主讲人: 李薇 外文医学数据库.

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主讲人: 李薇 外文医学数据库

(National Library of Medicine,NLM) 美国生物技术信息中心 (National Center of Biotechnology Information, NCBI) 开发 Pubmed 美国国家医学图书馆 (National Library of Medicine,NLM)

PubMed ♦ PubMed数据库简介 ♦ PubMed数据范围 ♦ PubMed主页 ♦ PubMed检索方法 ♦ 检索结果的处理

一、PubMed数据库简介 PubMed是美国国家医学图书馆NLM所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的一个以Web方式向用户提供服务的生物医学文献检索系统,是目前世界上查找医学文献利用率最高的网上免费数据库

二、PubMed的数据范围 ♦ PreMedline ♦ MEDLINE ♦ OLDMEDLINE(1950-1965) ♦ 出版商提供的书目信息

学科范围: 使用词表:MeSH(医学主题词表) 基础生命科学 临床生命科学 生物科学 解剖学 组织学 化学与药物 心理学 社会医学 基础生命科学 临床生命科学 生物科学 解剖学 组织学 化学与药物 心理学 社会医学 农业 医技设备学   医技工业学 医学信息学 使用词表:MeSH(医学主题词表)

MEDLINE数据库简介 收录范围:来源于美国和世界上70多个国家和地 区、50种语言的7395种权威生物医学及相关学科 期刊,内容涉及生物医学各个领域;85%以上原 文为英语,80%记录有文摘,5%免费全文。目前 记录已达约2200万条,约40万篇/年 。 回溯时间:1966年至今。 记录中有[indexed for MEDLIEN]标记

PreMEDLINE 一种由正在加工处理中的文献记录组成的数 据库,这些新记录还未被或正在标引,暂时存放 在PreMEDLINE数据库中。每天更新,经过标 引(增加主题词、文献类型、数据库存取号等字 段)以后转入Medline,一旦记录被转入到 Medline数据库,就被从PreMEDLINE数据库中 删除。记录中有[PubMed-in process]的 标记。

New Data Collect Pre-Medline 最新信息 Medline Process 一周以后 PubMed

出版商提供的书目信息 (Publisher-Supplied Citation) 出版商直接向PubMed提供的非Medline收录的电子刊物,记录标有[Record as supplied by publishers]标记。(如:Science或Nature中的地质学文献等)。

标记不同,出自分库亦不同

PubMed简介 获取生物医学权威期刊最多 世界上70多个国家的7395种权威期刊 多种检索方法,多条检索途径 时效性极强(每周更新) 回溯年代久远(1950年至今) 利用MeSH作为转换词表,标引质量高 部分文献可以免费获取全文 检全率、检准率高 13

PubMed主页 进入途径: http://www.pubmed.com http://www.pubmed.gov http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez

三、PubMed的检索途径和方法 基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索

Pubmed 主页界面http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ 基本检索输入框 个人空间 高级检索 检索限制 常用工具 使用帮助 其他资源:

检索运算符 1、逻辑运算符:OR、AND、NOT 运算顺序:OR<AND<NOT,可用()改变检索词的 处理顺序。 2、截词符:* eg: cell*:cell、cells、celliferous、cellophane和cellular等词 的文献。 3、利用字段标识符进行限定检索: 检索式格式:检索词A[字段标识B],检索在字段中含有检 索词A的文献。 如: hepatitis[TI],smith [AU] 。 4、“ ”,将短语做为不可分割的整体进行检索。 如:“OXYGEN FREE RADICALS ” 注意: [ ]和“ ”必须为英文或中文半角。

Pubmed简单检索实例 例一     查找有关“肝癌和肝炎的关系”的文献,英文“liver cancer ” 和 “hepatitis”

检索文献数量

题录格式内容

在西文文献里,著者的署名一般名在前姓在后, 例:著者“Henry Hemila”应转换成 “ Hemila h”,后加著者字段限定来检索, 作者限定字段检索 例二 查找作者 Hemila h著作的文献 在西文文献里,著者的署名一般名在前姓在后, 例:著者“Henry Hemila”应转换成 “ Hemila h”,后加著者字段限定来检索, 注意:姓在前,名在后 姓全称,名缩写

三、PubMed的检索途径和方法 基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索

点击Edit可编辑检索框里面的策略式 字段 选择 检索史

四、PubMed的检索途径和方法 基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索

PubMed主题词检索 MeSH(Medical Subject Headings)即医学主题 词,是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。 NIH的工作人员按MeSH词表规定,浏览生物医学 期刊全文后标引出每篇文献中的MeSH主题词,其 中论述文献中心的主题词称主要主题词(major topic headings),论述主题某一方面的内容的词称 为副主题词(Subheadings)。

Mesh Database医学主题词表 功能: 确定规范化主题词 查看主题词词义注释、树状结构表 《医学主题词表》是对生物医学文献进行主题分 析、标引和检索的权威性词表。 功能: 确定规范化主题词 查看主题词词义注释、树状结构表 选择副主题词、扩展下位主题词、指定主要主题词

进入途径:

MeSH Database: 例1:从主题途径查找FK506副作用 例2:从主题途径查找肾移植的文献

kidney transplantation 检索流程 第一步:主题分析 英文转换 FK506 adverse effects kidney transplantation 点击MeSH Database Mesh界面 输入检索词 Go

第二步: 选定该主题词 主题词轮排表 点击该主题词 主题词细节屏

他克莫司 主题词轮排表

第三步: 主题词细节屏(主题词词义注释、副主题词、加权或不扩展、入口词、曾用词、树状结构) 选择合适的副主题词 选择加权或不扩展 主题词细节屏(主题词词义注释、副主题词、加权或不扩展、入口词、曾用词、树状结构) 选择合适的副主题词 选择加权或不扩展 send to

主题词细节屏 主题词词义注释 副主题词选择 加权检索 不扩展检索

入口词 曾用词 药理作用 树状结构

点击 搜索生成器

第四步: search box 点击 search PubMed 检索结果

点击搜索PUBMED

题录格式界面

逻辑组配(#5 and #7)

Pubmed主题词检索的功能: (1)理解词义和收入词表的时间 (2)限定副主题词 ,提高查准率。    (3)加权检索,提高查准率。    (4)了解树形结构,扩展检索,提高查全率 (5)了解同义词,提高查全率。

PubMed的检索途径和方法 基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索

Journal Database (期刊数据库) 可输入刊名全称、缩写或国际标准期刊号(ISSN)检 索特定期刊的编目信息;

引文匹配器 使用栏位化的检索方式,找寻特定刊名、卷期、作者、 篇名的文献资料。 引文匹配器 使用栏位化的检索方式,找寻特定刊名、卷期、作者、 篇名的文献资料。

PubMed 一、PubMed数据库简介 二、PubMed数据范围 三、PubMed主页 四、PubMed检索方法 五、检索结果的处理

检索结果处理 检索结果的显示与标记 检索结果的保存及定购 50

检索结果显示 默认为题录格式 每页显示20条记录 结果排序方式 每页显示记录数 结果显示格式 检索结果显示 默认为题录格式 每页显示20条记录

纯文本 方式显示

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