历史 索引加词检索

步骤1 点击预览和索引 步骤2 输入待选词 步骤4 确定与检索栏中检索提问的逻辑关系 步骤3 索引选词

3.History（检索史） 检索式回顾 编辑检索式 如#3 AND child

检索式编号可替代检索式进行输入检索如：#5 AND #6 检索历史回顾 检索时间 检索式 检出篇数 检索式编号可替代检索式进行输入检索如：#5 AND #6

4.Clipboard（剪贴板） 用于暂时存放选中的文献，以备集中显示、打印或存盘。 检索时间

4.Clipboard（剪贴板） 点击剪贴板显示被剪贴的内容

5.Details （匹配过程） 显示检索词转换匹配运算详细过程 用途：转换、确定规范词 如：liver cancer liver neoplasms 修改检索策略

5.Details （匹配过程） 检索明细 显示数据库自动匹配转换过程 检索词转换 显示用户输入的检索式

三、个性化检索 1.Mesh Database 2.引文匹配器 3.临床问题

三、个性化检索 1.Mesh Database 确定规范检索词 查看词义注释、树状结构表 副主题词、扩展、主要主题词 例：欲查肾衰竭的饮食疗法相关文献？

MeSH Database 规范主题词数据库检索肾衰竭饮食疗法课题 2.执行浏览 1.输入检索词 3.点按规范词可获详细注解

主题词注释 可选副主题词 限定作为主要主题词匹配 不进行下位词扩检

主题词树形结构表：显示该词的学科隶属关系 该主题词所替代的非规范词形式 主题词树形结构表：显示该词的学科隶属关系

选择检索 可选副主题词

点击执行检索

检出结果更为专指 通过MeSH Database 检索的结果，其中4篇综述文献

2.引文匹配器 （Citation Matcher）: Single citation matcher（单篇引文匹配器） 查找特定文献进行补缺，以查文献的准确信息。如查找：由Chang PY（taiwan yi xue hui za zhi ) 撰写、 1975 发表文献的其他著者 Batch citation matcher（批量引文匹配器）

特定文献查找（已知文献第一著者，欲查其他信息如其他著者等） 输入待检刊名 输入待检第一著者 特定文献查找（已知文献第一著者，欲查其他信息如其他著者等）

得出其他著者

插入文件 输入EMAIL地址 输入已知文献信息 用于核对批量文献信息

3.临床问题（Clinical Queries) 专门为临床医生设计的一种检索服务， Search by clinical study category Find systematic reviews Special queries

3.临床问题（Clinical Queries) 用于临床问题的检索

3.临床问题（Clinical Queries) 输入检索词 检索设置

3.临床问题（Clinical Queries) 检索结果

检索结果输出 显示检索结果 保存检索结果 保存检索策略 打印检索结果

显示字段选择（Display) Abstract :来源期刊、标题、著者、著者地址、记录性质、文献类型、勘误、评论、PMID或UI、摘要。 Summery：作者 Citation : 显示除上述内容外，加MeSH叙词、化学物质名称、资助项目号等字段。 MEDLINE : (最完整，有标识符）

显示字段选择（Display) 显示格式选择

记录选择 单一记录：著者姓名 所有记录： 选定记录: 方框内打钩

输出格式选择（send to） 选中题录（或文摘）后 Text： 文本格式，用浏览器文件保存 File ： 文件格式保存 Clipboad ：暂存需下载记录，多项检索后一起保存。 最多允许存储500条，保留8小时。 Email： 通过邮件发送 Other： 全文传递服务等申请，需帐号、收费

获取原文及相关资源 1.联机获取原文（ free full text article） 2. link out 3.向有关图书馆索要 4.其他数据库资源（生物信息学等）

文摘中的期刊图标链接

Linkout链接

点击获取原文

检索实例 1.哮喘的药物治疗（asthma, drug therapy） asthma/drug therapy 2.阿司匹林治疗心肌梗死（aspirin, therapeutic use, myocardial infarction, drug therapy） aspirin/therapeutic use AND myocardial infarction/drug therapy

1.哮喘的药物治疗 选择MeSH Database 输入检索词（单词、词组） （不能输有运算符的语句如：asthma AND therapy）

点击相关规范词

选择检索 选择副主题词

执行检索

检索结果 题录：著者、篇名、刊名

2.阿司匹林治疗心肌梗死 首先，将概念切分成2个面： Aspirin/治疗应用 心肌梗死/药物治疗 然后，分别进行规范词选择检索

这里是第一个概念面检出的文献，18885条记录

第二个概念面进行规范词选择检索

这是第二个概念面检出的结果10112条记录

在检索历史中进行2个概念面的编辑检索（注意逻辑符AND大写）

这是2个概念面逻辑AND的检索结果 1003条记录

再进行限定检索 限定文献发表的时间

可以输入具体时间年、月、日

这是两个概念2005年-2006年逻辑AND检索结果77条记录