第七章 基因突变 基因突变:由于DNA分子中碱基所发生的改变,导致DNA分子结构发生稳定的改变。
基因突变的修复方式:
第一节 基因突变的类型 体细胞突变(somatic mutation) 生殖细胞突变(germ-line mutations) 转换(transition)是指同类碱基之间的替换。 颠换(transversion mutation)是嘌呤与嘧啶之间的替换。 突变类型
从对遗传信息的改变看: 1、同义突变:没有改变产物氨基酸序列 的密码子变化。 2、错义突变:碱基序列的改变引起了产物 点突变中的碱基替代突变可进一步分为: 1、同义突变:没有改变产物氨基酸序列 的密码子变化。 2、错义突变:碱基序列的改变引起了产物 氨基酸序列的密码子变化。 3、无义突变:产生终止密码子的突变。 无义突变中产生UAG的为瑚珀型Amb 无义突变中产生UAA的为赫石型Och 无义突变中产生UGA的为乳石型Opa
中性突变(neutral mutation)多肽链中相应位 点发生的氨基酸的取代并不影响蛋白质的功能; 沉默突变(silent mutation)蛋白质中相应位点 是发生了相同氨基酸的取代,即同义突变。 移码突变(frameshift mutation)由于碱基数目 的改变所引起的密码子阅读框架发生改变。
回复突变与抑制突变 回复突变(reverse mutation), 一类是正向突变(forward mutation)突变方向是从野生型向突变型;另一种是回复突变,其突变方向是从突变型向野生型 抑制突变(suppressor mutation)突变的作用还可以通过其它位点的突变而得到减少或校正。
抑制基因所引起的抑制突变----基因间抑制 抑制基因(suppressor)或称校正基因: 能够逆转或抑制另一个突变效应的基因。 (一)无义抑制(nonsense suppressor) 产生互补于由于突变所产生的无 义密码子的tRNA反密码子的突变 1. tRNA反密码子的突变 2. tRNA其它结构的改变
(二)错义抑制 产生能够互补于由于突变而产生的错义密码子的tRNA反密码子的突变 1.完全恢复活性------氨基酸种类不变 2.部分恢复活性------氨基酸种类变化
(二)错义抑制
抑制突变的特点: 1.不是所有抑制基因都能产生有功能的蛋白质,关键是要看氨基酸取代的情况。 2. 校正的作用不可能是完全的。 ①校正的tRNA分子是有限的而且还要和释放 因子竞争; ②若是错义抑制的话,由于氨基酸发生取 代,使得蛋白质的活性有所降低。 3. 每种抑制tRNA一般都只识别UAG终止密码子,而不再识别原来相应的密码子。
4. 当细胞中含有多个tRNA拷贝时,抑制才能发挥作用。 5. 有的抑制基因,不仅可以识别终止密码子,而且还可以识别原来的密码子。如野生型tRNATrp的反密码子是CCA,它可以识别原来的密码子UGG,而且还可以识别终止密码子UGA。
6.校正基因一般不会影响正常的终止 (1)校正基因识别的终止密码子不一定和正常终止的密码子相同。有时正常终止位点有两个连续的终止密码子,而且结构不同,如UAG-UAA; (2)释放因子将和抑制基因竞争和终止密码子的结合; (3)抑制基因的效率很低,通常为1~5%,所以常不会抑制正常终止。
第二节 突变的原因 一.自发突变(spontaneous mutations) 突变率(mutation rate)是指在单位时间内某种突变发生的概率. (一) DNA复制错误 (二) 自发的化学变化 1. 脱嘌呤(depurination) 2. 脱氨(基)(deamination)作用 3. 氧化作用损伤碱基(oxidatively damaged bases)
(一)DNA复制错误
(二) 自发的化学变化 1.脱嘌呤
2.脱氨基
3.氧化损伤 过氧化物原子团(O2-) (H2O2),(-OH)等需氧代谢的副产物都是有活性的氧化剂, 它们可导致DNA的氧化损伤, T氧化后产生T-乙二醇, G氧化后产生8-氧-7,8二氢脱氧鸟嘌呤
二. 诱发突变 (一) 放射线 紫外线、 X-射线、 γ射线、 宇宙射线 (二) 化学物质 1.碱基类似物 (1) 5-溴尿嘧啶(5-bromouracil,5-BU) (2) 氨基嘌呤(2-aminopurine 2-AP) (3) 迭氮胸苷(AZT, azidothymidine)
2.碱基的修饰剂 (1) 亚硝酸(introus acid, NA) (2) 羟胺 (3) 烷化剂,它们的作用是使碱基烷基化 3.DNA插入剂 原黄素(proflavin) 吖啶橙(acridine orange) 溴化3,8-二氨基-5-乙基-6-苯基菲啶鎓 (etnidium bramide) ICR的复合物等
(一) 紫外线诱发胸苷二聚体
(二) 化学物质 1.碱基类似物 (1)5-溴尿嘧啶和T很相似,仅在第5个碳元子上由Br取代了甲基 5-BU有,酮式,烯醇式两种异构体,可分别与A及G配对结合
(2) 2-氨基嘌呤(2-AP)也是碱基的类似物,有正常状态和稀有状态两种异构体,可分别与T和C配对结合。当2-AP掺入到 DNA复制中时,由于其异构体的变换而导致A∶T G ∶ C
2. 碱基的修饰剂 (1) 亚硝酸(introus acid, NA)有氧化脱氨作用,可使G第2个碳原子上的氨脱去,产生黄嘌呤(xanthine,x),次黄嘌呤 (H) 仍和C配对,故不产生转换突变。但C和A脱氨后分别产生U和次黄嘌呤H,产生了转换,使C∶G转换成A∶T,A∶T转换成G∶C
(2)羟胺只特异地和胞嘧啶起反应,在第4个C原子上加-OH,产生4-OH-C,此产 物可以和A 配对,使C∶G转换成T∶A
(3)烷化剂如甲基黄酸乙脂(EMS),氮芥(NM),甲基黄酸甲脂(MMS),亚硝基胍(NG)等,它们的作用是使碱基烷基化,EMS使G的第6位烷化,使T的第4位上烷化,结果产生的O-6-E-G和 O-4-E-T分别和T、G配对,导致G∶C对转换成A∶T对;T∶A对转换成C∶G
3.DNA 插入剂
4. 体外定点突变 1985年加拿大的Michael Smith建立,于1993年获得了诺贝尔化学奖。 具体方法有三种: (1)聚核苷酸介导的用单链模板定点突 变; (2)双引物法定点突变; (3)用掺入U的单链为模板进行聚核苷 酸介导的体外定点突变。
第三节 DNA的修复机 一.直接修复(Direct repair) (一) 通过DNA聚合酶校正修复 (二)光复活反应 光复活(photoreactivation)或光修复(light repair) 光裂合酶(photolyase),由phr 基因编码 烷基转移酶(Alkyltransferases)
二. 切除修复(excixion-repair) (一) 一般切除修复 切除修复(excixion-repair) 暗修复(dark repair) 短-补丁修复(short-patch repair) 长-补丁修复(long-patch repair) 着色性干皮病(Xeroderma pigmentosum)是一种切除修复酶的缺陷
在E.coli中的切除修复系统 切除:外切酶除去切口间的DNA 损伤:突变的碱基错配或改变DNA结构 合成:DNA pol 合成取代DNA 剪切:内切酶在损伤碱基位点两侧剪切 连接酶封闭缺口
Uvr系统在修复各阶段中的作用 UvrAB识别损伤; UvrBC在DNA上切一缺口; UvrD使被标记区解旋
(二) 特殊切除修复途径 (1) AP核酸内切酶修复途径 AP位点 :无嘌呤(apurinic)和 无嘧啶(apyrimidinic)位点 (2) 糖基酶修复途径
三、复制后修复 (一) 错配修复(mismatch repair) (1) 识别错配的碱基对; (2) 对错配的一对碱基要能准确区别哪一个 是错的,哪一个是对的; (3) 切除错误的碱基,并进行修复合成。
MutS识别错配 位点,并易位到 GATC位点。 MutH在GATC 位点剪切非甲 基化链,内切酶从GATC到错配位点降解 DNA MutL MutS识别错配 位点,并易位到 GATC位点。 MutH在GATC 位点剪切非甲 基化链,内切酶从GATC到错配位点降解 DNA MutS MutH
(二)重组修复(recombination-repain)
在E.coli中的提取(retrival)系统
(三) SOS修复系统 差错倾向修复(Error prone repair) Jeam Weigle 等发现 UV λ噬菌体 细菌(UV未照射过) - 存活率低 UV-复活(UV-reactivation),也称W-复活 SOS反应(SOS response)