美国医学文献数据库PubMed 福建医科大学图书馆 林菲菲.

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美国医学文献数据库PubMed 福建医科大学图书馆 林菲菲

主要内容 一 认识Pubmed数据库 Pubmed的基本检索 三 Pubmed的高极检索(检索历史功能) 四 期刊数据库的检索 1、初步检索 2、检索结果过滤器 3、结果显示设置 4、结果输出 5、更多信息 三 Pubmed的高极检索(检索历史功能) 四 期刊数据库的检索 五 Mesh主题词检索 六 单引文匹配器(题录检索)

一、数据库概况 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ NCBI:National Center for Biotechnology Information(美国国立生物技术信息中心) NCBI是目前国际上几个重要分子生物信息网站之一,是NIH底下的NLM的部门之一。 Pubmed是NCBI数据库之一。 NLM: National Library of Medicine(国立医学图书馆) NIH: National Institutes of Health (国立卫生研究所)

(一)主办单位:NLM创建的生物医学文献书目型数据库 (二)收录范围: 年限:1949-今 文献量: - 收录全球80多个国家和地区的5200多种生物医学期刊,大都经美国卫生健康研究院的文献选择技术评估委员会Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)评估挑选,由NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。 - 累积了2200多万篇文献,年收录文献约40万篇,涉及37个语种,回溯至1950年的数据涉及60个语种。数据库47%为美国本土出版的文献,90%为英文文献,79%的文献有著者撰写的英文摘要。

PubMed是一个免费的生物医学文摘数据库,约10%论文提供全文( PubMed Central, PMC),大部分论文提供指向全文提供者(付费或免费)的链接。 学科范围: - 主要收录生物医学和健康科学以及生命科学相关领域的文献。 - 包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学,基础研究和临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。 - 2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。

(三)PubMed数据来源 MEDLINE(完整的核心数据) 是美国国立医学图书馆最重要的书目文摘数据库,PubMed主体部分, 1966至今的MEDLINE已标引数据,有MeSH字段和摘要,每条记录 标有[PubMed-indexed for MEDLINE] OldMDENLINE(早期的旧数据) 1949-1965年间的MEDLINE数据,没有MeSH字段和摘要,每条记录标有[PubMed-OLDMEDLINE]

(三) PubMed数据来源 MEDLINE Inprocess(正在被标引的数据) PubMed每天收录由Medline的期刊出版商提供的尚未经规范处理的数据,该库中的记录只有简单的书目信息和文摘,又称PreMedline 。该库中的数据每周一次转入MEDLINE,同时从PreMedline中删去。当进入MEDLINE时就会被标引,每条记录标有[PubMed-in process]。 Not MEDLINE(数据商提供的数据) 出版商提供的电子文献中MEDLINE不收录的数据。出版商一般提供的是整本期刊的信息,一部分数据每日将被添加到PreMedline中去,若有部分没有被MEDLINE收录,PubMed仍保存。每条记录标有[PubMed-as supplied by publisher]。

PubMed数据收录情况 Medline Not Medline New Data Collect Medline Pre-Medline Process PubMed Not Medline OldMedline

点击数据库名称

基本检索框 高级检索 主题词检索 题录检索 期刊检索

例1:检索有关心瓣膜疾病(heart valve disease)诊断(diagnosis)方面的文献。 输入检索式 点击“Search” 例1:检索有关心瓣膜疾病(heart valve disease)诊断(diagnosis)方面的文献。

文献类型 文献可获取内容 读者评论 出版时间 物种 语言 性别 主题 期刊来源

年龄 检索字段

例2:检索近两年有关细胞凋亡的综述文献,要求检出免费全文 内容特征: apoptosis 外部特征: last 2 years review free full text

显示设置 排序 输出格式 时间 摘要 相关度 文本格式摘要 出版时间 文摘 第一作者 文本格式文摘 通讯作者 期刊 网页格式 标题

结果输出 文本 剪贴板 邮箱 文献管理软件

按收入时间/相关度排序切换 按年统计的文章图表 标题含有检索词文献

查找相关文献 详细检索过程 点击See more 最近检索行为

点击“URL”

点击“Create alert”

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点击“My NCBI”

二、高级检索 1、检索式编制(search builder) 通过字段限定和索引选词构建复杂检索式 内容特征 例3:研究更年期抑郁症激素替代疗法的非中文文献 内容特征 激素替代疗法 Hormone Replacement 更年期抑郁症 Involutional Depression 外部特征 非中文 NOT chinese

输入检索词: hormone replacement

直接编辑检索式 执行检索结果预览 执行检索

例4:检索2000年以来美国斯安那州Pennington Biomedical Center 的Smith SR在期刊Diabetes上发表了多少篇文献。

五、主题词检索(MeSH Database) 确定规范化主题词 查看主题词词义注释、树状结构表 选择副主题词、扩展主题词、主要主题词

例5:欲查近5年研究肾衰竭饮食疗法并进一步观察其疗效的相关文献。 内容特征: renal failure diet therapy treatment outcome 外部特征: last 5 years

输入自由词:renal failure

点按规范词可获详细注解

主题词注释 检索式构建盒 副主题词选择

主题词树形结构表:显示该词的学科隶属关系 加权 扩展树:不进行下位词扩检 入口词:该规范词所代替的非规范词 主题词树形结构表:显示该词的学科隶属关系

一篇文献的所有主题词中,论述文献中心的主题词称主要主题词(major topic headings) ,如以下三篇文献的所有主题词中红色框里带星号的就是主要主题词

进一步检索肾衰竭综合疗效观察(treatment outcome) 输入新主题词: Treatment outcome 将组配检索式放入检索盒中

选择逻辑组配符

通过MeSH Database检索的结果,共85篇 检索结果更为专指

六、单引文匹配( Single Citation Matcher) 输入文献外部特征信息,查找特定文献。 刊名要准确,缩写要标准 著者姓名大小写不敏感 例6:查找黄国俊2006年发表在中华肿瘤杂志上的文献

1、查找“65岁及以上男性老年人老年痴呆症的预防”的文献。(分别用Pubmed数据库的快速检索和Mesh主题词检索) 2、查找近五年老年人肺小细胞癌综述性文献 (语种为英文并有免费全文) 3、查找Jeannine Farina发表于《Nephrology Nursing Journal》的文章。

下课啦 谢谢!