吉林大学农学图书馆 沈洪杰

主 要 内 容 1 2 3 4 5 初识Pubmed 检索规则 检索方法 个性化使用 检索举例 模板来自于 http://meihua.docer.com/ 个性化使用 4 检索举例 5 2

1.1 1.2 1.3 1.4 1 初识Pubmed 基本知识 数据来源 发展历程 特点 模板来自于 http://meihua.docer.com/ 1.3 发展历程 1.4 特点 3

1.1 基本知识 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed http://www.pubmed.gov NIH 美国国立卫生研究院(National Institutes of Health) NLM 美国国立医学图书馆(National Library of Medicine) NCBI 美国国立生物技术信息中心( National Center for Biotechnology Information ) Entrez资源整合系统 NCBI所提供的在线资源检索器。 该资源将GenBank序列与其原始文献出处链接在一起。 包括核酸，蛋白以及Medline文摘数据库等。

1.1 基本知识 Medline NLM生产的国际性综合生物医学信息书目数 据库，是当前国际上最权威的生物医学文献数据库。 内容包括美国《医学索引》（Index Medicus, IM） 的全部内容和《牙科文献索引》（Index to Dental Literature）、《国际护理索引》（International Nursing Index）的部分内容。 PubMed是由美国国立医学图书馆(NLM)下属国家生物 技术信息中心(NCBI)开发的基于Web的生物医学信息 检索系统。收录自1966年来源于80多个国家和地区的 5000多种生物医学期刊的文摘及题录，涉及医学、护 理、牙科、兽医、药理学、保健等领域。现有2400万 余条文献,类型有期刊论文、综述、会议论文等。

1.2 数据来源 MEDLINE Indexed 1966 to prensent的MEDLINE已标引数据，有MeSH字段和摘要，每条记录标有：[PubMed-indexed for MEDLINE] OldMEDLINE 1949-1965年间的MEDLINE数据，无MeSH字段和摘要，每条记录标有：[PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966] MEDLINE Inprocess 最新的MEDLINE处理中数据，未标引，无MeSH字段。每条记录标有：[PubMed-in process] Publisher-Supplied 出版商提供的电子文献题录，每条记录标有: [PubMed-as supplied by publisher]

1.3 发展历程

1.4 特点 免费提供题录和文摘 每条记录均有唯一的识别号PMID(PubMed Unique Identifier) 可与提供原文的网址链接(可免费获取PMC和OA期刊的文 献以及部分出版商提供的免费期刊文献） 提供检索词自动转换匹配（对输入检索框中的检索词进 行智能化校对，将其逐步地与其数据库中的各类术语匹 配的原则） 更新速度快，数据实时更新 个性化服务（My NCBI）

2 检索规则 模板来自于 http://meihua.docer.com/ 10

2 检索规则 逻辑运算符 AND（与） OR（或） NOT（非） 同时输入多个检索词,系统默认检索词间的逻辑关系为 AND,逻辑运算符优先级别 （ ）>NOT>AND>OR 如：aspirin and diabetes，将检索出同时包含阿司匹林和 糖尿病两个检索词的文献；hypertension therapy NOT nifedipine，将检索关于高血压治疗但不含硝苯地平的文献。 截词检索功能 * 作为通配符进行截词检索,截词检索只限单词，对词 组无效。 如：bacter*，系统会找到前一部分是bacter的单词，如 bacteria、bacterium等。

2 检索规则 短语精确检索 用双引号强制系统执行精确检索,此时系统自动关 闭词语匹配功能。如：“oxygen free radicals”,不 再自动转换和扩展检索。 著者检索 姓前名后，姓用全称，名用首字母或全称。如 Smith SR[au],Hu, Da yi[fau] 字段限定检索 在检索词后输入检索字段标识进行字段限定检索， 提高查准率。如 作者[AU] 语种[LA]

2 检索规则 词语自动转换 Automatic Term Mapping， PubMed对输入的检 索词进行智能化校对，逐步与数据库中各类术语匹配。 （1）MeSH转换表，包括MeSH词、参见词、副主题词等。 如 vitamin h—”biotin”[MeSH Terms] OR “biontin”[All Fields] OR “vitamin h”[All Fields] （2）刊名转换表，包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。 如 new england joumal of medicine----“N Engl J Med”[Joumal] OR “new England journal of medicine”[All Fields] （3）著者索引，如果键入的词语未在上述各表找到匹配的词， 或键入的词后面跟有1--2个字母，PubMed即查著者索引。 如 Smith JA----Smith JA[Author]

MeSH Translation Table Journals Translation Table 2.4检索规则----词语自动转换 如果仍找不到匹配 词，PubMed会把该词断 开后再重复上述自动词 汇转换过程，直到找到 与键入的词语相匹配词 语为止。若仍然没有匹 配词，单个词会被联在 一起（用AND）在全部字 段中检索。 MeSH Translation Table 主题词注释表 Journals Translation Table 期刊注释表 Common Phrase List 常用词组表 Author Index 作者索引表 No Mapping 检索词拆分AND

检索规则----词语自动转换 ("oxygen"[MeSH Terms] OR "oxygen"[All Fields]) AND ("free radicals"[MeSH Terms] OR ("free"[All Fields] AND "radicals"[All Fields]) OR "free radicals"[All Fields]) 以下两个条件同时满足： 1 “oxygen”[MeSH Terms] ，“oxygen”[All Fields]， 这 二者至少匹配（出现）一个。 2“free radicals”[MeSH Terms] ，(“free”[All Fields] AND “radicals”[All Fields]) ，“free radicals”[All Fields])这三者至少匹配（出现）一个。

与精确检索对比（无词语自动转换匹配）

3.1 3.2 3.3 3.4 3.5 3.6 3 检索方法 基本检索 高级检索 主题词检索（MeSH） 期刊检索 单篇引文匹配检索 模板来自于 http://meihua.docer.com/ 3.4 期刊检索 3.5 单篇引文匹配检索 3.6 临床查询 主题词检索 17

Pubmed主页 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed 基本检索 高级检索 主题词检索 单篇引文匹配器 期刊检索 临床试验 临床查询

3.1基本检索

检索结果的排序与显示

3.2 高级检索 编辑框 检索框 检索历史

3.2 高级检索 查找吉林大学张西臣老师发文情况。

检索结果的显示----Filter过滤器

检索结果的分组分析----Filter过滤器

3.3 主题词检索 MESH 《医学主题词表》(Medical Subject Headings，简称 MeSH)，是NLM编制的权威性主题词表。它是一部规范化的可 扩充的动态性叙词表，是生物医学标引的依据，用于编制《医 学索引》（Index Medicus）及建立MEDLINE数据库。 《MeSH》汇集约18,000多个医学主题词。 在进行检索时，用户输入一个主题词后，系统会自动显示该主 题词所能组配的副主题词。《MeSH》有一个副主题词表，副 主题词(Subheadings)又称限定词(Qualifiers)，与主题词进行 组配，对某一主题词的概念进行限定或复分，使主题词具有更 高的专指性。 如 肺发育不全，输入主题词“肺”后，在副主题词菜单中选择“畸 形”表示发育不全；副主题词治疗应用therapeutic use 与药物、 生物制品和物理作用物主题词组配。指用于预防和治疗疾病， 包括兽医用药。

3.3 主题词检索 gene therapy

3.4 期刊检索 Veterinary and comparative oncology

3.5单篇引文匹配检索 gene therapy 1999 mitochondrial gene therapy

3.6临床查询 cholecystitis 临床研究类文献 系统评价 医学遗传学

4 个性化使用 模板来自于 http://meihua.docer.com/ 30

4 个性化使用

5 检索举例 模板来自于 http://meihua.docer.com/ 32

查找近五年来关于丹参治疗心脏病 的临床实验研究文献和综述文献。 检索举例 查找近五年来关于丹参治疗心脏病 的临床实验研究文献和综述文献。

检索举例----课题分析 本题涉及“丹参”、“心脏病”、“临床试验研 究”三个概念，前两个是文献内容概念，“临床试 验研究”、“综述”是对文献类型的限定。 主题词检索步骤：进入主题词检索页面，依次 查找心脏病和丹参的主题词，确定逻辑关系，将两 个主题词依次添加到主题词构建器，点击执行检索。 在检索结果显示页面左侧的结果过滤器，可以 看到临床实验和综述文献的数量，点击五年内5 years ，可浏览相关临床实验研究和综述文献。 在检索结果中筛选符合条件的文献。

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